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群体分析工具包的并行设计与实现

群体分析工具包的并行设计与实现

作者：井睿勍黑龙江大学

学位级别：硕士

随着生物数据量逐年急剧增长,生物大数据处理技术显得越来越重要。如何针对特定生物数据设计并行算法以提高算法运行效率成为研究热点之一。本文采用OpenMP技术,针对一系列群体分析工具设计并实现了相应并行算法,使得大豆数据处理效率... 详细信息

随着生物数据量逐年急剧增长,生物大数据处理技术显得越来越重要。如何针对特定生物数据设计并行算法以提高算法运行效率成为研究热点之一。本文采用OpenMP技术,针对一系列群体分析工具设计并实现了相应并行算法,使得大豆数据处理效率得以提高。本文以大豆的基因变异信息作为主要的实验数据,对基于F统计的种群分析工具、GWAS中鲁棒性关系推理工具和关联性分析工具分别进行并行化研究。F统计工具通过读取vcf源文件和两个种群文件,对两种文件中的个体名做比对,提取有效生物信息并计算出种群间的关系值,进而得到两个种群的分化程度。GWAS中鲁棒性关系推理工具,主要通过对vcf源文件中的GT值进行截取,得出原始数据并进行相应运算,从而得出每两个个体间的关系值,通过关系值可以对生物原有的系谱进行填补,使生物间的关系更加完整。关联性分析工具是通过对vcf原文件的读取和预处理,再对数据进行比对,得出个体SNP杂合位点数和纯合位点数,以此进行计算,得出每两个个体间的关联值,通过对关联值做相应生物处理,可以找到生物的潜在的遗传可能性。论文首先设计了易于并行化的串行算法,然后根据运算对象的独立性,针对算法中的可并行部分进行并行处理。最终对每个工具的串/并行的结果与时间进行了比较分析。实验结果表明,采用OpenMP并行技术可以有效地提高每个群体分析工具的数据处理和分析的效率,对处理大量的生物信息数据很有意义。

关键词：群体分析 F统计量鲁棒性关联性分析 OpenMP

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江苏日伪县知事县长群体分析

史学月刊 2006年第7期 52-57页

作者：潘敏同济大学文法学院上海200092

沦陷时期江苏苏中、苏南地区的伪县知事、县长在清乡(1942年)前后有较大的变化。清乡前大多由地方上的耆老、商会会长等头面人物担任,清乡后则主要是由日伪政权机关任命的较为年轻者组成,且相当一部分人出身行伍。清乡前日伪中央政权及... 详细信息

沦陷时期江苏苏中、苏南地区的伪县知事、县长在清乡(1942年)前后有较大的变化。清乡前大多由地方上的耆老、商会会长等头面人物担任,清乡后则主要是由日伪政权机关任命的较为年轻者组成,且相当一部分人出身行伍。清乡前日伪中央政权及省政府并不能有效控制县级政权,之后其控制范围也仅囿于苏南各县;而日本占领者对县级政权的人员任免和控制程度正好与伪中央政权相反。

关键词：沦陷时期群体分析县知事县长

社会利益群体理论与群体分析方法--论创立认识社会主义初级阶段社会结构的理论和方法

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科学社会主义 1990年第3期 95-103页

作者：顾杰善中共黑龙江省委宣传部

文章认为，全面而又准确地认识社会主义初级阶段的社会结构，必须在坚持一定范围内的阶级斗争、阶级分析方法的基础上，发展马克思主义关于社会结构的学说，创立从宏观和总体上认识现阶段社会结构的新的理论和方法，即社会利益群体理论... 详细信息

文章认为，全面而又准确地认识社会主义初级阶段的社会结构，必须在坚持一定范围内的阶级斗争、阶级分析方法的基础上，发展马克思主义关于社会结构的学说，创立从宏观和总体上认识现阶段社会结构的新的理论和方法，即社会利益群体理论和利益群体分析方法，作者从多重角度上对社会利益群体理论及其方法的概念、范畴、基本原则等有关问题作了论证和分析，概括性地对社会利益群体理论及其方法的基本思想作了总体描述，并对人们比较关心的经济上的一致性与差异性、思想上的统一性与多样性、政治上的一元论与多元性的关系作了重点论述．

关键词：社会主义初级阶段社会利益社会结构群体理论群体分析发展马克思主义阶级分析方法阶级斗争

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含油气薄互层的群体分析与油气检测

石油地球物理勘探 1991年第2期26卷 254-258,266页

作者：潘尧嘉石油地球物理勘探局解释中心

在陆相碎屑岩沉积盆地中,储集层很少是厚层,多数是薄互层,在横向上又往往不连通。对于这种情况,仍然采用常规的解释方法和作图方法显然是不够的。我们在实践中,对薄互层的解释和油气检测作了一些探索,下面介绍具体做法和几点体会。含油... 详细信息

在陆相碎屑岩沉积盆地中,储集层很少是厚层,多数是薄互层,在横向上又往往不连通。对于这种情况,仍然采用常规的解释方法和作图方法显然是不够的。我们在实践中,对薄互层的解释和油气检测作了一些探索,下面介绍具体做法和几点体会。含油气薄互层的群体分析在陆相碎屑岩沉积盆地中,储集层的厚度通常在3～10m之间。

关键词：薄互层群体分析油气检测

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老龄问题群体分析视角理论框架构建研究

人口研究 2013年第2期37卷 73-82页

作者：姚远陈昫中国人民大学人口与发展研究中心武汉大学社会学系

老年群体更替已逐渐成为我国人口老龄化的一种常态化现象。但在已有研究中,重点依然是老年人数量和人口结构。因此,关注老年群体更替并建立一个相应的群体分析视角是必要的。文章提出了包括概念、理论、命题、指标和运用等部分的群体分... 详细信息

