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两种猕猴属动物肠道微生物多样性比较研究

昭通学院学报 2019年第5期41卷 39-45页

作者：赵俊松张梅桑正林吴银梅昭通学院科技处云南昭通657000 昭通学院农学与生命科学学院云南昭通657000

通过现有恒河猴(Macaca mulatta,Mm)和藏酋猴(Macaca thibetana,Mt)肠道微生物的16SrRNA高通量测序鉴定结果进行对比分析;结果显示,恒河猴和藏酋猴肠道微生物门分类水平中的核心菌群包括Firmicutes、Bacteriodetes、Proteobacteria、Actinobacteria和Spirochaetia,占藏酋猴肠道微生物总量的95.81%;占恒河猴肠道微生物总量的90.87%。在属分类水平中核心菌群包括Catenibacterium、Dialister、Faecalibacterium、Blautia、Dorea、Roseburia和Helicobacter,占藏酋猴肠道微生物总量的27.43%;占恒河猴肠道微生物总量的9.31%。从门分类水平和属分类水平中,猴属动物肠道微生物共有核心菌群所占比例显著大于种群特有菌群,但在不同物种中丰富度存在显著差异;目前研究表明上述共有菌群大多与动物生活环境和食物资源存在一定联系;或许这也表明动物适应性进化过程中,环境和食性等其他因素对动物肠道微生物组成结构的影响更大。

关键词：肠道微生物 16S rRNA基因协同适应猕猴属

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猕猴属种间及亚种间RAPD分析

中山大学学报（自然科学版） 1999年第1期38卷 111-114页

作者：黄韧陈琛马昭林梁兴林广东省实验动物监测所华南濒危动物研究所

应用ＲＡＰＤ技术分析了猕猴属（Ｍａｃａｃａ）种间和亚种间６个分类群之间的遗传多态性，共筛选出１６个随机引物每个分类群平均获得７７个遗传标记，根据遗传距离构建了系统发育进化树，结果显示从ＲＡＰＤ数据分析得到的６个分类群... 详细信息

应用ＲＡＰＤ技术分析了猕猴属（Ｍａｃａｃａ）种间和亚种间６个分类群之间的遗传多态性，共筛选出１６个随机引物每个分类群平均获得７７个遗传标记，根据遗传距离构建了系统发育进化树，结果显示从ＲＡＰＤ数据分析得到的６个分类群的相互关系与形态、同功酶、ｍｔＤＮＡ的研究结果基本一致．表明ＲＡＰＤ技术适用于猕猴属中近缘种间和亚种间的分类分析．

关键词：猕猴属 RAPD分析遗传多态性种间亚种间

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中国大陆猕猴属物种资源快速鉴定方法的研究

中国大陆猕猴属物种资源快速鉴定方法的研究

作者：周月才福建农林大学

学位级别：硕士

中国大陆猕猴属物种资源已十分稀少并具减少趋势,在野外调查和保护执法工作中获得的猕猴属疑似样品往往是污染、腐败、残缺不全(如毛发、骨骼、蹄甲、脏器、肌肉纤维等)或极微量的检材,难以检查辨认。为了更有力的保护猕猴属野生动物,... 详细信息

