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肺腺癌转移至肾透明细胞癌1例

中华病理学杂志 2022年第3期51卷 245-247页

作者：王旖刘哲温玉婷西安市第九医院病理科西安710054

同一患者同时存在2个或2个以上的原发肿瘤很常见,但一个肿瘤转移到另一个肿瘤中,即肿瘤间转移(tumor-to-tumor metastasis,TTM)却非常罕见。肺癌向肾癌转移是最常见的肿瘤间转移。我们报道了1例46岁男性,因右侧肾脏肿物行右肾根治术。... 详细信息

同一患者同时存在2个或2个以上的原发肿瘤很常见,但一个肿瘤转移到另一个肿瘤中,即肿瘤间转移(tumor-to-tumor metastasis,TTM)却非常罕见。肺癌向肾癌转移是最常见的肿瘤间转移。我们报道了1例46岁男性,因右侧肾脏肿物行右肾根治术。肿物为肾透明细胞癌,其内可见多灶游离的微乳头状结构。随后患者行左下叶肺穿刺活检,病理诊断为肺腺癌。通过免疫组织化学染色结果支持肾透明细胞癌内的微乳头状结构来源于肺腺癌转移。肿瘤间转移的病理生理机制尚不清晰。明确诊断对于临床及病理均是一项挑战。

关键词：肾透明细胞癌病理生理机制肺穿刺活检原发肿瘤左下叶肺腺癌肿瘤转移 metastasis

肺腺癌合并血管内大B细胞淋巴瘤1例并文献复习

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中国肺癌杂志 2024年第2期27卷 152-156页

作者：王彤彤陈小悦段国辰张霄鹏赵庆涛许顺赵焕芬河北医科大学研究生学院石家庄050000 河北省人民医院病理科河北省儿童医院胸外科河北省人民医院胸外科中国医科大学附属第一医院胸外科沈阳110001

血管内大B细胞淋巴瘤(intravascular large B-cell lymphoma,IVLBCL)是一种侵袭性结外大B细胞淋巴瘤,在同一器官与其他恶性肿瘤同时发生非常罕见,尤其是肺。本文报道1例肺腺癌合并IVLBCL的罕见病例。患者因腹泻伴发热、咳嗽入院。胸部... 详细信息

血管内大B细胞淋巴瘤(intravascular large B-cell lymphoma,IVLBCL)是一种侵袭性结外大B细胞淋巴瘤,在同一器官与其他恶性肿瘤同时发生非常罕见,尤其是肺。本文报道1例肺腺癌合并IVLBCL的罕见病例。患者因腹泻伴发热、咳嗽入院。胸部计算机断层扫描(computed tomography,CT)示右肺上叶不规则斑片状高密度影,边缘有磨玻璃影。入院后给予患者抗感染等治疗,但仍有间断低热(最高37.5 ℃)。经皮肺穿刺活检(percutaneous lung biopsy,PLB)病理诊断为贴壁生长为主的腺癌,局部考虑浸润。手术后病理诊断为肺浸润性非黏液性腺癌合并IVLBCL。本文通过分析其临床病理特征,并复习相关文献,以提高临床和病理医师对该肿瘤的认识,避免漏诊或误诊。

关键词：肺肿瘤肺腺癌血管内大B细胞淋巴瘤

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肺腺癌亚型分类技术研究进展

计算机工程与应用 2023年第17期59卷 67-79页

作者：刘茗传张魁星江梅张晓丽李丽萍山东中医药大学智能与信息工程学院济南250355

肺腺癌存在多种不同类型,各有表征,准确对其分类是临床诊断和治疗的重要依据。从肺腺癌组织病理学、影像学、基因组学等多个方面进行肺腺癌亚型分类研究一直是临床研究的热点问题之一。特别是近年来机器学习和深度学习技术的发展为肺腺... 详细信息

肺腺癌存在多种不同类型,各有表征,准确对其分类是临床诊断和治疗的重要依据。从肺腺癌组织病理学、影像学、基因组学等多个方面进行肺腺癌亚型分类研究一直是临床研究的热点问题之一。特别是近年来机器学习和深度学习技术的发展为肺腺癌分类研究提供了新的方法和思路。详细阐述了当前肺腺癌分类技术的研究进展,对各种亚型分类技术应用进展进行了系统的评价。总结了各类分类技术的优缺点、传统分类方法的难易程度和常用的机器学习、深度学习技术模型的算法复杂度,分析了当前研究的相关问题,并对未来的研究方向进行了展望。

