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东北三省致病疫霉线粒体dna单倍型鉴定分析及生物学特性研究

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河北农业大学学报 2018年第5期41卷 25-31页

作者：田荟遥蒋继志李成斌侯宁申芬李岩河北大学生命科学学院河北保定071002 邢台医学高等专科学校河北邢台054000

为明确东北三省马铃薯致病疫霉线粒体dna单倍型组成和分布以及不同线粒体单倍型与其生物学特性之间的关系,采用PCR-RFLP方法分析了2017年从东北三省分离纯化的137株马铃薯致病疫霉菌株的线粒体dna单倍型类型,并比较4种线粒体单倍型菌株... 详细信息

为明确东北三省马铃薯致病疫霉线粒体dna单倍型组成和分布以及不同线粒体单倍型与其生物学特性之间的关系,采用PCR-RFLP方法分析了2017年从东北三省分离纯化的137株马铃薯致病疫霉菌株的线粒体dna单倍型类型,并比较4种线粒体单倍型菌株在不同温度下的菌丝产孢量、生长量以及对马铃薯离体叶片的致病力。结果显示,Ⅱa型为主要单倍型,占71.5%,其次是Ⅱb型,占21.2%,最少的为Ⅰa型,占7.3%,没有检测到Ⅰb型。4种线粒体单倍型菌株均在20℃时生长最快,其中Ⅱa型菌株的生长速度最快(6.43mm/d)、平均产孢量也最多(33.5×10~4个/mL),I b型菌株生长速度最慢(3.41mm/d),产孢量也最少(6.4×10~4个/mL),且不同类型之间差异性显著(P线粒体单倍型有3种,且不同类型单倍型与其菌丝生长、孢子囊产生尤其是致病力之间存在明显相关性。

关键词：致病疫霉线粒体dna单倍型生物学致病力

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修饰因子对线粒体dna突变致聋的影响

中华医学遗传学杂志 2011年第2期28卷 165-171页

作者：杨爱芬郑静吕建新管敏鑫浙江省温州医学院Attardi线粒体生物医学研究院和浙江省医学遗传学重点实验室 325035 Division of Human Genetics Cincinnati Children's Hospital Medical CenterCincinnatiOhio 45229 USA

线粒体dna突变是引起感音神经性耳聋的重要原因之一,这些突变主要位于线粒体12SrRNA和tRNA基因上.其中12S rRNA基因上的同质性A1555G和C1494T突变与氨基糖甙类抗生素造成的耳聋相关.携带这两个突变的个体对耳毒性药物高度敏感,导致临床... 详细信息

线粒体dna突变是引起感音神经性耳聋的重要原因之一,这些突变主要位于线粒体12SrRNA和tRNA基因上.其中12S rRNA基因上的同质性A1555G和C1494T突变与氨基糖甙类抗生素造成的耳聋相关.携带这两个突变的个体对耳毒性药物高度敏感,导致临床上常见的＂一针致聋＂现象.但携带A1555G或C1494T突变的个体在没用药的情况下也能产生非综合征型耳聋,而且同一家系内和不同家系间的母系成员在听力损失程度、发病年龄及听力曲线上存在很大差异.这些数据表明A1555G或C1494T突变是导致非综合征型耳聋发生的首要因子,其他修饰因子包括氨基糖甙类抗生素、线粒体dna单倍型和核修饰基因等,在线粒体12S rRNA A1555G或C1494T突变相关的耳聋表型表达上起协同作用.作者简要介绍了这些因素对线粒体dna突变致聋的影响以及母系遗传性耳聋发生的可能致病机制.

关键词：线粒体dna突变非综合征型耳聋氨基糖甙类抗生素线粒体dna单倍型核修饰基因

五个母系遗传非综合征性耳聋和药物性耳聋的中国汉族家系

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中华医学遗传学杂志 2011年第4期28卷 367-373页

作者：张婷陈波蓓郑静龚莎莎张初琴吕建新管敏鑫温州医学院Attardi线粒体生物医学研究院和浙江省医学遗传学重点实验室 325035 温州医学院附属第二医院耳鼻喉科 Division of Human Genetics Cincinnati Children's Hospital Me GJB2 gene dical Center CincinnatiOhio 45229 USA

