检索结果-南通市图书馆

弓形虫毒力效应因子ROP18竞争性抑制剂的筛选及亲和活性分析

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中国病原生物学杂志 2019年第3期14卷 298-303,310页

作者：邱潇程允堂王利磊赵桂华姚营营徐超孙慧刘功振肖婷朱嵩魏庆宽黄炳成闫歌尹昆山东省医学科学院山东省寄生虫病防治研究所山东济宁272033 济南大学山东省医学科学院医学与生命科学学院济宁市第一人民医院济宁市疾病预防控制中心

目的采用药物靶标虚拟筛选技术筛选靶向弓形虫毒性因子ROP18的小分子竞争性抑制剂,并对中靶小分子进行活性分析。方法通过MOE软件的Structure Prepare完成ROP18三维晶体结构的结构准备;以ATP结合口袋作为筛选起点,分别参考EHT药效团注... 详细信息

目的采用药物靶标虚拟筛选技术筛选靶向弓形虫毒性因子ROP18的小分子竞争性抑制剂,并对中靶小分子进行活性分析。方法通过MOE软件的Structure Prepare完成ROP18三维晶体结构的结构准备;以ATP结合口袋作为筛选起点,分别参考EHT药效团注释及构建方法,以及TypeⅠ激酶抑制剂药效团特征构建靶向天然配体口袋的药效团;通过Pharmacophore Search导入包含202 919个化合物优势构象的SPECS数据库,通过EHT药效团注释方法进行小分子相似性筛选;筛选的小分子经分子对接和打分函数排序后,对排名前100的分子构象进行SAR分析。结果构建的药效团模型具有4个典型的TypeⅠ激酶抑制剂特征,保证了筛选的多样性和互作特异性;在SPECS数据库中共计通过了1 314个符合该模型的小分子,最终选取了25种活性较高的小分子。这些小分子具有2种母环核心Scaffold骨架聚类,分别命名为ScaffoldⅠ类及ScaffoldⅡ类。另有13种Scaffold各异的化合物类型。结论成功构建了靶向ROP18的ATP-结合口袋的药效团模型,筛选得到25种代表性小分子,形成2种Scaffold聚类及13种多样性骨架结构,为开发新型抗弓形虫病药物先导物奠定了基础。

关键词：虚拟筛选药效团模型竞争性抑制剂棒状体蛋白激酶18 弓形虫

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酶竞争性抑制剂对固定化青霉素酰化酶的影响

中国医药工业杂志 2007年第11期38卷 768-771页

作者：王卫黎继烈曾柏全吴耀辉中南林业科技大学生命科学学院生物工程教研室湖南长沙410004

利用酶竞争性抑制剂与酶活性中心具有特异性亲和作用,将青霉素酰化酶和一定浓度苯乙酸混合,投入表面修饰环氧基团的磁性微球进行酶固定化。结果表明,在碱性缓冲液系统中,磁性和微带负电荷;加入苯乙酸后,固定化酶活力比对照组提高了136%... 详细信息

利用酶竞争性抑制剂与酶活性中心具有特异性亲和作用,将青霉素酰化酶和一定浓度苯乙酸混合,投入表面修饰环氧基团的磁性微球进行酶固定化。结果表明,在碱性缓冲液系统中,磁性和微带负电荷;加入苯乙酸后,固定化酶活力比对照组提高了136%。溶液酶K_m为1.188×10^(-5)mol/L,固定化酶K’_m为5.879×10^(-4)mol,L,苯乙酸竞争性K_1为2.685×10^(-4)mol/L。

关键词：青霉素酰化酶竞争性抑制剂环氧化磁性微球活力

紫杉烷14β-羟化酶活性位点预测及其潜在竞争性抑制剂研究

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化学研究与应用 2021年第9期33卷 1651-1659页

作者：卢轩章煜唐川唐小渊冯宝民秦海宏大连大学生命科学与技术学院辽宁大连116622 大连大学护理学院辽宁大连116622

紫杉烷14β-羟化酶(T14H)是催化产生紫杉烷支路化合物的关键酶。抑制T14H活性可以促进前体流向紫杉醇代谢途径,从而提高紫杉醇含量。本文根据T14H的一级结构,构建T14H蛋白模型,选取最优蛋白模型进行优化并评估。随后,对模型潜在活性位... 详细信息

