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生物信息技术分析脑胶质瘤血清蛋白指纹图诊断模型的临床意义

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中华检验医学杂志 2005年第1期28卷 30-33页

作者：刘建吴敏良董琦余捷凯胡跃徐文莉沈宏郑树浙江大学附属第二医院肿瘤研究所杭州310009 浙江大学附属第二医院检验科杭州310009

目的　探讨筛选的脑胶质瘤血清蛋白指纹图诊断模型的临床应用价值。方法　用疏水性表面芯片 (H4 )和表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱技术 (SELDI TOF MS)及生物信息学分析方法与SPSS10 0软件 ,检测分析 2 8例胶质瘤、37例其他脑良... 详细信息

目的　探讨筛选的脑胶质瘤血清蛋白指纹图诊断模型的临床应用价值。方法　用疏水性表面芯片 (H4 )和表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱技术 (SELDI TOF MS)及生物信息学分析方法与SPSS10 0软件 ,检测分析 2 8例胶质瘤、37例其他脑良性肿瘤和 4 0名健康人的血清蛋白指纹图 ,并建立脑胶质瘤血清蛋白指纹图诊断模型。结果　用建立的区分脑胶质瘤与健康人的血清蛋白指纹图诊断模型进行盲法检测的准确率、敏感性和特异性分别为 95 7% (2 2 / 2 3)、88 9% (8/ 9)和 10 0 % (14 / 14 )。建立的区分胶质瘤与其他脑良性肿瘤的血清蛋白指纹图诊断模型 ,盲法检测脑胶质瘤的准确率、敏感性和特异性分别为 86 4 % (19/ 2 2 )、88 9% (8/ 9)和 84 6 % (11/ 13)。建立的区分Ⅰ Ⅱ级与Ⅲ Ⅳ级脑胶质瘤的血清蛋白指纹图诊断模型的准确率分别为 85 7% (13/ 15 )、84 6 % (11/13)。结论　用SELDI TOF MS技术与生物信息分析法建立的 3个血清蛋白指纹图诊断模型对脑胶质瘤的定性诊断提供了一条新途径。

关键词：脑胶质瘤血清蛋白指纹图盲法 TOF 健康人临床意义生物信息技术 SELDI 特异性

生物信息技术预警乌头类中药抗乳腺癌用药风险

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中国药物警戒 2021年第7期18卷 655-662页

作者：王雨林志健姜卓希杨婷王笑张冰北京中医药大学中药学院北京100029 北京中医药大学中药药物警戒与合理用药研究中心北京100029

目的以乌头类中药抗乳腺癌研究为例,探讨毒性中药治疗恶性肿瘤的用药风险预警。方法采用文献计量学手段分析乌头类中药的不良反应/事件(ADR/AE)。采用生物信息学技术,提取基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中芯片数据集GSE85... 详细信息

目的以乌头类中药抗乳腺癌研究为例,探讨毒性中药治疗恶性肿瘤的用药风险预警。方法采用文献计量学手段分析乌头类中药的不良反应/事件(ADR/AE)。采用生物信息学技术,提取基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中芯片数据集GSE85871,对乌头类中药中主要生物碱成分对乳腺癌细胞MCF7差异表达基因进行基因本体论(gene oncology,GO)注释、京都基因组与基因百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集及蛋白质互作网络分析。结果乌头类中药治疗乳腺癌的过程中,可能会伴随醛固酮合成分泌途径、内分泌代谢途径、神经化学转导途径及骨代谢途径异常。结论在应用乌头类中药治疗乳腺癌时,须对患者循环系统、神经系统、内分泌系统、骨骼系统相关机体状态进行整体评价及密切关注,综合评估用药风险。

关键词：乌头类中药乳腺癌用药风险预警文献计量学生物信息技术

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生物信息技术的知识产权保护初探

知识产权 2006年第1期16卷 27-32页

作者：朱雪忠常俊丽何光源中南财经政法大学知识产权研究中心华中科技大学知识产权战略研究院中英HUST-RRes基因工程和基因组学联合实验室

生物信息学是伴随着人类基因组计划(HGP)的开展而得以迅速发展起来的新兴交叉学科。由于其所带来的巨大社会经济效益,对生物信息技术的知识产权保护越来越引起人们的关注。本文据此对生物信息技术中涉及的知识产权保护客体,即基因和蛋... 详细信息

