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生物多样性 2016年第9期24卷 1068-1076页

作者：杨顺孙微刘杏忠向梅春中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室北京100101 中国科学院大学北京100049

石生真菌是一类生长在裸露岩石上形成紧凑暗色菌落的特殊生命,在自然界未发现其有性生殖结构,它们具有丰富的物种多样性。石生真菌是地球上最具耐受力的一种真核生命,具有独特的适应性,并进化出各种适应机制以占据严酷的生态位,它们在... 详细信息

石生真菌是一类生长在裸露岩石上形成紧凑暗色菌落的特殊生命,在自然界未发现其有性生殖结构,它们具有丰富的物种多样性。石生真菌是地球上最具耐受力的一种真核生命,具有独特的适应性,并进化出各种适应机制以占据严酷的生态位,它们在细胞结构、代谢方式、抗逆机制等方面具有特殊性。尽管石生真菌很常见,但由于其体积小、生长缓慢并且缺乏明显的形态特征而常常被人们忽视。本文在介绍石生真菌的多样性、研究方法和研究历史的基础上,重点介绍石生真菌的逆境耐受性和抗逆机制以及石生真菌的应用研究。以期能引起科学工作者对这类特殊生境里的真菌研究的重视,更好地理解这类真菌在地球上的重要作用。

关键词：石生真菌多样性抗逆性文物保护天体生物学

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石林石漠化地区可培养石生真菌多样性研究

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西南农业学报 2019年第6期32卷 1397-1403页

作者：陈晓溪熊忠平李选文聂中良张珊凌溪熊智西南林业大学生命科学学院

【目的】为开发利用石林石漠化地区石生真菌资源、探索石生真菌对碳酸盐岩风化及矿化作用提供理论基础。【方法】实验采用PDA和MEA培养基对采集自石林石漠化地区的40份岩石样品进行石生真菌的分离纯化,并观察分离得到的石生真菌的形态... 详细信息

【目的】为开发利用石林石漠化地区石生真菌资源、探索石生真菌对碳酸盐岩风化及矿化作用提供理论基础。【方法】实验采用PDA和MEA培养基对采集自石林石漠化地区的40份岩石样品进行石生真菌的分离纯化,并观察分离得到的石生真菌的形态显微结构、分析rDNA-ITS序列同源性。【结果】从40份岩石样品中共分离获得68株石生真菌,分别隶属于2门5纲7目8科8属12种。其中31株镰刀菌属( Fusarium )、9株毛壳菌属( Chaetomium )、7株曲霉属( Aspergillus )、6株葡萄座腔菌属( Botryosphaeria )、5株青霉属( Penicillium )、4株粪壳菌属( Sordaria )、3株毛霉属( Mucor )、3株被孢霉属( Mortierella Coemans )。镰刀菌属、毛壳菌属、曲霉属具较高相对分离率,分别为45.58 %、13.23 %、10.29 %。【结论】综合两种培养基,石生真菌的Shannon-Weiner多样性指数为2.41922。石林石漠化地区石生真菌多样性丰富。

关键词：石林石漠化石生真菌可培养多样性

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石生真菌的抗逆机制和溶磷真菌的筛选与功能评价

石生真菌的抗逆机制和溶磷真菌的筛选与功能评价

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中国菌物学会2016年学术年会

作者：杨顺孙微苏尧刘杏忠向梅春中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室中国科学院大学

石生真菌（Rock-inhabiting fungi,RIF）是以裸露的岩石为基质、生长缓慢的一类暗色真菌。石生真菌是地球上最具耐受力的真核生命之一,具有独特的适应性,并进化出各种适应机制来占据生态位,它们在细胞结构、代谢方式、抗逆机制等方面具... 详细信息

