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16S rDNA克隆文库方法分析好氧颗粒污泥细菌组成

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环境科学研究 2009年第10期22卷 1218-1223页

作者：李建婷纪树兰刘志培秦振平刘缨杨媛媛北京工业大学环境与能源工程学院北京100124 中国科学院微生物研究所北京100101

采用构建16SrDNA克隆文库方法对好氧颗粒污泥的细菌种群多样性进行研究.随机测定了82个克隆子序列(700 bp),Blast比对结果表明,好氧颗粒污泥中微生物群落具有高度多样性,可分为7个主要类群,其中,β变形菌(β-Proteobacteria)类群和鞘脂... 详细信息

采用构建16SrDNA克隆文库方法对好氧颗粒污泥的细菌种群多样性进行研究.随机测定了82个克隆子序列(700 bp),Blast比对结果表明,好氧颗粒污泥中微生物群落具有高度多样性,可分为7个主要类群,其中,β变形菌(β-Proteobacteria)类群和鞘脂杆菌(Sphingobacteria)类群在文库中所占比例最大,分别为34.16%和30.50%;其次是Candidate division TM7类群、黄杆菌(Flavobacteria)类群和γ变形菌(γ-Proteobacteria)类群,分别为9.76%,7.32%和7.32%;放线菌(Actinobacteria)类群和α变形菌(α-Proteobacteria)类群所占比例相对较小,分别为4.88%和1.22%.序列分析结果表明,好氧颗粒污泥中不仅含有对好氧颗粒污泥形成和稳定运行具有重要作用的食酸菌属(Acidovorax)细菌、假单胞菌(Pseudomonas)等细菌,还含有对CODCr和氨氮具有很好去除能力的Micropruina glycogenica,丛毛单胞菌科(Comamonadaceae)等细菌.

关键词：好氧颗粒污泥 16SrDNA克隆文库细菌组成

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盐碱地养虾池塘养殖期间细菌组成分析

华中农业大学学报 2011年第2期30卷 225-228页

作者：么宗利周凯罗璋来琦芳王慧徐赟霞应成琦冯守明中国水产科学研究院东海水产研究所/盐碱地渔业工程技术研究中心上海200090 天津市水产养殖病害防治中心天津300221

对天津地区盐碱地凡纳滨对虾（Litopenaeus vannamei）养殖池塘的细菌种类和垂直变化规律进行了研究。结果表明：池塘中细菌总数维持在2.4×10^3-8.5×10^5cfu/mL之间,弧菌总数维持在1.75×10^2-2.3×10^5cfu/mL之间,细菌总数和弧菌总... 详细信息

对天津地区盐碱地凡纳滨对虾（Litopenaeus vannamei）养殖池塘的细菌种类和垂直变化规律进行了研究。结果表明：池塘中细菌总数维持在2.4×10^3-8.5×10^5cfu/mL之间,弧菌总数维持在1.75×10^2-2.3×10^5cfu/mL之间,细菌总数和弧菌总数分别在8月份和9月份达到高峰。反硝化细菌总数维持在3.4×10^4-2.8×10^5cfu/mL之间,硫酸盐还原菌总数维持在2.9×10^2-7.5×10^4cfu/mL之间,氨化细菌总数维持在1.2×10^2-7.0×10^4cfu/mL之间。养殖水体中共检测到13种细菌,养殖前期弧菌属、产碱菌属、棒杆菌属为优势菌群;养殖中期产碱菌属、弧菌属、气单胞菌属、肠杆菌科为优势菌群;养殖后期弧菌属、气单胞菌属、噬纤维菌属为优势菌群。通过多样性指数分析表明,7月份细菌多样性指数最高,9月份细菌多样性指数最低。

关键词：盐碱地养虾池塘细菌组成变化

应用16S rDNA克隆文库法分析有机物料腐熟菌剂细菌组成

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微生物学通报 2007年第5期34卷 939-942页

作者：李国媛李俊姜昕李力沈德龙中国农业科学院农业资源与农业区划研究所北京100081

应用16SrDNA克隆文库法对有机物料腐熟菌剂A和B样品中的细菌组成进行分析研究。结果表明,样品A有14个OTU,主要是融合乳杆菌(Weissella confusa)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)和短小芽孢杆菌(Bacillus pumilus),其比例分别占总克隆... 详细信息