生物信息学是伴随着人类基因组计划(HGP)的开展而得以迅速发展起来的新兴交叉学科。由于其所带来的巨大社会经济效益,对生物信息技术的知识产权保护越来越引起人们的关注。本文据此对生物信息技术中涉及的知识产权保护客体,即基因和蛋白质序列和结构、生物信息数据库、生物信息技术软件和硬件的知识产权保护国内外现状及目前存在的若干问题进行了初步的探讨。

关键词：生物信息技术知识产权基因蛋白质数据库计算机软件

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生物信息技术发展态势分析

中国生物工程杂志 2003年第5期23卷 101-103,108页

作者：赵爱民科学技术部中国生物工程开发中心北京100081

随着计算机科学和互联网技术的进步 ,生物信息学得到了长足的发展。综述了国际生物信息技术的发展态势 ,分析了生物信息技术研发和应用的热点和重点 ,并且在概述国内生物信息发展状况的基础上 ,提出发展我国生物信息技术的建议。

关键词：生物信息技术生物信息学基因组蛋白质组

基于生物信息技术预警他汀类药物防治动脉粥样硬化安全风险

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中国药物警戒 2021年第2期18卷 184-189页

作者：邹丽娜林志健张晓朦张冰黄政凯北京中医药大学中药学院北京100029 北京中医药大学中药药物警戒与合理用药研究中心北京100029

目的通过生物信息技术探讨他汀类药物治疗动脉粥样硬化潜在的安全风险。方法采用生物信息技术提取GEO数据库中的基因芯片数据集GSE32547,对他汀类药物干预人脐静脉内皮细胞差异表达基因进行基因本体注释、信号通路分析以及蛋白质互作网... 详细信息

目的通过生物信息技术探讨他汀类药物治疗动脉粥样硬化潜在的安全风险。方法采用生物信息技术提取GEO数据库中的基因芯片数据集GSE32547,对他汀类药物干预人脐静脉内皮细胞差异表达基因进行基因本体注释、信号通路分析以及蛋白质互作网络分析,以探讨其用药风险预警。结果生物信息分析结果显示,他汀类药物治疗动脉粥样硬化时会伴随骨骼肌损伤,以及神经化学传导、甲状腺代谢、呼吸系统及生殖异常的安全风险。结论他汀类药物用于动脉粥样硬化防治具有潜在的不良反应,使用时应密切关注患者骨骼肌状况,对于有骨骼肌疾患的患者应进行风险-效益评价。同时要注意神经系统、内分泌系统、呼吸系统及生殖系统等的用药安全风险。

关键词：他汀类药物动脉粥样硬化生物信息技术风险预警

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生物信息技术在亚健康检测与评估中的应用

上海中医药大学学报 2021年第3期35卷 7-11,32页

作者：郭晓静许家佗李勇枝上海中医药大学基础医学院上海201203 中国航天员科研训练中心北京100084

亚健康作为疾病与健康的中间状态,其早期识别和干预对降低发病率及维护大众健康有着重要的意义。近年来,生物信息技术在医学研究中广泛应用,与疾病相关的生物标志物逐渐被人们发现,推动了对疾病的精准治疗。采用生物信息技术联合中医诊... 详细信息

亚健康作为疾病与健康的中间状态,其早期识别和干预对降低发病率及维护大众健康有着重要的意义。近年来,生物信息技术在医学研究中广泛应用,与疾病相关的生物标志物逐渐被人们发现,推动了对疾病的精准治疗。采用生物信息技术联合中医诊断疾病的方法不仅能够凸显中医特色,为亚健康识别提供依据,也使得更早期干预以维护机体健康状态成为可能。因此,探索生物信息技术在亚健康检测与评估中的应用路径和方法十分重要。

