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“磨玻璃影”特征的早期肺腺癌中MPP成分的突变特征分析及ZNF469基因的探索

中国肺癌杂志 2023年第12期26卷 889-900页

作者：许有涛孙钦泓王思炜朱鸿宇董国璋孟凡尘夏志军游静孔祥茹吴金涛陈鹏袁方慰余新宇季金芾李知桐朱鹏程孙宇翔刘桐言尹荣许林南京医科大学附属肿瘤医院江苏省肿瘤医院胸外科江苏省肿瘤防治研究所江苏省恶性肿瘤分子生物学及转化医学重点实验室南京210009

背景与目的目前,肺癌依然是我国发病率和死亡率最高的恶性肿瘤。而在早期肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)中,微乳头(micropapillary,MPP)成分尤其常见,且通常表现出高侵袭性,其与早期转移、淋巴浸润的风险以及患者的5年生存率显著相... 详细信息

背景与目的目前,肺癌依然是我国发病率和死亡率最高的恶性肿瘤。而在早期肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)中,微乳头(micropapillary,MPP)成分尤其常见,且通常表现出高侵袭性,其与早期转移、淋巴浸润的风险以及患者的5年生存率显著相关。本研究旨在探究以磨玻璃影(ground-glass opacities,GGOs)为特征的早期LUAD中MPP成分和非MPP成分的异同,寻找MPP成分所特有的突变特征,并分析锌指蛋白家族的ZNF469基因与早期LUAD预后以及免疫浸润的关系。方法收集31例LUAD恶性肺结节,采用显微解剖法将其分为成对的MPP和非MPP成分。对早期恶性肺结节组分进行全外显子组测序(whole-exome sequencing,WES),利用maftools、非负矩阵分解(Nonnegative Matrix Factorization,NMF)法、Sigminer等方法进行突变特征分析,以揭示侵袭性LUAD中MPP组分相比于其他肿瘤组织所特有的基因组突变特征。利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)的LUAD数据库中ZNF469的表达情况,探讨其与肺癌预后的关系;利用GeneMANIA数据库以及基因本体(Gene Ontology,GO)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析探索LUAD中与ZNF469相关基因的互作网络及信号通路;利用TIMER和TISIDB数据库分析ZNF469表达与LUAD中免疫细胞浸润水平的相关性。结果MPP成分具有较多的基因组变异,相比于非MPP成分的肿瘤组织,癌症体细胞突变目录(Catalogue of Somatic Mutations in Cancer,COSMIC)的13号突变特征(胞苷脱氨酶家族,APOBEC)是MPP成分所特有的,这提示其参与了MPP成分对LUAD早期侵袭过程的促进作用;并且APOBEC特征高的MPP样本具有更高的肿瘤突变负荷(tumor mutational burden,TMB),提示这些患者更能从免疫治疗中获益。LUAD中突变ZNF469的表达高于正常组织,与LUAD患者的不良预后有关。基因互作网络分析以及GO和KEGG富集分析发现,COL6A1、COL1A1、COL1A2、TGFB2、MMP2、COL8A2、C2CD4C等与ZNF469具有相互作用,且主要与编码胶原蛋白、参与细胞外基质构成有关。ZNF469表达与肿瘤的免疫浸润呈正相关。结论本研究揭示了中国人群侵袭性LUAD中MPP成分的特有突变特征,并发现突变ZNF469的高表达影响LUAD预后与免疫浸润,推测ZNF469可作为LUAD潜在的诊断及预后生物标志物。

关键词：肺肿瘤磨玻璃影微乳头成分突变特征分析 ZNF469基因

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基于M-K方法的大凌河中游降水量时空演变及突变特征分析

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水利技术监督 2017年第1期25卷 130-133页

作者：景淑娟徐世民辽宁省辽阳水文局辽宁辽阳1110101 辽宁省阜新水文局辽宁阜新118000

以大凌河中游大城子水文站以上为研究区域,结合区域内1955~2014年近60年实测降水量数据,应用M-K方法分析大凌河中游降水量时空演变以及降水突变特征。并在此基础上定量分析降水量和地下水埋深之间的关系。研究结果表明:近60以来大凌河... 详细信息

以大凌河中游大城子水文站以上为研究区域,结合区域内1955~2014年近60年实测降水量数据,应用M-K方法分析大凌河中游降水量时空演变以及降水突变特征。并在此基础上定量分析降水量和地下水埋深之间的关系。研究结果表明:近60以来大凌河中游降水量增长趋势较弱,呈现5~10年的变化周期,不同季节降水量突变年份呈现个异性变化;从20世纪90年代到2000年后降水空间呈现由北向南逐渐递增的趋势,增长幅度较大;降水量和区域地下水埋深呈现较好的线性关系,相关系数达到0.7167。研究成果对于区域水资源变化评估提供参考价值。

关键词： M-K方法降水量时空演变分析突变特征分析大凌河中游

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大凌河下游近55年水沙演变趋势及突变特征分析

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水利技术监督 2018年第5期26卷 161-164页

作者：贾玉娟辽宁省水文局辽宁沈阳110003

文章采用显著突变检验方法对大凌河下游近55年的水沙演变进行趋势分析。研究结果表明:从1961—2016年大凌河下游径流量和输沙量总体呈现显著下降趋势,M-K统计值通过95%的显著性检验,20世纪80年代大凌河下游的水沙呈现一定的上升趋势;除... 详细信息

文章采用显著突变检验方法对大凌河下游近55年的水沙演变进行趋势分析。研究结果表明:从1961—2016年大凌河下游径流量和输沙量总体呈现显著下降趋势,M-K统计值通过95%的显著性检验,20世纪80年代大凌河下游的水沙呈现一定的上升趋势;除春季外,其他季节大凌河下游水沙相关系数在0.6253~0.797之间,属于高度相关;大凌河下游径流突变年份出现在1985年,而输沙量的突变年份出现在1994年;人类活动对汛期水沙累积关系影响较为明显,非汛期影响较弱。

关键词：显著突变检验方法趋势演变突变特征分析水沙关系水沙累积

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