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应用加权基因共表达网络分析识别肝细胞癌发生和进展过程中关键通路和基因作用研究

实用肝脏病杂志 2024年第4期27卷 599-602页

作者：徐思洁秦浩张振华安徽医科大学第二附属医院感染肝病科合肥市230601 合肥市第三人民医院感染性疾病科

目的探讨肝细胞癌(HCC)发生进展过程中功能富集通路和关键基因表达。方法从基因表达数据库(GEO)下载HBV感染不同阶段和正常对照肝脏转录组数据,构建基因网络并使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)将基因分类为不同的模块,对相关模块中的... 详细信息

目的探讨肝细胞癌(HCC)发生进展过程中功能富集通路和关键基因表达。方法从基因表达数据库(GEO)下载HBV感染不同阶段和正常对照肝脏转录组数据,构建基因网络并使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)将基因分类为不同的模块,对相关模块中的基因进行富集分析。应用GEO数据集进一步验证重要基因水平。结果共6145个组间差异基因参与构建加权基因共表达网络,被分为9个模块,进一步描绘了从肝脏早期病变到肿瘤的进化轨迹,从正常组织到癌组织过程中的细胞增殖、DNA损伤修复和细胞衰老相关通路线性激活;随疾病进展,脂质代谢和凝血等肝脏功能相关通路逐渐受到抑制;在肿瘤发生前,慢性炎症期免疫相关通路被激活,后期逐渐趋向于抑制状态;共鉴定出3个重要衰老相关基因,即CCNA2、UBE2C和ANAPC1,并在外部数据集验证了这3个基因水平变化;进一步分析显示上述3个基因水平与肝癌患者不良预后密切相关(P癌发生和进展过程中潜在途径和重要参与基因,为诊断和治疗干预提供了潜在的靶标。

关键词：肝细胞癌加权基因共表达网络分析基因集富集分析癌发生机制

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RegIV在胃癌及胃非癌组织中的表达及意义

RegIV在胃癌及胃非癌组织中的表达及意义

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作者：高雅玲福建医科大学

学位级别：硕士

目的检测再生基因4 (regenerating islet-derived family member 4,RegIV)在各种胃癌(gastric carcinoma,GC)及胃非癌组织中的表达情况,并探讨其可能临床意义。方法运用免疫组织化学方法半定量检测73例我院胃癌手术切除标本和90例胃癌... 详细信息

目的检测再生基因4 (regenerating islet-derived family member 4,RegIV)在各种胃癌(gastric carcinoma,GC)及胃非癌组织中的表达情况,并探讨其可能临床意义。方法运用免疫组织化学方法半定量检测73例我院胃癌手术切除标本和90例胃癌、癌旁非癌组织芯片中RegIV蛋白的表达情况。结果RegIV选择性表达于胃黏膜的壁细胞中,胃小凹上皮细胞为RegIV阴性。RegIV在胃黏膜肠化生杯状细胞呈固定强胞浆染色(阳性率100%)。肠型胃癌(杯状细胞可见)、胃印戒细胞癌、粘液腺癌的癌细胞中呈RegIV的频繁免疫反应性(分别为100%(3/3)、93.3%(14/15)和90.9%(10/11))。RegIV强核周染色在肠化生基础上的神经内分泌细胞中见到,6例胃神经内分泌癌无1例见RegIV表达。RegIV的表达与胃癌的侵袭参数(包括浸润深度、转移或TNM分期)无明显相关性(P>0.05),RegIV的表达与胃癌的组织分型相关(P癌中的表达差异有统计学意义。组织芯片免疫组化染色形态同我院石蜡组织切片。但30例胃管状腺癌无1例出现RegIV阳性表达(阳性率0%)。RegIV在胃粘液腺癌和印戒细胞癌中的表达阳性率分别为43.3%(13/30)和40.0%(12/30),与我院组织标本的阳性率有较大差异。结论RegIV在胃黏膜肠化生杯状细胞、胃印戒细胞癌、粘液腺癌中显示频繁免疫反应性,RegIV可能参与从肠上皮化生、杯状异型增生发展成胃腺癌的癌变过程。RegIV的表达是否与胃癌的神经内分泌分化有关需进一步证实。RegIV的表达与胃癌患者的临床病理学特征无明显相关,但不能完全排除其可能参与肿瘤细胞的侵袭浸润行为。我院石蜡包埋胃癌手术标本与组织芯片的免疫组化结果并未显示严格一致性,考虑与地域差异等因素有关。

关键词：胃癌再生基因4 免疫组化组织芯片癌发生机制

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