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高通量测序分析结肠腺瘤患者肠道黏膜菌群的构成变化

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南方医科大学学报 2017年第9期37卷 1156-1163页

作者：陆颖影曾悦胡国勇王兴鹏南京医科大学附属上海一院临床医学院消化内科上海201620

目的探讨结直肠癌发展早期肠道菌群的变化规律。方法通过结肠镜活检收集31例结肠腺瘤患者的腺瘤组织以及20例健康志愿者的肠道黏膜,提取基因组DNA,对细菌16SrRNA基因序列V_3~V_4高变区进行PCR扩增,lluminaMiSeq平台上高通量测序分析。... 详细信息

目的探讨结直肠癌发展早期肠道菌群的变化规律。方法通过结肠镜活检收集31例结肠腺瘤患者的腺瘤组织以及20例健康志愿者的肠道黏膜,提取基因组DNA,对细菌16SrRNA基因序列V_3~V_4高变区进行PCR扩增,lluminaMiSeq平台上高通量测序分析。结果结肠腺瘤患者的肠道黏膜菌群多样性比健康对照人群显著增高(P腺瘤组黏膜菌群结构和健康对照者相比差异显著。门水平上:结肠腺瘤组变形菌门明显增多(P结肠腺瘤组乳球菌属、链球菌属和假单胞菌属增多(P腺瘤比较发现:结肠高级别和低级别上皮内瘤变组肠道黏膜菌群整体结构相似,埃希菌-志贺菌属在高级别上皮内瘤变组呈现上升趋势,但差异无统计学意义(P>0.05)。结论结肠腺瘤患者肠道菌群多样性和构成与正常健康人存在明显差异,腺瘤患者黏膜菌群结构发生明显失衡,形成了易于肿瘤生长的肠道微生态环境。

关键词：结肠腺瘤肠道菌群结构失调 16Sr RNA 高通量测序

结肠腺瘤癌变过程中MTA1、RECK的表达及意义

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临床与实验病理学杂志 2017年第4期33卷 432-435页

作者：陈现亮吴义娟吕卓赵慧敏韩宝娟河北医科大学附属邢台市人民医院消化内科邢台054000

目的分析MTA1、RECK在结肠腺瘤及结肠癌组织中的表达,探讨MTA1、RECK在结肠腺瘤癌变过程中的作用。方法应用免疫组化SABC法检测104例结肠癌组织、114例结肠腺瘤组织、30例正常结肠组织中MTA1、RECK蛋白表达,并复习相关文献。结果正常结... 详细信息

目的分析MTA1、RECK在结肠腺瘤及结肠癌组织中的表达,探讨MTA1、RECK在结肠腺瘤癌变过程中的作用。方法应用免疫组化SABC法检测104例结肠癌组织、114例结肠腺瘤组织、30例正常结肠组织中MTA1、RECK蛋白表达,并复习相关文献。结果正常结肠组织、管状腺瘤、绒毛状腺瘤至结肠癌组织中MTA1的阳性率呈逐渐增高趋势(P结肠腺瘤(中重度异型增生)组中MTA1的阳性率高于结肠腺瘤(轻度异型增生)组(P结肠癌中的阳性率随肿瘤临床Dukes分期的提高、淋巴结转移及肿瘤分化程度的降低而升高(P结肠组织、管状腺瘤、绒毛状腺瘤、结肠癌组中的阳性率分别为100%、78.57%、77.27%、53.85%;正常结肠组织、管状腺瘤、绒毛状腺瘤至结肠癌组中RECK的阳性率呈逐渐降低趋势;中重度异型增生结肠腺瘤组中RECK的阳性率明显低于轻度异型增生结肠腺瘤组,差异有统计学意义(P结肠癌中的阳性率随肿瘤临床Dukes分期的提高、淋巴结转移及肿瘤分化程度的降低而降低(P结肠癌组织中MTA1呈高表达,RECK表达缺失。MTA1、RECK参与正常组织、癌前病变、癌组织的发生、发展,在结肠腺瘤的癌变过程中起着重要作用。

关键词：结肠肿瘤结肠癌结肠腺瘤 MTA1 RECK

青海地区结肠腺瘤、结肠癌与小肠细菌过度生长关系的临床研究

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青海地区结肠腺瘤、结肠癌与小肠细菌过度生长关系的临床研究

作者：马子玉青海大学

学位级别：硕士

目的:采用甲烷-氢呼气试验检测青海地区结肠腺瘤、结肠癌患者小肠细菌过度生长(Small Intestinal Bacterial Overgrowth,SIBO)的发生情况,进一步探讨结肠腺瘤、结肠癌与小肠细菌过度生长的关系。方法:选取从2020年11月—2021年12月就诊... 详细信息