石生真菌（Rock-inhabiting fungi,RIF）是以裸露的岩石为基质、生长缓慢的一类暗色真菌。石生真菌是地球上最具耐受力的真核生命之一,具有独特的适应性,并进化出各种适应机制来占据生态位,它们在细胞结构、代谢方式、抗逆机制等方面具有特殊性。尽管石生真菌很常见,但由于其体积小、生长缓慢并且缺乏明显的形态特征而常常被人们忽视。我们首先进行了石生真菌的分离鉴定,分离并初步鉴定了石生真菌500余株,选取石生真菌代表菌株进行高温、干旱胁迫和溶磷功能筛选;对岩石回接成功菌株Lithophila catenulatus进行基因组测序,该石生真菌基因组约为32.2Mb,组装后得到42个scaffolds,N50达到4.3Mb,经基因注释发现该石生真菌基因组编码10762个基因;同时用20%PEG6000ME对该菌株进行抗旱胁迫,对胁迫组和正常培养组进行RNA的提取,已对转录组进行测序,正在分析测序结果;建立了溶磷真菌的筛选体系,选取200余株石生真菌和300余份土壤样品进行溶磷菌株的筛选,未发现石生真菌具有溶磷能力,从土壤样品中筛选出5株真菌具有溶磷活性,其中P1-1、P2-2溶磷能力最强,能溶解磷酸钙、磷酸锌、磷灰石和卵磷脂。本研究丰富和挖掘了我国的石生真菌资源,为揭示石生真菌的生态作用提供重要依据;并且筛选溶磷真菌为构建功能微生物菌群提供了菌种资源,具有重要应用价值。

关键词：石生真菌多样性抗逆机制溶磷真菌

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散囊菌纲石生真菌多样性研究

散囊菌纲石生真菌多样性研究

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中国菌物学会2016年学术年会

作者：孙微杨顺向梅春刘杏忠中国科学院微生物研究所中国科学院大学

石生真菌是指生存于各种岩石表面及内部,但并不与藻类或蓝细菌形成地衣的一类真菌。石生真菌大多分布在极端缺水或者是营养极为贫乏的戈壁和沙漠。石生真菌在自然条件下形成的微菌落没有太大的形态差异,很难区分不同物种,即使获得纯培养... 详细信息

石生真菌是指生存于各种岩石表面及内部,但并不与藻类或蓝细菌形成地衣的一类真菌。石生真菌大多分布在极端缺水或者是营养极为贫乏的戈壁和沙漠。石生真菌在自然条件下形成的微菌落没有太大的形态差异,很难区分不同物种,即使获得纯培养物,由于其生长极其缓慢和几乎没有什么形态特征,很难进行分类研究。石生真菌研究中存在的问题:形态单一,分子数据较少,存在大量未知的分类单元等问题。在大量分离菌株的基础上,通过形态学与多基因系统发育学相结合的方式解决该石生真菌的分类学问题及对石生真菌多样性进行研究。本实验室提出石生真菌的分类学的研究策略,建议石生真菌属及科以上的级别的研究利用联合r DNA ITS和nuc LSU进行鉴定。而种的鉴定至少使用4个基因进行鉴定,主要包括的基因有:r DNA ITS、nuc LSU、nuc SSU、mt SSU、mt-rrn S、TUB2、RPB1和/或RPB2。可以从这些基因中选择合适的基因来联合鉴定。本研究前期分别从甘肃,安徽,云南,河北,贵州,广西,江西,河南,北京和西藏等地区采集了岩石样品分离1000余株石生真菌,进一步对38株属于Trichomeriaceae（Ascomycota）的菌株进行了重新鉴定,利用形态和多基因的方法共鉴定出1个新属,12个新种和2个已知种,对这些种类进行了系统的描述,完成了论文初稿。第二个研究内容对61株Herpotrichiellaceae科的石生真菌进行了菌株整理和初步鉴定;第三个研究内容对55株Chaetothyriales目的未能定位的真菌进行定位。本研究不仅为丰富和挖掘我国石生真菌资源及揭示石生真菌的生态作用提供依据,同时有助于阐明真菌生存极限、起源、进化及对逆境的适应机制,具有较重要的理论和现实意义。