中国大陆猕猴属物种资源已十分稀少并具减少趋势,在野外调查和保护执法工作中获得的猕猴属疑似样品往往是污染、腐败、残缺不全(如毛发、骨骼、蹄甲、脏器、肌肉纤维等)或极微量的检材,难以检查辨认。为了更有力的保护猕猴属野生动物,打击非法走私和狩猎,建立对我国大陆猕猴属物种的分子生物学鉴定技术是十分有意义的。试验一:本试验主要采用非损伤性的方法,从中国大陆四种猕猴属物种粪样中提取DNA ,同时从Genbank下载一些常见动物、猕猴属5种动物及同科相近属、同目相近科动物的cyt b基因序列,利用软件设计并合成猕猴属通用引物1对(Ms/Ma)、豚尾猴特异性引物1对(Ts/Ta)、猕猴特异性引物(Ys/Ya)、短尾猴特异性引物2对(Ds1/Da1、Ds2/Da2)、熊猴特异性引物2对(Xs1/Xa1、Xs2/Xa2),并通过大量试验对其特异性、稳定性和敏感性进行验证。结果表明:通用引物Ma、Ms对我国猕猴属物种DNA特异,只能特异性地扩增猕猴属物种DNA,而对一些常见动物及近源动物的DNA不能扩增;其它几对引物也具有良好的特异性和稳定性。尤其是敏感性试验,测出了各引物能检测出该物种所需的最低浓度。试验二:利用Primer Express软件设计合成Taqman探针:豚尾猴1条(Ts/Ta)、猕猴3条(Ms0/Ma0、Ms1/Ma1、Ms2/Ma2)、短尾猴1条(Ds1/Da1)、熊猴1条(Xs1/Xa1),经大量试验验证,结果表明:猕猴探针(Ms0/Ma0)、豚尾猴探针(Ts/Ta)和短尾猴(Ds1/Da1)探针特异性很好,能将其与中国大陆其它猕猴属区分开来。猕猴探针(Ms1/Ma1、Ms2/Ma2)能首先将猕猴、短尾猴与熊猴、豚尾猴区分开,再利用短尾猴探针(Ds1/Da1)将猕猴和短尾猴区分开即可。本试验首次采用了分步鉴定的方法,这对其它野生动物的鉴定具有借鉴意义。试验三:从多种微量检材:猕猴毛发、肌肉,短尾猴毛发、血液中提取DNA ,与从粪样中取得的DNA模板做比较,检验结果的一致性。结果表明:从毛发、肌肉、血液中获取的DNA与从粪样中取得的DNA检测结果具有一致性。表明本方法稳定、可靠,从而达到对猕猴属微量组织鉴定的目的。试验四:对琼脂糖凝胶电泳跑的比较亮的目的条带进行切胶回收并测序,看结果是否是需要的目的条带。结果表明,测序所得的序列与网上发布的序列结果一致,即为所要的目的条带。同时还设计测序引物,测得了四种猕猴属物种的部分Cytb序列,为以后的研究提取科学依据。本试验建立了我国大陆猕猴属4种动物的分子生物学查验和实验室确证方法。为野外调查中遇到的猕猴属动物的残余物及其部分微量样品的查验提供了方便、灵敏、可靠的检测手段。

关键词：猕猴属物种鉴定 cyt b 特异性PCR 荧光PCR

中国猕猴属进化分析及物种特异性遗传标记的研究

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中国猕猴属进化分析及物种特异性遗传标记的研究

作者：张俊明福建农林大学

学位级别：硕士

对野外调查和保护执法工作中获得的猕猴属动物疑似样品进行物种鉴定时,往往是面对污染、腐败、残缺不全（如毛发、骨骼、蹄甲、脏器、肌肉纤维等）或极微量的检材,难以检查辨认。建立对我国猕猴属物种（特别是微量组织）进行分子检测的... 详细信息

对野外调查和保护执法工作中获得的猕猴属动物疑似样品进行物种鉴定时,往往是面对污染、腐败、残缺不全（如毛发、骨骼、蹄甲、脏器、肌肉纤维等）或极微量的检材,难以检查辨认。建立对我国猕猴属物种（特别是微量组织）进行分子检测的灵敏、精确、可靠的方法,解决我国猕猴属5个物种的分子生物学鉴定技术问题是十分有意义的。试验一:参照人类和猕猴cytb基因两端序列设计合成引物对Ca、Cs,对猕猴属2个物种熊猴和豚尾猴的cytb基因进行扩增,并将扩增片断测序,测得cytb基因全长1140bp的片断序列（其中豚尾猴的基因登陆号是:EU204975）。利用DNAstar软件进行比对,构建猕猴属系统进化树,进行遗传进化分析,并为其物种的分子鉴定奠定基础。试验二:从Genbank下载的7种常见的物种、猕猴属5个物种及同科相近属、同目相近科10个物种的cytb基因序列,利用DNAstar软件进行种间序列比对,寻找猕猴属5个物种的保守突变位点,然后再根据引物设计有关原则,设计合成对该属物种的一对特异性引物:Ma、Ms。用该对引物对从10种近源物种和7种常见物种的肌肉、毛发或粪便中提取的总DNA或mtDNA的细胞色素b段进行PCR扩增,并对其特异性、敏感性和重复性进行了验证。结果表明,引物Ma、Ms对我国猕猴属物种DNA特异,即在PCR反应时,该引物只能特异地扩增猕猴属物种DNA,而对一些常见物种及近源物种的DNA不能扩增,经验证检测正确率100%,表明了本方法稳定、灵敏、可靠。从而达到对猕猴属微量组织鉴定的目的,建立了猕猴属5个物种的分子生物学查验和实验室确证方法。为野外调查中获得的猕猴属动物的残余物及其部分微量样品的查验提供了便捷、可靠的检测手段。比对猕猴属5个物种cytb基因序列,寻找各物种的保守突变点,并根据这些突变,利用Primer 5.0和Oligo 6.0软件设计各物种的特异引物,然后对其特异性、敏感性和重复性进行了验证,并对PCR条件进行了优化。验证结果表明:各猕猴属物种的特异引物对相应物种的DNA能特异PCR扩增,即在PCR反应时,引物只能分别特异地扩增相应物种的DNA目的片断,而对猕猴属其他物种的DNA不能扩增,经验证检测正确率100%,表明本方法稳定、灵敏、可靠。从而达到对猕猴属5个物种微量组织鉴定的目的,建立了猕猴属5个物种分子生物学查验和实验室检验的方法。为野外调查中获得的猕猴属动物的残余物及其部分微量样品的查验提供了方便、可靠的检测手段。

