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二乙基亚硝胺诱导的大鼠肝癌前期病变肠道微生物组-短链脂肪酸代谢途径的动态变化及益生素干预效应

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中国病原生物学杂志 2024年第7期19卷 761-767页

作者：卢宏全时彩艳林明利张诚胜海南西部中心医院肿瘤内科海南儋州571700 海南西部中心医院放疗科儋州市人民医院检验科海南医学院第二附属医院肿瘤内科

目的探讨二乙基亚硝胺(DEN)诱导的大鼠肝癌前期病变中肠道微生物组-短链脂肪酸代谢途径的动态变化,以及益生素干预的效应。方法本研究选用雄性SD大鼠,通过一次性腹腔注射DEN诱导肝癌模型。实验分为对照组、DEN模型组和DEN模型干预组,... 详细信息

目的探讨二乙基亚硝胺(DEN)诱导的大鼠肝癌前期病变中肠道微生物组-短链脂肪酸代谢途径的动态变化,以及益生素干预的效应。方法本研究选用雄性SD大鼠,通过一次性腹腔注射DEN诱导肝癌模型。实验分为对照组、DEN模型组和DEN模型干预组,后者自DEN注射次日起接受益生菌饮食干预。通过16S rRNA基因测序分析肠道菌群组成,采用气相色谱-质谱联用(GC-MS)检测粪便中的SCFA含量,并通过生化指标、组织病理学检测和分子生物学方法评估干预效果。结果 DEN模型组大鼠的体重增长显著缓慢(30±20 g),肝功能损害指标(ALT、AST、ALP、GGT)显著升高,与对照组(体重增长50±15 g;ALT 35±5 U/L,AST 30±4 U/L,ALP 90±10 U/L,GGT 20±3 U/L)和干预组(体重增长40±18 g;ALT 70±15 U/L,AST 65±10 U/L,ALP 150±20 U/L,GGT 45±8 U/L)相比有统计学差异。DEN模型组大鼠的HGF、TGF-β和α-SMA表达量显著高于对照组和干预组。肠道菌群分析显示,DEN模型组的Chao1和Shannon指数显著低于对照组和干预组。SCFA分析结果表明,DEN模型组大鼠的丙酸(0.52±0.19 mmol/L)和异戊酸(0.36±0.054 mmol/L)含量显著降低,而在DEN模型干预组中丙酸(0.80±0.21 mmol/L)和异戊酸(0.64±0.19 mmol/L)含量较DEN模型组显著恢复。结论 DEN诱导的大鼠肝癌模型中,肠道微生物组结构和SCFA代谢途径发生显著变化,益生素干预可以改善肠道微生物组成,增加SCFA产量,减轻肝脏损伤,对抗肝脏纤维化和肿瘤发展。这些发现为利用肠道微生物组和SCFA代谢途径预防和治疗肝癌提供了新的视角。

关键词：二乙基亚硝胺(DEN) 肝细胞癌(HCC) 肠道微生物组短链脂肪酸(SCFAs) 益生素干预

慢性肾脏病血液透析患者血管钙化、死亡风险和肠道微生物组之间的潜在联系

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中国病原生物学杂志 2024年第7期19卷 795-799页

作者：吴海莉吴秀萍张敏敏胡迪铜陵市立医院血液透析中心安徽铜陵244000

目的初步分析慢性肾脏病(CKD)血液透析患者血管钙化、死亡风险和肠道微生物组之间的潜在联系,为该类患者的治疗防控提供参考。方法选取本院符合纳入标准的慢性肾脏病患者45例作为研究对象,其中24例进行血液透析的患者为透析组,21例未... 详细信息