应用16SrDNA克隆文库法对有机物料腐熟菌剂A和B样品中的细菌组成进行分析研究。结果表明,样品A有14个OTU,主要是融合乳杆菌(Weissella confusa)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)和短小芽孢杆菌(Bacillus pumilus),其比例分别占总克隆文库的28.6%、30.4%和23.2%;样品B有43个OTU,主要是布氏乳杆菌(Lactobacillus buchneri)、香肠乳杆菌(Lactobacillus farciminis)和耐酸乳杆菌(Lactobacillus acetotolerans),占总克隆文库的比例分别为18.03%、18.86%和13.12%;所得出的结果均与产品标注存在差异,样品A未提及细菌的种类,而样品B只标注短小芽孢杆菌。研究表明这一方法在微生物菌剂细菌组成分析及其质量检测中具有良好的应用前景。

关键词：有机物料腐熟菌剂 16S rDNA克隆文库法细菌组成

近自然管理对橡胶林土壤细菌组成及多样性的影响

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西部林业科学 2021年第5期50卷 81-89页

作者：李明美全飞孙树晴兰国玉杨川吴志祥中国热带农业科学院橡胶研究所海南海口571101 海南大学林学院海南海口570228 农业农村部儋州热带作物科学观测试验站海南儋州571737

以更好地了解近自然管理方式对于橡胶林土壤细菌的影响为目的,依据自然林核心理论建立一个1 hm 2的橡胶林固定样地进行近自然管理,通过四点采样法进行样品采集,运用土壤农业化学分析方法和基因测序,对土壤理化性质、微生物生物功能、细... 详细信息

以更好地了解近自然管理方式对于橡胶林土壤细菌的影响为目的,依据自然林核心理论建立一个1 hm 2的橡胶林固定样地进行近自然管理,通过四点采样法进行样品采集,运用土壤农业化学分析方法和基因测序,对土壤理化性质、微生物生物功能、细菌组成等进行实验分析,研究近自然管理后橡胶林土壤细菌群落的变化。结果显示:对橡胶林进行近自然管理后,土壤pH升高,土壤细菌中的酸杆菌门种类减少;橡胶林土壤细菌α多样性并未显著增加,但是在OUT水平上γ多样性(伽玛多样性)显著提高;雨季时近自然管理橡胶林土壤细菌γ多样性高于常规管理,旱季时则相反。研究表明:橡胶林进行近自然管理后土壤pH升高,从而改变了细菌群落的物种组成,细菌多样性提高。其研究结果可为橡胶林近自然管理方式下生物多样性的恢复提供理论依据。

关键词：橡胶林近自然管理土壤细菌细菌组成多样性

有机、无机肥配施比例对植烟土壤细菌组成及烤烟产质量的影响

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河南农业科学 2018年第6期47卷 52-58页

作者：刘昌黄莺陈雪喻奇伟夏忠文熊晶谢志勇贵州大学农学院贵州贵阳550025 贵州省烟草品质重点实验室贵州贵阳550025 贵州大学烟草学院贵州贵阳550025 贵州省毕节市烟草公司贵州毕节551700

在贵州黔西县采用定点田间试验的方法,研究了不同有机、无机肥配施比例(有机氮取代无机氮比例分别为0%、25%、50%、75%、100%)下植烟土壤细菌组成的变化及烤烟产质量的差异,以期为贵州烟区施用有机肥替代部分无机肥、实现减肥增效提供... 详细信息

