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普通核桃与深纹核桃中叶绿体基因组密码子使用特征对比

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江苏农业学报 2024年第8期40卷 1507-1520页

作者：朱艳韩长志西南林业大学林学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

本研究旨在对比分析普通核桃与深纹核桃中叶绿体基因组密码子的使用偏好性,对普通核桃与深纹核桃中各53条蛋白质编码区序列开展预测分析,明确上述2种核桃叶绿体基因组中的最优密码子,为未来开展核桃物种的亲缘关系研究提供理论依据。利... 详细信息

本研究旨在对比分析普通核桃与深纹核桃中叶绿体基因组密码子的使用偏好性,对普通核桃与深纹核桃中各53条蛋白质编码区序列开展预测分析,明确上述2种核桃叶绿体基因组中的最优密码子,为未来开展核桃物种的亲缘关系研究提供理论依据。利用Codon W 1.4.2和在线软件CUSP等分析普通核桃与深纹核桃中的叶绿体基因组密码子,获得相对同义密码子使用度(RSCU)、有效密码子数(ENC)、G+C含量等参数,再进行中性绘图分析、有效密码子数分析及奇偶偏好性分析。普通核桃与深纹核桃中叶绿体基因组的密码子适应指数均为0.167,ENC均在45.00以上,表明密码子偏好性弱。普通核桃与深纹核桃中叶绿体基因组密码子的G+C含量整体表现为:基因中所有密码子第1位碱基G+C的含量(GC_(1))>基因中所有密码子第2位碱基G+C的含量(GC_(2))>基因中所有密码子第3位碱基G+C的含量(GC_(3))。进一步分析发现,第3位碱基的使用频率表现为T大于A,G大于C。从普通核桃中筛选出14个最优密码子,从深纹核桃中筛选出17个最优密码子,其中共有23个最优密码子在第3个位置偏好以A/U结尾。总之,普通核桃和深纹核桃中叶绿体基因组密码子偏好性主要受到自然选择的影响,本研究结果可以为进一步探索核桃抗性遗传基因的改良和表达提供理论基础和数据支撑。

关键词：普通核桃深纹核桃叶绿体基因组同义密码子偏好性

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滇西北深纹核桃(Juglans sigillata)种质资源遗传多样性研究

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云南农业大学学报（自然科学版） 2018年第4期33卷 597-604页

作者：肖良俊陈少瑜宁德鲁吴涛贺娜云南省林业科学院经济林研究所云南昆明650201 云南省林业科学院云南省木本油料工程技术研究中心云南昆明650201 云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201

【目的】揭示滇西北深纹核桃(Juglans sigillata)种质资源的遗传多样性,为该区域深纹核桃资源的有效利用和科学保护提供依据。【方法】采用微卫星(SSR)分子标记技术对滇西北13个群体共332份深纹核桃种质进行了遗传多样性分析;利用分子... 详细信息

【目的】揭示滇西北深纹核桃(Juglans sigillata)种质资源的遗传多样性,为该区域深纹核桃资源的有效利用和科学保护提供依据。【方法】采用微卫星(SSR)分子标记技术对滇西北13个群体共332份深纹核桃种质进行了遗传多样性分析;利用分子方差分析(AMOVA)揭示群体间的遗传分化状况;用Mantel检验估算群体间遗传距离和地理距离的相关性。【结果】(1)滇西北13个核桃群体的期望杂合度介于0.456 5~0.630 0之间,平均为0.528 6;Shannon信息指数介于0.852 9~1.336 7之间,平均为1.026 4;Nei’s基因多样性指数在0.442 1~0.622 5之间,平均为0.528 6,遗传多样性属于中等水平,遗传多样性呈由西北群体(迪庆和怒江)向东南群体(丽江和大理)逐步降低的分布格局。(2)群体间的遗传分化系数为0.101 1,遗传变异主要来自群体内;AMOVA分析也得到了类似的结果,群体内的分化是该区域种质资源变异的主要来源。(3) UPGMA聚类结果显示:13个群体在遗传一致度为0.85时被聚成了4组;Mantel检验结果表明:群体间遗传距离与地理距离相关性显著(r=0.644 1,P=0.002 0)。【结论】长期的自然选择及人为影响,导致了滇西北核桃种质资源遗传多样性水平及特有的分布格局,该区域核桃资源群体间的遗传分化较低,遗传变异主要来源于群体内。资源选育和保护时,在选择遗传多样性高的群体基础上,应侧重于群体内家系和单株的选择。