目的:采用甲烷-氢呼气试验检测青海地区结肠腺瘤、结肠癌患者小肠细菌过度生长(Small Intestinal Bacterial Overgrowth,SIBO)的发生情况,进一步探讨结肠腺瘤、结肠癌与小肠细菌过度生长的关系。方法:选取从2020年11月—2021年12月就诊于青海省人民医院的患者,其中包括结肠癌患者39例,结肠腺瘤患者45例;同时选取健康体检者50例作为对照组。收集所有研究对象一般临床资料,并完成胃肠道症状问卷调查表,通过甲烷-氢呼气试验检测结肠腺瘤、结肠癌患者SIBO的发生情况,比较观察组与对照组的SIBO阳性率以及在6个时间点的氢气和甲烷呼气数值。比较癌症组与腺瘤组在胃肠道症状和合并症方面的差异。根据甲烷-氢呼气试验结果将结肠癌和结肠腺瘤组分别分成SIBO阳性组和SIBO阴性组,分别比较各亚组在腹痛、腹胀、腹泻、恶心胃肠道症状方面有无统计学差异。结果:1.结肠腺瘤组SIBO阳性率77.8%(35/45);结肠癌组SIBO阳性率76.9%(30/39);对照组SIBO阳性率24.0%(12/50)。结肠腺瘤组及结肠癌组SIBO的阳性率均明显高于对照组,差异有统计学意义(X2=36.546,P结肠腺瘤组与结肠癌组SIBO阳性率无统计学差异(X2=0.009,P=0.926);结肠腺瘤及结肠癌组在6个时间点的氢气和甲烷数值比对照组升高。2.结肠癌患者合并糖尿病的发生显著高于结肠腺瘤组,且结肠癌患者在腹痛、腹泻症状方面显著高于结肠腺瘤组(P结肠腺瘤SIBO阳性组的腹胀发生率显著高于阴性组(P结肠癌SIBO阳性组的腹痛、腹胀显著高于阴性组(P结肠腺瘤及结肠癌有着密切的联系,并且与结肠腺瘤、结肠癌发生腹胀、腹痛、腹泻等症状有一定的相关性。因此,我们认为SIBO发生情况可能成为结肠癌、结肠腺瘤发生的预测指标之一。

关键词：小肠细菌过度生长结肠癌结肠腺瘤甲烷-氢呼气试验

高通量RNA测序技术分析结肠腺瘤转变为结肠癌的关键基因

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中国现代普通外科进展 2024年第4期27卷 286-291页

作者：边杰王涛叶长春高根旺麻春宏孙学军孙祺西安交通大学第一附属医院普通外科陕西西安710061

目的:通过RNA测序技术分析比较正常结肠组织、结肠腺瘤及癌组织中基因表达谱的差异,识别从结肠腺瘤发展为结肠癌过程中的关键基因,并探究其潜在机制。方法:对同一患者的正常结肠组织、腺瘤及癌组织进行RNA测序分析,识别在结肠癌中显著... 详细信息

目的:通过RNA测序技术分析比较正常结肠组织、结肠腺瘤及癌组织中基因表达谱的差异,识别从结肠腺瘤发展为结肠癌过程中的关键基因,并探究其潜在机制。方法:对同一患者的正常结肠组织、腺瘤及癌组织进行RNA测序分析,识别在结肠癌中显著表达、腺瘤组织中不显著表达的差异基因并进行GO和KEGG功能富集分析。结果:在结肠癌中显著表达、腺瘤组织中不显著表达的差异基因有4307个,其中5个差异最大的基因是EPYC、LINC01614、MCEMP1、NOX4、CLEC5A。对这些基因进行GO和KEGG功能富集分析发现,主要富集于生物过程调节、细胞过程调节、蛋白质结合等生物学过程和癌症通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路等。结论:EPYC、LINC01614、MCEMP1、NOX4、CLEC5A等多个基因参与结肠腺瘤到结肠癌发展的过程,这些基因有望成为结直肠癌的治疗靶点。

关键词：结肠癌结肠腺瘤 RNA测序

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结肠腺瘤-正常文库的生物信息学分析

遗传 2006年第4期28卷 385-392页

作者：吕炳建崔晶徐静张昊罗敏捷朱益民来茂德浙江大学医学院病理学与病理生理学系杭州310031 浙江大学计算机科学与技术学院计算机系杭州310031 浙江大学公共卫生学院流行病学教研室杭州310031

