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北京市2015-2020年流感流行季流感样病例和流感病原学分析

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中华实验和临床病毒学杂志 2021年第1期35卷 44-48页

作者：马春娜吴双胜张莉张奕孙瑛段玮杨鹏王全意北京市疾病预防控制中心北京市预防医学研究中心传染病地方病控制所100013 北京市疾病预防控制中心北京全球健康中心办公室100013

目的了解2015-2020年流感流行季北京市流感流行特征。方法使用北京市2015-2020年流感样病例(influenza-like illness,ILI)和流感病原学监测数据,分析流感流行趋势和流感病毒流行特征。结果2015年第27周至2020年第26周共涉及5个流感流行... 详细信息

目的了解2015-2020年流感流行季北京市流感流行特征。方法使用北京市2015-2020年流感样病例(influenza-like illness,ILI)和流感病原学监测数据,分析流感流行趋势和流感病毒流行特征。结果2015年第27周至2020年第26周共涉及5个流感流行季,流感样病例百分比(percentage of influenza-like illness,ILI%)为1.58%。共检测ILI标本96892件,流感病毒核酸阳性率为16.32%,其中A(H3N2)亚型6474件(40.89%)、甲型H1N14410件(27.86%)、乙型Victoria系3290件(20.78%)、乙型Yamagata系1597件(10.09%)。ILI周报告数、ILI%与流感病毒阳性率变化趋势基本一致(r=0.796,P流感流行符合北半球流行特征,其中2017-2018和2018-2019流行季活跃期较长、流行水平较高,且各流行季优势毒株不同。

关键词：流感流感样病例亚型监测

基于哨点医院电子病历计算机自动识别技术的流感样病例试点监测评价

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中华预防医学杂志 2020年第6期54卷 691-695页

作者：朱爱琴刘建华徐承中张皓杨孝坤赵宏婷李志丽王丽萍冯录召郑亚明秦颖李中杰中国疾病预防控制中心传染病监测预警重点实验室传染病管理处北京102206 湖北省宜昌市疾病预防控制中心 443003

目的比较基于病历资料的医生报告与计算机自动识别方式对门急诊流感样病例(ILI)监测的准确性。方法2019年4—10月在宜昌市中心医院发热门诊、呼吸内科门诊及急诊内科门诊就诊的患者中,选取国际疾病分类第10版诊断编码属于J00-J22范围且... 详细信息

目的比较基于病历资料的医生报告与计算机自动识别方式对门急诊流感样病例(ILI)监测的准确性。方法2019年4—10月在宜昌市中心医院发热门诊、呼吸内科门诊及急诊内科门诊就诊的患者中,选取国际疾病分类第10版诊断编码属于J00-J22范围且病历症状信息完整的病例,共3542例,以流感监测专业人员根据ILI病例定义的判断结果为金标准,绘制受试者工作特征(ROC)曲线,计算灵敏度、特异度、诊断一致率,分析计算机自动识别与医生报告两种方式对ILI病例监测的准确性。结果病例年龄M(P25,P75)为30(24,38)岁;其中符合定义标准ILI病例为1179例(33.29%),医生报告ILI为1306例(36.87%),计算机自动识别ILI为1150例(32.47%);男性为1391例(39.27%)。计算机自动识别和医生报告与金标准判断的结果一致性Kappa值分别为0.97和0.66,ROC曲线下面积分别为0.98和0.84。计算机自动识别方式的灵敏度和特异度(分别为96.95%和99.70%)均高于医生报告方式(灵敏度和特异度分别为82.27%和85.78%)(P值均病例监测,具有良好的灵敏度和特异度。

关键词：流感样病例计算机自动识别电子病历监测方法评价

2011-2020年美国流感样病例的时空分析及其与气象因素的关联性

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2011-2020年美国流感样病例的时空分析及其与气象因素的关联性

作者：宋志娟郑州大学

学位级别：硕士

目的流感是一种传染性呼吸系统疾病,具有传染性强,发病率高等特点,在世界范围内造成了巨大的疾病负担。本研究通过流感样病例(influenza-like illness,ILI)数据了解流感的流行特征、探讨流感流行的影响因素,建立多元时间序列模型,并对... 详细信息

