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葱属洋葱亚属栽培类群的鉴别与开发

葱属洋葱亚属栽培类群的鉴别与开发

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作者：胡春亚桂林医学院

学位级别：硕士

目的:利用DNA条形码候选序列ITS、psb A-trn H、mat K和rbc L探讨洋葱亚属栽培类群及其近缘种的系统进化关系及分子鉴定方法。方法:采集洋葱亚属洋葱组的洋葱、香葱、火葱和楼子葱及Sacculiferum组的藠头及其近缘种样品共8种31份,经DNA... 详细信息

目的:利用DNA条形码候选序列ITS、psb A-trn H、mat K和rbc L探讨洋葱亚属栽培类群及其近缘种的系统进化关系及分子鉴定方法。方法:采集洋葱亚属洋葱组的洋葱、香葱、火葱和楼子葱及Sacculiferum组的藠头及其近缘种样品共8种31份,经DNA提取、PCR扩增和测序,获取其DNA序列信息,同时整合Gen Bank已有序列数据,分别运用最大简约法(Maximum Parsimony,MP)、贝叶斯推断法(Bayesian inference,BI)和邻接法(Neighbor-Joining,NJ)进行系统发育重建。结果:1.基于ITS(13种2变种共80条序列)和mat K(7种2变种共31条序列)的洋葱组系统发育重建表明,该组由Altaicum alliance、Galanthum+Oschaninii alliance和Cepa alliance三个互为单系类群的进化支组成,其系统演化关系可能为并系关系;其中火葱在ITS进化树上分别嵌套在三个进化支之中,而在mat K系统树上仅与Altaicum alliance有联系;楼子葱与Altaicum alliance、Galanthum+Oschaninii alliance有关,均与Cepa alliance无关;香葱仅与Altaicum alliance有关,与Cepa alliance无关。2.基于ITS的Sacculiferum组及相关类群(19种2变种共62条序列)的系统发育重建表明,ITS不适合作为Sacculiferum组的条形码序列,但作为朝鲜薤异名处理的*** Vved.是该组所有类群的姊妹群;产于朝鲜半岛的“***”嵌套在Sacculiferum组之中,而产于我国的长柱韭与阿拉善韭密切相关。3.基于psb A-trn H、mat K和rbc L的藠头及其近缘种(5种1变型共60条序列)的分子鉴别评价表明,psb A-trn H不能鉴别藠头及其近缘种,而mat K和rbc L及其组合均能有效区分藠头与其近缘类群。结论:1.根据树状图提示:火葱应为杂交起源,不支持将其处理为洋葱的变种,建议处理为A.×aggregatum;楼子葱支持作为杂交种的分类处理,即A.×proliferm,而不是洋葱的变种;香葱为二倍体,可能不是杂交起源,建议处理为葱*** L.的异名或变种。*** Vved.应恢复作为独立物种的分类学地位;树状图显示不支持将长柱韭置于Sacculiferum组或Condensatum组。*** A-trn H不能作为鉴别藠头及其近缘种的DNA条形码序列,而mat K和rbc L及其组合均可作为鉴别藠头及其近缘种的DNA条形码序列。

关键词：洋葱亚属洋葱组 Sacculiferum组系统发育分子鉴别

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