检索结果-南通市图书馆

基于经典单核苷酸多态性和多位点可变数目串联重复序列分析的中国炭疽芽胞杆菌基因遗传特征分析

疾病监测 2025年第1期 92-97页

作者：张恩民张慧娟贺金荣李伟魏建春中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室

目的分析中国炭疽芽胞杆菌基因型多态性，掌握中国炭疽芽胞杆菌基因遗传特征。方法收集中国20个省份的炭疽芽胞杆菌菌株，采用经典单核苷酸多态性（canSNP）和多位点可变数目串联重复序列分析（MLVA）进行基因型鉴定，分析不同分离来... 详细信息

目的分析中国炭疽芽胞杆菌基因型多态性，掌握中国炭疽芽胞杆菌基因遗传特征。方法收集中国20个省份的炭疽芽胞杆菌菌株，采用经典单核苷酸多态性（canSNP）和多位点可变数目串联重复序列分析（MLVA）进行基因型鉴定，分析不同分离来源菌株基因型的分布特征；采用Bionumerics 5.1软件进行聚类分析，并计算各位点的Simpson指数。结果 533株中国炭疽芽胞杆菌均属于全球炭疽菌基因谱系中的A群，并具有全球12种亚群中的6种亚群，分别为***.001/00 2、***、***94、***.008/009、***和***.005/006，其中***.001/002亚群（60.98%）是中国的主要流行谱系，各地区均有分布，***94(14.26%)、***.008/009(11.82%)和***(4.69%)3个亚群主要分离自1980和1990年代的新疆维吾尔自治区（新疆），***亚群菌株主要来自内蒙古自治区，主要分离自2010年代，***.005/006亚群菌株最少，分离自2019年后。canSNP亚群在中国的地理分布不均衡，新疆、广西壮族自治区、青海省、内蒙古自治区、河北省等具有4～5种亚群，而四川省等10省仅有1种亚群，新疆以***94和***.008/009为优势亚群，其他地区均以***.001/002为优势亚群。不同分离年代菌株的亚群分布有差异，在以***.001/002为主要流行亚群的基础上，1980和1990年代***.008/009、***和***94相继出现并流行传播，2000年后***亚群逐渐传播扩散，2019年***.005/006亚群被检测到，显示了炭疽菌株基因型的传播和变异趋势。通过MLVA15分型研究菌株具有91个基因型，结果与canSNP亚群基本一致，且各亚群内MLVA15的分型能力均较好。结论本研究建立了中国炭疽芽胞杆菌canSNP和MLVA基因型数据库，掌握了中国炭疽杆菌基因型分布特征及其传播扩散趋势，为炭疽疫情防控及分子溯源技术提供了参考依据。

关键词：炭疽芽胞杆菌基因分型经典单核苷酸多态性多位点可变数目串联重复序列分析遗传特征中国

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