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一株致猪肺炎大肠杆菌的分离鉴定及其耐药表型、耐药基因型分析

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黑龙江畜牧兽医 2014年第12期 132-134,259页

作者：于雪郭霞张馨元孔令聪刘树明马红霞吉林农业大学动物科学技术学院长春130118 吉林农业大学动物生产及产品质量安全教育部重点实验室长春130118

为了了解猪肠外致病性大肠杆菌的耐药性,试验采用菌落形态观察、小鼠毒力试验、回归动物试验和PCR等方法对1株引起猪肺炎的病原菌进行鉴定,并通过微量稀释法进行耐药性检测,在全基因组测序的基础上对耐药基因型进行分析。结果表明:该病... 详细信息

为了了解猪肠外致病性大肠杆菌的耐药性,试验采用菌落形态观察、小鼠毒力试验、回归动物试验和PCR等方法对1株引起猪肺炎的病原菌进行鉴定,并通过微量稀释法进行耐药性检测,在全基因组测序的基础上对耐药基因型进行分析。结果表明:该病原菌是肠外致病性大肠杆菌,呈多重耐药,其染色体基因组携带有外排调控基因Mar C、SoxR,外排泵基因MATE和ABC,耐药基因移动原件IS,四环素耐药基因tet,氟苯尼考耐药基因FloR及氯霉素乙酰转移酶基因等。

关键词：猪肺炎肠外致病性大肠杆菌鉴定动物回归试验耐药表型耐药基因型

脑卒中相关性肺炎患者多药耐药菌感染影响因素及其耐药基因型

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中华医院感染学杂志 2023年第7期33卷 1025-1029页

作者：金海淼金信春周海金邵佳辉蔡海波温岭市第一人民医院神经内科浙江温岭317500

目的探讨脑卒中相关性肺炎患者多药耐药菌耐药性及耐药基因情况,分析感染的影响因素。方法选择2018年2月-2021年5月温岭市第一人民医院收治的90例脑卒中相关性肺炎患者作为研究对象,收集患者临床资料,进行病原菌检测及耐药性分析,统计... 详细信息

目的探讨脑卒中相关性肺炎患者多药耐药菌耐药性及耐药基因情况,分析感染的影响因素。方法选择2018年2月-2021年5月温岭市第一人民医院收治的90例脑卒中相关性肺炎患者作为研究对象,收集患者临床资料,进行病原菌检测及耐药性分析,统计多药耐药菌感染比例及影响因素。结果90例脑卒中相关性肺炎患者共分离95株细菌,其中革兰阴性菌58株(61.05%),革兰阳性菌28株(29.47%),真菌9株(9.47%)。鲍氏不动杆菌检出CTX-M、TEM、SHV、gyrA、PBP2B基因突变株5、6、2、4、2株,肺炎克雷伯菌检出CTX-M、TEM、SHV、mecA、gyrA、PBP2B基因突变株4、3、2、2、2、1株;金黄色葡萄球菌检出mecA、PBP2B基因突变株3、2株;表皮葡萄球菌检出mecA、PBP2B基因突变株1、2株。90例脑卒中相关性肺炎患者中,多药耐药感染者44例。多因素分析示,入住ICU治疗、意识障碍、晚发型肺炎、预防性抗菌药物使用是发生多药耐药菌感染的独立影响因素(P耐药菌感染比例较高,且入住ICU治疗、意识障碍、晚发型肺炎、预防性抗生素使用是发生多药耐药菌感染的影响因素,可为早期干预提供参考。

关键词：脑卒中相关性肺炎多药耐药菌感染风险模型病原菌分布耐药性耐药基因型

重症监护病房耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌的耐药基因型及系统进化分析

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安徽医药 2023年第8期27卷 1605-1610,I0011页

作者：胡小骞王琴安徽医科大学第二附属医院医院感染管理办公室安徽合肥230601

目的通过分析某三甲医院重症监护病房(ICU)的耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的耐药基因及系统进化关系,为耐药菌防控的管理提供参考依据。方法收集安徽医科大学第二附属医院2018年3―7月ICU住院病人分离的19株CRKP,使用VITEK-2 Compac... 详细信息

目的通过分析某三甲医院重症监护病房(ICU)的耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的耐药基因及系统进化关系,为耐药菌防控的管理提供参考依据。方法收集安徽医科大学第二附属医院2018年3―7月ICU住院病人分离的19株CRKP,使用VITEK-2 Compact系统进行细菌鉴定及药敏试验,应用Illumina Hiseq 2500平台进行全基因组测序(WGS),应用MLST软件测定ST型,应用Kaptive软件检测荚膜型,应用Staramr软件筛查菌株的耐药基因,应用Ridom SeqSphere+软件进行cgMLST分型及最小生成树(MST)的构建,并应用CSI Phylogeny 1.4软件及FigTree v1.4.4软件构建最大似然树(MLT),以分析其系统进化关系。结果19株CRKP除了对替加环素敏感,对其他常用抗菌药物均呈现耐药,19株CRKP均携带blaKPC-2耐药基因,均属于ST11-KL64型,MST图中以AY7007、AY7003为中心聚集为一簇,cgMLST分型均为CT1774型,MLT图显示分为四组克隆型,组内亲缘性关系相近。结论该院ICU分离的CRKP以ST11-KL64-CT1774型为主,并具有多重耐药性,存在医院内播散的风险。