老年群体更替已逐渐成为我国人口老龄化的一种常态化现象。但在已有研究中,重点依然是老年人数量和人口结构。因此,关注老年群体更替并建立一个相应的群体分析视角是必要的。文章提出了包括概念、理论、命题、指标和运用等部分的群体分析视角理论框架。框架中的老年群体是指出生同批和经历同期的人口学群体;老年群体差异是由环境、社会建构及其累积共同作用的结果,体现为生命历程理论、动态老龄化理论和混沌理论等;其差异性,既表现在背景、能动性和需求方面,又表现在影响和政策构建方面;并可通过背景、能力(行为和观念)、需求等指标进行衡量;重视群体更替、关注其能动性、辩证分析影响、增加政策的群体更替视角等均是运用中的重要问题。

关键词：老龄问题老年群体更替群体分析研究方法理论框架

战后地方参议会议员群体分析--以江西省于都县为个案

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江苏社会科学 2008年第1期 168-172页

作者：陈德军罗开林上海大学历史系副教授200444

本文运用大量档案资料,分析了战后江西省于都县参议会议员群体的实际状态。文中着重分析了县参议会议员群体的形成和参政水平、议员群体的构成特点以及其实际的待遇收入情况,从而对战后的地方参议会议员群体进行历史的揭示。

关键词：战后地方参议会议员群体分析

利用RIL群体分析HMW-GS对面条品质性状的量化效应

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中国粮油学报 2005年第3期20卷 9-12,21页

作者：赵京岚李斯深范玉顶孙海燕李瑞军山东农业大学农学院泰山职业技术学院泰安271000

利用重组自交系群体———RIL-8群体的80个系及其亲本为材料,分析了不同高分子量麦谷蛋白亚基对面条品质性状影响的量化效应以及不同亚基组合的面条品质差异。结果表明RIL-8群体Glu-A1、Glu-B1、Glu-D1位点编码的亚基分别为1、N,7+9、7+... 详细信息

利用重组自交系群体———RIL-8群体的80个系及其亲本为材料,分析了不同高分子量麦谷蛋白亚基对面条品质性状影响的量化效应以及不同亚基组合的面条品质差异。结果表明RIL-8群体Glu-A1、Glu-B1、Glu-D1位点编码的亚基分别为1、N,7+9、7+8和5+10、2+12,主要存在6种亚基组合类型。同一位点不同亚基和不同的亚基组合对面条的适口性、韧性、粘性和总分有显著的影响。对于不同亚基,5+10、1亚基是适合制作优质面条的亚基,尤以5+10亚基为好;N、7+8、7+9和2+12亚基不是制作优质面条的适宜亚基。对于不同亚基组合,(1,7+9,5+10)、(N,7+8,5+10)和(1,7+8,5+10)是制作优质面条的适宜亚基组合,而(1,7+8,2+12)、(N,7+8,2+12)和(1,7+9,2+12)不适合制作优质面条。

关键词：量化效应品质性状 HMW-GS 群体分析高分子量麦谷蛋白亚基重组自交系群体亚基组合优质面条 5+10亚基 Glu 品质差异组合类型制作适口性位点亲本

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一种基于群体分析的态势评估与威胁估计模型

火力与指挥控制 2008年第2期33卷 36-40,45页

作者：蔡益朝张维明刘忠贺玲国防科技大学信息系统与管理学院湖南长沙410073

了解指挥人员的决策过程是利用STA技术进行决策支持的前提。当前的STA研究虽然大多都注意到了STA功能在认知上的层次性,却忽略了STA过程上的层次渐进性。针对该问题,着眼于军事决策过程的层次性,提出了群体分析的概念及相应的功能模型,... 详细信息

了解指挥人员的决策过程是利用STA技术进行决策支持的前提。当前的STA研究虽然大多都注意到了STA功能在认知上的层次性,却忽略了STA过程上的层次渐进性。针对该问题,着眼于军事决策过程的层次性,提出了群体分析的概念及相应的功能模型,并进一步提出了基于群体分析的STA方法。该方法把对整个战场态势的理解分解为对各指挥层次的多个群体的理解,将STA过程分解为一个逐部分、逐层次进行的过程。该过程符合指挥人员的认知过程,能满足不同层次指挥人员不同粒度的认知需求,从而能更有效地支持STA系统的设计。

关键词：态势评估与威胁估计(STA) 群体分析决策支持

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网络中的意见领袖群体分析

青年记者 2012年第9Z期 75-76页

作者：颜廷昆傅振国山东大学文学与新闻传播学院山东大学威海分校新闻传播学院

在网络世界中,信息的传播不仅受到信息内容的影响,而且会因传播者的不同角色而产生不同的传播效果,特别是网络世界中的意见领袖,他们发布的信息及评论,在很大程度上能左右部分网民的意见倾向。一个事件在成为网络议题的过程中,网络意见... 详细信息

在网络世界中,信息的传播不仅受到信息内容的影响,而且会因传播者的不同角色而产生不同的传播效果,特别是网络世界中的意见领袖,他们发布的信息及评论,在很大程度上能左右部分网民的意见倾向。一个事件在成为网络议题的过程中,网络意见领袖起到很大的作用,甚至能影响到事件的性质及议题走向。

关键词：意见领袖群体分析拉扎斯菲尔德传播学者信息内容大众传播学表达观点引导作用社会化媒体新闻传播学院