检索结果-南通市图书馆

基于线粒体16s rRNA基因部分序列探讨贵州9种菊头蝠(翼手目:菊头蝠科)的分子系统进化关系(英文)

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

四川动物 2009年第6期28卷 816-820页

作者：宋华王会陈学平谷晓明贵州师范大学生命科学学院贵阳550001

依据部分线粒体16s rRNA基因序列,我们对贵州九种菊头蝠进行了分子系统进化关系研究。结果表明:马铁菊头蝠与其他菊头蝠亲缘关系较远,它可能是最原始的种类。中华菊头蝠和贵州菊头蝠聚在同一分支,表明它们之间亲缘关系非常接近,高鞍菊... 详细信息

依据部分线粒体16s rRNA基因序列,我们对贵州九种菊头蝠进行了分子系统进化关系研究。结果表明:马铁菊头蝠与其他菊头蝠亲缘关系较远,它可能是最原始的种类。中华菊头蝠和贵州菊头蝠聚在同一分支,表明它们之间亲缘关系非常接近,高鞍菊头蝠和贵州菊头蝠的DNA差异百分比最小(1.13%),因此认为这两个种亲缘关系也非常接近。

关键词：系统发生蝙蝠线粒体16s rDNA 菊头蝠

12种石鲈科鱼类线粒体16s rRNA基因的部分序列分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

热带海洋学报 2007年第3期26卷 48-52页

作者：任岗章群钱开诚徐忠能林小涛暨南大学水生生物研究所

分析了5属12种石鲈科鱼类的线粒体16s rRNA基因部分序列特征,并参照RNA二级结构模型区分配对区和非配对区。结果表明,配对区对G有偏好(33.5%),非配对区对A有偏好(38.5%);与配对区相比,非配对区存在更多的变异和系统发育信息。从序列的Ju... 详细信息

分析了5属12种石鲈科鱼类的线粒体16s rRNA基因部分序列特征,并参照RNA二级结构模型区分配对区和非配对区。结果表明,配对区对G有偏好(33.5%),非配对区对A有偏好(38.5%);与配对区相比,非配对区存在更多的变异和系统发育信息。从序列的Jukes-Cantor遗传距离结果看,石鲈科胡椒鲷属Plectorhynchus、矶鲈属Parapristipoma、石鲈属Hapalogenys、髭鲷属Pomadasys、Haemulon属5个属属间的差异水平都接近或超过了其与外类群科间的差异水平。从构建的ME系统发育树结果看,石鲈科鱼类分成二大分支,未能形成单一类群。在亲缘关系上,胡椒鲷属和矶鲈属较近,石鲈属和Haemulon属较近,髭鲷属与其它4个属较远,髭鲷属在鲈亚目中的分类地位可能应提高到科的水平。初步确定研究中选用的16s rRNA基因片段基本适用于石鲈科属间和属内种间关系的研究。

关键词：石鲈科线粒体16s rRNA基因 RNA二级结构序列分析系统发育

浅色黄姑鱼线粒体16s rRNA基因片段序列特征分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

海洋水产研究 2007年第3期28卷 85-91页

作者：童馨杜博喻达辉龚世园郭奕惠黄桂菊李莉好华中农业大学水产学院武汉430070 中国水产科学研究院南海水产研究所广州510300

PCR扩增100个浅色黄姑鱼个体的线粒体16srRNA基因片段序列,得到大约620bp的扩增产物。将其中5个个体的扩增产物进行测序和同源比对,得到468bp可供比对分析的片段。比对结果表明,5条序列包括两个单倍型,两个单倍型之间有1个碱基突变。PCR... 详细信息

PCR扩增100个浅色黄姑鱼个体的线粒体16srRNA基因片段序列,得到大约620bp的扩增产物。将其中5个个体的扩增产物进行测序和同源比对,得到468bp可供比对分析的片段。比对结果表明,5条序列包括两个单倍型,两个单倍型之间有1个碱基突变。PCR-RFLP分析结果显示,两个种群的100个样品中98%的个体为其中一种单倍型,只有2%的个体呈另一种单倍型,表明这两个种群的遗传多样性较低。两个单倍型平均碱基组成为:T22.0%,C26.3%,A29.8%,G21.9%,GC含量平均为48.2%。与GenBank中石首鱼科7属9种的11条同源序列比对,得到429个比对位点,其中包括69个简约信息位点、55个单突变子和16个插入/缺失位点。聚类分析显示,浅色黄姑鱼与黄姑鱼亲缘关系较近,与形态分类相符。

关键词：浅色黄姑鱼线粒体16s rRNA基因序列分析 RFLP

基于18s rRNA和线粒体16s rRNA基因序列的柳蚕进化分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