关键词：猕猴属物种鉴定 cytb基因特异性PCR

猕猴属6个种的rDNA变异及其系统进化关系

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Acta Genetica Sinica 1996年第5期23卷 343-350页

作者：王文宿兵兰宏刘瑞清张亚平中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化开放实验室

以人２８Ｓ、１８ＳｒＤＮＡ为探针，用１５种限制性内切酶构建了猕猴属６个种（Ｍ．ｍｕｌａｔｔａ、Ｍ．ｆａｃｓｉｃｕｌａｒｉｓ、Ｍ．ａｒｃｔｏｉｄｅｓ、Ｍ．ａｓｓａｍｅｎｓｉｓ、Ｍ．ｔｈｉｂｅｔａｎａ、Ｍ．ｎｅｍｅｓｔｒ... 详细信息

以人２８Ｓ、１８ＳｒＤＮＡ为探针，用１５种限制性内切酶构建了猕猴属６个种（Ｍ．ｍｕｌａｔｔａ、Ｍ．ｆａｃｓｉｃｕｌａｒｉｓ、Ｍ．ａｒｃｔｏｉｄｅｓ、Ｍ．ａｓｓａｍｅｎｓｉｓ、Ｍ．ｔｈｉｂｅｔａｎａ、Ｍ．ｎｅｍｅｓｔｒｉｎａ）和滇金丝猴（Ｒｈｉｎｏｐｉｔｈｅｃｕｓｂｉｅｔｉ）、白颊长臂猿（Ｈｙｌｏｂａｔｅｓｌｅｕｃｏｇｅｎｙｓ）核糖体ＤＮＡ重复单位的限制性内切酶图谱。红面猴（Ｍ．ａｒｃｔｏｉｄｅｓ）与熊猴（Ｍ．ａｓｓａｍｅｎｓｉｓ）拥有完全相同的限制性内切酶图谱。基于内切酶图谱得到了６８个信息位点并计算了各种ｒＤＮＡ重复型间的遗传距离。用ＰＨＹＬＩＰｖｅｒｓｉｏｎ３．５ｃ软件包中的ＮＥＩＧＨＢＯＲ和ＲＥＳＴＭＬ程序，以滇金丝猴和白颊长臂猿为外群，构建了ＮＪ树和最大似然树。两棵树的拓扑结构不完全一致，但恒河猴（Ｍ．ｍｕｌａｔｔａ）和食蟹猴（Ｍ，ｆａｃｓｉｃｕｌａｒｉｓ）总是位于树的基部，提示它们可能是最早分化出的类群。熊猴－红面猴（Ｍ．ａｓｓａｍｅｎｓｉｓ－Ｍ．ａｒｃｔｏｉｄｅｓ）虽然与藏猴（Ｍ．ｔｈｉｂｅｔａｎａ）共享的限制性位点数更多，在ＮＪ树上两类动物也最为接近，但在最大似然树中熊猴－红面猴却与平顶猴（Ｍ?

关键词：猕猴属灵长目核糖体DNA 系统进化

基于线粒体控制区序列的猕猴属系统发育研究(英文)

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Zoological Research 2004年第5期25卷 385-390页

作者：李青青张亚平中国科学院昆明动物研究所分子进化与基因组多样性实验室中国科学院研究生院北京100039

通过线粒体部分控制区DNA序列数据探讨 7种猕猴属物种的分子系统发育关系。结果表明熊猴的核苷酸多样度最高 ,而藏酋猴核苷酸多样度较低。基于控制区序列数据所构建的最大似然树 ,不考虑食蟹猴的位置 ,7种猕猴物种可粗略地分为 3个种组 ... 详细信息