目的流感是一种传染性呼吸系统疾病,具有传染性强,发病率高等特点,在世界范围内造成了巨大的疾病负担。本研究通过流感样病例(influenza-like illness,ILI)数据了解流感的流行特征、探讨流感流行的影响因素,建立多元时间序列模型,并对流感进行短期预测。方法收集美国本土49个地区(48个州和哥伦比亚特区)2011年第1周至2020年第29周流感样病例发病数据。采用描述性分析方法分析流感样病例发病的时间特点及患病人群的年龄构成,地理信息系统用于实现发病率数据的可视化及数据统计特征提取,并应用时空分析探索流感的空间自相关和时空聚集性,识别流感发病高风险地区。以识别到的高风险地区为研究目标,收集该地区2011年第1周至2020年第29周的气象数据及PM数据。对于流感影响因素研究,先采用Spearman秩相关分析探索单个因素与流感样病例之间的关系,然后构建分布滞后非线性模型,在研究主要影响因素与流感样病例发病率之间的关联时将其他影响因素作为混杂因素进行调整。运用时间序列分析构建季节性移动平均自回归(seasonal autoregressive integrated moving average model,SARIMA)模型,在此基础上纳入气象因素构建SARIMAX模型,检验模型预测效能,并对高风险地区流感发病率进行短期预测。结果1.2011年第1周至2020年第29周美国共计报告流感样病例9,176,771人次。占门诊就诊病例的2.24%。ILI的年发病率在5.92-15.84/10万之间波动。流感样病例全年均有发生,在每年12月至次年2月达到高峰,并可持续到5月。在所有流感样病例中,5-24岁人群的占比最高,约为35.66%,65岁以上年龄的患者最少,约为6.72%。不同年龄组之间发病率的差异有统计学意义(P流感样病例累积发病率(1/10万)较高的前三个州,分别为1355.54、1062.45和1061.51。报告的流感样病例累积发病率较低的是俄亥俄州、华盛顿州和爱荷华州。2.在美国整体水平上,除2011年、2018年和2019年外,流感样病例发病均存在空间相关性。局部空间自相关结果显示,密西西比州常年具有较高的ILI发病率,并呈现高-高聚集性,时空扫描结果也显示密西西比州为流感的高发聚集区,有较好的代表性,所以作为后续重点研究的州。3.分布滞后非线性模型分析结果显示,在密西西比州,温度与流感样病例发病率呈负相关,气压与流感样病例发病率呈正相关。在0-4周的累积暴露温度下,相对危险度(relative risk,RR)在温度降至0.5℃时最高(RR=4.63,95%CI:3.63-5.90),压力升高至102.0kpa时最高(RR=6.64,95%CI:3.74-11.80)。极端低温和高压可增加ILI的发病风险。4.在温度滞后1周、风速滞后0周和气压滞后4周下的SARIMAX(1,0,0)(1,1,0)模型为最优模型,赤池信息准则(akaike information criterion,AIC)和贝叶斯信息准则(bayesian information criterion,BIC)值最低。分别采用SARIMA模型和SARIMAX模型对密西西比州2019年第1周至2020年第29周流感样病例发病率进行预测,实际值与预测值的相对误差表明,预测值与实际值吻合较好,平均绝对百分比误差(mean absolute percentage error,MAPE)为33.386%,且SARIMAX模型对ILI发病的预测效果优于SARIMA模型。最后应用SARIMAX(1,0,0)(1,1,0)对2020年第30周至2021年第52周的流感发病率进行预测。结论1.美国流感流行存在明显的季节性。高危集群主要集中在美国东南部,尤其以密西西比州最有代表性,其ILI发病率呈现高-高聚集,时间聚类主要集中在每年的1-3月。2.在短期内,密西西比州ILI的发病率与温度和压力密切相关,低温和高压是密西西比州ILI发病的危险因素,我们需要在寒冷和高压的冬季更加重视ILI的发病。3.SARIMAX模型在流感的短期预测上有较好的预测效果,因此可以结合气象等因素构建SARIMAX模型,对未来流感进行短期预测。