目的初步分析慢性肾脏病(CKD)血液透析患者血管钙化、死亡风险和肠道微生物组之间的潜在联系,为该类患者的治疗防控提供参考。方法选取本院符合纳入标准的慢性肾脏病患者45例作为研究对象,其中24例进行血液透析的患者为透析组,21例未进行血液透析的患者为未透析组。应用16SrDNA测序技术检测患者肠道菌群,并使用生物信息学方法分析各组对象肠道菌群变化。结果透析组发生血管钙化12例,死亡1例;未透析组发生血管钙化5例,死亡0例;透析组血管钙化率及死亡率均高于未透析组,但差异无统计学意义(P>0.05)。2组厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门和放线菌门丰度较高,透析组患者拟杆菌门的丰度低于未透析组(P组,差异有统计学意义(P组肠道菌群有离散趋势,说明两组肠道菌群组成存在差异。2组Shannon指数和Chaol指数比较,差异无统计学意义(P>0.05)。2组比较有16个差异菌,透析组患者中肠杆菌目、放线菌门、埃希菌?志贺菌属等的丰度升高,未透析组的拟杆菌门、毛螺菌属丰度升高。结论慢性肾脏病血液透析患者血管钙化、死亡风险和肠道微生物组密切相关,互相影响。透析组的肠道菌群中潜在病原体显著增加,有益细菌显著减少,血液钙化及死亡风险高于未透析组。

关键词：慢性肾脏病血液透析血管钙化死亡风险肠道微生物组

六味地黄丸调节肠道微生物组平衡抑制卵巢早衰小鼠的氧化应激

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中国组织工程研究 2024年

作者：仲佳雯姜波张文燕李晓荣秦岭高婷 1.宁夏医科大学,中医学院 2.宁夏医科大学,生育力保持重点实验室 3.宁夏医科大学,少数民族医药现代化教育部重点实验室 4.宁夏医科大学总医院宁夏医科大学中医学院宁夏医科大学生育力保持重点实验室宁夏医科大学少数民族医药现代化教育部重点实验室宁夏医科大学总医院

背景：研究表明，卵巢早衰患者肠道菌群结构发生变化，肠道菌群失调可能是卵巢早衰发生的重要机制之一。目的：探讨六味地黄丸对环磷酰胺诱导卵巢早衰小鼠氧化应激和肠道微生物群的影响。方法：45只雌性ICR小鼠随机分为3组：空白组(正... 详细信息

背景：研究表明，卵巢早衰患者肠道菌群结构发生变化，肠道菌群失调可能是卵巢早衰发生的重要机制之一。目的：探讨六味地黄丸对环磷酰胺诱导卵巢早衰小鼠氧化应激和肠道微生物群的影响。方法：45只雌性ICR小鼠随机分为3组：空白组(正常小鼠)、模型组(卵巢早衰小鼠)、六味地黄丸组，后2组小鼠一次性腹腔注射环磷酰胺(120 mg/kg)制备卵巢早衰小鼠模型，造模成功后六味地黄丸组小鼠连续灌胃六味地黄丸(1.56 g/kg)28 d，其余2组灌胃等量生理盐水28 d，灌胃结束后取材。每周记录小鼠体质量，计算卵巢指数，苏木精-伊红染色观察小鼠卵泡的发育情况，ELISA法检测血清抗苗勒管激素、雌二醇、促卵泡激素、超氧化物歧化酶、谷胱甘肽过氧化物酶和丙二醛水平，并通过16S rDNA测序检测所有小鼠的肠道微生物组。结果与结论：(1)模型组小鼠的毛发疏松，活力及抓力下降，体质量几乎无增长，卵巢指数下降；六味地黄丸治疗后小鼠的体质量高于模型组，卵巢指数也随之升高(P 组小鼠动情周期紊乱；六味地黄丸能恢复卵巢早衰小鼠的发情周期，减少闭锁卵泡数量。(3)模型组小鼠血清中促卵泡激素、丙二醛水平显著升高(P 组小鼠血清促卵泡激素、丙二醛水平显著降低(P 肠道微生物群的丰度和多样性，可增加有益菌的相对丰度，KEGG通路分析显示，肠道微生物群与代谢途径、次生代谢产物的生物合成、不同环境中的微生物代谢、氨基酸的生物合成等通路受六味地黄丸的调控。(5)结论：肠道微生物组的改变可能是六味地黄丸治疗卵巢早衰的潜在机制之一。六味地黄丸能调节肠道微生物组结构，增加有益菌数量，减少有害菌数量，从而改善肠道微生态平衡。这种调节作用有助于降低氧化应激水平，进一步抑制卵巢早衰小鼠卵巢氧化应激。

关键词：六味地黄丸卵巢早衰肠道微生物组氧化应激

微生物组学方法评估介入超声引导下的前列腺癌活检对患者肠道菌群的影响

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中国病原生物学杂志 2024年第4期19卷 430-435页