紫杉烷14β-羟化酶(T14H)是催化产生紫杉烷支路化合物的关键酶。抑制T14H活性可以促进前体流向紫杉醇代谢途径,从而提高紫杉醇含量。本文根据T14H的一级结构,构建T14H蛋白模型,选取最优蛋白模型进行优化并评估。随后,对模型潜在活性位点进行分析,从19个活性位点中选取较合理的5个活性位点进行下一步的分子对接研究。将150个植物内生菌次级代谢产物及4种羟化酶抑制剂一次对接于5个活性口袋,对比分析互作模式与结合分数进行筛选。筛选出可作为T14H抑制剂的先导化合物,对开发研究T14H的竞争性抑制剂有指导意义。

关键词：紫杉烷 T14H 活性位点同源建模分子对接竞争性抑制剂

中华人民共和国农业农村部公告(第801号)

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中华人民共和国农业农村部公报 2024年第7期 73-75页

作者：无农业农村部

根据《兽药管理条例》规定,农业农村部组织制定了清瘟败毒片中非法添加三磷酸核苷竞争性抑制剂(GS-441524)检查方法,现予发布,自发布之日起执行。农业农村部将加强相关兽药产品监督抽检力度,对发现的非法添加行为,按照兽药严重违法行为... 详细信息

根据《兽药管理条例》规定,农业农村部组织制定了清瘟败毒片中非法添加三磷酸核苷竞争性抑制剂(GS-441524)检查方法,现予发布,自发布之日起执行。农业农村部将加强相关兽药产品监督抽检力度,对发现的非法添加行为,按照兽药严重违法行为从重处罚情形严厉查处。

关键词：严重违法行为从重处罚兽药产品非法添加竞争性抑制剂监督抽检

基于多光谱技术和计算机模拟研究牡荆素抑制α-淀粉酶的分子机制

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南昌大学学报（理科版） 2022年第6期46卷 611-620页

作者：张国文吴健妹倪孟婷南昌大学食品科学与技术国家重点实验室江西南昌330047

本文采用多种光谱学方法结合计算机模拟手段,通过研究牡荆素对α-淀粉酶的抑制作用、相互作用的结合特性和空间结合构象及其诱导酶分子结构的变化对酶催化底物的影响,进而阐释牡荆素抑制α-淀粉酶的分子机制。结果表明,牡荆素以可逆性... 详细信息

本文采用多种光谱学方法结合计算机模拟手段,通过研究牡荆素对α-淀粉酶的抑制作用、相互作用的结合特性和空间结合构象及其诱导酶分子结构的变化对酶催化底物的影响,进而阐释牡荆素抑制α-淀粉酶的分子机制。结果表明,牡荆素以可逆性竞争的方式抑制α-淀粉酶的活性,其半抑制浓度(IC50值)为2.25×10-3mol·L-1,抑制常数为(2.28±0.13)×10-3mol·L-1。牡荆素也能够与淀粉结合来减少淀粉的消化分解为葡萄糖。牡荆素通过单一静态方式猝灭α-淀粉酶的内源荧光,其中荧光基团Trp残基的贡献大于Tyr残基。牡荆素结合在α-淀粉酶的一个位点处,结合常数Ka为103数量级,主要依靠疏水力驱动,两者结合作用使α-淀粉酶的α-螺旋含量降低,β-折叠和β-转角含量增加,表面疏水性减小,酶结构趋于松散。分子模拟显示,牡荆素能够对接于α-淀粉酶的活性空腔,并与周围的氨基酸残基Asp197、Glu233、Ile235、His299、Asp300与His305等发生相互作用。推测牡荆素通过与α-淀粉酶结合,改变了酶分子的构象,并且与底物竞争α-淀粉酶的活性位点,而阻碍了底物被酶分解,进而抑制了α-淀粉酶的活性。

关键词： α-淀粉酶牡荆素竞争性抑制剂抑制机制分子模拟

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高中生物学教学中关于酶的抑制剂的认识误区

中学生物教学 2022年第32期 46-48页

作者：戴渝洋桑春花河北省定州市第二中学 073000 河北省唐山市第二中学 063001

在高中生物学教学中,针对有关酶抑制剂的认识误区,以杨荣武《生物化学原理》为依据,比较和区分竞争性抑制剂和非竞争性抑制剂,帮助一线教师走出教学误区。

关键词：酶的抑制剂竞争性抑制剂非竞争性抑制剂

Imatinib耐药的胃肠道间质瘤细胞系的建立及其生物学特征鉴定

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中华实验外科杂志 2012年第3期29卷 550-551页

作者：郑松王昊冷建杭童文娟陶德友潘月龙杭州市第一人民医院杭州市肿瘤医院肿瘤内科 310006 杭州市第一人民医院中心实验室杭州市第一人民医院检验科浙江省台州医院肿瘤外科

