检索结果-南通市图书馆

糖苷水解酶基因FvGH16-2参与拟轮枝镰孢菌生长发育及致病性

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

植物保护学报 2024年第2期51卷 342-351页

作者：任志国刘宁陈悦孙蔓莉曹志艳董金皋河北农业大学植物保护学院保定071000 河北农业大学河北省植物生理与分子病理学重点实验室华北作物改良与调控国家重点实验室保定071000 河北农业大学生命科学学院保定071000

为明确糖苷水解酶16(glycoside hydrolase,GH16)家族基因在拟轮枝镰孢菌Fusarium verticillioides生长发育和致病过程中的作用,利用生物信息学分析软件对其GH16家族成员进行鉴定,采用转录组分析及实时荧光定量PCR技术对GH16家族成员在... 详细信息

为明确糖苷水解酶16(glycoside hydrolase,GH16)家族基因在拟轮枝镰孢菌Fusarium verticillioides生长发育和致病过程中的作用,利用生物信息学分析软件对其GH16家族成员进行鉴定,采用转录组分析及实时荧光定量PCR技术对GH16家族成员在不同培养温度下的表达水平进行检测,并通过遗传转化法对家族成员FvGH16-2基因进行敲除及回补,分析其在拟轮枝镰孢菌生长发育及致病过程中的作用。结果显示,在拟轮枝镰孢菌基因组中共鉴定到23个GH16家族基因,其中FvCH16-2、FvCH16-4和FvCH16-12等多个上调表达基因与病菌的生长和抗逆性相关。敲除FvGH16-2基因导致拟轮枝镰孢菌的生长速率及产孢能力降低,细胞壁完整性受损,对H2O2更加敏感,同时对玉米籽粒和茎秆的致病力减弱。表明FvGH16-2基因在拟轮枝镰孢菌生长发育和致病过程中发挥着重要作用,是拟轮枝镰孢菌细胞壁完整性和致病性所必需的。

关键词：糖苷水解酶家族拟轮枝镰孢菌玉米病害基因表达功能分析

蜜环菌糖苷水解酶家族基因在菌索与菌丝间的差异表达分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

菌物学报 2021年第6期40卷 1369-1379页

作者：李兵刘柳单婷婷郭顺星中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所北京100193

蜜环菌是一种兼性腐生和寄生的真菌,通过降解伴栽基质并为药用植物(天麻)或菌物(猪苓)提供营养物质,而糖苷水解酶是这一过程的主要酶类。本研究从蜜环菌Armillaria mellea 541菌株转录数据库中共获得糖苷水解酶家族基因170个,分布于39... 详细信息

蜜环菌是一种兼性腐生和寄生的真菌,通过降解伴栽基质并为药用植物(天麻)或菌物(猪苓)提供营养物质,而糖苷水解酶是这一过程的主要酶类。本研究从蜜环菌Armillaria mellea 541菌株转录数据库中共获得糖苷水解酶家族基因170个,分布于39个亚家族。进一步分析发现,这些家族基因编码的糖苷水解酶家族蛋白(glycoside hydrolase family,GHF)结构域多达48种181个,以Aamy、Glycohydro、MelibiaseC、Nod B homology和PA14等结构域为主。对糖苷水解酶家族蛋白进行了系统的Gene Ontology(GO)功能注释和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)代谢通路分析,其功能以结合、水解和催化细胞壁成分为主。编码GHF3(A0A2H3D3T6)、GHF78(A0A2H3D8T6)、GHF51(A0A2H3E4X4)、GHF47(A0A2H3EK71)和GHF5(A0A2H3EBW7)等5个糖苷水解酶家族蛋白的基因在A. mellea541菌索与菌丝间差异表达,其结构域依次为PA14、Bacrhamnosid6H/C、Alpha-L-AFC、Glycohydro47和Glycohydro5,可能发挥结合碳水化合物和催化鼠李糖苷、阿拉伯呋喃糖苷、甘露糖残基和纤维素等水解的功能,这为研究蜜环菌与天麻或猪苓的相互作用提供了理论依据。

关键词：蜜环菌菌索糖苷水解酶家族糖苷水解酶结构域

糖苷水解酶第3家族β-葡萄糖苷酶的研究进展

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

食品工业科技 2017年第14期38卷 330-335页

作者：周林芳江波张涛李淑华江南大学食品科学与技术国家重点实验室江苏无锡214122 江苏工程职业技术学院江苏南通226007

β-葡萄糖苷酶属于糖苷水解酶家族,在食品、医药、生物质转化中有着重要的作用。本文主要对糖苷水解酶家族3的β-葡萄糖苷酶进行综述,主要包括理化性质、底物特异性、反应动力学、三维结构、催化残基和酶基因克隆表达等几个方面,为从基... 详细信息

