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沙雷氏菌SCR21026对黄芪幼苗生长及黄芪皂苷合成相关基因表达的影响

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中南民族大学学报（自然科学版） 2022年第1期41卷 27-31页

作者：姜仕林赵伟琼苗莉云刘婷宋发军张鹏中南民族大学生命科学学院武汉430074 山西中医药大学基础医学院晋中030619

分析了沙雷氏菌SCR21026对黄芪幼苗生长和生理指标以及对黄芪皂苷合成相关基因表达的影响,结果表明沙雷氏菌SCR21026对黄芪幼苗的生长具有一定的促进作用,对黄芪幼苗的可溶性糖、可溶性淀粉、MDA、GA和可溶性蛋白含量及POD活力的影响较... 详细信息

分析了沙雷氏菌SCR21026对黄芪幼苗生长和生理指标以及对黄芪皂苷合成相关基因表达的影响,结果表明沙雷氏菌SCR21026对黄芪幼苗的生长具有一定的促进作用,对黄芪幼苗的可溶性糖、可溶性淀粉、MDA、GA和可溶性蛋白含量及POD活力的影响较大.施加沙雷氏菌SCR21026能够促进黄芪皂苷合成相关基因的表达,施菌后第15天时,HMGR、IDI、FPS、SS、SE、CAS基因的相对表达量分别是对照组的103.33、42.12、24.83、66.57、35.00、43.00倍.本研究为利用微生物改良和提高黄芪人工种植技术提供了潜在的菌种资源.

关键词：沙雷氏菌黄芪生长指标生理指标黄芪皂苷

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沙雷氏菌S2中铬还原酶的分离纯化与鉴定

基因组学与应用生物学 2019年第10期38卷 4545-4551页

作者：顾芮嘉董兰岚何元白群华贾燕肖虹重庆医科大学公共卫生与管理学院

探讨沙雷氏菌S2中铬还原酶的分离纯化与鉴定的系统方法,利用从铬污染环境中筛选出的除铬菌沙雷氏菌S2,以超声破碎的方法提取细菌总蛋白,分别采用硫酸铵分级沉淀,Q-Sepharose H.P.琼脂糖凝胶阴离子交换层析和SephadexG-100凝胶过滤层析... 详细信息

探讨沙雷氏菌S2中铬还原酶的分离纯化与鉴定的系统方法,利用从铬污染环境中筛选出的除铬菌沙雷氏菌S2,以超声破碎的方法提取细菌总蛋白,分别采用硫酸铵分级沉淀,Q-Sepharose H.P.琼脂糖凝胶阴离子交换层析和SephadexG-100凝胶过滤层析分离纯化铬还原酶。通过纯化,酶比活力显著提高到15.41 U/mg,且酶比活力的纯化倍数高达940倍。用葡聚糖凝胶过滤法和聚丙烯酰胺凝胶电泳法(SDS-PAGE)对其进行分子量判断和纯度鉴定,随后通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法(MALDI-TOF-MS)鉴定该酶的蛋白质性质。分离纯化后得到的铬还原酶分子量为47 kD,编码431个氨基酸,与该酶肽质量指纹图谱符合率最高(30%)的已知蛋白质是NADH醌氧化还原酶亚基D(NuoD),说明从沙雷氏菌S2中得到的铬还原酶属于NuoD。本研究为沙雷氏菌S2中铬还原酶的后续酶学研究及功能基因研究提供了良好的基础。

关键词：沙雷氏菌铬还原酶分离纯化鉴定

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一株产红色素沙雷氏菌基因表达谱差异分析

生物学杂志 2022年第5期39卷 38-44页

作者：李靖宇张肖冲李艳楠袁存霞刘建利金多马志山北方民族大学生物科学与工程学院银川750021 宁夏特殊生境微生物资源开发与利用重点实验室银川750021

利用转录组测序技术对分离纯化获得的一株产红色素沙雷氏菌在不同生长阶段(产色素和不产色素)中基因表达谱差异特征进行分析,该菌株不同生长阶段基因表达谱共获得显著差异基因2512个,其中:显著上调基因1317个,基于该基因集的KEGG Pathwa... 详细信息