胃肠道间质肿瘤（GIST）是位于胃肠道或腹腔内的表达KIT（CDll7）蛋白的间叶源性肿瘤，大多数存在KIT和血小板源性生长因子受体α-多肽（PDGFRA）基因的突变。伊马替尼（Imatinib）是一种口服的ATP的竞争性抑制剂，能竞争性地结合于KIT... 详细信息

胃肠道间质肿瘤（GIST）是位于胃肠道或腹腔内的表达KIT（CDll7）蛋白的间叶源性肿瘤，大多数存在KIT和血小板源性生长因子受体α-多肽（PDGFRA）基因的突变。伊马替尼（Imatinib）是一种口服的ATP的竞争性抑制剂，能竞争性地结合于KIT酪氨酸激酶功能区的ATP结合位点，从而阻断了失控的信号传导通路，因此目前已成为治疗GIsT的标准药物。

关键词：胃肠道间质瘤 Imatinib 生物学特征血小板源性生长因子受体α 细胞系竞争性抑制剂胃肠道间质肿瘤鉴定

虚拟筛选竞争性抑制NDRG3与L-Lactate结合的小分子研究

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华南师范大学学报（自然科学版） 2018年第3期50卷 58-64页

作者：曹洪玉吴艳华周兴智郑学仿蒋革大连大学生命科学与技术学院大连116622

竞争性抑制NDRG3(N-myc Downstream Regulated Gene 3)蛋白与L-Lactate结合可有效阻遏NDRG3介导的低氧反应.文中通过同源模建技术构建NDRG3蛋白的三维结构,并将L-Lactate对接到NDRG3蛋白的潜在活性位点中,发现L-Lactate主要通过与Asn133、Ala162、His163、His164、Ser235、Pro236及Ala237等氨基酸相互作用结合于NDRG3.对近3 000个化合物进行虚拟筛选,选择4种竞争性抑制最强的化合物作为参考分子分析相互作用关系.结果发现:部分化合物和不同氨基酸能够通过不同的作用力与NDRG3蛋白结合,占据NDRG3蛋白的活性位点,从而竞争性抑制L-Lactate与NDRG3蛋白结合.例如,它们能够与Lys139、Asp143、His163、Arg203产生静电作用;它们与His163形成π-π堆积作用;它们与Phe165、Ala237等产生疏水作用;它们与Asn133、Asp135、Gly140、Arg203、Ser235、Ala237等形成氢键作用.以上数据表明:这些化合物可能成为阻遏NDRG3介导的低氧反应及靶向治疗低氧诱导疾病的候选药物.

关键词： NDRG3 L-Lactate 竞争性抑制剂同源模建分子对接虚拟筛选

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DPP Ⅳ抑制剂筛选模型的优化与应用

DPP Ⅳ抑制剂筛选模型的优化与应用

作者：江慧贤南方医科大学

学位级别：硕士

研究背景和目的糖尿病（diabetes mellitus, DM）由多种病因引起的以慢性高血糖为特征的代谢紊乱,伴有因胰岛素分泌和/或作用缺陷引起的糖、脂肪和蛋白质代谢异常。该病在临床上的主要病征为“三多一少”,即多饮、多食、多尿、体重... 详细信息