作者：李金罗乐何糠胡德军李明星西南医科大学附属医院超声科四川泸州646000 德阳市人民医院超声科

目的评估介入超声引导下的前列腺活检(TPPBx)对患者肠道菌群结构的影响。方法本前瞻性队列研究选取2023年3月1日至10月30日在德阳市人民医院泌尿科就诊的15名因前列腺特异性抗原(PSA)升高建议行TPPBx的患者。采集患者TPPBx前后的粪便样... 详细信息

目的评估介入超声引导下的前列腺活检(TPPBx)对患者肠道菌群结构的影响。方法本前瞻性队列研究选取2023年3月1日至10月30日在德阳市人民医院泌尿科就诊的15名因前列腺特异性抗原(PSA)升高建议行TPPBx的患者。采集患者TPPBx前后的粪便样本,并通过16S rRNA基因测序分析肠道微生物组成。结果放线菌门、拟杆菌门、厚壁菌门、变形菌门、疣微菌门和古菌门是肠道菌群的主要组成部分,占比超过80%。与Pre-TPPBx组相比,Post-TPPBx组中拟杆菌门的比例显著降低(16.20%±7.57%vs.13.12%±8.13%,t=2.583,P=0.013),而厚壁菌门的比例显著增加(14.29%±6.49%vs.16.51%±7.54%,t=2.962,P=0.029)。在多样性分析中,与Pre-TPPBx组相比,Post-TPPBx组患者的肠道菌群Alpha多样性指数有显著下降,包括Shannon指数(1.94±0.62 vs.1.54±0.54,t=-3.100,P=0.004)、Simpson指数(0.79±0.09 vs.0.55±0.09,t=4.751,P=0.001)和Chao1指数(31.51±11.36 vs.27.68±9.27,t=2.964,P=0.007)。Beta多样性分析也显示了两组之间明显的差异分布。LEfSe分析显示,Post-TPPBx样本中与缓解炎症相关的细菌属如Eubacterium eligens group、Lachnospira和Butyricicoccus的相对丰度更高,Pre-TPPBx样本中富集了多个与炎症和焦虑有关的细菌属。结论TPPBx可能会改变患者的肠道微生物群结构,具体表现为增加有益菌属和与减少炎症相关的菌属。本研究强调了在前列腺癌诊断中考虑微生物组的重要性,并为未来的研究提供了新的方向。

关键词：前列腺活检肠道微生物组 16S rRNA基因测序 TPPBx 微生物群结构

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肠道微生物组在麻醉学领域的研究现状及进展

实用医学杂志 2023年第7期39卷 914-918页

作者：张魏怡宋辛叶栾永大连医科大学附属第一医院麻醉科辽宁大连116011

近年来,人类微生物组在健康和疾病中的研究为临床医学的许多领域带来了新的启示。新的研究表明,肠道微生物组与麻醉剂和镇痛剂的作用、围手术期结局、重症监护和术后疼痛等不同临床领域均有相互作用及潜在的临床应用。然而,人们对肠道... 详细信息

近年来,人类微生物组在健康和疾病中的研究为临床医学的许多领域带来了新的启示。新的研究表明,肠道微生物组与麻醉剂和镇痛剂的作用、围手术期结局、重症监护和术后疼痛等不同临床领域均有相互作用及潜在的临床应用。然而,人们对肠道微生物组在麻醉和疼痛中的作用知之甚少,仍有广阔的研究空间。为此本文回顾了人类肠道微生物组的基本概念、影响宿主的可能机制和干预微生物用于治疗的方式方法,概述了将肠道微生物组与麻醉学相关领域联系起来的证据。

关键词：肠道微生物组麻醉学术后疼痛

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三种圈养金丝猴肠道微生物组差异分析

野生动物学报 2023年第3期44卷 580-592页

作者：张媛媛赵素芬王运盛李祥翔蒋鹏刘燕张成林卢岩北京动物园管理处圈养野生动物技术北京市重点实验室北京100044

川、滇、黔金丝猴(Rhinopithecus roxellana、Rh.bieti、Rh.brelichi)均为我国特有种,国家一级重点野生保护动物。作为典型的食叶动物,其肠道微生物组特性研究也备受学者关注。为探究川、滇、黔金丝猴肠道微生物组结构,促进金丝猴胃肠... 详细信息