目的通过对母系遗传非综合征性耳聋家系临床和分子遗传学特征分析，进一步探讨线粒体12S rRNA基因对母系遗传药物性耳聋的影响。方法收集5个非综合征性耳聋患者家系，提取基因组dna，然后进行线粒体dna全序列和间隙连接蛋白β2（gap jun... 详细信息

目的通过对母系遗传非综合征性耳聋家系临床和分子遗传学特征分析，进一步探讨线粒体12S rRNA基因对母系遗传药物性耳聋的影响。方法收集5个非综合征性耳聋患者家系，提取基因组dna，然后进行线粒体dna全序列和间隙连接蛋白β2（gap junction protein beta 2，GJB2）基因扩增并测序分析。结果5个家系内和家系间的母系成员在听力损失、发病年龄和听力曲线上存在较大差异。5个家系耳聋发生的外显率分别为17．6％、50．0％、66．7％、31．3％和23．1％，平均外显率是37．7％。线粒体全序列显示家系间存在已知的1555A〉G突变和不同的多态性位点，分别属于东亚人群D4b2b、B4c1bl、F3、C1、D5a单倍型。这5个家系没有携带已知的线粒体dna继发突变，但发现了2个保守性较高的ND1 L89T和C03A200T突变。而且，GJB2基因上未发现与耳聋相关的突变。结论这5个母系遗传非综合征性耳聋家系中，线粒体dna继发突变、GJB2基因可能没有影响1555A〉G的表型表达。然而，氨基糖甙类抗生素、线粒体dna多态性及其他核修饰基因可能对这5个耳聋家系的表型表达起到修饰作用。

关键词：非综合征性耳聋线粒体12S rRNA 突变线粒体dna单倍型外显率

贵州从江侗族Y-dna及线粒体dna序列多态性分析

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遗传 2005年第1期27卷 30-34页

作者：齐晓岚谢渊单可人褚迅刘烜李毅赵艳吴昌学马骄修瑾任锡麟贵阳医学院分子生物学重点实验室贵州贵阳550004

为分析贵州从江侗族父系及母系遗传结构,探讨其起源及迁徙,通过聚合酶链式反应限制性片段长度多态性(PCR RFLP),研究贵州从江侗族无亲缘关系个体由10个单核苷酸位点(SNPs)组成的Y染色体单倍型及11个单核苷酸位点组成的线粒体dna单倍群... 详细信息

为分析贵州从江侗族父系及母系遗传结构,探讨其起源及迁徙,通过聚合酶链式反应限制性片段长度多态性(PCR RFLP),研究贵州从江侗族无亲缘关系个体由10个单核苷酸位点(SNPs)组成的Y染色体单倍型及11个单核苷酸位点组成的线粒体dna单倍群频率。结果显示,从40份男性样本的Y SNP基因分型中,得到H6、H11、H14共3种单倍型;H11的频率为92.5%;通过对线粒体dna基因分型,得到6种单倍群,有75%的个体能明确分类其所携带的单倍群特征,说明贵州从江侗族父系遗传构成相对简单。通过主成分分析,证明贵州从江侗族与其他的壮侗语族人群相聚,母系遗传结构复杂,无C单倍群分布可能为该民族特征之一。

关键词：贵州侗族 Y染色体单倍型线粒体dna单倍型

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致病疫霉超级生理小种遗传多样性分析

菌物学报 2013年第5期32卷 791-801页

作者：徐小虎杨志辉朱杰华张维宏王春一河北农业大学植物保护学院河北保定071000 河北省南皮县农业局河北南皮061500

通过交配型和甲霜灵抗性以及线粒体dna单倍型、SSR和AFLP基因型分析对40个超级生理小种菌株进行了遗传多样性分析。在被测菌株中发现了A1、A2和自育3种不同类型的交配型。其中,A1和自育型菌株数量多,分别为21株和14株,而A2交配型仅5株... 详细信息