昆虫知识 2010年第2期47卷 285-292页

作者：朱保建刘朝良曹甲李旭全魏国清安徽农业大学生命科学学院合肥230036

为探讨柳蚕Actias selene Hübner与鳞翅目昆虫的系统发育关系,本研究利用PCR扩增获得了柳蚕核糖体18s rRNA和线粒体16s rRNA基因的部分序列,长度分别为391bp和428bp。并采用邻近距离法(NJ)、最大简约法(MP)、类平均聚类法(UPGMA)构建... 详细信息

为探讨柳蚕Actias selene Hübner与鳞翅目昆虫的系统发育关系,本研究利用PCR扩增获得了柳蚕核糖体18s rRNA和线粒体16s rRNA基因的部分序列,长度分别为391bp和428bp。并采用邻近距离法(NJ)、最大简约法(MP)、类平均聚类法(UPGMA)构建系统进化树。结果表明,柳蚕线粒体16srRNA基因序列与大蚕蛾科昆虫的16srRNA基因序列均表现出偏好于碱基AT的倾向。柳蚕与所研究的其它蚕类的遗传距离介于0.016至0.140之间,其中与温带柞蚕Antheraea roylii的遗传距离最小,与野桑蚕Bombyx mandarina的遗传距离最大。而基于鳞翅目昆虫18s rRNA基因部分序列的进化分析显示,柳蚕与柞蚕Antheraea pernyi之间的遗传距离最小(0.010),与蓖麻蚕samia ricini的遗传距离最大(0.017)。

关键词：柳蚕核糖体18s RNA 线粒体16s rRNA 进化分析

运用基因芯片技术检测牛、山羊、猪和鸡源性成分

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

生物工程学报 2010年第6期26卷 823-829页

作者：石丰运缪建锟张利平陶虹吕建强阮周曦宗卉甘肃农业大学动物科学技术学院兰州730070 深圳出入境检验检疫局深圳518010 中国农业大学农业生物技术国家重点实验室北京100193

本研究通过对脊椎动物分子标记基因进行序列分析,最终选择线粒体DNA(mtDNA)16s rRNA基因为目标基因,利用一对通用引物,在该引物扩增区间设计了4条特异性基因芯片检测探针及2条质控探针用于对牛、山羊、猪、鸡等4种动物源性成分进行检测... 详细信息

本研究通过对脊椎动物分子标记基因进行序列分析,最终选择线粒体DNA(mtDNA)16s rRNA基因为目标基因,利用一对通用引物,在该引物扩增区间设计了4条特异性基因芯片检测探针及2条质控探针用于对牛、山羊、猪、鸡等4种动物源性成分进行检测。通过对PCR扩增体系及杂交体系的优化,该检测方法能实现对上述4种动物源性成分同时进行快速、准确地检测,具有很好的特异性,灵敏度均达到1pg,最终建立了这4种动物源性基因芯片检测方法。该基因芯片检测技术将为我国进出口饲料中的动物源性成分的鉴别提供新的检测方法和技术支持。

关键词：线粒体16s rRNA基因 DNA芯片动物源性

唇口目苔藓动物分子系统演化及其主要类群分歧时间的推测

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

科学通报 2005年第12期50卷 1205-1212页

作者：郝家胜李春香孙晓燕杨群中国科学院南京地质古生物研究所南京210008

对40种唇口目苔藓动物(包括新测的24种)线粒体16srRNA基因序列进行了比较分析,运用邻接法和最大简约法构建了系统发生树;同时基于适宜的谱系发生关系和确证的化石记录资料,计算了唇口目苔藓动物16srRNA基因的演化速率,并据此推测了唇口... 详细信息

对40种唇口目苔藓动物(包括新测的24种)线粒体16srRNA基因序列进行了比较分析,运用邻接法和最大简约法构建了系统发生树;同时基于适宜的谱系发生关系和确证的化石记录资料,计算了唇口目苔藓动物16srRNA基因的演化速率,并据此推测了唇口目2大主要类群(无囊类和狭义有囊类)的起源和分歧时间.结果显示,唇口目高级分类单元(超科及以上分类阶元)的系统发生大都和现今形态分类体系间存在明显的分歧;据估算,现生无囊类和狭义有囊类苔藓动物在约263Ma(中二叠纪,瓜德鲁普世)和183Ma(早侏罗纪)之前就已分化出来.

关键词：苔藓动物分歧时间唇口目系统演化推测类群 rRNA基因序列分子线粒体16s 系统发生树最大简约法比较分析记录资料发生关系分类体系分类单元早侏罗纪二叠纪狭义化石分化

16s rRNA基因序列变异与中国鮡科鱼类系统发育

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

科学通报 2004年第14期49卷 1371-1379页

作者：郭宪光张耀光何舜平陈宜瑜中国科学院水生生物研究所武汉430072 西南师范大学生命科学学院重庆400715

采用PCR技术获得了中国鮡科鱼类10属9种鰋鮡鱼类和6种非鰋鮡鱼类线粒体DNA 16s rRNA基因部分序列. 序列分析表明, 16s rRNA序列非配对区有A碱基偏倚性, 配对区有G碱基偏倚性. 在非配对区, 主要由于A→G转换引起转换大于颠换的偏倚, 且... 详细信息