关键词：流感样病例时空分析气象因素分布滞后非线性模型多元时间序列模型

2013-2020年江苏省镇江市流感样病例及其病原学监测分析

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疾病监测 2021年第12期36卷 1302-1307页

作者：孙丽娜袁兆虎刘金缪春华镇江市疾病预防控制中心江苏镇江212004

目的了解2013—2020年江苏省镇江市流感样病例(ILI)的流行病学特征及流感病毒的病原学变化趋势,为流感的防控提供科学依据。方法利用镇江市现有的流感监测哨点医院和流感监测网络实验室进行病例和病原学监测,并对2013—2020年的监测数... 详细信息

目的了解2013—2020年江苏省镇江市流感样病例(ILI)的流行病学特征及流感病毒的病原学变化趋势,为流感的防控提供科学依据。方法利用镇江市现有的流感监测哨点医院和流感监测网络实验室进行病例和病原学监测,并对2013—2020年的监测数据进行统计分析。结果2013—2020年镇江市流感监测哨点医院共报告207252例ILI,年平均ILI百分比(ILI%)为3.50%,总体呈上升趋势(趋势χ2=30554.00,P病例分别占39.91%、27.53%、7.40%、17.93%、7.23%。在同一个流感监测年度内ILI%存在2个高峰(12月至次年2月、6—9月)。2013—2020年镇江市共检测ILI标本25318份,流感阳性标本2780份,流感病毒检出率为10.98%,甲型流感(检出率为7.08%)的流行强度高于乙型流感(检出率为3.90%),甲型H1N1流感集中在1—3月,甲型H3N2集中在7—12月,乙型Victoria系集中在4—6月,乙型Yamagata系集中在1—3月。季节性流感病毒的流行存在2个特点:一是以某种型别毒株单独流行为主,二是多种型别毒株混合流行。2013—2019年镇江市共报告39起ILI暴发疫情,其中37起发生在学校和幼托机构,2020年未报告ILI暴发疫情。2020年新型冠状病毒肺炎防控期间镇江市ILI%(6.82%)较2013—2019年均值(3.03%)增加125.08%,并以≥60岁人群增加最多,增幅为176.61%;2020年1月流感病毒检出率为52.21%,2月为11.20%,3月为0.37%,4—12月为0,全年检出率(5.37%)比2013—2019年均值(11.79%)减少54.41%。结论镇江市各级政府及相关部门应根据当地ILI和流感病毒的流行特点,有针对性地加强流感防控工作,2020年新型冠状病毒肺炎防控期间所采取的防控措施值得借鉴。

关键词：流感样病例病原学监测新型冠状病毒肺炎流行病学

基于R语言的季节性自回归滑动平均(SARIMA)模型对流感样病例发病趋势的预测

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医学动物防制 2022年第4期38卷 349-353页

作者：王磊侯烨周美静王颖颖杨磊许振华李小平王露刘亚保定市疾病预防控制中心河北071000 保定市卫生监督局

目的探讨季节性自回归滑动平均(seasonal autoregressive integrated moving average,SARIMA)模型在流感样病例(influenza like illness,ILI)发病趋势预测中的可行性。方法收集保定市流感监测哨点医院2014年第1周—2020年第52周每周流感样病例就诊比例(consultation rate of influenza like illness,ILI%)资料,运用R语言进行时间序列分析并建立预测模型。结果保定市2014年第1周—2020年第18周ILI%时间序列不平稳,先缓慢上升,随后呈"V"形变动,并且具有明显的季节性。本次研究采用2014年第1周—2020年第18周的ILI%对数转换的序列建模,最适预测模型为ARIMA(1,1,0)(0,1,1)_(52),在残差Box-Pierce检验结果中,6阶延迟为χ^(2)=5.4204,P>0.05;12阶延迟为χ^(2)=10.109,P>0.05,残差为白噪声序列。利用2020年第19—52周的ILI%对数转换值进行预测,实际值均在预测值的95%置信区间(95%confidence interval,95%CI)内。结论SARIMA模型可用于保定市ILI短期发病趋势的预测。