关键词：肺腺癌分类技术计算机断层扫描(CT)影像病理组织图像机器学习深度学习

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肺腺癌预后代谢相关基因的生物信息学分析

细胞与分子免疫学杂志 2023年第1期39卷 41-48页

作者：张文婷刘亚锋胡春晓王雪芹谢军张雪胡万发吴静邢应如胡东安徽理工大学医学院安徽淮南232001 安徽理工大学附属肿瘤医院检验科安徽淮南232001 安徽省职业健康安全工程实验室安徽淮南232001 安徽工业粉尘深度净化与职业健康教育部重点实验室安徽淮南232001

目的基于代谢基因的生物信息学构建肺腺癌预后模型及验证。方法获取癌症基因组图谱(TCGA)数据库和基因表达数据集(GEO)肺腺癌相关数据,套索(LASSO)回归构建多基因预后模型并计算风险值(RS)。单因素、多因素Cox独立预后分析,通过受试者... 详细信息

目的基于代谢基因的生物信息学构建肺腺癌预后模型及验证。方法获取癌症基因组图谱(TCGA)数据库和基因表达数据集(GEO)肺腺癌相关数据,套索(LASSO)回归构建多基因预后模型并计算风险值(RS)。单因素、多因素Cox独立预后分析,通过受试者工作特征(ROC)曲线评价模型的ROC曲线下面积(AUC)并进行生存分析。构建列线图评价模型的可行性,通过基因集富集分析(GSEA)进行代谢基因功能富集分析。肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库分析患者RS与免疫细胞浸润以及与免疫检查点分子表达的相关性。结果运用TCGA数据库基于18个代谢相关基因构建肺腺癌预后模型,RS可以作为独立的预后因子。ROC曲线下面积为0.713。生存分析显示,与高风险组相比,低风险组总体生存率更高,预后模型与免疫细胞的浸润以及与免疫检查点分子的表达有关。结论代谢相关基因肺腺癌预后模型的RS是独立预后因子,模型具有较高的预后判断价值。

关键词：肺腺癌代谢基因预后模型生物信息学

肺腺癌中可变剪接调控因子KHSRP调控的差异剪接基因分析

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中国癌症杂志 2023年第7期33卷 637-645页

作者：刘晓丽柴文君孙磊闫明霞潘洪玉孙跃喜复旦大学附属肿瘤医院肿瘤研究所复旦大学上海医学院肿瘤学系上海200032 同济大学附属同济医院急诊医学科上海200065

背景与目的:可变剪接在细胞增殖、生长、凋亡及分化等复杂的蛋白质功能调控中发挥着至关重要的作用,能参与包括肿瘤在内的多种疾病的发生、发展过程,目前大多数可变剪接调控因子的功能及其作用机制尚不清楚。本研究旨在探讨KH型剪接调... 详细信息

背景与目的:可变剪接在细胞增殖、生长、凋亡及分化等复杂的蛋白质功能调控中发挥着至关重要的作用,能参与包括肿瘤在内的多种疾病的发生、发展过程,目前大多数可变剪接调控因子的功能及其作用机制尚不清楚。本研究旨在探讨KH型剪接调控蛋白(KH-type splicing regulatory protein,KHSRP)在肺腺癌中的差异剪接靶基因及靶基因的表达与患者预后及免疫细胞功能的相关性。方法:通过高通量可变剪接测序,筛选KHSRP下游差异剪接靶基因。通过肿瘤免疫评估资源(Tumor IMmune Estimation Resource,TIMER)和阿拉巴马大学伯明翰分校癌症数据分析门户(the University of Alabama at Birmingham cancer data analysis portal,ULCAN)分析KHSRP下游差异剪接靶基因在肺腺癌中的表达。通过Kaplan数据库分析KHSRP下游差异剪接靶基因的表达与患者预后的相关性。通过TIMER免疫模块分析KHSRP下游差异剪接靶基因与免疫细胞功能的相关性。结果:NUMB、ADD3及LIMCH1为KHSRP的下游关键可变剪接靶基因。NUMB、ADD3及LIMCH1在肺腺癌肿瘤组织中均呈低表达,其低表达者预后不良。NUMB、ADD3及LIMCH1与免疫细胞功能呈正相关。结论:在肺腺癌中,NUMB、ADD3及LIMCH1为KHSRP的差异剪接靶基因,且NUMB、ADD3及LIMCH1低表达会导致预后不良,并且与免疫细胞功能呈正相关。

