检索结果-南通市图书馆

中国兽医学报 2022年第10期42卷 2071-2079页

作者：李晔张玉珠霍俊元唐明瑞蔡桦林孙真真刘祥雨谢光洪刘云东北农业大学动物医学学院黑龙江哈尔滨150030 吉林大学动物医学学院吉林长春130062

本研究旨在分析患骨癌犬的癌组织的菌群特征及其与癌旁组织菌群的构成差异,进而探究癌内菌群对犬骨癌发生发展的影响。提取癌组织与癌旁组织菌群的基因组总DNA,进行高通量测序,结合数据分析两者的菌群特征,并利用Tax4Fun对其菌群进行功... 详细信息

本研究旨在分析患骨癌犬的癌组织的菌群特征及其与癌旁组织菌群的构成差异,进而探究癌内菌群对犬骨癌发生发展的影响。提取癌组织与癌旁组织菌群的基因组总DNA,进行高通量测序,结合数据分析两者的菌群特征,并利用Tax4Fun对其菌群进行功能预测。结果发现,2组菌群的丰富度指数(Ace、Chao1)和多样性指数(Shannon、Simpson)无显著性差异(P>0.05)。相对丰度方面,2组样本在门水平的菌群主要是变形菌门、拟杆菌门和厚壁菌门,其中癌组织的拟杆菌门(t=0.114,P=0.039)、广古菌门(t=0.067,P=0.017)、脱硫菌门(t=0.019,P=0.002)以及螺旋菌门(t=0.021,P=0.072)显著高于癌旁组织;在属水平上主要由绿脓杆菌属、乳杆菌和链球菌属等组成,其中癌组织的甲烷杆菌属(t=0.495,P=0.02)、互营杆菌属(t=0.495,P=0.004)以及Sarcina属(t=0.436,P=0.011)显著高于癌旁组织,且癌旁组织中不含有Sarcina属。PCoA图提示2组肠道菌群有显著性差异;LDA差异贡献分析发现2组之间共有27个物种存在显著性差异,其中影响较大的有硝化螺旋菌属(t=0.159,P=0.003)、反刍甲烷杆菌(t=0.495,P=0.029)、拟杆菌门(t=0.114,P=0.039)、Exilispira (t=0.495,P=0.022)、假单胞菌科(t=0.296,P=0.032)、假单胞菌目(t=0.284,P=0.032);功能预测结果表明,2组的代谢功能具有最高的相对丰度,在2组中相对丰度均超过45%,其中癌组织明显升高的代谢通路有氨基酸代谢、能量代谢、核苷酸代谢以及辅助因子和维生素的代谢等(P癌的癌变部位与癌旁部位组织中均存在特异的微生物菌群。

关键词：犬骨癌癌内菌群癌旁菌群 16S rRNA测序

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

欢迎您,

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

欢迎您,

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：