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模拟细菌菌落进化过程的群体智能算法

系统仿真学报 2013年第2期25卷 251-255页

作者：李明西南林业大学机械与交通学院昆明650224

针对常规群体智能算法缺乏进化能力,存在易于陷入早熟收敛的不足,将问题的解空间视为细菌培养液,在其中放置单个或少量细菌个体,模拟细菌菌落的生长进化过程,提出一种新的群体智能算法。该算法本身具有进化机制,并且能够自然结束,从而... 详细信息

针对常规群体智能算法缺乏进化能力,存在易于陷入早熟收敛的不足,将问题的解空间视为细菌培养液,在其中放置单个或少量细菌个体,模拟细菌菌落的生长进化过程,提出一种新的群体智能算法。该算法本身具有进化机制,并且能够自然结束,从而为优化算法提出了一种新的结束准则。通过仿真实验验证了算法的有效性,同时仿真实验结果还表明通过简单改进,算法可以达到全局最优。

关键词：群体智能细菌菌落优化算法进化机制

不同保存方式对新鲜母乳中免疫活性因子、细菌菌落及营养成分的影响

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实验与检验医学 2022年第2期40卷 148-150,170页

作者：周晓萍刘璐陈兵兵郑州大学第一附属医院产科河南郑州450000

目的探讨不同保存方式对新鲜母乳中免疫活性因子、细菌菌落及营养成分的影响。方法采集2018年10月至2020年10月在我院分娩后的86例产妇产后42d的新鲜母乳140 mL,分为7份,每份20 mL,1份新鲜母乳,其余6份分别储放于聚乙烯储奶瓶中。将储... 详细信息

目的探讨不同保存方式对新鲜母乳中免疫活性因子、细菌菌落及营养成分的影响。方法采集2018年10月至2020年10月在我院分娩后的86例产妇产后42d的新鲜母乳140 mL,分为7份,每份20 mL,1份新鲜母乳,其余6份分别储放于聚乙烯储奶瓶中。将储奶瓶分别存放至4℃、-18℃和-20℃的冰箱中(每个温度条件各2份)。于4℃保存48 h、72 h,-18℃和-20℃中存放30 d和90 d后检测储放母乳的免疫活性因子[白介细胞素-6(IL-6),乳铁蛋白(LF),肿瘤坏死因子(TNF-α)]、细菌菌落水平及营养成分(脂肪、蛋白质、碳水化合物),并与新鲜母乳比较。结果与新鲜母乳比较,在各设定条件下的LF水平、细菌菌落计数比较无明显差异(P>0.05);IL-6水平在各设定条件下随着时间的推移逐渐下降(P<0.05),TNF-α水平在4℃的条件下保存72 h下降,在-18℃与-20℃的条件下保存30 d、90 d均上升(P<0.05);各营养物质在4℃的保存条件下仅脂肪水平在72 h后下降明显(P<0.05),其余物质水平无明显差异(P<0.05)。在-18℃与-20℃的条件下各营养物质下降趋势明显(P<0.05)。结论在低温环境下保存母乳对免疫活性因子和营养物质有一定的影响,建议在4℃的保存条件下保存时长不应超过72 h,在-18℃与-20℃的保存条件下保存时长不应超过90 d。

关键词：保存方式新鲜母乳免疫活性因子细菌菌落营养成分

细菌菌落观察与抗生素检测高通量微流控芯片系统的构建

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细菌菌落观察与抗生素检测高通量微流控芯片系统的构建

作者：孙鹏西北农林科技大学

学位级别：硕士

在药理应用,环境监测,食品安全和军事等领域中,标准的细菌检测(例如:细菌生长抑制检测)是检测水中毒性物质(例如:抗生素)唯一通用的检测方法。但是,为了鉴定毒性物质对细菌生长的抑制作用,这种方法是麻烦的。因为当用于高通量与平行检测... 详细信息

