检索结果-南通市图书馆

检索条件"主题词=线粒体COI标记"

共 2 条记录，以下是1-10 订阅

全选清除本页清除全部题录导出标记到"检索档案"

详细简洁

排序：

基于线粒体coi标记的4种鲤亚科鱼类的亲缘地理分析

基于线粒体COI标记的4种鲤亚科鱼类的亲缘地理分析

引用

2016年中国水产学会学术年会

作者：姜文钊姚东林王桢璐叶峭周爱国邹记兴华南农业大学海洋学院清远市北江水产科学研究所

为探讨鲤亚科鱼类目前存在的亲缘地理关系问题,本实验以华南鲤、尖鳍鲤、三角鲤和须鲫四种鲤为研究对象,线粒体COⅠ为分子标记,在每个基因片段独立分析的基础上分析遗传多样性,亲缘关系和进化地位。研究表明,三个华南鲤种群之间有较近... 详细信息

为探讨鲤亚科鱼类目前存在的亲缘地理关系问题,本实验以华南鲤、尖鳍鲤、三角鲤和须鲫四种鲤为研究对象,线粒体COⅠ为分子标记,在每个基因片段独立分析的基础上分析遗传多样性,亲缘关系和进化地位。研究表明,三个华南鲤种群之间有较近的遗传关系,遗传差距最大为0.002。须鲫、尖鳍鲤和三角鲤三者的遗传多样性都处于很低的水平,这和这3个物种本身的分布范围较小、生存能力较低有关系。尖鳍鲤和华南鲤的遗传距离均低于0.01,遗传差距均在小于0.003,表明两者之间关系密切。三角鲤的遗传差距与其他五个种群差异也较大,Fst均超过0.6370,而基因交流指数Nm最高仅为0.0570;须鲫与其他五个群体遗传距离均超过了0.1,其他五个种群的Fst指数均超过了0.98,Nm值均在0.01以内,亲缘关系较远。

关键词：鲤亚科线粒体coi标记亲缘多样性分析

来源： cnki会议评论

在线全文

cnki会议

学校读者我要写书评

暂无评论

鲢微卫星标记开发及湖北养殖群体遗传多样性分析

鲢微卫星标记开发及湖北养殖群体遗传多样性分析

引用

作者：王亚军长江大学

学位级别：硕士

鲢(Hypophthalmichthys molitrix)属于辐鳍亚纲(Actinopterygii)、鲤形目(Cypriniformes)、鲤科(Cyprinidae)、鲢亚科(Hypophthalmichthyinae)、鲢属(Hypophthalmichthys),是我国重要的四大家鱼之一,具有生长速度快、经济价值高、净化水体等特点。为分析基因组中微卫星的分布特征及规律,开发多态性的分子标记,本研究基于鲢基因组筛选并开发出了21对具有多态性的微卫星标记,并使用多态性较高的微卫星和线粒体coi分别分析了湖北石首(SS)、监利(JL)、窑湾(YW)、浠水(XS)、红安(HA)、随州(SZ)、孝昌(X C)、黄陂(HP)8个养殖群体的遗传多样性和遗传结构,以期为鲢的种质资源保护提供理论依据。主要研究结果如下:(1)使用MISA软件在842.01 Mb的鲢基因组中共筛选出368,572个微卫星重复序列,微卫星序列全长为6,492,076 bp,占全基因组总长的0.77%,平均长度为84.66 bp,频率为437.73 loci/Mb,密度为7,713.16 bp/Mb。其中二碱基重复数量最多(204,873个),占微卫星总数的55.59%,其次是四核苷酸占19%(70,012个)、五核苷酸占12.19%(44,921个)、三核苷酸占10.32%(38,048个)、六核苷酸占2.91%(10,718个)。鲢全基因组中前十的优势微卫星类型分别为AC、AT、AG、AAT、AAAT、AGAT、AAAAT、AAC、AAAAAT和ATC重复。染色体上的SSR数量与长度呈正相关。8个鲢样本中共筛选出21个能够稳定扩增且具有多态性的SSR标记,21个微卫星标记共检测到94个等位基因,等位基因(Na)范围为2～7(平均值4.476),有效等位基因(Ne)为1.052～4.765(平均值2.757),观测杂合度(Ho)为0.017～0.875(平均值0.517),期望杂合度(He)为0.049～0.800(平均值0.553),多态信息含量(PIC)为0.048～0.768(平均值0.512)。(2)利用多态性较高的11对微卫星标记在湖北省的8个养殖群体中进行遗传多样性和遗传结构分析,发现8个群体的遗传多样性较丰富,8个群体中的等位基因数为4～8,平均为6.125,观测杂合度范围为0.580～0.712,平均值为0.632,期望杂合度为0.567～0.722,平均为0.658,多态性信息含量为0.516～0.689,平均为0.618,监利群体的遗传多样性最高,窑湾群体相对较低。群体间的遗传分化处于中等水平(Fst=0.10147)。AMOVA分析结果表明,89.43%的遗传变异来于群体内,群体间的遗传变异为10.57%。基于遗传距离及聚类分析均将8个群体划分为两个显著分化的谱系。(3)运用线粒体coi基因对湖北省8个鲢养殖群体进行了遗传多样性和遗传结构分析,8个群体中共检测出18种单倍型,76个变异位点,其中单位点突变为21个,简约信息位点55个。8个群体的平均T、C、A和G碱基的含量分别为:30.03%、26.62%、26.08%及17.32%。单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.604和0.00325,监利群体的遗传多样性最高(Hd:0.883,π:0.00699),窑湾群体遗传多样性最低(Hd:0.186,π:0.00085),群体间的遗传分化处于中等偏下的水平(Fst:0.05924),群体间和群体内的遗传距离较小,分别为0.00353和0.00329,分子方差分析(AMOVA)表明遗传变异主要发生于群体内(93.42%),群体间的变异较少(6.58%)。UPGMA聚类树结果显示,监利群体最先聚为一支,随后黄陂、随州、浠水、红安、孝昌、窑湾和石首群体两两聚为一支,未形成较为显著的地理群体。基于18个单倍型构建的NJ系统发育树各节点分支的支持率较低(<50%),与单倍型网络图结果一致,均未形成明显的系统地理群体。

关键词：鲢微卫星标记线粒体coi标记遗传多样性遗传结构

来源：

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

全选清除本页清除全部题录导出标记到“检索档案”

共1页 << < 1 > >>

回到顶部

执行限定条件

欢迎您,

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

在线全文

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

欢迎您,

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

在线全文

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：