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浙江省和江西省蔬菜病毒鉴定与变异研究

浙江省和江西省蔬菜病毒鉴定与变异研究

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作者：刘雪建浙江大学

学位级别：硕士

蔬菜病毒病已成为制约蔬菜产业发展的一个重要因素,然而目前对蔬菜病毒病的种类、发生分布、变异进化等缺乏系统的了解。鉴于蔬菜病毒病的严重危害,本论文对浙江省和江西省蔬菜病毒病的种类、发生分布及变异进化规律开展了系统研究,以... 详细信息

蔬菜病毒病已成为制约蔬菜产业发展的一个重要因素,然而目前对蔬菜病毒病的种类、发生分布、变异进化等缺乏系统的了解。鉴于蔬菜病毒病的严重危害,本论文对浙江省和江西省蔬菜病毒病的种类、发生分布及变异进化规律开展了系统研究,以期为蔬菜病毒病的防治提供依据。 2013-2014年,在浙江省和江西省分别采集蔬菜样品1816份和995份,涵盖茄科、葫芦科、豆科、十字花科等蔬菜。首先,利用黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus, CMV)番茄花叶病毒(Tomato mosaic virus, ToMV)、烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)、番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellow leaf curl virus, TYLCV)、番茄斑萎病毒(Tomato spotted wilt virus, TSWV)、芜菁花叶病毒(Turnip mosaic virus, TuMV)、黄瓜绿斑驳花叶病毒(Cucumber green mottle mosaic virus, CGMMV)、蚕豆萎蔫病毒(Broad bean wilt virus, BBWV)的单克隆抗体,运用班点杂交ELISA (Dot-ELISA)方法对所有蔬菜样品进行普查,初步明确这些常见病毒病在浙江省和江西省的发生分布和危害情况。小RNA深度测序技术是最近兴起的一种挖掘病毒的新方法,具有灵敏度高、不依赖于病毒序列等优点。我们对葫芦科、豆科、茄科等蔬菜进行8个混合样本的小RNA深度测序。测序结果表明,蔬菜上的病毒病种类非常丰富,包括西瓜花叶病毒(Watermelon mosaic virus, WMV)、小西葫芦黄花叶病毒(Zucchini yellow mosaic virus, ZYMV)、甘薯羽状斑驳病毒(Sweet potato feathery mottle virus, SPFMV)、甘薯G病毒(Sweet potato virus G, SPVG)、甘薯C病毒(Sweet potato virus C, SPVC)、甘薯潜隐病毒(Sweet potato latent virus, SPLV)、南方番茄病毒(Southern tomato virus, STV)、辣椒脉斑驳病毒(Pepper veinal mottle virus, PVMV)、红辣椒脉斑驳病毒(Chilli veinal mottle virus, Chi VMV).辣椒轻斑驳病毒(Pepper mild mottle virus, PMMoV)、辣椒斑驳病毒(Pepper mottle virus, PepMoV)、辣椒隐症病毒(Pepper cryptic virus, PCV)、紫荆黄环斑病毒(Redbud yellow ringspot virus, RYRV)、菜豆普通花叶病毒(Bean common mosaic virus, BCMV)甘薯杆状DNA病毒B (Sweetpotato badnavirus B, SPBV-B)、甘薯杆状DNA病毒A (Sweetpotato badnavirus A, SPBV-A)等等。利用PCR/RT-PCR对小RNA深度测序发现的病毒进行扩增和序列测定,明确了浙江省和江西省蔬菜病毒病的种类和发生分布。浙江省的蔬菜病毒病种类主要为CMV、TMV、ToMV、TLCV、CGMMV、WMV、ZYMV、TuMV、BBWV、 PepMoV、PVMV、STV、PMMoV和BCMV;江西省蔬菜病毒病种类与浙江省的类似,此外还包括PCV,不过没有检测到TYLCV的发生。其中,感染茄科的主要病毒是CMV、ToMV、TMV、TYLCV、BBWV、PepMoV、PVMV、ChiVMV、 STV和PMMoV,还检测到PCV、TMV、马铃薯X病毒(Potato virus X, PVX)和马铃薯Y病毒(Potato virus Y, PVY)。葫芦科蔬菜上的主要病毒病是CMV、 ***和CGMMV,此外还检测到番木瓜环斑病毒(Papaya ringspot virus, PRSV)、甜瓜黄斑病毒(Melon yellow spot virus, MYSV)和瓜类褪绿黄化病毒(Cucurbit chlorotic yellows virus, CCYV)。豆科蔬菜上的主要病毒病是CMV、 BBWV和BCMV,还检测到黑眼豇豆花叶病毒(Blackeye cowpea mosaic virus, B1CMV)、苎麻花叶病毒(Ramie mosaic virus, RaMoV)、花生条纹病毒(Peanut stripe virus, PStV)、大豆褪绿斑驳病毒(Soybean chlorotic mottle viru

关键词：蔬菜病毒病小RNA深度测序技术系统关系树 PepMoV分离物

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