在贵州黔西县采用定点田间试验的方法,研究了不同有机、无机肥配施比例(有机氮取代无机氮比例分别为0%、25%、50%、75%、100%)下植烟土壤细菌组成的变化及烤烟产质量的差异,以期为贵州烟区施用有机肥替代部分无机肥、实现减肥增效提供理论依据和技术支撑。结果表明,与单施无机肥处理相比,有机、无机肥配施处理可以提高土壤细菌的多样性,主要表现在Sobs指数、Shannon指数、Ace指数和Chao指数提高;可以改变土壤细菌科、属水平的结构组成,施有机肥处理间的土壤细菌各菌属丰度更为相似,且提高了有益微生物如鞘脂单细胞菌属、亚硝化单胞菌科、厌氧绳菌科、小单孢菌科等的丰度,从而改善土壤细菌的组成;同时,也能在一定程度上提高烤烟的产值和中上等烟比例,增加烤烟的经济效益。综合比较,以有机氮取代无机氮比例为50%时的效果最好。

关键词：有机肥无机肥配施比例植烟土壤细菌组成烤烟产量质量

应用16S rDNA克隆文库法分析B6-Co小鼠角膜炎细菌组成

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眼科新进展 2014年第12期34卷 1124-1127页

作者：宋鸿雁仇保丰刘春朱顺星缪进王生存吴刘成王旭邵义祥南通大学实验动物中心南通大学比较医学研究所江苏省南通市226001 南通出入境检验检疫局动检科江苏省南通市226004

目的鉴定B6-Co突变系小鼠角膜的病原菌组成,并与人类细菌性角膜炎病原菌组成进行比较分析。方法选取10 d龄B6小鼠和B6-Co小鼠各6只为实验动物,提取小鼠角膜组织刮取物细菌基因组DNA,通过PCR扩增构建16S rDNA克隆文库,采用随机测序法分析... 详细信息

目的鉴定B6-Co突变系小鼠角膜的病原菌组成,并与人类细菌性角膜炎病原菌组成进行比较分析。方法选取10 d龄B6小鼠和B6-Co小鼠各6只为实验动物,提取小鼠角膜组织刮取物细菌基因组DNA,通过PCR扩增构建16S rDNA克隆文库,采用随机测序法分析B6-Co小鼠角膜细菌组成,B6小鼠作为对照。结果 B6-Co角膜混浊小鼠中共鉴定出20种细菌,隶属于15个属,包括葡萄球菌属、假单胞菌属、链球菌属、微球菌属、棒状杆菌属等。葡萄球菌属和假单胞菌属为优势群,葡萄球菌属丰度为19.7%~53.1%,假单胞菌属的丰度为17.4%~32.8%。其中葡萄球菌属主要是表皮葡萄球菌,丰度为13.8%~20.9%;缓慢葡萄球菌,丰度为14.0%~30.9%;金黄色葡萄球菌,丰度为7.4%~20.3%。此外,棒状杆菌和微球菌也比较常见。10 d龄B6小鼠未检测出细菌。结论 B6-Co突变系小鼠角膜细菌组成与人类角膜炎病原菌相似,是研究人类角膜炎诊断方法、发病机理及临床用药的很好的动物模型。

关键词：细菌性角膜炎 16S r DNA克隆文库细菌组成 B6-Co小鼠

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鲤鱼饲养池里细菌组成的变化

国外水产 1986年第3期 37-39页

作者： Sugita 陈宝华

淡水鱼的肠道中含有多种需氧菌和厌氧菌（Sakata 等,1980;Sugita 等,1981、1982、1983）。这些菌随粪便排出,分散到环境水体中。在集约饲养池里,养殖鱼的大量粪便排入水体后,再由水生微生物分解。释放出的肠道菌,浓度达10;～10;个/克粪... 详细信息

淡水鱼的肠道中含有多种需氧菌和厌氧菌（Sakata 等,1980;Sugita 等,1981、1982、1983）。这些菌随粪便排出,分散到环境水体中。在集约饲养池里,养殖鱼的大量粪便排入水体后,再由水生微生物分解。释放出的肠道菌,浓度达10;～10;个/克粪（Sakata 等,1980;Sugita 等,1983）,因而它能改变养殖水体中的细菌组成。人们已知异养菌在保持水质方面起着重要作用,但对养殖池、塘中的微生物类群的研究不多（Gilmour 等,1976;Sugita 等,1981）。本