通过交配型和甲霜灵抗性以及线粒体dna单倍型、SSR和AFLP基因型分析对40个超级生理小种菌株进行了遗传多样性分析。在被测菌株中发现了A1、A2和自育3种不同类型的交配型。其中,A1和自育型菌株数量多,分别为21株和14株,而A2交配型仅5株。甲霜灵抗性测定检测出高抗菌株26株,敏感菌株14株。线粒体dna单倍型测定出Ia型和IIa型两种,比例接近1:1。基于5个基因座被测40个超级生理小种菌株共鉴定出了7种SSR基因型。利用6对荧光引物共检测到258条AFLP谱带,其中多态性谱带204条,多态性为79.1%。将供试的40个菌株划分为38个基因型,几乎每个菌株都为1个特有基因型。而且,我国南方和北方超级生理小种群体存在着明显的遗传差异。结果表明我国致病疫霉超级生理小种具有丰富的遗传多样性,可以推断致病疫霉中的任何小种都可在多个抗病基因的强大选择压力下,在短时间内通过与之对应的无毒基因快速突变而成为超级生理小种。当前对致病疫霉生理小种的鉴定及监测对生产上利用抗病品种防控晚疫病的指导意义不大。

关键词：超级生理小种交配型甲霜灵抗性线粒体dna单倍型简单重复序列扩增酶切片段多态性

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一个马铃薯种质资源圃致病疫霉群体的分析

菌物学报 2013年第5期32卷 802-811页

作者：马云芳孙洁平马丽杰权军利单卫星西北农林科技大学植物保护学院旱区作物逆境生物学国家重点实验室陕西杨凌712100

由致病疫霉Phytophthora infestans引起的晚疫病是马铃薯生产上最严重的病害之一,认识其群体结构特征,可为晚疫病防控策略的制定以及抗病品种的合理布局提供指导。对2009年采自宁夏一个种植有93个品种(品系)的马铃薯种质资源圃的致病疫... 详细信息

由致病疫霉Phytophthora infestans引起的晚疫病是马铃薯生产上最严重的病害之一,认识其群体结构特征,可为晚疫病防控策略的制定以及抗病品种的合理布局提供指导。对2009年采自宁夏一个种植有93个品种(品系)的马铃薯种质资源圃的致病疫霉进行了交配型、致病型和线粒体dna单倍型分析,结果表明,116个致病疫霉菌株中存在A1、A2和自育型3种交配型,发生频率分别为24.1%、57.8%和18.1%,A2交配型为优势类型;对其中43个菌株的致病型进行测试,检测到两种致病类型:1.***.3.4.5.***.7.8.9.10.11和3.4.10,发生频率分别为95.3%和4.7%,可克服所有11个抗病基因的1.***.3.4.5.***.7.8.9.10.11类型占绝对优势;对62个菌株的线粒体dna单倍型进行分析,检测到Ia和IIa两种类型,发生频率分别为74.2%和25.8%。综合表型和基因型数据分析发现,该马铃薯种质资源圃中致病疫霉群体致病型单一,但致病型毒力因子高度复合;线粒体dna分析表明,该马铃薯种质资源圃引入了遗传背景较为复杂的致病疫霉"新"群体。

关键词：致病疫霉交配型致病型线粒体dna单倍型马铃薯晚疫病

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宁夏固原致病疫霉群体结构特征

植物保护学报 2012年第5期39卷 418-424页

作者：宋俊丽朱杰华杨志辉王春一河北农业大学植物保护学院保定071001 河北省南皮县农业局南皮061500

为揭示宁夏固原致病疫霉群体遗传结构,用对峙培养法和菌落直径法测定致病疫霉的交配型和甲霜灵抗性,利用限制性片段长度多态性聚合酶链反应(PCR-RFLP)技术检测致病疫霉线粒体dna单倍型,并采用简单重复序列(SSR)和扩增片段长度多态性(AF... 详细信息

为揭示宁夏固原致病疫霉群体遗传结构,用对峙培养法和菌落直径法测定致病疫霉的交配型和甲霜灵抗性,利用限制性片段长度多态性聚合酶链反应(PCR-RFLP)技术检测致病疫霉线粒体dna单倍型,并采用简单重复序列(SSR)和扩增片段长度多态性(AFLP)技术确定致病疫霉群体的基因型。在94株供试菌株中,发现了1株A1交配型、86株A2交配型及7株自育型菌株,全部为甲霜灵抗性菌株。菌株的线粒体单倍型均为Ⅰa型,共鉴定出2种SSR基因型,Ⅰ型占绝对优势。AFLP聚类分析显示,在相似系数0.68时分成α和β两组,宁夏固原菌株全部聚在β组。研究表明,宁夏固原致病疫霉群体结构比较单一、遗传多样性水平较低。