关键词：深纹核桃种质资源滇西北 SSR标记遗传多样性

基于UHPLC-QE-MS代谢组学分析云南不同产地深纹核桃仁品质差异

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食品工业科技 2024年

作者：雷舒雯赵红付晓萍龚加顺彭春秀云南农业大学食品科学技术学院云南省农业科学院农产品加工研究所云南农业大学园林园艺学院

采用非靶向代谢组学方法，探究云南不同产地深纹核桃仁代谢产物的差异性。运用超高效液相色谱-串联质谱（UHPLC-QE-MS），通过主成分分析、正交偏最小二乘判别分析、聚类分析、代谢物及代谢通路差异性分析对云南深纹核桃仁的代谢组学特... 详细信息

采用非靶向代谢组学方法，探究云南不同产地深纹核桃仁代谢产物的差异性。运用超高效液相色谱-串联质谱（UHPLC-QE-MS），通过主成分分析、正交偏最小二乘判别分析、聚类分析、代谢物及代谢通路差异性分析对云南深纹核桃仁的代谢组学特征进行研究。研究结果共鉴定出305种代谢物，其中脂肪酸、莽草酸和苯丙酸、氨基酸和多肽占比较高，主要参与苯丙氨酸代谢，黄酮和黄酮醇的生物合成，缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸的生物合成等代谢途径。8个产地深纹核桃仁中差异代谢物有185种（VIP > 1且P 核桃仁潜在标志物，丁香酸、邻苯二甲酸二异癸酯、癸酸等为丽江市古城区核桃仁潜在标志物，4-羟基-3-甲氧基肉桂醛为迪庆州香格里拉市核桃仁潜在标志物，异土木香内酯、山奈酚、胆绿素等为大理州漾濞县核桃仁潜在标志物，香兰素为普洱市景东县核桃仁潜在标志物，山奈素、亮氨酸、异亮氨酸等为楚雄州大姚县核桃仁潜在标志物，N-乙酰苯丙氨酸、丙二酸、天冬酰胺等为保山市昌宁县核桃仁潜在标志物，多巴黄质、7-乙酰氧基-4-甲基香豆素、十一烷酸等为临沧市凤庆县核桃仁潜在标志物，这些差异可能会对核桃仁的抗氧化活性产生一定的影响。通过指纹图谱和相似度分析有效实现了不同产地核桃仁区分。该研究提供了云南不同产地深纹核桃仁代谢物信息，UHPLC-QE-MS技术对云南不同产地深纹核桃仁的鉴别具有可行性。

关键词：深纹核桃代谢组学不同产地差异代谢物指纹图谱

怒江州深纹核桃种质资源SSR遗传多样性分析

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福建农林大学学报（自然科学版） 2019年第2期48卷 252-258页

作者：吴涛陈少瑜宁德鲁肖良俊贺娜唐春云和玉德云南省林业科学院云南昆明650201 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201 云南省木本油料工程技术研究中心云南昆明650201 怒江州木本油料产业发展研究所云南泸水673199 怒江州林业科学研究所云南泸水673199

采用SSR分子标记技术对怒江州4个群体122份深纹核桃种质资源进行遗传多样性分析,揭示其多样性水平及遗传结构情况.结果表明:(1)怒江州核桃资源的遗传多样性属于中等水平.4个核桃群体的期望杂合度介于0.503～0.650之间,平均为0.591;Shan... 详细信息