通过线粒体部分控制区DNA序列数据探讨 7种猕猴属物种的分子系统发育关系。结果表明熊猴的核苷酸多样度最高 ,而藏酋猴核苷酸多样度较低。基于控制区序列数据所构建的最大似然树 ,不考虑食蟹猴的位置 ,7种猕猴物种可粗略地分为 3个种组 ,即狮尾猴组 (包括北平顶猴 )、头巾猴组 (包括红面猴、熊猴和藏酋猴 )和食蟹猴组 (包括恒河猴和台湾猴 )。与前人 (Fooden&Lanyon ,1989;Tosietal,2 0 0 3a ;Deinard&Smith ,2 0 0 1;Evansetal ,1999;Hayasakaetal,1996 ;Morales&Melnick ,1998)的结果不同 ,我们的结果支持食蟹猴比北平顶猴分化早的假设 ;东部恒河猴 (相对于台湾猴 )和东部熊猴 (相对于藏酋猴 )出现并系。与Y染色体、等位酶、核基因以及部分形态学数据推测的结果 (Delson ,1980 ;Fooden&Lanyon ,1989;Fooden ,1990 ;Tosietal,2 0 0 0 ,2 0 0 3a ,b ;Deinard&Smith ,2 0 0 1)一致 ,红面猴应归于头巾猴组 ,但此结论与前人(Hayasakaetal,1996 ;Morales&Melnick ,1998;Tosietal,2 0 0 3a)依据线粒体得到的结果有较大分歧。

关键词：线粒体猕猴属恒河猴食蟹猴体部核苷酸控制区物种分子系统发育多样度

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猕猴属动物冷应激休克的诊治体会

浙江畜牧兽医 2018年第2期43卷 43-43页

作者：邹建强杭州野生动物世界浙江杭州311422

猕猴属（Macaca）动物包括22种猕猴。主要特征是具有颊囊,躯体粗壮,前肢与后肢同等长,拇指能与其它四指相对,抓握东西灵活,前额低,有一突起的棱。猕猴属的栖息地广泛,草原、沼泽及各类森林地区皆可居留栖息,主要分布于亚洲东南部。群居... 详细信息

猕猴属（Macaca）动物包括22种猕猴。主要特征是具有颊囊,躯体粗壮,前肢与后肢同等长,拇指能与其它四指相对,抓握东西灵活,前额低,有一突起的棱。猕猴属的栖息地广泛,草原、沼泽及各类森林地区皆可居留栖息,主要分布于亚洲东南部。群居,数十只乃至数百只大群。主要以树叶、嫩枝、野菜等为食,也捕食其它小动物。相互之间联系时会发出各种声音或手势,互相之间梳毛也是一项重要的社交活动。

关键词：猕猴属小动物冷应激诊治休克森林地区社交活动栖息地

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猕猴属五个种mtDNA多态性研究

Acta Genetica Sinica 1990年第1期17卷 23-33页

作者：张亚平施立明中国科学院昆明动物研究所

本文以10种限制性内切酶研究猕猴属5个种(Macaca mulatta.M.nemestrina.M.assemensis.M.thibetana,M arctoides)线粒体DNA进化。在13个个体中,共检出8种限制性类型。恒河猴种内存在广泛的线粒休DNA限制性片段长度多态性(RFLP)。结合日本... 详细信息

本文以10种限制性内切酶研究猕猴属5个种(Macaca mulatta.M.nemestrina.M.assemensis.M.thibetana,M arctoides)线粒体DNA进化。在13个个体中,共检出8种限制性类型。恒河猴种内存在广泛的线粒休DNA限制性片段长度多态性(RFLP)。结合日本猴(M.fuscata)的有关资料,构建了猕猴属6个种的分子系统树,并给出各个种的分化时间。结果表明,这6个种可分成4个类群,熊猴和藏酋猴、恒河猴和日本猴之间的遗传距离较近,可分别划为同一类群,红面猴与其他5种猴的遗传距离最远,在系统发生上分离最早。

关键词：猕猴属线粒体DNA 多态性

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西藏墨脱发现猕猴属一新种——白颊猕猴

兽类学报 2015年第3期35卷 296-296页

作者：范朋飞大理大学东喜马拉雅资源与环境研究所

近日,由影像生物调查所（Imaging biodiversity expedition,IBE）摄影师,深圳民间探险家李成、西南林业大学赵超（并列第一作者）和大理大学范朋飞教授（通讯作者）合作撰写的“西藏墨脱发现猕猴属一新种——白颊猕猴”在《美国灵长类学... 详细信息

近日,由影像生物调查所（Imaging biodiversity expedition,IBE）摄影师,深圳民间探险家李成、西南林业大学赵超（并列第一作者）和大理大学范朋飞教授（通讯作者）合作撰写的“西藏墨脱发现猕猴属一新种——白颊猕猴”在《美国灵长类学报American Journal of Primatology》杂志网站正式在线发表。

关键词：猕猴属新种脱发西藏林业大学生物调查摄影师探险家