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宏基因组二代测序技术在肺部感染病原学检测的应用进展分析

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中文科技期刊数据库（引文版）医药卫生 2023年第6期 171-174页

作者：陆玲丽桂林市妇女儿童医院广西桂林541001

肺部感染发生率较高,常发生于机体抵抗力下降,例如熬夜、受凉时致使病原体大量繁殖,进而引起肺部感染症状。常规的诊断主要是基于患者的临床表现、影像学表现和实验室检查。传统的病原体鉴定的实验室检测仅限于血清学检测、特异性聚合... 详细信息

肺部感染发生率较高,常发生于机体抵抗力下降,例如熬夜、受凉时致使病原体大量繁殖,进而引起肺部感染症状。常规的诊断主要是基于患者的临床表现、影像学表现和实验室检查。传统的病原体鉴定的实验室检测仅限于血清学检测、特异性聚合酶链反应(PCR)和培养。早期确定感染病原体是提升临床治愈率、减少死亡的发生的重要举措。血清学检测敏感性低,特异性聚合酶链反应(PCR)需要特定引物,培养耗时长,对于早期诊断效果不大。因此,迫切需要一种能够高精度快速识别病原体的新技术。宏基因组测序有特异性高、快速等优点,用在混合感染、免疫抑制感染等诊断中均具有较好应用价值,但此种技术还有治疗关系不确定、耐药基因检测难度高等缺点。本文主要针对宏基因组二代测序技术在肺部感染病原学检测的应用进展进行概述,现将详细内容报告如下。。

关键词：肺部感染病原学检测宏基因组二代测序技术临床诊断

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伊犁河谷某种鹅场病原学检测分析报告

新疆畜牧业 2023年第5期39卷 27-30页

作者：王小雨张浩伊犁职业技术学院新疆伊宁市835000

伊犁河谷具有发展畜牧业得天独厚的优越自然条件,为了解察布查尔县某新种鹅养殖场疾病流行情况,运用RT-PCR方法对危害水禽养殖严重的5种传染病(禽流感、新城疫、禽呼肠孤、禽腺病毒4型、鸭坦布苏病毒病)进行了检测,结果显示:在采集的90... 详细信息

伊犁河谷具有发展畜牧业得天独厚的优越自然条件,为了解察布查尔县某新种鹅养殖场疾病流行情况,运用RT-PCR方法对危害水禽养殖严重的5种传染病(禽流感、新城疫、禽呼肠孤、禽腺病毒4型、鸭坦布苏病毒病)进行了检测,结果显示:在采集的90份全血样品、90份咽拭子、90份肛拭子和40份环境拭子中均未检测出这5种病原。这表明养殖场饲养环境良好,有利于种鹅的健康发展。

关键词：伊犁河谷种鹅病原学检测

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肺部真菌感染病原学检测的方法及其临床意义

中华结核和呼吸杂志 2011年第9期34卷 644-647页

作者：施毅孙文逵南京军区南京总医院呼吸科 210002

肺部真菌感染的患者临床表现多样，影像学特征不典型，实验室病原学检查就成为诊断的重要依据，其中临床体液标本涂片的显微镜检查（简称镜检）和真菌培养应用最为广泛，该方法虽然在某些真菌感染的诊断中尚难以鉴别是定植还是感染，但... 详细信息

肺部真菌感染的患者临床表现多样，影像学特征不典型，实验室病原学检查就成为诊断的重要依据，其中临床体液标本涂片的显微镜检查（简称镜检）和真菌培养应用最为广泛，该方法虽然在某些真菌感染的诊断中尚难以鉴别是定植还是感染，但其结果作为“微生物学证据”，无疑对于侵袭性真菌病的诊断和治疗均有重要的参考价值。

关键词：肺部真菌感染临床意义病原学检测显微镜检查侵袭性真菌病影像学特征病原学检查临床表现

福建省猪群感染牛病毒性腹泻病毒的病原学检测与分析

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畜牧兽医学报 2014年第12期45卷 2006-2012页

作者：徐磊曾亮明王玉玲陈先进林伯全林拱阳傅光华施少华程龙飞黄瑜张渊魁福建农业职业技术学院动物科学系福州350119 福建省农业科学院畜牧兽医研究所福州350013 福州大北农生物技术有限公司福州350014