β-葡萄糖苷酶属于糖苷水解酶家族,在食品、医药、生物质转化中有着重要的作用。本文主要对糖苷水解酶家族3的β-葡萄糖苷酶进行综述,主要包括理化性质、底物特异性、反应动力学、三维结构、催化残基和酶基因克隆表达等几个方面,为从基础领域研究该家族此酶的催化机理及表达调控机制提供参考。

关键词： β-葡萄糖苷酶糖苷水解酶家族三维结构催化残基克隆表达

糖苷水解酶GH12家族活性架构中关键氨基酸的功能分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

糖苷水解酶GH12家族活性架构中关键氨基酸的功能分析

作者：李单单山东大学

学位级别：硕士

以纤维素为主要成分的植物生物质是地球上最丰富的可再生资源,对木质纤维素的高效开发利用越来越受到人们的重视。目前,人们对大量的纤维素酶认识却存在不足,没有任何普遍性规律存在,利用生物信息学统计分析酶分子的序列、结构与功能之... 详细信息

以纤维素为主要成分的植物生物质是地球上最丰富的可再生资源,对木质纤维素的高效开发利用越来越受到人们的重视。目前,人们对大量的纤维素酶认识却存在不足,没有任何普遍性规律存在,利用生物信息学统计分析酶分子的序列、结构与功能之间的关系将有助于纤维素酶催化机制的研究,寻找其共性规律,从而奠定蛋白质理性设计的理论基础。本文利用结构生物信息学展开了对GH12家族糖苷水解酶的研究,分析蛋白质家族活性架构序列谱,并对关键氨基酸进行定点设计,以期进一步阐明酶分子结合机理与催化过程。本文的主要内容以及结果如下： 1.GH12家族糖苷水解酶活性架构序列谱的生成及关键氨基酸分析 GH12家族糖苷水解酶分布于真菌、细菌以及占菌中,构建进化树表明进化关系较远,其拓扑结构为p-果冻卷,活性架构是马鞍型的催化凹槽、有较强的负电性,催化残基为两个谷氨酸残基。研究发现该家族蛋白质结构保守,有较好的重叠性,基于结构比对生成了GH12家族糖苷水解酶活性架构序列潜,并检验了其有效性,构建了一种快速的定位功能氨丛酸残丛及其空间组合的变化规律的方法,具有家族特异性,大大缩小了序列空间搜索强度。基于该家族活性架构序列谱中25个氨基酸残基,筛选出其中10个较高保守性的关键氨基酸,推测其中的N95、D99、E116、M118、E200与催化有关,N20、W22与底物结合有关。 2.GH12家族糖苷水解酶的异源表达及重组酶性质的研究利用大肠杆菌与毕赤酵母两种表达体系对GH12家族的纤维素酶EGⅢ/Eg1A进行了异源表达,研究发现,大肠杆菌体系胞外未诱导出蛋白EGIII,周质空间只有极低的含量;通过大肠杆菌体系诱导的蛋白Eg1A分子量偏大,部分形成包涵体,酶活力降低10%;毕赤酵母表达体系则可以使两种蛋白分泌性表达,酶活力接近于本源表达。实验测定表明,Eg1A、EGⅢ对CMC反应的最适pH分别为3.9和5.0,两者最适温度都为50。C。因此,毕赤酵母表达体系更适合于GH12家族纤维素酶的表达,为后续定点突变研究奠定了技术平台。 3.GH12家族糖苷水解酶活性架构中关键氨基酸的丙氨酸筛选与性质分析以GH12家族纤维素酶EGIII为代表,对活性架构序列谱中部分关键氨基酸位点N20、Y60、D99、M118以及P129进行丙氨酸筛选,研究发现这些位点突变后均造成内切纤维素酶活的降低,可见,这些位点在GH12家族糖苷水解酶降解纤维素过程中发挥着重要作用;同时不同突变体蛋白造成不同程度的酶活损失,也说明各氨基酸残基在酶的活性架构执行不同的功能。由于这些关键氨基酸都位于凹槽内侧且与糖链的一侧发生相互作用,可以识别纤维素与木葡聚糖共同的局部结构,突变体蛋白试验表明两种底物的酶活有相同的变化趋势,验证了这些关键氨基酸的空间组合应是其识别不同底物共有的结构基础。4.GH12家族糖苷水解酶活性架构中决定多功能关键氨基酸的功能分析氨基酸残基N20,Y60,D99丙氨酸筛选时酶活降低较为明显,D99与亲核基团E116形成氢键,突变为D99A、D99E与D99N,分析表明突变体蛋白均丧失了相关水解活性,证明GH12家族纤维素酶的催化机制应为催化三联体。突变体蛋白Y60A基本完全丧失相关的水解酶活,但Y60F却基本维持原酶活,说明酪氨酸残基发挥作用的是苯酚环,根据二面角推测此位点可能对于糖链在酶蛋白催化孔道中维持正确构象与走向发挥重要作用。N20与纤维素链-2位糖环C2位上的羟基形成氢键,对于结合底物起着关键作用,N20D其酶解产物谱未变化,但酶活力降低48%,这种变化应为氢键结合力减弱导致;N20A酶解后的产物谱没有单糖产生,寡糖含量升高530%,导致酶功能由EC3.***.1.74向EC3.***.1.4的快速演变,具有商业价值。