采用SSR分子标记技术对怒江州4个群体122份深纹核桃种质资源进行遗传多样性分析,揭示其多样性水平及遗传结构情况.结果表明:(1)怒江州核桃资源的遗传多样性属于中等水平.4个核桃群体的期望杂合度介于0.503～0.650之间,平均为0.591;Shannon信息指数介于0.937～1.365之间,平均为1.157;Nei′基因多样性指数在0.485～0.641之间,平均为0.576.4个群体中兰坪群体的遗传多样性最高,泸水群体的遗传多样性最低.(2)群体间的遗传分化系数介于0.027 1～0.126 4之间,平均为0.060 9,表明遗传变异主要来自群体内;基因流平均为3.858 3.(3)UPGMA聚类显示4个群体在遗传一致度为0.85时被聚成了4组,兰坪与福贡聚为一组,贡山和泸水分别单独聚为一组,Mantel检验结果表明,群体间遗传距离与地理距离相关性显著(r=0.702 9,P=0.032 9).

关键词：深纹核桃遗传多样性 SSR 怒江州

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不同类型深纹核桃的表型多样性研究

西部林业科学 2022年第6期51卷 31-38,78页

作者：余务刚肖良俊吴涛马婷李贤忠宁德鲁西南林业大学云南昆明650224 云南省林业和草原科学院云南昆明650201

为了比较不同类型深纹核桃质量和品质差异,以来自云南多地3个类型的深纹核桃作为研究对象,对其株型、枝叶和花果的表型性状进行方差分析、变异分析和表型多样性分析。结果显示:经F值检验,各表型性状在不同类型深纹核桃间差异性显著(P<0.... 详细信息

为了比较不同类型深纹核桃质量和品质差异,以来自云南多地3个类型的深纹核桃作为研究对象,对其株型、枝叶和花果的表型性状进行方差分析、变异分析和表型多样性分析。结果显示:经F值检验,各表型性状在不同类型深纹核桃间差异性显著(P深纹核桃间差异显著。泡核桃株型较为细长(树高3.27 m,干径6.75 cm),果枝率低(31.0%),雌花序数多(15.9个),果实小质量轻但出仁率高(55.0%),雌花序数变异系数大(1.09),果形Simpson指数高(0.9081),发枝力(2.2986)和小叶数(2.2995)Shannoon-Wiener指数高;夹绵核桃株型挺拔健壮(树高3.16 m,干径7.2 cm),果枝率一般(32.0%),雌花序数多(18.7个),雌花序数变异系数大(0.71),果形Simpson指数高(0.9087),三径均值Shannoon-Wiener指数高(3.6134);铁核桃株型矮小纤细(树高2.66 m,干径5.68 cm),果枝率高(34.0%),雌花序数较少(11.8个),果形大质量重但出仁率较低(44.0%),雌花序数变异系数大(1.11),果形Simpson指数高(0.9220),仁重(2.2982)和三径均值(2.2993)Shannoon-Wiener指数高。

关键词：深纹核桃表型多样性变异分析多样性指数

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20份深纹核桃种质资源的开花物候观察

西部林业科学 2021年第6期50卷 61-67页

作者：谢蕾马婷吴涛肖良俊宁德鲁李贤忠西南林业大学云南昆明650224 云南省林业和草原科学院云南昆明650201

为掌握深纹核桃资源在昆明的开花物候特征,筛选出其适宜的授粉组合,通过对昆明树木园核桃种质资源圃中收集的来自云南省9个州(市)14个县的20份深纹核桃资源开花物候进行观测。结果显示:供试的20份深纹核桃资源雌花单花开放持续18~29 d,... 详细信息