利用转录组测序技术对分离纯化获得的一株产红色素沙雷氏菌在不同生长阶段(产色素和不产色素)中基因表达谱差异特征进行分析,该菌株不同生长阶段基因表达谱共获得显著差异基因2512个,其中:显著上调基因1317个,基于该基因集的KEGG Pathway富集分析表明,参与群体感应功能的基因存在显著富集趋势,产色素阶段高表达自诱导物AI-2激酶lsrK以及LuxR家族转录调节因子sdiA;显著下调基因1195个,基于该基因集的KEGG Pathway富集分析表明,参与核糖体、鞭毛组装、TCA循环、肽聚糖生物合成、氨酰tRNA生物合成、原核生物碳固定、阳离子抗菌肽耐药性、细菌趋化性、细菌分泌系统、氧化磷酸化,以及丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢等功能的基因存在显著富集趋势。

关键词：红色素沙雷氏菌转录组基因表达谱差异群体感应

普城沙雷氏菌ACCC 02146产灵菌红素调控基因的鉴定

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福建农业学报 2023年第4期38卷 485-496页

作者：丁霞飞贾宪波林陈强庄振宏陈济琛福建农林大学生命科学学院福建福州350001 福建省农业科学院土壤肥料研究所福建福州350003

【目的】鉴定影响普城沙雷氏菌ACCC 02146产灵菌红素能力的基因,构建ACCC 02146的转座子突变体文库,为进一步研究普城沙雷氏菌ACCC 02146灵菌红素合成机制奠定基础。【方法】采用平板划线法从菌种保藏中心购买菌株和实验室保藏菌株中获... 详细信息

【目的】鉴定影响普城沙雷氏菌ACCC 02146产灵菌红素能力的基因,构建ACCC 02146的转座子突变体文库,为进一步研究普城沙雷氏菌ACCC 02146灵菌红素合成机制奠定基础。【方法】采用平板划线法从菌种保藏中心购买菌株和实验室保藏菌株中获得15株产灵菌红素的菌株。采用16S rRNA基因测序法鉴定各菌株,邻接建树将其分类,并比较不同类别菌株灵菌红素合成基因簇启动子序列差异,观察各菌株产色能力。对16S rDNA序列和灵菌红素合成基因簇启动子序列均有异于其他菌株的普城沙雷氏菌ACCC 02146合成灵菌红素的调控基因展开研究。构建ACCC 02146的转座子突变体文库,筛选出产色能力明显改变的克隆子并鉴定出对应的转座子插入突变基因。【结果】该突变体文库中有74个突变体表现出产灵菌红素能力的变化。其中25个突变体转座子插入发生在pigA、pigB、pigC、pigD和pigH等5个灵菌红素合成簇基因上,49个突变体转座子插入基因为灵菌红素合成基因簇之外的基因。在鉴定到的产色能力改变的突变体中,麦芽糖O-乙酰基转移酶基因突变菌株有6个,二氢乳清酸脱氢酶基因突变菌株有4个,MarR家族转录因子SlyA基因突变体有3个,winged helix家族的双组分转录调控因子RstA基因突变体有3个,H-醌氧化还原酶亚基I基因突变菌株有3个,NADH-醌氧化还原酶G链基因突变菌株有3个,肽基脯氨酰异构酶B基因突变菌株有3个,其他突变基因对应的克隆子数量为1~2个。【结论】在沙雷氏菌中,除了灵菌红素合成簇基因调控灵菌红素合成,推测灵菌红素合成簇外编码相关酶、转录调控因子和一些结构蛋白的基因通过直接或间接途径在不同程度上调控了灵菌红素的合成。

关键词：沙雷氏菌灵菌红素转座子突变体库调控基因

沙雷氏菌(Serratia marcescens)Yj1的分离鉴定及菌体有机磷降解酶的分离纯化

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生物技术通报 2015年第7期31卷 180-187页

作者：于亭王春红张婷婷汲添武志海杨美英吉林农业大学长春130118

从大豆土壤中分离纯化得到一株具有卵磷脂和乐果降解能力的菌株Yj1,对该菌株进行鉴定、生长条件优化、酶活性鉴定以及有机磷降解酶的分离纯化。结果表明,Yj1与Serratia marcescens WW4(CP003959.1)的16S r DNA相似度为99%。正交试验对... 详细信息