关键词：交配型甲霜灵抗性线粒体dna单倍型简单重复序列扩增片段长度多态性

河北省番茄上致病疫霉Phytophthora infestans群体结构的分析

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菌物学报 2010年第4期29卷 508-517页

作者：吴婧莲杨志辉秦宇轩朱杰华韩彦卿刘蕊董立新河北农业大学植物保护学院保定071001 河北农业大学食品科技学院保定071001 广东省梅州市农业科学研究所梅州514071 河北省秦皇岛市农业局秦皇岛066004

番茄晚疫病是河北省番茄生产上最具毁灭性的病害之一,对引起该病害的致病疫霉群体结构进行分析有利于病害的防治。利用对峙培养法和菌落直径法对2007-2008年采自河北省保定、沧州和唐山分离自番茄的49个致病疫霉菌株进行了交配型和甲霜... 详细信息

番茄晚疫病是河北省番茄生产上最具毁灭性的病害之一,对引起该病害的致病疫霉群体结构进行分析有利于病害的防治。利用对峙培养法和菌落直径法对2007-2008年采自河北省保定、沧州和唐山分离自番茄的49个致病疫霉菌株进行了交配型和甲霜灵抗性的表型测定,结果表明该群体所有菌株均为A1交配型,以甲霜灵敏感菌株为主,抗性菌株仅7株。利用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)、简单序列重复(SSR)和扩增片段长度多态性(AFLP)等分子技术对该群体的基因型进行了分析,结果表明供试菌株线粒体基因型均为Ia型,共鉴定出了Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ3种SSR基因型,AFLP聚类分析在相似系数0.87时可以形成α、β和γ等3个不同的分支。河北省所有番茄上致病疫霉菌株均分布在α分支上,该分支又可进一步分为7个亚分支。AFLP亚分支与甲霜灵抗性和地理来源均无明显相关性,但Ⅱ型SSR与甲霜灵抗性和地理来源有明显的相关性。综合表型和基因型数据说明河北省番茄上致病疫霉群体结构比较单一,遗传多样性程度较低。

关键词：番茄晚疫病菌甲霜灵抗性交配型线粒体dna单倍型扩增片段长度多态性简单序列重复

mtdna单倍型D4和B4a细胞线粒体功能及其影响衰老发生的机制研究

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中国细胞生物学学报 2017年第6期39卷 756-764页

作者：周超高静熊静霆仇如意沈丽君吕建新温州医科大学检验医学院、生命科学学院浙江省医学遗传学重点实验室Attardi线粒体生物医学研究院温州325035 浙江大学医学院附属儿童医院杭州310003 杭州医学院杭州310053

该文初步分析了两个与衰老发生抑制及促进的线粒体dna(mitochondrial dna,mtdna)单倍型D4和B4a细胞的线粒体功能情况,并对其影响衰老的可能机制进行了探究。通过细胞融合构建两个核背景一致但mtdna单倍型分别是D4和B4a的胞质杂合细胞。... 详细信息

该文初步分析了两个与衰老发生抑制及促进的线粒体dna(mitochondrial dna,mtdna)单倍型D4和B4a细胞的线粒体功能情况,并对其影响衰老的可能机制进行了探究。通过细胞融合构建两个核背景一致但mtdna单倍型分别是D4和B4a的胞质杂合细胞。应用RT-PCR方法检测细胞mt dna拷贝数以及线粒体基因的mRNA水平,氧电极法和非变性梯度聚丙烯酰胺凝胶电泳(blue native polyacrylamide gelelectrophoresis,BN-PAGE)技术检测细胞线粒体氧化呼吸能力及线粒体复合体水平,TMRM染料和DCFH-DA染料法检测细胞线粒体膜电位和活性氧(reactive oxygen species,ROS)生成水平。结果显示,D4单倍型细胞线粒体氧呼吸能力、膜电位水平以及线粒体基因(mt-ND1、mt-7S RNA)转录水平均明显高于B4a单倍型细胞,而ROS生成水平明显降低,mt dna拷贝数则并无明显差异。该结果表明,在D4单倍型细胞中,通过提高某些线粒体基因的表达,使得线粒体呼吸复合体表达得到提升,继而提高线粒体氧化呼吸功能,降低细胞氧化损伤,从而延缓衰老的发生。

关键词：线粒体dna单倍型线粒体功能氧化损伤衰老