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番茄褐色皱纹果病毒分子检测与基因组部分序列分析

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华北农学报 2024年第3期39卷 179-186页

作者：华明艳宋兰芳崔少杰孙海波金凤媚天津市农业科学院天津300192

为了确定张家口及银川番茄产区是否发生番茄褐色皱纹果病毒病(ToBRFV),探究番茄ToBRFV的遗传信息和演化,为番茄褐色皱纹果病毒的诊断和防治及番茄抗病毒病基因工程提供重要的科学依据,采用张家口和银川两地区疑似病果进行分子检测,并利... 详细信息

为了确定张家口及银川番茄产区是否发生番茄褐色皱纹果病毒病(ToBRFV),探究番茄ToBRFV的遗传信息和演化,为番茄褐色皱纹果病毒的诊断和防治及番茄抗病毒病基因工程提供重要的科学依据,采用张家口和银川两地区疑似病果进行分子检测,并利用相关分子生物学软件对该病毒基因进行序列分析及全基因组的系统进化分析。结果表明,张家口及银川果实病毒分离物与GenBank中大部分ToBRFV分离物的基因组结构相似性在99%以上,确定两地区番茄果实病毒为番茄褐色皱纹果病毒。ToBRFV分离物的地域性很强,中国不同地区的ToBRFV病毒,与来自欧洲和亚洲的多个国家地区都有关联,张家口分离物与中国分离物(MT018320.1)亲缘关系最近,银川分离物与秘鲁分离物聚类到一起,说明银川分离物可能来自南美洲。张家口分离物与中国分离物(MT018320.1)的4个ORF氨基酸相似性最高,而银川分离物与张家口分离物相似性较低。另外,研究结果首次发现,银川分离物CP蛋白的第444位碱基由A突变成G,从而导致CP蛋白的氨基酸第131位由V(缬氨酸)突变为A(丙氨酸),CP蛋白发生了有义突变。综上所述,张家口及银川番茄产区发生了番茄褐色皱纹果病毒病,且两地区的病毒来自不同的地方。

关键词：番茄番茄褐色皱纹果病毒分子检测序列分析

番茄褐色皱纹果病毒(ToBRFV)研究进展

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园艺学报 2024年第2期51卷 439-452页

作者：韦建明黄鑫李云洲梁燕贵州大学农学院贵阳550025 西北农林科技大学园艺学院陕西杨凌712100

番茄褐色皱纹果病毒(tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)为帚状病毒科(Virgaviridae)烟草花叶病毒属(Tobamovirus)RNA病毒,可侵染包括番茄在内的多个科属植物,严重威胁安全生产。ToBRFV于2014年首次在以色列发现,随后蔓延至多个... 详细信息

番茄褐色皱纹果病毒(tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)为帚状病毒科(Virgaviridae)烟草花叶病毒属(Tobamovirus)RNA病毒,可侵染包括番茄在内的多个科属植物,严重威胁安全生产。ToBRFV于2014年首次在以色列发现,随后蔓延至多个国家和地区。2021年4月中国将该病毒列为检疫性病毒。本文中对该病毒的基因组结构、寄主范围、发病症状、传播方式、检测方法、寄主抗性以及防御措施等的研究进展进行了归纳总结,以期为防控和抗ToBRFV育种提供参考和借鉴。

关键词：番茄番茄褐色皱纹果病毒抗病育种

番茄褐色皱纹果病毒（ToBRFV）云南建水分离物鉴定及全基因组序列分析

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植物病理学报 2024年

作者：肖雨晴吕高莹李树军陈永对苏晓霞杨李源滨周晓罡余大朝王田田郑宽瑜张仲凯云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室云南神谷科技股份有限公司

番茄褐色皱纹果病毒（tomato brown rugose fruit virus,To BRFV）近年来在全球番茄产区快速发生蔓延，造成严重的经济损失。云南建水番茄上出现疑似To BRFV感染的症状，并对周边番茄产区产生危害。本研究对云南建水田间疑似To BRFV感... 详细信息