关键词：糖苷水解酶家族纤维素酶结构生物信息学活性架构功能分析

右旋糖酐-α-1,6键水解酶的家族、结构及其应用

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

中国生物化学与分子生物学报 2012年第11期28卷 989-995页

作者：焦豫良王淑军吕明生淮海工学院海洋学院江苏连云港222005

右旋糖酐(dextran)水解酶种类繁多,其中右旋糖酐-α-1,6键水解酶(D-α-1,6 H)是主要的水解酶类.该类酶包括右旋糖酐酶(EC 3.***.1.11)、葡萄糖右旋糖酐酶(EC 3.***.1.70)、异麦芽糖右旋糖酐酶(EC 3.***.1.94)等,分属不同糖苷水解酶家族.D-α-1... 详细信息

右旋糖酐(dextran)水解酶种类繁多,其中右旋糖酐-α-1,6键水解酶(D-α-1,6 H)是主要的水解酶类.该类酶包括右旋糖酐酶(EC 3.***.1.11)、葡萄糖右旋糖酐酶(EC 3.***.1.70)、异麦芽糖右旋糖酐酶(EC 3.***.1.94)等,分属不同糖苷水解酶家族.D-α-1,6 H的结构和催化方式多样,分类和进化关系复杂,是糖苷水解酶催化机制研究和酶蛋白分子进化研究的好材料.D-α-1,6H及该类酶的催化产物在工业和医学中均有重要而广泛的应用.近年来对D-α-1,6H的理论和应用研究逐渐增加,但仍缺乏深入的系统性研究.本文对D-α-1,6H的家族、结构和功能进行分析,并对其在工业和医学中的最新应用研究作以总结.

关键词：右旋糖酐右旋糖酐-α-1,6键水解酶(D-α-1,6H) 糖苷水解酶家族应用研究

纤维素酶家族及其催化结构域分子改造的新进展

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

生物工程学报 2013年第4期29卷 422-433页

作者：张小梅李单单王禄山赵越陈冠军山东大学生命科学学院微生物技术国家重点实验室山东济南250100

纤维素酶的分子改造是其催化性能改进及催化效率提升的重要手段。近年来,组学技术与结构测定技术的迅速发展,人们已建立了包括糖苷水解酶(Glycoside hydrolase,GH)在内的碳水化合物活性酶组分数据库。通过对同一蛋白家族进行序列比对、... 详细信息

纤维素酶的分子改造是其催化性能改进及催化效率提升的重要手段。近年来,组学技术与结构测定技术的迅速发展,人们已建立了包括糖苷水解酶(Glycoside hydrolase,GH)在内的碳水化合物活性酶组分数据库。通过对同一蛋白家族进行序列比对、分子进化分析与祖先基因重构,以结构模建分析为指导的纤维素酶分子改造,可以明显缩小序列或结构的搜索空间,加快酶分子改造的速度,增大理性设计成功的概率;同时针对催化中心活性架构的分析可以进一步阐明纤维素酶的催化机理与酶分子持续性降解机制。文中主要对纤维素酶家族及其催化结构域的分子改造取得的最新进展作了综述。在后基因组时代基于蛋白质家族中的海量数据分析,以其保守结构信息为指导的理性设计,将会成为纤维素酶分子改造的重要方向,从而推动生物质转化工艺的快速发展。

关键词：纤维素酶糖苷水解酶家族结构生物信息学分子改造理性设计

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

β-半乳糖苷酶的研究现状与进展

食品与生物技术学报 2018年第4期37卷 337-343页

作者：董艺凝陈海琴张灏陈卫滁州学院生物与食品工程学院安徽滁州239000 江南大学食品学院江苏无锡214122

β-半乳糖苷酶是一种重要的食用生物催化剂,具有催化β-1,4糖苷键水解和转糖苷作用,并被广泛应用于乳糖水解及低聚半乳糖合成。作为糖苷水解酶家族的重要成员,β-半乳糖苷酶在理论与应用方面均积累了丰富的研究成果。作者从酶的家族分... 详细信息

β-半乳糖苷酶是一种重要的食用生物催化剂,具有催化β-1,4糖苷键水解和转糖苷作用,并被广泛应用于乳糖水解及低聚半乳糖合成。作为糖苷水解酶家族的重要成员,β-半乳糖苷酶在理论与应用方面均积累了丰富的研究成果。作者从酶的家族分布、催化机制形成、分子结构分析及特殊酶学性质发掘等方面对β-半乳糖苷酶的研究现状进行综述,以期为β-半乳糖苷酶催化调控的深入探索与应用开发提供参考。

关键词： β-半乳糖苷酶糖苷水解酶家族催化机制结构研究