为进一步分析腺瘤相对正常SSH文库(A-N)的差异表达候选基因的表达谱,结合通用的生物信息学软件,自行开发、搭建包括核酸自动分析平台及GetUni软件包的生物信息学平台,实现了将A-N文库109个差异克隆序列与本地下载的非冗余核酸数据库、人... 详细信息

为进一步分析腺瘤相对正常SSH文库(A-N)的差异表达候选基因的表达谱,结合通用的生物信息学软件,自行开发、搭建包括核酸自动分析平台及GetUni软件包的生物信息学平台,实现了将A-N文库109个差异克隆序列与本地下载的非冗余核酸数据库、人UniGene数据库比对、聚类,至获取差异表达候选基因的自动化分析。对这些基因进行GOTM(GOTree Machine)初步生物信息学分析及RT-PCR验证。结果共发现62个候选基因,包括6个核糖体蛋白成员,6个免疫相关基因。Reg4和FAM46A两个基因出现频次最高,分别为13次和4次,半定量RT-PCR显示这两个基因分别在10/10和9/10例腺瘤相对正常黏膜表达上调。对于这些差异表达候选基因的进一步分析和研究将有助于揭示结肠腺瘤发生的分子机制。

关键词：结肠腺瘤黏膜基因表达 UniGene

MCT1在结肠癌、结肠腺瘤及正常结肠黏膜中的表达研究

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MCT1在结肠癌、结肠腺瘤及正常结肠黏膜中的表达研究

作者：侯凯佳河北北方学院

学位级别：硕士

目的:本研究通过分析单羧酸转运蛋白1(monocarboxylate transporter 1 MCT1)在正常黏膜、结肠腺瘤、结肠癌组织中表达情况,以期为揭示结肠癌发生发展及治疗提供新的理论思路。方法:收集2021.05-2021.12于河北北方学院附属第一医院进行... 详细信息

目的:本研究通过分析单羧酸转运蛋白1(monocarboxylate transporter 1 MCT1)在正常黏膜、结肠腺瘤、结肠癌组织中表达情况,以期为揭示结肠癌发生发展及治疗提供新的理论思路。方法:收集2021.05-2021.12于河北北方学院附属第一医院进行电子肠镜检查并经病理结果证实的结肠腺瘤患者及结肠癌患者各30例,记录并整理患者年龄、性别、吸烟、饮酒、既往病史及病理结果等一般临床资料,依据病理结果分为正常结肠黏膜组(30例)、低级别上皮内瘤变组(15例)、高级别上皮内瘤变组(15例)、结肠癌组30例。通过Western Blot法分别测四组的MCT1表达水平的差异,并且利用免疫组织化学技术检测四组组织中MCT1表达阳性率。结果:(1)Western Blot结果显示:MCT1随着肿瘤进展,表达呈上升趋势。MCT1/GAPDH灰度值依次为:在正常结肠黏膜中表达较弱(0.4215±0.2466),低级别上皮内瘤变组(0.6212±0.6355),高级别上皮内瘤变(0.9735±0.5557),结肠癌组(1.0925±0.29810),且组间两两比较均具有统计学意义(P结肠黏膜组中1例(3.33%),低级别上皮内瘤变腺瘤组中5例(33.33%),高级别上皮内瘤变腺瘤组中9例(40%),结肠癌中24例(80%),差异有统计学意义(X=37.083,P0.05),其它两两比较均具有统计学差异(P结肠腺瘤-癌”过程中呈逐渐升高趋势,MCT1可能与结肠癌的发生发展起到一定的关系,对其深入研究可能对揭示结肠癌在临床上的发生、发展、诊断及治疗方面提供新的思路。

关键词：结肠癌单羧酸转运蛋白1 结肠腺瘤低级别上皮内瘤变高级别上皮内瘤变

结肠腺瘤患者与健康人肠液菌群的结构差异性分析

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现代消化及介入诊疗 2021年第1期26卷 56-60页

作者：张蓓陈文晖汪妍上海电力医院消化内科 202157

目的探索结肠腺瘤患者和健康人肠液菌群结构的差异性,并找到特定的差异分类。方法选取2019年1月至2019月9年上海电力医院消化内科结肠腺瘤患者10例(腺瘤组)和健康人12例(对照组),内镜下取其肠液样本,对基因组DNA完成精准提取,对细菌16Sr... 详细信息