番茄褐色皱纹果病毒（tomato brown rugose fruit virus,To BRFV）近年来在全球番茄产区快速发生蔓延，造成严重的经济损失。云南建水番茄上出现疑似To BRFV感染的症状，并对周边番茄产区产生危害。本研究对云南建水田间疑似To BRFV感染的番茄果实样品进行电子显微镜观察及RT-PCR检测鉴定，并进一步对分离株进行全基因组测序分析，构建系统进化树分析其与其它To BRFV分离株的进化关系。结果表明，从感病的番茄果实上发现杆状病毒粒体，大小约18nm×300nm，具有烟草花叶病毒属病毒的典型形态特征；用To BRFV特异性检测引物进行RT-PCR扩增得到591bp目的片段，经NCBIblast比对，与To BRFV具有最高一致率（达99%以上），将该分离株命名为To BRFV-2022-JS(GenBank登录号：OR593752)。测序发现ToBRFV-2022-JS基因组全长6 386 nt，具有4个ORFs，分别编码126 kDa和183 kDa复制酶，30 kDa运动蛋白MP和17.5 kDa外壳蛋白CP。进化树分析显示该分离株与To BRFV银川分离株（GenBank登录号：OR500698.1）的亲缘关系最近，核苷酸序列一致率为99.73%。上述结果表明云南建水番茄果实受到To BRFV感染。该结果为To BRFV在云南番茄产区的监测与防控提供了依据。

关键词：番茄褐色皱纹果病毒云南建水番茄果实病毒基因组系统进化分析

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番茄褐色皱纹果病毒分子检测与鉴定

中国蔬菜 2023年第6期 34-40页

作者：王少骅陈利达石延霞谢学文李磊范腾飞李宝聚柴阿丽中国农业科学院蔬菜花卉研究所蔬菜生物育种全国重点实验室北京100081

利用3对番茄褐色皱纹果病毒(Tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)特异性引物对云南红河、宁夏银川、北京顺义疑似病毒病样本进行RT-PCR检测,分别扩增出大小为812、842、1053 bp的特异性条带。对扩增产物进行测序及系统进化分析,发... 详细信息

利用3对番茄褐色皱纹果病毒(Tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)特异性引物对云南红河、宁夏银川、北京顺义疑似病毒病样本进行RT-PCR检测,分别扩增出大小为812、842、1053 bp的特异性条带。对扩增产物进行测序及系统进化分析,发现云南、宁夏、北京的ToBRFV分离物与约旦、意大利、荷兰的ToBRFV分离物聚在同一分支上,亲缘关系较近。致病性结果显示,接种后的番茄植株表现出与田间相同的症状,且在发病组织中检测到病毒ToBRFV。表明来自云南红河、宁夏银川、北京顺义的番茄植株均被ToBRFV侵染。

关键词：番茄褐色皱纹果病毒分子检测 ToBRFV RT-PCR

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番茄褐色皱纹果病毒的发生分布及防控对策

中国蔬菜 2020年第5期 12-17页

作者：张宇张松柏张德咏刘慧张战泓张友军刘勇湖南省农业科学院植物保护研究所湖南长沙410125 全国农技推广中心北京100026 湖南省农业科学院蔬菜研究所湖南长沙410125 中国农业科学院蔬菜花卉研究所北京100081

番茄褐色皱纹果病毒(Tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)是烟草花叶病毒属(Tobamovirus)的新成员,主要危害番茄、辣椒等茄科作物。2014年在以色列番茄上首次发现该病毒,随后快速扩展至欧洲、美洲的茄科作物主产区。2019年我国山... 详细信息

番茄褐色皱纹果病毒(Tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)是烟草花叶病毒属(Tobamovirus)的新成员,主要危害番茄、辣椒等茄科作物。2014年在以色列番茄上首次发现该病毒,随后快速扩展至欧洲、美洲的茄科作物主产区。2019年我国山东发现ToBRFV侵染番茄,要警惕该病毒在我国暴发危害。本文综述了国内外ToBRFV的分布、为害症状、传播途径、鉴定方法以及致病性等方面的研究进展,并结合烟草花叶病毒属病毒的侵染循环特征,提出防控对策;此外,对未来的研究重点、防控技术研发等进行了展望。

关键词：番茄褐色皱纹果病毒烟草花叶病毒属茄科作物发生分布防控对策综述

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警惕番茄褐色皱纹果病毒在我国的传播和危害

植物保护 2022年第6期48卷 42-48页

作者：石钰杰马子玥杨秀玲周雪平中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室北京100193

番茄褐色皱纹果病毒(tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)是烟草花叶病毒属的一个新种,在自然界中主要危害番茄、辣椒等茄科作物。自2014年首次在以色列发现以来,ToBRFV迅速蔓延至全球4个洲的35个国家,严重影响番茄和辣椒的产量和... 详细信息