关键词：石生真菌系统学生物多样性

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中国石生真菌多样性研究

中国石生真菌多样性研究

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中国菌物学会第五届会员代表大会暨2011年学术年会

作者：苏磊郝阳田建卿刘杏忠国立耘中国科学院微生物研究所中国农业大学植物病理系

石生真菌（Lithobiotic fungi）是指能够不与其他生物共生而独自生存在岩石表面或内部的一类真菌。主要分布在高温、高辐射、高盐、缺乏营养和水分的岩石中。石生真菌细胞一般可以呈多向分裂生长,以分生组织状或微型菌落形式存在。石生... 详细信息

石生真菌（Lithobiotic fungi）是指能够不与其他生物共生而独自生存在岩石表面或内部的一类真菌。主要分布在高温、高辐射、高盐、缺乏营养和水分的岩石中。石生真菌细胞一般可以呈多向分裂生长,以分生组织状或微型菌落形式存在。石生真菌的形态多以黑色、酵母状或暗色丝状为主（Palmer et al.1990;Sterflinger et al.1997,Sterflinger et al.2001;Serta et al.2007）,按形态特征可划分为黑酵母、黑色分生真菌和微型菌落真菌3种类型,主要隶属于子囊菌的Chaetothyriales、Dothideales、Capnodiales和Pleosporales 4个目中,以Chaetothyriales中最多。石生真菌分布十分广泛,具有非常丰富的遗传多样性,但是由于其生长极其缓慢,至今没有很好的被认识。为了深入了解我国石生真菌资源、多样性及其对极端环境的适应机制,我们从我国9省市38个采样点采集232份样品,分离获得了303株石生真菌。通过形态学观察和ITS序列分析,初步鉴定出50种左右,其中有相当一部分是新种;目前已描述新种1个。除此之外,本研究还发现不同气候环境和营养条件下的石生真菌在岩石上的形态结构存在一定的差异,如在甘肃戈壁沙漠地带的石样上,由于营养贫乏,环境恶劣,石生真菌细胞呈球状或椭球状;北京的岩石样品,可能由于气候温和以及有机污染比较严重,岩石上的石生真菌在生长阶段主要呈桑椹型菌落,通常从菌落内部长出一支粗壮的匍匐状菌丝向外延伸,当遇到适宜生长点后,菌丝顶端膨大,嵌入岩石中,重新形成桑椹型菌落或以分生孢子形式直接萌发;而来自云南热带雨林石样中的石生真菌,由于当地气候湿润,营养丰富,石生真菌主要以圆柱型细胞形成的菌丝形式存在。石生真菌作为一种生长在极端环境中的特殊生命形式,对其生存机制和定殖策略的研究不仅有助于我们更好的了解生命的本质和探索生命的起源,也将为石质建筑和文物的保护提供理论依据。石生真菌具有抗辐射性、耐盐性、耐高温等特点,对其抗性特点的研究不仅可以作为选择抗逆基因,研究抗逆机制和发育调控的模式生物,还可作为开发生物工程酶类、药物等重要化合物的原材料。

关键词：石生真菌形态结构鉴定极端环境

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低温和石生真菌多样性及其适应机制研究

低温和石生真菌多样性及其适应机制研究

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2010年中国菌物学会学术年会

作者：王曼曼郝阳刘杏忠中国科学院微生物研究所真菌地衣系统学实验室

当前,极端环境微生物研究已成为生命科学与生物技术发展的新方向。特殊环境导致了丰富的真菌多样性,为了适应特殊的生态环境,这些真菌形成了独特的细胞结构和代谢机制,也可能存在新的遗传基因。本研究主要针对石生和嗜冷真菌的多样性及... 详细信息

当前,极端环境微生物研究已成为生命科学与生物技术发展的新方向。特殊环境导致了丰富的真菌多样性,为了适应特殊的生态环境,这些真菌形成了独特的细胞结构和代谢机制,也可能存在新的遗传基因。本研究主要针对石生和嗜冷真菌的多样性及其适应机制进行研究。