旨在建立鉴别牛病毒性腹泻病毒(BVDV)与猪瘟病毒(CSFV)的RT-PCR检测方法,用于福建省猪群感染BVDV的病原学检测,并进行猪源BVDV协同感染的病原学调查。根据BVDV 5′-UTR保守序列建立猪源BVDV的特异性RT-PCR,进行敏感性、特异性、重复性试... 详细信息

旨在建立鉴别牛病毒性腹泻病毒(BVDV)与猪瘟病毒(CSFV)的RT-PCR检测方法,用于福建省猪群感染BVDV的病原学检测,并进行猪源BVDV协同感染的病原学调查。根据BVDV 5′-UTR保守序列建立猪源BVDV的特异性RT-PCR,进行敏感性、特异性、重复性试验,然后对福建省9个地市42个猪场的458份临床样品进行BVDV检测及测序,并参照已有的CSFV、PRRSV、HP-PRRSV、PRV和PCV-2病原检测方法对BVDV阳性样品进行协同感染检测。结果显示该方法敏感度达0.1 TCID50,检测CSFV、PRRSV、HP-PRRSV、PRV、PCV-2和PPV均为阴性,重复5次进行敏感性和特异性试验的结果一致;样品BVDV病原阳性率10.04%(46/458),猪场阳性率78.57%(33/42),9个地市阳性率100%(9/9);其中46份BVDV阳性样品CSFV、PRRSV、HP-PRRSV、PRV和PCV-2感染的阳性率分别为91.30%(42/46)、50.00%(23/46)、41.30%(19/46)、63.04%(29/46)、37.00%(17/46)。结果表明,建立的RT-PCR方法敏感性高、特异性强、重复性好,适合用于猪源BVDV的监测;福建省猪群BVDV感染情况较普遍,且与多种病毒协同,其中CSFV协同感染率最高。

关键词：福建省猪源牛病毒性腹泻病毒 RT-PCR 病原学检测协同感染

冠状病毒感染性疾病尸体检验相关病原学检测回顾与展望

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法医学杂志 2021年第1期37卷 69-76页

作者：王韵怡周南乐嘉诚张凯赵乾皓郑大胡丙杰成建定中山大学中山医学院法医学系广东广州510080 广州医科大学病理学教研室广东广州511436

冠状病毒曾经给世界带来两次严重的人类间大流行,包括严重急性呼吸综合征(severe acute respiratory syndrome,SARS)和中东呼吸综合征(Middle East respiratory syndrome,MERS),2019年岁末新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)再次引发了全球性的重大公共卫生事件。由于新型冠状病毒传染性较强,相关死亡病例的解剖工作难以广泛开展。本文对既往冠状病毒感染性疾病尸体检验相关的病原学检测情况进行回顾,介绍了临床上正在开展的新型冠状病毒的检测手段,旨在为开展COVID-19尸体检验相关的病原学检测和研究提供借鉴和参考。

关键词：法医病理学冠状病毒新型冠状病毒肺炎严重急性呼吸综合征中东呼吸综合征尸体解剖病原学检测综述

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脑炎156例临床诊断与病原学检测

中华传染病杂志 2009年第1期27卷 50-52页

作者：龙健中黎祖秋刘巍李洁莲陈发明广西壮族自治区桂平市人民医院神经内科 537200 广西壮族自治区桂平市人民医院检验科 537200 广西壮族自治区桂平市疾病预防控制中心疾病控制科广西壮族自治区疾病预防控制中心新发传染病研究室

脑炎是中枢神经系统常见的感染性疾病，根据不同的感染部位、不同的病原体及病损的程度进行临床分类，不同类型的感染早期临床表现不一，早期明确诊断是治疗的关键。因此，了解脑炎的临床特征及病原学，对提高临床早期诊断准确率和有效... 详细信息

脑炎是中枢神经系统常见的感染性疾病，根据不同的感染部位、不同的病原体及病损的程度进行临床分类，不同类型的感染早期临床表现不一，早期明确诊断是治疗的关键。因此，了解脑炎的临床特征及病原学，对提高临床早期诊断准确率和有效治疗尤为重要。本研究对156例脑炎患者，结合其临床表现，运用ELISA、PCR技术对患者的血清和脑脊液进行病毒特异性抗体检测，

关键词：病原学检测临床诊断脑炎早期临床表现感染性疾病中枢神经系统有效治疗 ELISA

2010至2012年手足口病病原学检测变化与分析

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中华检验医学杂志 2013年第12期36卷 1140-1142页