关键词：肺炎克雷伯菌碳青霉烯类抗药性,细菌重症监护病房耐药基因型系统进化分析

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耐碳青霉烯类抗菌药物的肠杆菌科细菌耐药基因型分析及治疗

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齐齐哈尔医学院学报 2021年第14期42卷 1201-1207页

作者：艾杨刘丽佳木斯大学临床医学院黑龙江佳木斯154000

目的通过对齐齐哈尔市第一医院碳青霉烯类抗生素耐药的肠杆菌科细菌(CRE)耐药基因型的检测及耐药机制分析,为临床抗生素的合理应用和感染的防控提供科学依据。方法收集2018年5月—2020年1月齐齐哈尔市第一医院检验科住院患者的痰液、创... 详细信息

目的通过对齐齐哈尔市第一医院碳青霉烯类抗生素耐药的肠杆菌科细菌(CRE)耐药基因型的检测及耐药机制分析,为临床抗生素的合理应用和感染的防控提供科学依据。方法收集2018年5月—2020年1月齐齐哈尔市第一医院检验科住院患者的痰液、创口分泌物、肺泡灌洗液、尿液及血液等临床病房患者合格标本中分离到的肠杆菌科细菌,应用梅里埃Vitek2-compact全自动微生物细菌鉴定与药敏仪及K-B纸片扩散法鉴定和筛选CRE菌株;采用改良Hodge试验初步判断CRE菌株产碳青霉烯酶情况;应用聚合酶链式反应PCR法检测CRE菌株的耐药基因型以及膜孔蛋白相关基因型。结果38株CRE中,26株肺炎克雷伯菌,9株大肠埃希菌及3株阴沟肠杆菌,标本主要来源于痰,主要分布于ICU、神经外科等科室。检测了CRE菌株对该院临床常用的19种抗生素的耐药性:头孢菌素类药物,除头孢吡肟耐药率89.5%、头孢他啶耐药率94.8%外,头孢唑啉、头孢呋辛及头孢曲松耐药率都为100%;β-内酰胺类抑制剂复合制剂类药物氨苄西林/舒巴坦、头孢哌酮/舒巴坦及哌拉西林/他唑巴坦耐药率分别为100%、84.2%及81.6%;喹诺酮类药物环丙沙星及左氧氟沙星耐药率分别为94.7%及81.6%;碳青霉烯类药物厄他培南及亚胺培南耐药率分别为97.4%及84.2%;氨基糖苷类药物庆大霉素、妥布霉素及阿米卡星耐药率分别为60.5%、42.1%及26.3%;氨曲南耐药率为84.2%;复方新诺明耐药率为57.9%;未检出对替加环素耐药的菌株。改良Hodge试验阳性菌株都为产KPC型碳青霉烯酶的肺炎克雷伯菌。PCR方法检测菌株耐药基因型:SHV有24株,CTX有23株,KPC有15株,NDM有5株,其中IMP、TEM、VIM、GES、OXA基因型未检出,检出膜孔蛋白OmpC有36株,膜孔蛋白OmpF、OmpK35、OmpK36均未检出,有15株菌株检测出两种或两种以上耐药基因型。结论该院CRE菌株主要为肺炎克雷伯菌,主要来源于临床患者痰液标本,CRE感染常发生于ICU、神经外科等患者基础疾病较多、抗生素应用以及机械通气较频繁的科室;CRE菌株对临床常用药物耐药情况严重,使CRE在治疗中面临用药选择的困难;改良Hodge试验可以用来初筛菌株是否产KPC型碳青霉烯酶;该院CRE菌株耐药机制以产碳青霉烯酶为主,其次为β-内酰胺酶和/或AmpC酶基因的表达同时合并膜孔蛋白的突变或缺失。

关键词：感染 CRE 耐药基因型碳青霉烯酶

应用基因芯片分析结核分枝杆菌常见耐药基因型的研究

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中国防痨杂志 2006年第1期28卷 4-10页

作者：吴雪琼张琼张俊仙梁建琴鲁红丽李洪敏张洪恩陆阳荣利吕翠环张广宇邢婉丽解放军第309医院结核病中心研究室北京100091 生物芯片北京国家工程研究中心北京102206 河北省胸科医院石家庄050041