番茄褐色皱纹果病毒(tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)是烟草花叶病毒属的一个新种,在自然界中主要危害番茄、辣椒等茄科作物。自2014年首次在以色列发现以来,ToBRFV迅速蔓延至全球4个洲的35个国家,严重影响番茄和辣椒的产量和品质。本文综述了ToBRFV的发现与分布、基因组结构、传播方式、寄主范围和检测方法,并提出了相应的防控建议,以防范ToBRFV在我国的进一步传播和危害。

关键词：番茄褐色皱纹果病毒分布基因组结构寄主范围传播方式防控措施

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一种新发植物病毒--番茄褐色皱纹果病毒

植物检疫 2020年第5期34卷 57-60页

作者：刘明航冯黎霞余辛叶菁陈萍李盼畔广州海关技术中心广东广州510623 广州白云机场海关南沙海关

番茄褐色皱纹果病毒是一种新发植物病毒,已知可侵染番茄、辣椒。该病毒发展迅速,潜在的危害性巨大。我国于2019年在山东禹城报道发生。本文对该病毒的生物学特征、发生与分布、危害特点、检测方法进行了介绍,并提出了防控措施建议。

关键词：番茄褐色皱纹果病毒分布生物学检测防控

北京、山东、陕西部分地区番茄褐色皱纹果病毒的检测及同源性分析

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中国蔬菜 2021年第4期 48-52页

作者：高文征范丽娜李晓东陈一帆邱卓瑶黄泽军李君明舒金帅刘磊国艳梅杜永臣王孝宣中国农业科学院蔬菜花卉研究所北京100081 西安金鹏种苗有限公司陕西西安710018

番茄褐色皱纹果病毒(tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)于2015年在约旦被首次报道,随即迅速在全世界蔓延。本试验对北京南口、山东寿光及陕西白水出现的疑似ToBRFV典型症状的感病植株的保守结构域进行RT-PCR扩增检测,结果表明ToB... 详细信息

番茄褐色皱纹果病毒(tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)于2015年在约旦被首次报道,随即迅速在全世界蔓延。本试验对北京南口、山东寿光及陕西白水出现的疑似ToBRFV典型症状的感病植株的保守结构域进行RT-PCR扩增检测,结果表明ToBRFV已经在北京、山东和陕西发生。对ToBRFV保守基因RdRP测序发现,北京、山东、陕西感病材料的ToBRFV RdRP基因遗传距离较近,与其他国家的ToBRFV RdRP基因遗传距离较远。

关键词：番茄褐色皱纹果病毒烟草花叶病毒属 RT-PCR RdRP基因

RT-RAA-CRISPR/Cas12a可视化检测番茄褐色皱纹果病毒

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植物检疫 2024年第3期38卷 14-20页

作者：赵振兴范奇璇王思元董铮胡中泽周涛张永江中国检验检疫科学研究院北京100176 中国农业大学植物保护学院江苏省农业科学院泰州农科所

番茄褐色皱纹果病毒(tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)严重威胁番茄等茄科园艺作物的生产安全。本研究根据其外壳蛋白(coat protein,CP)基因及其同属病毒的差异序列,设计了特异性重组酶介导等温核酸扩增技术(recombinase-aided ... 详细信息

番茄褐色皱纹果病毒(tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)严重威胁番茄等茄科园艺作物的生产安全。本研究根据其外壳蛋白(coat protein,CP)基因及其同属病毒的差异序列,设计了特异性重组酶介导等温核酸扩增技术(recombinase-aided amplification,RAA)引物,并基于CRISPR/Cas12a的设计原则,设计了靶向RT-RAA扩增产物的CRISPR RNA(crRNA)。通过优化获得了检测信号最强的反应体系,其中报告基因FQ终浓度为600nmol/L、Cas12a和crRNA终浓度分别为200nmol/L和1000nmol/L,最终总反应时间仅为30 min。该方法可特异性检测ToBRFV,对携带ToBRFV的番茄样品RNA检测灵敏度为RT-PCR和RT-qPCR的10000和100倍,检测限为3.46fg/μL。阳性样品验证结果显示,本研究建立的RT-RAA-CRISPR/Cas12a检测技术可以在不同来源的辣椒、番茄侵染的植物叶片、果实及种子中检测到ToBRFV,表明该技术可用于番茄褐色皱纹果病毒的快速、灵敏的可视化检测。

关键词：番茄褐色皱纹果病毒 RT-RAA CRISPR/Cas12a 可视化检测