为掌握深纹核桃资源在昆明的开花物候特征,筛选出其适宜的授粉组合,通过对昆明树木园核桃种质资源圃中收集的来自云南省9个州(市)14个县的20份深纹核桃资源开花物候进行观测。结果显示:供试的20份深纹核桃资源雌花单花开放持续18~29 d,‘JC-17’子房最先显露,‘QJ-11’柱头最晚枯萎,3月下旬至4月上旬雌花进入盛花期;雄花单花开放天数持续19~29 d,‘HP-07’雄花单花开放持续时间最长,3月中旬至4月下旬为雄花盛花期;20份深纹核桃资源的雌花可授期持续7~14 d,多集中在8 d左右,雄花散粉期维持5~10 d,以9 d居多;根据雌雄花开放的先后顺序确定‘HP-07’‘LX-09’和‘YB-18’3份资源为雌雄同熟型其余均为雄先型。综合考虑20份深纹核桃资源雌花和雄花的花期相遇程度,得出‘YS-03’‘YS-05’‘YS-06’‘DQ-15’的雄花散粉期与‘LP-10’‘ZX-14’‘JC-17’和‘LP-20’的雌花可授期完全相遇,为最适宜的配置方案。

关键词：深纹核桃开花物候雄花散粉期雌花可授期授粉组合

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深纹核桃种质资源评价与挖掘研究进展

林业科技通讯 2021年第11期 26-31页

作者：谢蕾李贤忠宁德鲁马婷吴涛西南林业大学昆明650224 云南省林业和草原科学院昆明650201

深纹核桃(Juglans sigillata)在我国栽培广泛,种质资源是核桃良种选育的基础,现对我国深纹核桃种质资源的起源与分布、调查与收集情况以及资源评价和良种选育方面进行综述。根据目前深纹核桃种质资源评价与挖掘中存在的问题提出今后工... 详细信息

深纹核桃(Juglans sigillata)在我国栽培广泛,种质资源是核桃良种选育的基础,现对我国深纹核桃种质资源的起源与分布、调查与收集情况以及资源评价和良种选育方面进行综述。根据目前深纹核桃种质资源评价与挖掘中存在的问题提出今后工作的重点和方向,同时为核桃种质资源的开发利用提供参考。

关键词：深纹核桃 Juglans sigillata 资源评价良种选育

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云南省深纹核桃产业发展现状问题及对策

南方农业 2024年第3期18卷 199-203页

作者：李胜成李浩王翔吴涛西南林业大学云南昆明650224 云南农垦核桃产业发展有限公司云南昆明650224 云南省林业和草原科学院云南昆明650201

通过梳理云南省核桃产业、“一县一业”示范县建设、特色产区现状等,分析了存在的问题,提出从全省宏观层面上打造云南深纹核桃区域品牌的建议,持续发挥深纹核桃在乡村振兴和坚果产业中作为云南省“绿色银行”和“铁杆庄稼”的作用。

关键词：深纹核桃产业区域公用品牌云南

疏密降冠修剪对深纹核桃冠层特性和产量的影响

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云南农业科技 2024年第5期 21-25页

作者：郝佳波铁学江张雁东唐永奉冯丽娜陆斌云南省林业和草原科学院昆明650201 临沧市林业科学院云南临沧677099 大理白族自治州林业和草原科学研究所云南大理671099

为探讨疏密降冠修剪对深纹核桃冠层特性和产量的影响,连续2年对2处试验地修剪组和对照组的共36株深纹核桃进行冠层特性和产量测定。结果显示,修剪后,深纹核桃树体冠层的叶面积指数和冠层郁闭度数于第2年逐渐恢复,并略微提高,同时其落叶... 详细信息

为探讨疏密降冠修剪对深纹核桃冠层特性和产量的影响,连续2年对2处试验地修剪组和对照组的共36株深纹核桃进行冠层特性和产量测定。结果显示,修剪后,深纹核桃树体冠层的叶面积指数和冠层郁闭度数于第2年逐渐恢复,并略微提高,同时其落叶期延后5~10d;此外,修剪后的树体高度显著降低,干果单株和折算每公项产量于修剪后第1年略微变化后,第2年显著上升。

关键词：修剪叶面积指数冠层郁闭度深纹核桃