川、滇、黔金丝猴(Rhinopithecus roxellana、Rh.bieti、Rh.brelichi)均为我国特有种,国家一级重点野生保护动物。作为典型的食叶动物,其肠道微生物组特性研究也备受学者关注。为探究川、滇、黔金丝猴肠道微生物组结构,促进金丝猴胃肠道健康及为相关疾病防控提供参考数据,以北京动物园管理处圈养的3种7只金丝猴为研究对象,采用16S r DNA测序及分析技术,开展相同圈养环境下3种金丝猴肠道微生物组差异研究。结果显示:圈养健康金丝猴肠道微生物组的优势菌门为厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和变形菌门(Proteobacteria),这与人类肠道微生物组成分相似,金丝猴暴露于人类影响和圈养环境中可能会引起肠道微生物组人源化;川金丝猴样本的肠道微生物群落的丰富度和多样性低于滇、黔金丝猴,3种金丝猴在细菌域不同分类水平上存在多物种的差异,且3种金丝猴OTUs在不同分类水平共检测到47个微生物标志物的相对丰度存在显著差异。圈养条件下,3种金丝猴的食物种类和结构基本一致,这提示相同圈养环境下3种金丝猴肠道微生物组间的差异可能并非源于圈养环境下的食物组成;此外,腹泻滇金丝猴样本肠道微生物组多样性显著降低,同时伴随着优势菌结构的改变和潜在病原菌的出现,肠道微生物菌群的紊乱可能导致个体腹泻的发生,变形菌门弧菌属(Vibrio)、肠杆菌属(Enterobacter)、克雷伯氏菌属(Klebsiella)和泛菌属(Pantoea)4个属的出现可能导致个体腹泻。研究结果可为圈养金丝猴的饲养繁殖、营养代谢和胃肠道适应等方面提供参考信息。

关键词：圈养川金丝猴滇金丝猴黔金丝猴 16S rDNA 肠道微生物组

基于肠道微生物组相关lncRNAs识别胃癌的预后及免疫治疗特征

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昆明理工大学学报（自然科学版） 2023年第5期48卷 140-153,231页

作者：王振张乐刘虹汝张钰哲大理大学基础医学院云南大理671000

肠道微生物组在人体的免疫反应、能量代谢、癌症发生中发挥着重要作用.长链非编码RNA(Long Non-coding RNAs,lncRNAs)的差异表达通常与肿瘤的发生、转移、预后和耐药性密切相关.然而,人们对于肠道微生物相关的lncRNAs与胃癌之间的关系... 详细信息

肠道微生物组在人体的免疫反应、能量代谢、癌症发生中发挥着重要作用.长链非编码RNA(Long Non-coding RNAs,lncRNAs)的差异表达通常与肿瘤的发生、转移、预后和耐药性密切相关.然而,人们对于肠道微生物相关的lncRNAs与胃癌之间的关系知之甚少.本研究通过癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库获取胃癌组织和癌旁组织的转录组数据和临床数据.皮尔森相关分析(|coefficients|>0.4,and p肠道微生物组相关的lncRNAs.单因素Cox回归,LASSO(Least Absolute Shrinkage and Selection Operator)回归算法和多因素Cox回归用于构建肠道微生物组相关lncRNAs的风险预测模型.通过3个肠道微生物组相关lncRNAs(AC093627.7,AL139147.1,AC083902.1)构建了风险模型.本研究采用K-M生存曲线和受试者工作特征(Receiver Operating Characteristics,ROC)曲线来验证和评估风险模型.此外,论文还构建了列线图用于预测患者的预后.基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集用于分析肠道微生物组高低风险组间潜在的生物功能和通路差异.最后,分析了肠道微生物组高低风险组间的免疫特征,免疫表观评分(Immunophenoscore,IPS),微卫星不稳定性(Microsatellite Instability,MSI),肿瘤突变负荷(Tumor Mutation Burden,TMB)和免疫治疗药物敏感性差异.MSI和TMB分析都表明肠道微生物组低风险组的胃癌患者更可能从免疫检查点抑制剂治疗中获益,这说明肠道微生物组在调控宿主的免疫反应中发挥作用,有潜力成为免疫检查点治疗的生物标志物之一.