关键词：季节性自回归滑动平均模型 R语言流感样病例预测发病趋势平稳序列时间序列防控

流感样病例咽拭子病毒核酸的临床检测结果分析

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智慧健康 2021年第20期7卷 19-21页

作者：吴凤华内蒙古赤峰市疾病预防控制中心内蒙古赤峰024000

目的分析流感样病例咽拭子病毒核酸的临床检测结果。方法研究自2019年1月至2020年12月采集到的咽拭子标本中,在随机原则下抽取1800份作为分析对象,标本均采集自流感样病例,回顾所有标本的核酸检测结果,分析其特点。结果1800份咽拭子核... 详细信息

目的分析流感样病例咽拭子病毒核酸的临床检测结果。方法研究自2019年1月至2020年12月采集到的咽拭子标本中,在随机原则下抽取1800份作为分析对象,标本均采集自流感样病例,回顾所有标本的核酸检测结果,分析其特点。结果1800份咽拭子核酸检测阳性的有476份,阳性率26.44%;男性和女性流感样病例咽拭子核酸检测阳性率对比,差异无统计学意义(P>0.05);城镇流感样病例咽拭子核酸检测阳性率高于农村,差异有统计学意义(P流感样病例咽拭子核酸检测阳性率比较,6~15岁高于其他年龄段,差异有统计学意义(P流感传播力度强,尤其是体质较差的人群,一旦发生容易累及全身各系统,通过对咽拭子标本进行病毒核酸检测,可以较准确的发现流感病毒的存在,并有效鉴别毒株类型,对流感防控具有重要意义。

关键词：流感样病例咽拭子病毒核酸检测特点

2016-2018年北京市朝阳区流感样病例中肠道病毒病原谱构成及分子流行病学特征

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中国病原生物学杂志 2019年第12期14卷 1443-1447,1480页

作者：梁海旭王海滨刘倩内蒙古科技大学包头医学院内蒙古包头014040 北京市朝阳区疾病预防控制中心中华预防医学会

目的探讨北京市朝阳区汽感样病例(ILI)中的肠道病毒(EV)病原谱构成及分子流行病学特征,为流感防控提供理论依据。方法采集2016年1月-2018年12月,北京中日友好医院、首都医科大学附属北京朝阳医院2家哨点医院就诊的6327例ILI咽拭子标本,... 详细信息

目的探讨北京市朝阳区汽感样病例(ILI)中的肠道病毒(EV)病原谱构成及分子流行病学特征,为流感防控提供理论依据。方法采集2016年1月-2018年12月,北京中日友好医院、首都医科大学附属北京朝阳医院2家哨点医院就诊的6327例ILI咽拭子标本,采用RT-PCT检测常见的11种呼吸道病原,对EV阳性标本采用普通PCR扩增病毒5-UTR片段,测序并进行基因分型。结果6327例ILI中,共检出EV阳性标本75例(1.19%),各年不同月份间及3年合计不同年龄组间EV阳性率比较差异有统计学意义(P均<0.05)。75例EV阳性标本其中28例分型成功,包括10例CV-A6.7例EV-68、6例CV-A10、2例CV-B1及CV-A2、CV-A4和CV-A5各1例。7例EV-68阳性标本进行聚类分析,5例A型,2例B型。结论2016-2018年北京市朝阳区ILI中EV病原谱主要包括CV-A6、EV-68、CV-A10、CV-B1、CV-A2、CV-A4和CV-A5,其中CV-A6、EV-68和CV-A10为优势病毒型,其中EV-68存在2个型别的共循环。

关键词：流感样病例肠道病毒感染谱分子流行病学

多重PCR检测方法在儿童流感样病例病原检测中的临床价值(附94例报告)

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中国实用儿科杂志 2020年第11期35卷 881-884页