目的应用基因芯片快速检测结核分枝杆菌耐药基因型,建立一种新的分子药敏试验方法。方法以传统药敏试验和PCR-直接测序方法为对照,应用基因芯片快速检测157株结核分枝杆菌临床分离株异烟肼(INH)、利福平(RFP)、链霉素(SM)和乙胺丁醇(EMB... 详细信息

目的应用基因芯片快速检测结核分枝杆菌耐药基因型,建立一种新的分子药敏试验方法。方法以传统药敏试验和PCR-直接测序方法为对照,应用基因芯片快速检测157株结核分枝杆菌临床分离株异烟肼(INH)、利福平(RFP)、链霉素(SM)和乙胺丁醇(EMB)耐药基因(katGr、poB、rp-sLr、rs和embB)的带荧光素标记的PCR产物。结果PCR-直接测序和基因芯片检测36株结核分枝杆菌药物敏感株的5种耐药基因均为野生型。121株结核分枝杆菌耐药分离株中,56株耐INH分离株,katG基因突变率为62.5%,其中katG缺失率为7.5%,315位密码子突变率为55.4%,279位密码子突变率为1.8%;104株耐RFP株,rpoB基因突变率为94.2%,最常见的突变位点为531位和526位密码子(突变率分别为60.6%、15.4%),双位点突变率为5.8%,还发现511、513、515、516、517、518和533位密码子突变;62株耐SM分离株,rpsL和rrs总突变率为88.7%(两者分别为82.3%、6.5%),rpsL突变位于43位和88位密码子(突变率分别为77.4%、4.8%),rrs突变位于513位和516位碱基(突变分别为4.8%、1.6%);57株为耐EMB株,embB基因突变率为61.4%,均为306位密码子突变,最常见的突变为ATG→GTG或ATA(突变率分别为35.1%、15.8%),还发现306位密码子ATG→ATC、ATT和CTG突变。通过基因芯片检出的突变与基因测序结果一致。结论应用基因芯片可分析大多数结核分枝杆菌耐药基因型,弥补传统药敏试验方法的不足,指导临床治疗。

关键词：基因芯片耐药基因型聚合酶链反应分枝杆菌结核

老年住院患者耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌感染的危险因素和耐药基因型分析

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浙江医学 2024年第24期46卷 2644-2648页

作者：张旭东潘伟勇陈佳琦武义县中医院检验科金华321200 武义县第一人民医院检验科丽水市人民医院检验科

目的探讨老年住院患者感染耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的危险因素,分析CRKP的耐药基因型。方法回顾性分析2021年1月至2023年12月武义县各哨点医院收治的178例老年肺炎克雷伯菌(KPN)阳性住院患者,根据KPN对碳青霉烯类药物是否耐药,... 详细信息

目的探讨老年住院患者感染耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的危险因素,分析CRKP的耐药基因型。方法回顾性分析2021年1月至2023年12月武义县各哨点医院收治的178例老年肺炎克雷伯菌(KPN)阳性住院患者,根据KPN对碳青霉烯类药物是否耐药,将患者分为碳青霉烯类敏感肺炎克雷伯菌(CSKP)组和CRKP组,分析老年住院患者CRKP感染的危险因素;采用胶体金法对CRKP菌株进行耐药基因型检测。结果老年住院患者CRKP感染占比为30.34%,ICU科室感染率最高(27.78%),样本主要来自痰液(40.74%)和尿液(24.07%)。CRKP对替加环素、阿米卡星和妥布霉素耐药率相对较低。单因素分析和二元logistic回归分析发现,碳青霉烯类、头孢菌素类、广谱青霉素等抗生素使用史、糖尿病、尿道插管和机械通气是老年住院患者CRKP感染的独立危险因素(均P耐药基因型检测显示,主要的碳青霉烯酶耐药表型为肺炎克雷伯菌碳青霉烯酶(70.37%)和新德里金属-B-内酰胺酶(16.67%)。结论老年住院患者中CRKP对常规抗生素有较高耐药性,临床应关注相关感染风险因素,加强监测和管理,以优化治疗策略和预防感染的发生。

关键词：碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌危险因素耐药基因型

上海市艾滋病感染者和病人中蛋白酶抑制剂耐药基因型的研究

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上海预防医学 2004年第7期16卷 311-313,317页

作者：潘启超薛以乐康来仪钟平郑晓虹林庆能潘孝彰金子辰张玮沈方伟方蕙宁镇陈安琪徐明珠高咸明庄鸣华袁政安上海市艾滋病研究中心复旦大学附属华山医院上海200040

艾滋病在全球的广泛流行已成为严重的公共卫生和社会问题.目前,随着各种影响艾滋病流行的因素不断增加,我国已进入艾滋病快速增长期,专家估计全国艾滋病感染者人数已愈百万.上海市自1987年首次发现HIV感染者以来,截止2002年底累计报告HI... 详细信息