目的探索结肠腺瘤患者和健康人肠液菌群结构的差异性,并找到特定的差异分类。方法选取2019年1月至2019月9年上海电力医院消化内科结肠腺瘤患者10例(腺瘤组)和健康人12例(对照组),内镜下取其肠液样本,对基因组DNA完成精准提取,对细菌16SrRNA基因序列所属的V3-V4高变片段进行系统的PCR扩增,对PCR产物加以检测,将纯化后的混合DNA产物于实验用lluminaMiSeq平台放置,进行高通量测序操作。结果两组之间微生物群OTU(Operational Taxonomic Unit,可操作分类单元)分布存在明显差异。腺瘤组变形菌门水平(33.98%)显著高于对照组(17.31%),P腺瘤组厚壁菌门水平(36.29%)显著低于对照组(46.5%),P腺瘤组假单胞菌属、杆菌属丰度显著增加(P结肠腺瘤患者肠液菌群结构呈明显改变,形成了易于腺瘤生长的肠道微生态环境。

关键词：结肠腺瘤肠道菌群差异分析

结肠腺瘤发生的危险因素及和幽门螺杆菌感染的相关性分析

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现代生物医学进展 2019年第22期19卷 4278-4282页

作者：朱疆依冯波梅琳孙瑞青郭长存孙相钊空军军医大学第一附属医院消化病医院消化内科陕西西安710032 空军军医大学第一附属医院心血管医院心脏外科陕西西安710032 广东廉江市人民医院消化内科广东廉江524400

目的:分析结肠腺瘤发生的危险因素及和幽门螺杆菌(Hp)感染的相关性。方法:选择我院2018年6月~2018年12月收治的180例结肠腺瘤患者,同时选择我院接受结肠镜检查无异常者152例作为对照组。收集和比较两组患者的一般资料,采用14C尿氮呼气... 详细信息

目的:分析结肠腺瘤发生的危险因素及和幽门螺杆菌(Hp)感染的相关性。方法:选择我院2018年6月~2018年12月收治的180例结肠腺瘤患者,同时选择我院接受结肠镜检查无异常者152例作为对照组。收集和比较两组患者的一般资料,采用14C尿氮呼气试验检测Hp的感染情况,多因素Logistic回归分析结肠腺瘤发生的危险因素。结果:多因素Logistic逐步回归分析结果显示男性、年龄、体质指数24 kg/m^2、腹型肥胖、饮酒、吸烟、喜食红肉、喜食果蔬、高脂血症、糖尿病、粪便隐血阳性、肿瘤家族史及Hp阳性是结肠腺瘤发生的危险因素,喜食果蔬为其发生的保护因素。HP阳性率组腺瘤>1 cm、腺瘤数目多发、左结肠率高于Hp阴性组(P腺瘤患者腺瘤蒂部分型、腺瘤病理类型比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论:结肠腺瘤的发生和多种危险因素有关,其中Hp感染可增加结肠腺瘤发生发展风险,临床应将此类高危人群作为结肠腺瘤的重点筛查对象,以降低结肠癌的潜在发生风险。

关键词：结肠腺瘤危险因素幽门螺旋杆菌

TKTL1在结肠腺瘤、结肠癌中的表达及其临床意义

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胃肠病学 2019年第10期24卷 610-613页

作者：翟科王春晖李勇狄纯婵山东省淄博市第一医院消化内二科

背景:各种肿瘤组织均有TKTL1表达,其表达水平与肿瘤侵袭转移和预后密切相关。目的:探讨TKTL1在结肠腺瘤、结肠癌中的表达及其临床意义。方法:选取2015年3月-2018年5月至淄博市第一医院行结肠镜检查证实的30例正常结肠黏膜、84例结肠腺... 详细信息

背景:各种肿瘤组织均有TKTL1表达,其表达水平与肿瘤侵袭转移和预后密切相关。目的:探讨TKTL1在结肠腺瘤、结肠癌中的表达及其临床意义。方法:选取2015年3月-2018年5月至淄博市第一医院行结肠镜检查证实的30例正常结肠黏膜、84例结肠腺瘤以及手术证实的84例结肠癌组织,以免疫组化法检测TKTL1蛋白表达,并分析TKTL1表达与结肠腺瘤、结肠癌临床病理参数的关系。结果:结肠腺瘤、结肠癌的TKTL1表达率显著高于正常结肠黏膜(57. 1%、85. 7%对13. 3%,P 结肠癌TKTL1表达率明显高于结肠腺瘤(P 结肠腺瘤患者的性别、年龄、病理类型和病理特征无关(P> 0. 05)。TKTL1表达与结肠癌患者的性别、年龄、组织分化程度无关(P> 0. 05),而与TNM分期、远处转移、淋巴结转移、浸润深度相关(P 结肠腺瘤、结肠癌中的表达显著高于正常结肠组织,且与结肠癌分期、转移有相关性,推测TKTL1表达与结肠癌的发生、发展密切相关。

关键词： TKTL1 结肠腺瘤结肠肿瘤免疫组织化学