关键词：肺腺癌 KH型剪接调控蛋白可变剪接差异剪接靶基因

肺腺癌昼夜节律基因相关预后风险模型的构建与验证

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中国胸心血管外科临床杂志 2024年

作者：崔严奇赵虎张亚伟倪琳连铎煌杨鲸蓉叶仕新许蜂蜂张锦灿曾志勇福建医科大学福总临床医学院联勤保障部队第九〇〇医院(原南京军区福州总医院)普外科联勤保障部队第九〇〇医院(原南京军区福州总医院)心胸外科

目的探索昼夜节律基因与肺腺癌（lung adenocarcinoma,LUAD）的发生发展、预后及肿瘤微环境（tumor microenvironment,TME）之间的关系。方法采用癌症基因组图谱数据，评估昼夜节律基因集在LUAD中的表达、拷贝数变异和体细胞突变频率... 详细信息

目的探索昼夜节律基因与肺腺癌（lung adenocarcinoma,LUAD）的发生发展、预后及肿瘤微环境（tumor microenvironment,TME）之间的关系。方法采用癌症基因组图谱数据，评估昼夜节律基因集在LUAD中的表达、拷贝数变异和体细胞突变频率。采用GO、KEGG和GSEA富集分析探索生物钟基因影响LUAD进展的潜在机制。通过Cox分析、LASSO回归、支持向量机递归特征消除和随机森林筛选特征昼夜节律基因并建立预后模型，并在此基础上构建列线图预测患者1、3、5年生存率。绘制Kaplan-Meier生存曲线、受试者工作特征（receiver operating characteristic,ROC）曲线和时间依赖性ROC曲线评价模型的预测能力，GEO外部数据集进一步验证了预测模型的预后价值。此外，我们还评估了预后模型与免疫细胞和免疫检查点基因的关联。最后，利用单细胞RNA测序（single cell RNA sequencing,scRNA-seq）分析探讨预后相关的特征昼夜节律基因与TME中不同免疫细胞群体之间的分子特征。结果昼夜节律差异表达基因主要富集于cGMP-PKG信号通路、脂质与动脉粥样硬化和JAK-STAT信号通路等相关生物学过程。筛选出7个昼夜节律基因：LGR4、CDK1、KLF10、ARNTL2、RORA、NPAS2、PTGDS。根据中位风险评分（RiskScore），将样本分为高风险组和低风险组。与低风险组患者相比，高风险组患者表现出更不利的预后结局。免疫学特征分析显示，低风险组和高风险组之间的多种免疫细胞存在浸润差异。大多数免疫检查点基因在高风险组中的表达水平较高，并且RiskScore与CD276、TNFSF4、PDCD1LG2、CD274和TNFRSF9的表达呈正相关，与CD40LG和TNFSF15的表达呈负相关。通过scRNA-seq分析，RORA和KLF10主要表达于自然杀伤细胞。结论基于7个特征昼夜节律基因的预后模型在预测LUAD的生存方面具有一定的预测价值。昼夜节律基因的表达失调可能通过影响TME来调控LUAD的发生、进展以及预后，这为之后从昼夜节律紊乱影响免疫细胞机制的角度寻找治疗LUAD的潜在策略提供了可能的方向。

关键词：昼夜节律肺腺癌机器学习免疫微环境单细胞分析列线图

初治肺腺癌患者EGFR基因突变和C-MET基因扩增共存的临床病理及预后分析

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中国医学科学院学报 2023年第4期45卷 627-633页

作者：王婉玲许存宝杨金玲张宏图陈一峰福建医科大学附属泉州第一医院病理科福建泉州362000 国家癌症中心、国家肿瘤临床医学研究中心、中国医学科学院、北京协和医学院、肿瘤医院病理科北京100021

目的探讨初治肺腺癌患者驱动基因EGFR突变和C-MET扩增共存的临床病理特征、预后。方法复阅病理切片,应用扩增阻遏突变系统—实时荧光定量聚合酶链反应检测EGFR基因突变,应用荧光原位杂交检测C-MET扩增,回顾性分析EGFR突变和C-MET扩增共... 详细信息