关键词：肠道微生物组胃癌长链非编码RNA 预后免疫检查点抑制剂

肠道微生物组在肿瘤发生中的作用和在癌症治疗中的应用

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癌症 2023年第7期42卷 319-351页

作者：李孟鸿中山大学胃肠病学研究所广东广州510020 中山大学附属第六医院结直肠肠及盆底疾病广东省重点实验室广东广州510020

研究表明,肠道菌群失调会导致生理变化,并与包括癌症在内的许多疾病有关。因此,应该在微生物组的背景下研究许多癌症类别和治疗方案。由于宏基因组测序和多组学研究的可用性,对肠道微生物群的物种特征、宿主遗传变化和代谢谱的分析变得... 详细信息

研究表明,肠道菌群失调会导致生理变化,并与包括癌症在内的许多疾病有关。因此,应该在微生物组的背景下研究许多癌症类别和治疗方案。由于宏基因组测序和多组学研究的可用性,对肠道微生物群的物种特征、宿主遗传变化和代谢谱的分析变得可行,促进了关于肿瘤发生过程中微生物群组成、分类学改变和宿主相互作用的指数级知识增益。然而,肠道微生物群的复杂性,以及大量未表征的宿主–微生物、微生物–微生物和环境相互作用,仍然是我们推进对微生物群–癌症相互作用理解的挑战。这些相互作用体现在信号传递、代谢、免疫、肿瘤发展、遗传不稳定性以及对癌症化疗和免疫治疗的敏感性。本综述总结了目前关于肠道微生物群与癌症发展之间关联的研究/分子机制,从而为可用于癌症诊断、治疗或预防的治疗策略提供参考。

关键词：癌症生物标志物化疗粪便微生物群移植肠道微生物组免疫疗法微生物群益生菌

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肠道微生物组与非吸烟女性肺癌关联研究

环境卫生学杂志 2023年第4期13卷 234-242页

作者：张帅郑萍许宁王强中国疾病预防控制中心环境与人群健康重点实验室中国疾病预防控制中心环境与健康相关产品安全所北京100021

目的探索肠道菌群变化与非吸烟女性肺癌风险的关联,为非吸烟女性肺癌的防控提供干预依据。方法采用以医院为基础的多中心病例对照研究,使用16S rRNA基因测序技术对所收集的192例研究对象(病例组n=92;对照组n=100)的粪便样本进行测序,利... 详细信息

目的探索肠道菌群变化与非吸烟女性肺癌风险的关联,为非吸烟女性肺癌的防控提供干预依据。方法采用以医院为基础的多中心病例对照研究,使用16S rRNA基因测序技术对所收集的192例研究对象(病例组n=92;对照组n=100)的粪便样本进行测序,利用多样性云分析平台分析肺癌患者肠道菌群特征。运用LASSO回归和Logistic回归分析两组差异肠道菌群分值与非吸烟女性肺癌的关联。结果病例组和对照组肠道菌群丰富度(Wilcoxon检验,P组和对照组共有22个差异菌属,其中病例组特征菌属为拟杆菌属(Bacteroides)、副拟杆菌属(Parabacteroides)、乳梭菌属(Lachnoclostridium)、无害芽孢梭菌属(Clostridium innocuum group)、罗姆布茨菌属(Romboutsia)等11个菌属,对照组特征菌属为Clostridium sensu stricto 1、Agathobacter、多利菌属(Dorea)、柯林斯菌属(Collinsella)、UCG-002等11个菌属。经过LASSO回归和Logistic回归分析,差异菌群的菌群分值与肺癌风险为正关联,是肺癌的危险因素(AOR=2.22,95%CI:1.63~3.02)。此外,居住环境(曾长期居住在地下室或一楼),腌菜、肉类和酸奶食用频率也与非吸烟女性肺癌的发生相关,其中曾长期居住在地下室或一楼、食用肉类和腌菜频率高是肺癌发生的危险因素,食用酸奶频率高是保护因素。结论肺癌患者与非肺癌对照人群肠道菌群结构存在一定的差异,肠道微生态变化可能是增加非吸烟女性肺癌患病风险的危险因素。

关键词：非吸烟女性肺癌肠道微生物组菌群分值 16S rRNA QIIME2 LASSO