关键词：杆菌厌氧菌琼脂培养基活菌计数细菌组成需氧培养需氧菌噬纤维菌属纤维粘菌属肠杆菌科革兰氏阴性兼性厌气杆菌假单胞菌优势菌肠道菌鲤鱼

陶粒生物膜上的细菌组成及其对COD、TN的去除率

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陶粒生物膜上的细菌组成及其对COD、TN的去除率

对虾养殖前期5种类型水体中细菌的组成和比较研究

第三届全国农业环境科学学术研讨会

作者：卢显芝贾永光田秀平郝建朝天津农学院农学系

生物膜法是进行污水处理的有效方法,近年来引起人们的广泛关注。而载体对膜形成的快慢、膜形成的质量以及对污水的处理效率有直接影响。本研究以陶粒为载体,采用排水浓缩法,用高浓度活性污泥接种,快速形成生物膜。实验结果表明生物膜上... 详细信息

生物膜法是进行污水处理的有效方法,近年来引起人们的广泛关注。而载体对膜形成的快慢、膜形成的质量以及对污水的处理效率有直接影响。本研究以陶粒为载体,采用排水浓缩法,用高浓度活性污泥接种,快速形成生物膜。实验结果表明生物膜上的菌株分别属于肠杆菌科（Enterobactericaeae）,黄杆菌属（Flavobaerium）和微球菌属（Micrococcus）。其中,肠杆菌科是明显的优势菌群,占细菌总数的71.55%。此生物膜上的一些菌株能够进行好氧反硝化作用。用此生物膜处理污水,在28d时对COD、TN的去除效果最好,去除率分别为46.1%和34.25%。

关键词：快速挂膜细菌组成 COD、TN去除率

来源： cnki会议评论

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cnki会议

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中国海洋大学学报（自然科学版） 2010年第11期40卷 39-44页

作者：周凯来琦芳罗璋王慧么宗利徐赟霞应成琦中国水产科学研究院东海水产研究所盐碱池渔业工程技术研究中心上海200090 天津市水产养殖病害防治中心天津300221

本文对天津和河北沧州地区的5种类型养虾水体(淡水、盐碱地水、浅层盐碱水、海水、高盐海水)养殖前期的细菌数量及组成进行比较研究。结果为:(1)5种水体中异养细菌、弧菌、氨化细菌、反硝化细菌、硫酸还原菌数量差异明显,异养细菌总数... 详细信息

本文对天津和河北沧州地区的5种类型养虾水体(淡水、盐碱地水、浅层盐碱水、海水、高盐海水)养殖前期的细菌数量及组成进行比较研究。结果为:(1)5种水体中异养细菌、弧菌、氨化细菌、反硝化细菌、硫酸还原菌数量差异明显,异养细菌总数高低的顺序为:海水>高盐海水>浅层盐碱水>盐碱地水>淡水;弧菌总数:高盐海水>海水>浅层盐碱水>盐碱地水>淡水;氨化细菌总数:海水>浅层盐碱水>盐碱地水>淡水>高盐海水;反硝化细菌总数:盐碱地水>淡水>海水>浅层盐碱水>高盐海水;硫酸还原菌总数:浅层盐碱水=淡水>海水>盐碱地水>高盐海水。(2)不同水体中细菌种类及相对数量存在差异,淡水中气单胞菌属、邻单胞菌属、肠杆菌科为主要菌群,分别占总数的21.34%,18.57%,17.14%;盐碱地水中产碱菌属、弧菌属、肠杆菌科、棒杆菌属为主要菌群,分别占总数的29.27%,19.51%,14.63%,14.63%;浅层盐碱水中弧菌属、气单胞菌属为主要菌群,分别占总数的23.08%,15.38%;海水中弧菌属、肠杆菌科为主要菌群,分别占总数的19.35%,16.13%;高盐海水中弧菌属、假单胞菌属为主要菌群,分别占总数的38.71%,12.90%。研究表明,养殖前期,5种类型养虾群体中的细菌组成结构存在明显差异。

关键词：养虾水体养殖前期细菌组成细菌数量