检索结果-南通市图书馆

检索条件"主题词=稀疏矩阵插补"

共 1 条记录，以下是1-10 订阅

全选清除本页清除全部题录导出标记到"检索档案"

详细简洁

排序：

基于稀疏矩阵恢复的scRNA-seq插补方法研究

基于稀疏矩阵恢复的scRNA-seq插补方法研究

引用

作者：刘晓红北京化工大学

学位级别：硕士

单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)技术是一种在单个细胞层面对RNA进行测序并定量基因表达谱的高通量测序技术。scRNA-seq技术在解析单个细胞基因表达、揭示细胞间异质性以及鉴定细胞亚群方面具有显著优势,并且在健... 详细信息

单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)技术是一种在单个细胞层面对RNA进行测序并定量基因表达谱的高通量测序技术。scRNA-seq技术在解析单个细胞基因表达、揭示细胞间异质性以及鉴定细胞亚群方面具有显著优势,并且在健康诊断、病情监测和疾病治疗的研究中发挥着重要作用。然而,由于技术原因,scRNA-seq数据经常存在大量缺失(dropout)现象,即零值或接近零值,给下游分析带来重大挑战。为此,本文提出一种基于增广拉格朗日乘子法的scRNA-seq数据插补方法,即scIALM。本文主要研究内容如下:(1)针对scRNA-seq数据插补问题的压缩感知理论应用可行性分析。针对scRNA-seq数据表达矩阵,将一维信号的稀疏性概念拓展为矩阵空间的低秩性,即矩阵的奇异值组成的向量是稀疏的。将压缩感知理论拓展为矩阵填充理论,使得采用压缩感知理论进行scRNA-seq缺失数据恢复具有可行性。(2)提出一种基于非精确的增广拉格朗日乘子法的插补算法,用于估算scRNA-seq数据表达矩阵的缺失值。将scRNA-seq表达矩阵插补问题建模为最小化矩阵秩的问题。首先,将非凸的优化问题转化为凸问题,目的是能够求得全局最优解。然后,利用增广拉格朗日乘子法,将带有等式约束的优化问题转化为无约束的优化问题进行求解,以简化求解过程,提高效率。(3)通过实验验证scIALM方法的有效性。在四个真实数据集(PBMC、Klein、Chen和Campbell)和三个模拟数据集上,将scIALM方法与其他六种方法进行了实验比较。实验结果显示,在插补效果方面,scIALM方法优于其他方法,在均方误差(MSE)、平均绝对误差(MAE)、皮尔逊相关系数(PCC)和余弦相似度(CS)指标上均表现出色。特别是在鲁棒性方面,scIALM方法明显优于其他六种方法,即使在高达50%的dropout噪声下,scIALM方法仍能维持有效性,并且随着噪声水平的不断增加,其性能下降幅度最小,显示出极高的稳定性。

关键词：单细胞RNA测序增广拉格朗日乘子法稀疏矩阵插补 dropout插补

来源：

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

全选清除本页清除全部题录导出标记到“检索档案”

共1页 << < 1 > >>

回到顶部

执行限定条件

欢迎您,

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

欢迎您,

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：