在药理应用,环境监测,食品安全和军事等领域中,标准的细菌检测(例如:细菌生长抑制检测)是检测水中毒性物质(例如:抗生素)唯一通用的检测方法。但是,为了鉴定毒性物质对细菌生长的抑制作用,这种方法是麻烦的。因为当用于高通量与平行检测时,标准的细菌检测是不可行的。因此,微型化,集成化,智能化和在线监测的生物传感器变得更加的重要。近些年,微流控芯片技术蓬勃发展,并且具有样品消耗少,快速检测,微型化,自动化,集成化与便携化等优点,因此,微流控芯片技术在生物传感器领域的应用引起广泛的关注。本研究构建了一种用于细菌菌落观察与抗生素检测的单层聚二甲基硅氧烷(PDMS)多微室的微流控芯片系统。每个芯片由七条平行管道组成,每条管道上有32个正方形微室。微室与主管道之间由30μm宽的毛细管相连。依据PDMS的透气性与溶气性,在连续的高速液流下,实现细菌菌液的灌注。利用L-阿拉伯糖(L-Ara)诱导重组大肠杆菌(E.coli)HB101, pGLO产生绿色荧光蛋白(GFP)这一原理,本研究实时观察微室中细菌菌落的生长情况,检测不同初始菌数表达GFP的荧光强度的差异,定量分析不同浓度的四环素与红霉素对细菌表达GFP水平的抑制作用以及实时观察细菌的形态学变化。获得的主要结果和结论如下: (1)制备出大肠杆菌HB101,pGLO工程菌,该菌可以稳定表达绿色荧光蛋白。用比浊法测得大肠杆菌HB101, pGLO的生长曲线,为在芯片上培养细菌提供依据,并且对了解其生长规律从而选择合适的生长期的菌种进行后续试验有着非常重要的作用。 (2)制作了单层多微室PDMS高通量微流控芯片。微室与主管道之间设计了柱状结构就是为了最大限度减少液流对微室内细菌的影响。经过小分子扩散的理论计算与分子扩散的模拟试验,微室与主管道之间的物质交换可以满足细菌在微室中生长。一旦细菌被灌注到微室里,就很难从微室中冲走。这样的设计为了最大限度减少液流对微室内细菌生长的影响,并且在微室中固定细菌为后续试验提供基础。 (3)实现了在微流控芯片上培养大肠杆菌,并且实时观察细菌生长的形态学变化与荧光强度的变化。与传统细菌培养方法相比较,芯片上培养细菌在指数生长期呈直线增长的时间要更长。证明在连续流供给营养和代谢产物不断移除的环境下,在芯片上细菌生存的环境优于常规实验。不同起始菌浓度在芯片上培养,只要培养条件相同,那么微室中的细菌在指数生长期呈直线部分的生长速率近似相等。这为建立高通量微流控系统用于细菌菌落观察与抗生素试验提供了保证。并且,起始菌浓度越大的细菌菌落进入指数生长期越早。 (4)定量分析不同浓度的四环素与红霉素对大肠杆菌HB101,pGLO合成绿色荧光蛋白的抑制作用。并且,实时观察细菌形态变化,发现只有四环素在3μg/mL浓度下,大肠杆菌才能形成长丝状细菌,细菌的平均长度在50μm以上。而在其他浓度的四环素作用下,大肠杆菌的长度与空白试验相似。

关键词：微流控细菌菌落抗生素高通量生物传感器

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一种混合的离散细菌菌落优化算法

计算机应用研究 2014年第2期31卷 358-360页

作者：宋德逻孔德福李明西南林业大学机械与交通学院昆明650224

为了利用细菌算法解决组合优化问题,提出了一种混合的离散细菌菌落优化算法。根据现有细菌优化算法,设计一种新的个体编码方式及进化模式,通过设计种群的自适应调整因子增强个体活力,并融合禁忌搜索算法,克服算法易于陷入过早收敛的不足... 详细信息

为了利用细菌算法解决组合优化问题,提出了一种混合的离散细菌菌落优化算法。根据现有细菌优化算法,设计一种新的个体编码方式及进化模式,通过设计种群的自适应调整因子增强个体活力,并融合禁忌搜索算法,克服算法易于陷入过早收敛的不足,并与其他算法在Taillard标准调度测试问题集上比较实验,验证了算法的有效性。仿真结果表明,该算法可以搜索到问题的最优组合,能够有效避免算法陷入局部最优,取得了满意的结果。

关键词：离散优化算法细菌菌落进化模式自适应调整

细菌接种实验菌落生长度监测系统的设计与实现

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细菌接种实验菌落生长度监测系统的设计与实现

作者：郑雪花电子科技大学

学位级别：硕士

细菌菌落生长度的监测是细菌接种实验的一个重要步骤。但传统的监测主要通过实验者经验的积累加以判断，难以普及。由于细菌生长过程是一种动态变化的过程，需要借助于先进的无线图像监测和温湿度监测设备和技术，动态实时记录细菌菌落... 详细信息