采用PCR技术获得了中国鮡科鱼类10属9种鰋鮡鱼类和6种非鰋鮡鱼类线粒体DNA 16s rRNA基因部分序列. 序列分析表明, 16s rRNA序列非配对区有A碱基偏倚性, 配对区有G碱基偏倚性. 在非配对区, 主要由于A→G转换引起转换大于颠换的偏倚, 且平均替代率几乎是配对区的2倍. 配对区和非配对区均没有替代饱和现象. 采用最大似然法(ML)和Bayesian方法构建分子系统树, 结果表明, 鮡科是一个单系群, 由(黑鮡属(魾属, 纹胸鮡属))与(褶鮡属+ 鰋鮡鱼类)两支构成. 鰋鮡鱼类可能不是一个单系群, 分子数据不支持褶鮡属与鰋鮡鱼类构成姐妹群关系. 褶鮡属与凿齿鮡属可能构成姐妹群关系. 鮡属不是一个单系, 与石爬鮡属和拟鰋属构成单系群. 前臀鮡可能是中华鮡的同物异名, 石爬鮡属可能只有一个有效种, 即青石爬鮡.

关键词：鮡科鲲鮡鱼类线粒体16s rRNA基因系统发育基因变异鲇形目

饲料中狐狸、水貂、貉子和狗源性的五重实时荧光PCR检测方法的建立

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国生物工程杂志 2017年第12期37卷 67-76页

作者：刘艳艳李会荣胡悦范阳阳李祥明谭晴晴吴家强步迅山东省农业科学院生物技术研究中心济南250100 山东省饲畜牧兽医局饲料质量检验所济南250022 山东省农业科学院家禽所济南250100

为了快速鉴别饲料中的狐狸、水貂、貉子和狗源性成分,根据线粒体16s r DNA种间保守序列,设计合成针对狐狸、水貂、貉子和狗的特异性引物和探针,通过对荧光PCR反应体系和反应条件的优化筛选,建立了多重实时荧光PCR方法,在同一PCR反应体... 详细信息

为了快速鉴别饲料中的狐狸、水貂、貉子和狗源性成分,根据线粒体16s r DNA种间保守序列,设计合成针对狐狸、水貂、貉子和狗的特异性引物和探针,通过对荧光PCR反应体系和反应条件的优化筛选,建立了多重实时荧光PCR方法,在同一PCR反应体系中可以同时完成4种动物源性成分检测。通过对15种其他物种的源性成分的检测,结果表明所设计的引物和探针具有很好的物种特异性,且灵敏度高,狐狸、水貂、貉子和狗的DNA检出限为0.01ng。对40份样品检测,其中5份检测出貉子、狐狸和水貂源性成分。结果表明,该方法可以有效地鉴别出饲料中狐狸、水貂、貉子和狗源性成分,同时适用于相关动物产品中。

关键词：线粒体16s r DNA多重实时荧光PCR狐狸水貂貉子和狗动物源性成分

中国石爬鮡属鱼类的形态变异及物种有效性研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

水生生物学报 2004年第3期28卷 260-268页

作者：郭宪光张耀光何舜平中国科学院水生生物研究所武汉430072 西南师范大学生命科学学院重庆400715

石爬属鱼类的青石爬和黄石爬的物种界限一直不清楚。采用形态判别和线粒体 16srRNA基因序列分析相结合的方法 ,分别研究分析了青石爬和黄石爬的物种划分、地理分化及遗传多态性。结果表明 :(1)区别青石爬和黄石爬的重要... 详细信息

石爬属鱼类的青石爬和黄石爬的物种界限一直不清楚。采用形态判别和线粒体 16srRNA基因序列分析相结合的方法 ,分别研究分析了青石爬和黄石爬的物种划分、地理分化及遗传多态性。结果表明 :(1)区别青石爬和黄石爬的重要特征腹鳍起点至臀鳍起点的距离是否大于至鳃孔下角的距离 ,腹鳍相对位置 ,头部相对大小与上颌须的须状延长部分等相互之间有一定的相关性 ,但是在研究的样本中没有截然的界限 ,而是有较大的重叠 ,难以区分 ;(2 )从地埋分布看 ,金沙江不同支流的样本在上述特征上有一定的区别 ,但是没有发现青衣江的样本与其他支流的样本有截然的界限和明显的地理变化规律 ;(3) 5 4 8bp序列中 ,检测出 2个多态位点 ,多态位点的比例为 0 .36 5 % ;(4)青石爬和黄石爬间的遗传差异极小 ,平均遗传距离仅为 0 .0 75 % ;(5 )石爬属鱼类个体间也无明显差异 ,遗传距离为 0— 0 .381% ,平均为 0 .0 6 9%。因此石爬属鱼类划分为一个种更为客观。

关键词：中国石爬鮡属鱼类形态变异物种有效性线粒体16s rRNA 遗传距离鲇形目