关键词：生物信息技术亚健康健康管理精准治疗中医诊疗

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生物信息技术在微生物研究中的应用

信息记录材料 2018年第9期19卷 59-60页

作者：任志芳濮阳医学高等专科学校河南濮阳457000

自上个世纪末期,计算机技术、网络技术及软件技术得到了快速发展,并广泛的应用到各行各业,为信息交流、资源共享及各研究机构之间的合作打通了快速发展的通道,这也促进了生物信息技术的快速发展,并且在微生物研究中应用的越来越广泛,为... 详细信息

自上个世纪末期,计算机技术、网络技术及软件技术得到了快速发展,并广泛的应用到各行各业,为信息交流、资源共享及各研究机构之间的合作打通了快速发展的通道,这也促进了生物信息技术的快速发展,并且在微生物研究中应用的越来越广泛,为人类对微生物的研究提供了有力支撑。

关键词：生物信息技术微生物研究应用

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生物信息技术公司50强

生物技术世界 2006年第4期3卷 65-70页

作者：无张伟（译）《Bio-IT World》编辑部不详

任一行业的“50强”评选都属于评选者主观的选择，并且不时会冒出反对的声音。例如流行杂志在评选“50名最美丽的人”时，我们总会怀疑那些被选中的能否得到读者的认同。不管怎样，最终的选择都是在质疑的声音中出炉的。

关键词：生物信息技术公司评选声音

基于生物信息技术对代谢酶基因多态性与肺癌易感性关系的研究

维普期刊数据库评论

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维普期刊数据库

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基于生物信息技术对代谢酶基因多态性与肺癌易感性关系的研究

作者：黄凤毛中南大学

学位级别：硕士

摘要：国内外对于代谢酶的基因多态性与肺癌易感性有很多研究报道,但结果不一致。本文基于生物信息技术研究Ⅰ相代谢酶CYP2A6、CYP1A1、CYP2D6的基因多态性在湖南汉族人群中的分布频率,探讨其基因多态性与肺癌易感性之间的关系。旨在为... 详细信息

摘要：国内外对于代谢酶的基因多态性与肺癌易感性有很多研究报道,但结果不一致。本文基于生物信息技术研究Ⅰ相代谢酶CYP2A6、CYP1A1、CYP2D6的基因多态性在湖南汉族人群中的分布频率,探讨其基因多态性与肺癌易感性之间的关系。旨在为确定肺癌易感性遗传标记,为肺癌的病因学研究和早期预防提供一定的实验研究依据。本文采取病例-对照研究方法,选取湖南省汉族168例肺癌患者及201例健康者作为对照,用蛋白酶K消化法提取外周血基因组DNA,用Primer Premier5.0软件设计PCR引物,采用两步法等位基因特异性PCR分析CYP2A6的基因多态性;采取PCR及PCR-RFLP技术检测代谢酶CYP1A1、CYP2D6基因型。对测序结果采用Chromas version2.22软件进行分析。对收集的数据采用SPSS16.0进行统计学分析,用χ2检验基因型的频率在正常对照组和肺癌组之间的分布差异,并进行多因素非条件logistic回归分析;采用MDR Soft-ware程序包(2.0eta版)进行基因-基因交互分析。研究结果表明,病例组和对照组之间CYP2A6基因型：野生型(WW),杂合型缺失(WD)和缺失基因型(DD)的频率没有显著差异(P>0.05);病例组和对照组之间CYP1A1, CYP2D6的野生型(WW),突变型(MM)和杂合突变型(WM)的基因频率无显著性差异(P>0.05)。然后进行多因素非条件logistic回归分析,CYP2A6、CYP1A1、CYP2D6基因多态性与肺癌患病风险无明显相关性。利用MDR(多因子降维分析法)检测环境与3个基因之间的交互作用,结果显示：CYP2A6、CYP1A1、CYP2D6三基因座交互模型为最佳模型,具有统计学意义(P值0.0004),交叉验证一致性10/10,检验样本准确度0.572。中国湖南汉族人群CYP2A6、 CYP1A1、CYP2D6三个基因不存在独立效应,但是存在三阶交互作用。CYP2A6、CYP1A1、CYP2D6基因型的改变对肺癌的发生不存在独立效应,但是,CYP2A6、CYP1A1、CYP2D6之间具有交互作用,增加肺癌遗传易感性。

关键词：细胞色素P450 生物信息技术基因多态性肺癌遗传易感性