目的探讨初治肺腺癌患者驱动基因EGFR突变和C-MET扩增共存的临床病理特征、预后。方法复阅病理切片,应用扩增阻遏突变系统—实时荧光定量聚合酶链反应检测EGFR基因突变,应用荧光原位杂交检测C-MET扩增,回顾性分析EGFR突变和C-MET扩增共存初治肺腺癌的临床病理及随访资料。结果11例EGFR突变合并C-MET扩增的送检组织中除1例难以评估组织结构的细胞块,其他10例均出现复杂腺体和实性的高级别成分。临床Ⅳ期的EGFR突变合并C-MET扩增组患病率显著高于EGFR突变组和C-MET扩增组,差异有统计学意义(P均0.05)。EGFR基因和C-MET扩增组间的生存率变化差异无统计学意义(χ^(2)=0.042,P=0.838),而EGFR突变合并C-MET扩增组患者的生存状况显著差于EGFR突变组(χ^(2)=246.72,P肺腺癌组织学分化较差、进展快、预后差,首诊时往往已经是癌症晚期,临床需重视这种并发的不良驱动分子事件,随着C-MET靶向抑制剂的可及性增加,这部分叠加分子事件的肺腺癌患者将可能从EGFR与C-MET双靶用药中获益。

关键词：肺腺癌 EGFR基因 C-MET扩增

肺腺癌铁死亡相关LncRNA的筛选及风险预测研究

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中国卫生统计 2023年第4期40卷 487-491,496页

作者：马宇杰田伟张薇刘美娜哈尔滨医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系 150081

目的筛选铁死亡相关长链非编码RNA(ferLncRNA)构建风险评分模型,并进行肺腺癌患者的生存预测。方法通过相关性分析、癌组织-癌旁组织差异分析,获得差异表达的铁死亡相关LncRNA(DEferlncRNA),使用配对算法获得DEferlncRNA pairs。利用LAS... 详细信息

目的筛选铁死亡相关长链非编码RNA(ferLncRNA)构建风险评分模型,并进行肺腺癌患者的生存预测。方法通过相关性分析、癌组织-癌旁组织差异分析,获得差异表达的铁死亡相关LncRNA(DEferlncRNA),使用配对算法获得DEferlncRNA pairs。利用LASSO Cox筛选与生存相关DEferlncRNA pairs,多因素Cox回归分析并构建风险评分模型;计算ROC曲线的AUC值评估模型。利用单因素和多因素Cox回归分析风险评分是否具有独立预后价值;分析生存时间、临床病理特征和化疗疗效等在高、低风险组之间的差别。结果相关性分析获取512个ferlncRNA,差异分析获得53个DEferlncRNA,配对算法获得1243个DEferlncRNA pairs。LASSO Cox分析获得40个与生存相关DEferlncRNA pairs,多因素分析得到17个DEferlncRNA pairs构建风险评分模型;模型的AUC为0.776。单因素和多因素分析提示风险评分可作为肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)的独立预后因素。患者化疗药物敏感性、TNM分期、临床分期、生存时间和生存状态在高、低风险组之间差异有统计学意义。结论利用DEferlncRNA构建的肺腺癌风险评分模型,可为预测肺腺癌患者预后提供依据。此外,低风险评分患者对化疗药物敏感,将为肺腺癌患者临床治疗提供参考。

关键词：肺腺癌铁死亡 LncRNA 生存分析预后

表皮生长因子受体突变的肺腺癌转化为肉瘤的临床分析

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中华结核和呼吸杂志 2024年第1期47卷 24-30页

作者：祝清清杜明占吴文婷郭凌川黄建安沈旦苏州大学附属第一医院呼吸与危重症医学科苏州215006 苏州大学附属第一医院病理科苏州215006

目的组织学转化是非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)-酪氨酸激酶抑制剂(tyrosine kinase inhibitor,TKI)耐药的一种形式,其中以小细胞癌转化多见,肉瘤转化鲜有报道。本文报道1例肺腺癌EGFR-TKI耐药后转化为肉瘤的临床资料,并复习文献,以提高对该耐药机制的认识。方法收集该例肺腺癌EGFR-TKI耐药后肉瘤转化患者的诊治过程、病理特征、临床转归等资料,并检索文献,对腺癌耐药后肉瘤样癌/肉瘤转化的发生机制、患者的临床特点以及治疗方案等进行分析。结果本例患者接受埃克替尼一线治疗后出现EGFR-T790M突变,二线使用阿美替尼治疗后出现肉瘤转化,随后行化疗、放射性粒子植入、抗血管生成治疗及免疫治疗等,效果均不理想。检索文献未见EGFR-TKI耐药肺腺癌转化为肉瘤的相关报道,14例腺癌转化为肉瘤样癌的相关报道中,8例伴EGFR突变,3例伴ALK突变,2例ROS1突变,1例未见相关敏感突变;14例患者转为肉瘤样癌后中位存活时间仅为3个月。结论肉瘤组织转化可为肺腺癌患者EGFR-TKI治疗后耐药的形式之一,腺癌患者肉瘤样转化后预后较差。

关键词：肺腺癌 EGFR-TKI耐药肉瘤转化