作者：史大伟张艳茹董艳葛丽霞李丹李静邵俊彦郭东星窦海伟宛瑞杰涂鹏王红辛德莉首都医科大学附属北京友谊医院儿科北京100050 首都医科大学附属北京友谊医院北京热带医学研究所热带病防治研究北京市重点实验室北京100050 民航总医院儿科北京100025 北京市昌平区中西医结合医院儿科北京100096 应急总医院儿科北京100028

目的探讨多重聚合酶链反应(PCR)检测方法在儿童流感样病例病原检测中的临床应用价值,了解儿童流感样病例病原情况。方法收集2018年11月至2019年2月北京地区94例儿童流感样病例咽拭子标本,采用多重PCR核酸检测技术测定甲型流感病毒(InfA... 详细信息

目的探讨多重聚合酶链反应(PCR)检测方法在儿童流感样病例病原检测中的临床应用价值,了解儿童流感样病例病原情况。方法收集2018年11月至2019年2月北京地区94例儿童流感样病例咽拭子标本,采用多重PCR核酸检测技术测定甲型流感病毒(InfA)、甲型流感病毒H1N1(InfA-H1N1)、甲型流感病毒H3N2(InfA-H3N2)、乙型流感病毒(InfB)、人副流感病毒、呼吸道合胞病毒(RSV)、人腺病毒(HADV)、人鼻病毒(HRV)、人博卡病毒、人偏肺病毒(HMPV)、人冠状病毒(HCoV)和肺炎支原体(MP)、衣原体13种病原核酸。结果94例标本中78例(82.98%)可测出病原,其中69例(73.40%)检出1种病原,9例(9.57%)检出2种病原;94例标本中52例(55.32%)检出流感病原,26例(27.66%)检出非流感病原。单一病原检出由多到少为InfAH1N131例,InfA-H3N210例,RSV 9例,HMPV 7例,InfA、HRV、HADV各3例,InfB、HCoV及MP各1例。9例检出2种病原的标本中,6例检出流感分别合并其他病毒(HRV、HADV、RSV、HCoV、HMPV),1例检出甲流H1N1和H3N2,2例分别检出RSV、HRV及HCoV、HADV。结论非流感病原微生物引起流感样病例并不少见,多重PCR检测有助于全面了解流感样病例的病原和混合感染情况。

关键词：多重PCR检测流感样病例呼吸道病原儿童

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北京地区流感样病例中肠道病毒血清型分析

中华微生物学和免疫学杂志 2018年第3期38卷 176-180页

作者：沈玲羽杜嘉鑫刘芳遥荆洪波龚成罗明黄芳张铁钢首都医科大学公共卫生学院北京100069 东城区疾病预防控制中心北京100005 海淀区疾病预防控制中心北京100095 顺义区疾病预防控制中心北京101300 北京市疾病预防控制中心、北京市预防医学研究中心 100013

目的对引起北京地区夏秋季节流感样病例的肠道病毒（Enterovirus, EV）进行监测，掌握流感样病例中不同血清型肠道病毒流行状况。方法收集北京地区8个地区2017年7—10月的流感样病例咽拭子标本，实时荧光PCR方法对肠道病毒进行筛查，对... 详细信息

目的对引起北京地区夏秋季节流感样病例的肠道病毒（Enterovirus, EV）进行监测，掌握流感样病例中不同血清型肠道病毒流行状况。方法收集北京地区8个地区2017年7—10月的流感样病例咽拭子标本，实时荧光PCR方法对肠道病毒进行筛查，对筛查阳性的标本，肠道病毒VP1进行血清分型，并对VP1序列进行BLAST比对和进化关系分析。结果2017年7—10月，共收集到666份流感样病例标本，其中91例肠道病毒检测阳性，检出率为13.66%，66例VP1扩增阳性，BLAST序列分析结果显示66例肠道病毒分属14个血清型，包括7种EV-A、6种EV-B和1种Rhv，主要流行血清型为CVA2和CVA6，进化关系分析显示，顺义区的8株CVA6、石景山区的7株CVB5高度同源。结论2017年夏秋季节，引起北京地区流感样病例的肠道病毒有14个血清型，CVA2和CVA6为主要流行的血清型。

关键词：肠道病毒流感样病例血清型