艾滋病在全球的广泛流行已成为严重的公共卫生和社会问题.目前,随着各种影响艾滋病流行的因素不断增加,我国已进入艾滋病快速增长期,专家估计全国艾滋病感染者人数已愈百万.上海市自1987年首次发现HIV感染者以来,截止2002年底累计报告HIV感染者和AI DS病人共计716例.近年来HIV/AIDS新发现人数每年以约25%～30%递增.在传播途径上虽然以静脉吸毒为主,但近年来经性接触传播、经血传播和母婴传播病例不断增加,还存在本市户口和外来人口传播途径上的截然差异,分别以性接触传播和吸毒传播为主.同时,在亚型分型方面,最近的研究分析发现上海地区除了有B/B'亚型流行外,还有A、C、E等多种亚型,并发现有AE、BC重组和混合感染的出现.

关键词：上海市艾滋病感染蛋白酶抑制剂耐药基因型

耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌耐药基因型及同源性分析

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社区医学杂志 2020年第12期18卷 865-868页

作者：刘静刘俊华焦作市第四人民医院检验科河南焦作454000

目的随着抗生素的不合理应用,耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant klebsiella pneumoniae,CRKP)感染率呈逐年增长趋势,对临床抗感染预防有严重影响。本研究旨在探讨CRKP耐药基因型和同源性,为临床预防及治疗提供参考。方法... 详细信息

目的随着抗生素的不合理应用,耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant klebsiella pneumoniae,CRKP)感染率呈逐年增长趋势,对临床抗感染预防有严重影响。本研究旨在探讨CRKP耐药基因型和同源性,为临床预防及治疗提供参考。方法收集焦作市第四人民医院2017-07-01-2019-01-31临床分离的20株CRKP,采用碳青霉烯酶失活法试验和改良Hodge试验对产酶表型检测,耐药相关基因通过PCR方法扩增,试验菌的同源性采用质谱技术分析。结果阿米卡星和替加环素耐药率分别为70.00%和100.00%,其他抗菌药物耐药率均>90.00%。碳青霉烯酶改良Hodge试验(modified Hodge test,MHT)阳性和CIM菌阳性均为65.00%,两种表型符合率为92.31%。未检出基因的占20.00%,同时存在两种耐药基因的占25.00%,同时存在3种耐药基因的占35.00%。MHT菌株产碳青霉烯酶的特异度为85.71%,灵敏度为92.31%,假阳性率和假阴性率均为7.69%。CIM菌株产碳青霉烯酶的特异度为100.00%,灵敏度为100.00%。20株细菌质谱同源性主要有B型(35.00%)及A型(65.00%)。结论 CRKP分离率较高,通常携带多种耐药基因型。A型是同源性的重要流行株。

关键词：耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌耐药基因型同源性

亚胺培南耐药鲍曼不动杆菌的耐药性及其耐药基因型分析

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国际检验医学杂志 2018年第A1期39卷 32-34页

作者：宗春光李军赵维川卢冬梅华正祥承德医学院附属医院河北承德067000

目的研究亚胺培南耐药鲍曼不动杆菌的耐药性特点以及分析碳青霉烯酶相关的耐药基因型。方法选取2016年6月-2017年6月在我院进行了亚胺培南耐药鲍曼不动杆菌分离操作的菌株40例；对其使用VITEK-2 compact的方法进行全自动微生物鉴... 详细信息

目的研究亚胺培南耐药鲍曼不动杆菌的耐药性特点以及分析碳青霉烯酶相关的耐药基因型。方法选取2016年6月-2017年6月在我院进行了亚胺培南耐药鲍曼不动杆菌分离操作的菌株40例；对其使用VITEK-2 compact的方法进行全自动微生物鉴定以及药敏测试；通过检测数据分析研究亚胺培南耐药鲍曼不动杆菌的耐药性特点，并检测其最小抑菌浓度；同时对已分离完毕的40株亚胺培南耐药鲍曼不动杆菌菌株使用基因扩增仪对其16S rRNA甲基化酶耐药基因以及碳青霉烯酶进行扩增测序。结果在40株亚胺培南耐药鲍曼不动杆菌菌株中：其中有38株菌株携带OXA-23型基因，且这38株菌株携带OXA-23型基因中均发现其上游序列ISAbal的存在。结论导致鲍曼不动杆菌对亚胺培南耐药性不断增长的主要原因是由带有OXA-23型基因的碳青霉烯酶而产生的；并且主导耐药性产生作用的物质是存在于上游序列的ISAbal。

关键词：鲍曼不动杆菌耐药性耐药基因型碳青霉烯酶