研究背景和目的糖尿病（diabetes mellitus, DM）由多种病因引起的以慢性高血糖为特征的代谢紊乱,伴有因胰岛素分泌和/或作用缺陷引起的糖、脂肪和蛋白质代谢异常。该病在临床上的主要病征为“三多一少”,即多饮、多食、多尿、体重减轻。近年来,随着我国社会经济条件的改善,人民生活水平的不断提高,饮食结构的改变,劳动强度的减低,糖尿病患病率在逐渐上升,糖尿病对我国人民健康的影响日趋严重,2009年卫生部与世界糖尿病基金会联合主办的“糖尿病国际论坛”上,与会各方指出,中国糖尿病患者仅次于印度,是世界第二位糖尿病患者的人数已居世界第二位,增长速度惊人。 Ⅱ型糖尿病是一种胰岛素抵抗伴B细胞分泌胰岛素不足而导致的,是由基因和环境因素相互影响引起的复杂、多基因性慢性高血糖疾病。据估计,Ⅱ型糖尿病的遗传率达70%-80%。遗传因素在Ⅱ型糖尿病中起主要的发病机理。而且,不同种群的发病率不尽相同,从白种人的5%到亚洲人的50%。 Ⅱ型糖尿病多在35-40岁之后发病,占糖尿病患者90%以上。可以通过某些口服药物刺激体内胰岛素的分泌;治疗的短期目标是控制血糖,长期目标是预防相关并发症的发生与发展。其基础治疗方案主要由运动和饮食构成,但是药物治疗和血糖监测往往也非常关键。常规治疗Ⅱ型糖尿病口服药大致分为磺酰脲类、双胍类、噻唑烷二酮类（胰岛素增敏剂）、α-葡萄糖苷酶抑制剂和非磺脲类胰岛素促泌剂。近年来,随着分子生物学的进展,对于糖尿病的发病机制有更深一步的了解,并根据不同的发病机制研发出不同作用机理的新型抗糖尿病药,为临床治疗糖尿病提供多种途径,二肽基肽酶Ⅳ（Dipeptidyl Peptidase Ⅳ, DPP Ⅳ）抑制剂就是其中的一种。二肽基肽酶-Ⅳ/CD26（DPP IV/CD26;EC3.***.14.5）属于脯氨酰寡肽酶家族中的丝氨酸蛋白酶,当氮末端第二位为脯氨酸或者丙氨酸时,DPP Ⅳ可以在该部位劈开蛋白或多肽。 20世纪以来,随着肠促胰岛素（incretin）概念的提出和研究的深入,该领域的研究越来越受到人们的重视;因其具有保护和促进胰岛β细胞增殖,促进胰岛素分泌同时抑制胰高血糖素分泌等作用而备受研究者青睐。但肠促胰岛素主要成分胰高血糖素样肽-1（glucagon-like peptide-1, GLP-1）和葡萄糖依赖性促胰岛素肽（glucose-dependent insulinotropic peptide, GIP）在体内易受DPP Ⅳ降解而半衰期很短暂,无法起到生理活性作用。对DPP Ⅳ抑制剂的研究成为糖尿病治疗研究的一个新热点,并且取得了显著的成效,以磷酸西他列汀（sitagliptin phosphate, Januvia）为代表的不同类型的小分子DPP Ⅳ抑制剂不断涌现,成为极具前景的Ⅱ型糖尿病新治疗策略。目前,国外对DPP Ⅳ抑制剂的研究较为深入,主要通过Caco-2细胞或动物肝肾组织细胞提取液获取DPP Ⅳ,与特异性底物甘氨酰-脯氨酰-对硝基苯胺（Gly-Pro-pNA）反应的方式来构建抑制剂筛选模型,而国内对DPP Ⅳ抑制剂体外筛选模型的研究匮乏。本研究旨在建立一个简便,快捷,高效的DPP Ⅳ抑制剂的体外筛选模型,并通过模型快速寻找该类抑制药物。本实验建立的筛选模型是对本实验室已有的DPP Ⅳ抑制剂筛选模型的细胞破碎液、底物浓度、pH,孵育时间三个条件进行优化。实验采用L9（34）正交实验,以酶比活力做判断的指标,考察以上三个条件对模型的影响,以期达到减少能耗、更快捷地进行抑制剂的筛选,为以后对批量化合物的DPP IV抑制活性进行高通量筛选提供依据。以高浓度的sitagliptin为阳性对照,纯水代替sitagliptin为阴性对照测定Z’因子、信噪比S/N,评价筛选模型的优劣;设置液氮、-20℃、4℃、25℃、37℃作为放置温度分别保存不同时间,检测细胞破碎液中DPPIV的活性;从1%-30%梯度设置7个体积浓度的DMSO.乙醇、乙酸乙酯,考查常用的有机溶媒对DPPIV活性的影响;利用实验测出的DPP IV动力学参数Km,Vmax的判断化合物JD-1,JD-2抑制的性质;使用本筛选模型筛选一系列合成的化合物对DPP IV抑制的活性。方法 ***-2细胞中DPP IV的提取、蛋白质含量测定于含10%胎牛血清,1%非必需氨基酸,1%谷氨酰胺的DMEM高糖培养基培养Caco-2细胞。反复冻融方法破碎细胞,取上清液,-70℃保存。考马斯亮蓝G-250法测细胞破碎液的蛋白质量。共测10管,1.00mg-mL-1BSA为标准蛋白,分别加入不同体积的纯水、考马斯亮蓝染料试剂和细胞破碎液。用标准蛋白浓度（mg·mL-1）为横坐标,用OD

关键词： DPPⅣ 筛选模型正交实验 Z’因子信噪比 Km 竞争性抑制剂