作者：代芳芳何菡李润青朱东袁星星赵秀英娄金丽孙桂珍首都医科大学附属北京佑安医院临床检验中心 100069 北京清华医院检验科

手足口病（hand，foot and mouth disease，HFMD）是由多种肠道病毒（enteroviruses，EV）感染引起的常见传染病，在世界多地都有HFMD流行。早期发现的与HFMD有关的病原体主要为肠道病毒柯萨奇A组16型（CA16）。1972年由肠道病毒71型（E... 详细信息

手足口病（hand，foot and mouth disease，HFMD）是由多种肠道病毒（enteroviruses，EV）感染引起的常见传染病，在世界多地都有HFMD流行。早期发现的与HFMD有关的病原体主要为肠道病毒柯萨奇A组16型（CA16）。1972年由肠道病毒71型（EV71）感染造成的HFMD被报道，此后由EV71和CAl6感染所致的HFMD交替流行。

关键词：手足口病病原学检测肠道病毒71型 HFMD 常见传染病柯萨奇A组 EV71 感染

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伤人犬狂犬病病原学检测与分析

贵州农业科学 2011年第4期39卷 160-162页

作者：李世军余春王月田克诚唐光鹏王定明贵州省疾病预防控制中心贵州贵阳550004

为了解贵州省2009年伤人犬狂犬病病毒感染的情况,采集伤人犬脑组织标本26份,利用直接免疫荧光法(DFA)对脑组织标本进行初筛,阳性和疑似阳性标本再用RT-nested PCR法检测。结果表明,DFA法检测狂犬病抗原有11份呈阳性、1份疑似阳性,阳性率... 详细信息

为了解贵州省2009年伤人犬狂犬病病毒感染的情况,采集伤人犬脑组织标本26份,利用直接免疫荧光法(DFA)对脑组织标本进行初筛,阳性和疑似阳性标本再用RT-nested PCR法检测。结果表明,DFA法检测狂犬病抗原有11份呈阳性、1份疑似阳性,阳性率为42.3%(11/26);再经RT-nested PCR法验证,狂犬病毒核酸阳性8份,阳性率为30.8%(8/26)。说明,贵州省伤人犬狂犬病病毒感染率较高,应加强对犬的免疫和管理。

关键词：狂犬病犬病原学检测

危重脑炎脑膜炎患儿的临床诊断与病原学检测分析

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中国现代医学杂志 2013年第23期23卷 101-104页

作者：周志红王华洪湖南岳阳市第一人民医院感染内科湖南岳阳市疾病预防控制中心湖南岳阳414000

目的对脑炎脑膜炎病例进行临床诊断与实验室检测,在病原学上为临床治疗提供直接依据。方法对入院患儿进行血常规、尿常规、生化及血凝检查,采集患儿脑脊液、血液及咽拭子标本,进行脑膜炎奈瑟菌、B型流感嗜血杆菌、金黄色葡萄球菌、肺炎... 详细信息

目的对脑炎脑膜炎病例进行临床诊断与实验室检测,在病原学上为临床治疗提供直接依据。方法对入院患儿进行血常规、尿常规、生化及血凝检查,采集患儿脑脊液、血液及咽拭子标本,进行脑膜炎奈瑟菌、B型流感嗜血杆菌、金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌、猪链球菌、大肠杆菌等分离培养;ELISA法检测麻疹病毒、风疹病毒IgM抗体;设计特异性引物RT-PCR法检测肠道病毒、乙脑病毒、水痘-带状疱疹病毒、单纯疱疹病毒、腮腺炎病毒,对核酸检测阳性的病原体进行基因测序、Blast比对及应用Mega 5.0构建分子进化树;根据病原体的种类及基因型别,有针对性地选择药物进行临床救治。结果脑炎脑膜炎患儿脑脊液、血液及咽拭子标本细菌培养均为阴性;咽拭子标本腮腺炎病毒PCR核酸检测阳性,琼脂糖凝胶电泳产物大小约300 bp;阳性产物测序结果与腮腺炎病毒疫苗株比较,存在部分核苷酸变异,关键的抗原位点没有发生变化;所测基因序列经分子进化分析确定为腮腺炎病毒基因F型,与目前中国流行毒株基因型别一致,患儿经对症治疗已康复出院。结论细菌学和病毒学实验室筛查,对引起脑炎脑膜炎的常见病原体具有积极的作用,早期病毒核酸测序能确诊腮腺炎病毒感染类别及基因型别。

关键词：脑炎脑膜炎临床诊断病原学检测腮腺炎病毒