关键词：嗜冷真菌石生真菌 PCR-SSCP 温度筛选试验

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中国石生真菌多样性的研究

中国石生真菌多样性的研究

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2012年中国菌物学会学术年会

作者：苏磊郝阳田建卿国立耘刘杏忠中国科学院微生物研究所中国农业大学植物病理系

石生真菌作为定殖于裸露岩石的一类特殊类群,具有抵御干旱、高辐射、高渗等极端环境的特点。对特殊生境中石生真菌种类组成及多样性的研究以及建立基于分子系统学分析的石生真菌的鉴定体系,不仅有利于发掘我国石生真菌的资源,而且可为... 详细信息

石生真菌作为定殖于裸露岩石的一类特殊类群,具有抵御干旱、高辐射、高渗等极端环境的特点。对特殊生境中石生真菌种类组成及多样性的研究以及建立基于分子系统学分析的石生真菌的鉴定体系,不仅有利于发掘我国石生真菌的资源,而且可为进一步研究真菌起源、进化、以及真菌对特殊环境适应机制等科学问题建立基础。本研究从新疆、西藏、云南和北京等地区共采集了215份岩石样品,通过室内分离,共获得石生真菌384株,通过形态观察与rDNAITS区域序列分析,共鉴定出29个属,102个种,其中新种2个。通过分子系统学研究发现,石生真菌的主要类群分布在子囊菌门中的四个目（Dothideales、Chaetothyriales、Pleosporales和Capnodiales）和三个分类单元（Coniosporium perforans group、Sarcinomyces ramicola group和Coniosporium apollinis group）中。优势种主要属于Sarcinomyces、Coniosporium、Preussia、Alternaria、Penicillium和Cladosporium六个属,分离频率分别为19.07%、17.67%、11.16%、8.84$%、6.05%和6.98%。研究还发现,不同地区的优势种类不同。其中,北京以Sarcinomyces和Coniosporium属为主;西藏以Coniosporium和Preussia属为主;新疆以Preussia和Alternaria属为主;云南以Coniosporium和Gliomastix属为主,Coniosporium和Cladosporium两个属广泛存在于各地区的岩石样品中。对不同生境的石生真菌群体进行多样性分析结果显示,生境对石生真菌群体的丰富度和多样性指数有明显的影响。其中,西藏地区石生真菌群体的多样性指数最高（2.13）,北京地区的最低（1.33）;但是北京地区的丰富度最高（5.19）;在北京地区,城市中的石质品和野外岩石上的石生真菌群体在多样性指数与丰富度上也有显著差异。研究结果表明,我国的石生真菌的资源十分丰富。研究中建立的基于分子系统学分析的石生真菌的鉴定方法为同类研究建立了基础。

关键词：石生真菌形态鉴定分子鉴定优势种多样性

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石耳目地衣内生菌的系统发育学分析

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山东科学 2011年第2期24卷 14-20页

作者：李铭王海英赵遵田山东师范大学生命科学学院山东济南250014

从采自中国和美国的13种石耳目地衣的21份标本中分离得到了33株黑化真菌。基于ITS序列的系统发育分析表明,这33株真菌全部是属于Capronia属的成员,可能分别属于12个种。分析结果还发现,这些真菌可能是地衣体中广泛而稳定定植的内生菌,... 详细信息

从采自中国和美国的13种石耳目地衣的21份标本中分离得到了33株黑化真菌。基于ITS序列的系统发育分析表明,这33株真菌全部是属于Capronia属的成员,可能分别属于12个种。分析结果还发现,这些真菌可能是地衣体中广泛而稳定定植的内生菌,其与宿主菌之间存在着一定程度的选择性,同种内生菌的不同成员可能在同一地衣体中先后多次定植。这些内生菌株中的多数是自由生活的石生真菌的近亲,而不是植物内生菌在地衣体中的延伸者。

关键词：内生菌地衣石耳目石生真菌

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