细菌菌落生长度的监测是细菌接种实验的一个重要步骤。但传统的监测主要通过实验者经验的积累加以判断，难以普及。由于细菌生长过程是一种动态变化的过程，需要借助于先进的无线图像监测和温湿度监测设备和技术，动态实时记录细菌菌落生长情况，为实验人员在实验过程在采集更多的信息。无线图像监测系统作为自动化、信息化的一个重要手段广泛应用于各行各业的各环节中，为提高工作效率和工作精度做出了很大贡献。本课题组充分使用ZigBee无线通讯技术、图像处理技术、SMS短信通讯技术、数据库关系理论和软件工程系统理论，采用VC++，VB等工具，构建了一套基于无线通讯网络环境下的细菌菌落生长度监测系统，根据系统需求分析，结合福建中医药大学细菌培育实验的实际情况，系统主要包括下位机通讯控制模块、实验室温度与湿度监测管理模块、监测图像处理模块、短信提示管理模块、信息查询与分析模块、操作权限管理模块、系统维护模块等，采用形成图像采集、图像传输和图像识别三模块。通过对监测系统的设计和实现，使菌落生长度的监测能够智能化，使传统的人工的医学实验模式能够有所创新。本论文从系统需求分析、系统设计、系统代码实现、系统测试等角度详细阐述了本课题的开发过程和结果。运用多个开发工具构建了一套完整细菌接种实验菌落生长度监测系统，并对系统进行了大量测试，系统的实际运行和测试结果表明：系统运行稳定，结果正确，达到项目的预期设计目标，能够有效地辅助实验人员管理细菌实验过程。

关键词：细菌菌落监测系统温度与湿度图像处理 UML模型设计

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细菌菌落标本的制备

临床检验杂志 1994年第1期12卷 37-37页

作者：黄锡全李良菊夏圣镇江医学院微生物学和免疫学教研室

细菌菌落标本的制备黄锡全，李良菊，夏圣（镇江医学院微生物学和免疫学教研室，２１２００１）每种细菌有它一定的菌落形态，对识别和鉴定细菌有一定的帮助。为了让学生掌握菌落特点，常用的方法是观察平板上新培养的菌落，但必须新鲜... 详细信息

细菌菌落标本的制备黄锡全，李良菊，夏圣（镇江医学院微生物学和免疫学教研室，２１２００１）每种细菌有它一定的菌落形态，对识别和鉴定细菌有一定的帮助。为了让学生掌握菌落特点，常用的方法是观察平板上新培养的菌落，但必须新鲜培养。我们采用漂浮法及挖取琼脂法，...

关键词：标本黄锡微生物学免疫学基础医学细菌菌落菌落形态

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不同稀释度对水中细菌菌落计数误差的影响

环境与健康杂志 1995年第4期12卷 154-154页

作者：韩秀媛叶秀文天津市卫生防病中心

不同稀释度对水中细菌菌落计数误差的影响韩秀媛，叶秀文在水细菌检验工作中，常常将样品进行稀释以便于计数。一般要求平皿计数以３０～３００个菌落为宜。我们对人工水样和天然水样分别进行不同稀释度的活菌计数检验，以了解不同稀释... 详细信息

不同稀释度对水中细菌菌落计数误差的影响韩秀媛，叶秀文在水细菌检验工作中，常常将样品进行稀释以便于计数。一般要求平皿计数以３０～３００个菌落为宜。我们对人工水样和天然水样分别进行不同稀释度的活菌计数检验，以了解不同稀释度对检验结果的影响。人工水样使用金...

关键词：稀释度水样细菌菌落计数误差检验结果

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一种离散细菌菌落优化算法研究

软件导刊 2013年第12期12卷 52-54页

作者：宋德逻孔德福李明西南林业大学机械与交通学院云南昆明650224

为了拓宽智能优化算法解决实际问题的能力,提出一种离散的细菌菌落优化算法。首先,设计新的个体编码方式以及进化方式;其次,融合禁忌搜素算法,克服算法易陷入早熟的不足;最后,与其它算法在Taillard标准调度测试问题集上比较实验,验证了... 详细信息

为了拓宽智能优化算法解决实际问题的能力,提出一种离散的细菌菌落优化算法。首先,设计新的个体编码方式以及进化方式;其次,融合禁忌搜素算法,克服算法易陷入早熟的不足;最后,与其它算法在Taillard标准调度测试问题集上比较实验,验证了算法的有效性。仿真表明,算法能够寻求到问题的最优组合。

关键词：智能优化离散优化算法细菌菌落禁忌搜索

猪鼻腔中细菌菌落PCR-DGGE引物条件优化

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农技服务 2015年第8期32卷 168-169页

作者：陈江贵州大学生命科学学院贵州贵阳550025

变性梯度凝胶电泳(Denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)技术是最先用于DNA突变检测的一种电泳技术。为获得最佳的PCR-DGGE上样模板,本实验分别采用十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法和Power Soil DNA Isolation Kit试剂盒抽提细... 详细信息

变性梯度凝胶电泳(Denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)技术是最先用于DNA突变检测的一种电泳技术。为获得最佳的PCR-DGGE上样模板,本实验分别采用十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法和Power Soil DNA Isolation Kit试剂盒抽提细菌基因组DNA,分别以Primer(338F/518R)/Primer(P2/P3)为16Sr DNA V3扩增引物,采用温度梯度PCR对引物扩增条件进行优化。结果显示:在Tm 56℃,通过CTAB法抽提细菌基因组DNA,采用primer(338F/518R)扩增16Sr DNA V3目的产物特异性最佳。

关键词：细菌菌落鼻腔