从大豆土壤中分离纯化得到一株具有卵磷脂和乐果降解能力的菌株Yj1,对该菌株进行鉴定、生长条件优化、酶活性鉴定以及有机磷降解酶的分离纯化。结果表明,Yj1与Serratia marcescens WW4(CP003959.1)的16S r DNA相似度为99%。正交试验对所需培养基进行优化,得到该菌株的最佳生长条件为甘露糖、蛋白胨和p H 8的组合。Yj1菌株在两种磷源条件下,菌株生长量均很低,但72 h内以大豆卵磷脂为磷源时的菌体生长情况优于乐果。以大豆卵磷脂为磷源时酸性磷酸酶、碱性磷酸酶与有机磷降解酶活性明显高于以乐果为磷源时的酶活,且72 h内碱性磷酸酶活性一直都高于酸性磷酸酶和有机磷降解酶。硫酸铵沉淀法结合阳离子交换层析成功从Yj1菌体中分离纯化了有机磷降解酶,SDS-PAGE结果显示纯化的蛋白为单一条带。且阳离子交换层析的提纯倍数是硫酸氨沉淀的5.303倍,硫酸氨沉淀为粗酶的1.416倍。

关键词：沙雷氏菌 Yj1 乐果大豆卵磷脂有机磷降解酶

一株产低温脂肪酶沙雷氏菌的鉴定、基因表达及酶学性质

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中国食品学报 2018年第6期18卷 121-129页

作者：刘元利陈吉祥李彦林周敏程琳兰州理工大学石油化工学院兰州730050

采用罗丹明B平板法从青海污染原油筛选到一株脂肪酶高产菌株LHY-1。根据培养特征、生理生化及16S r DNA序列分析,初步鉴定LHY-1为沙雷氏菌。其最佳生长和产脂肪酶的碳源、氮源分别是牛肉膏和酵母粉,最适温度20℃,初始p H 7.0,在盐度9%... 详细信息

采用罗丹明B平板法从青海污染原油筛选到一株脂肪酶高产菌株LHY-1。根据培养特征、生理生化及16S r DNA序列分析,初步鉴定LHY-1为沙雷氏菌。其最佳生长和产脂肪酶的碳源、氮源分别是牛肉膏和酵母粉,最适温度20℃,初始p H 7.0,在盐度9%的培养基中生长,优化培养条件后产脂肪酶可达1 326 U/m L。用特异性引物从LHY-1基因组克隆脂肪酶基因,构建表达载体p ET-28a(+)/lipase,在大肠杆菌高效表达,用NiNTA琼脂糖亲和柱纯化的蛋白分子质量为36 ku。重组脂肪酶最适温度为30℃,在4~30℃时表现出较大酶活力,属低温脂肪酶。该酶在p H 7.0~11.0范围稳定,30℃保持1 h,酶活力维持75%。Mg2+、Ca2+对酶活力有一定的促进作用。Co2+、Zn2+、SDS、PMSF、EDTA、EGTA对酶有部分抑制作用。纯化的脂肪酶能催化大豆油和乙醇酯交换反应,用于生物柴油的催化合成。

关键词：沙雷氏菌低温脂肪酶基因克隆性质生物柴油

沙雷氏菌菌株BRC-CXG2的分离、鉴定及其粗提物对苏云金芽胞杆菌的增效作用

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农业生物技术学报 2015年第11期23卷 1516-1523页

作者：吴松青陈思琪陈小刚熊悦婷李苹伍忠玲郭雅洁胡霞梁光红张飞萍福建农林大学林学院福建农林大学生物农药与化学生物学教育部重点实验室

沙雷氏菌属(Serratia sp.)中的许多菌株是一些昆虫的机会致病菌,具有一定的杀虫活性。本研究通过从患败血症的松墨天牛(Monochamus alternatus Hope)尸体中分离出一株BRC-CXG2菌株(KT366770),并对该菌株进行形态学鉴定、16S r DNA系统... 详细信息

沙雷氏菌属(Serratia sp.)中的许多菌株是一些昆虫的机会致病菌,具有一定的杀虫活性。本研究通过从患败血症的松墨天牛(Monochamus alternatus Hope)尸体中分离出一株BRC-CXG2菌株(KT366770),并对该菌株进行形态学鉴定、16S r DNA系统发育分析、生理生化反应、药敏分析以及生物测定。结果表明,分离的菌株BRC-CXG2属于沙雷氏菌属的一种新种,且对头孢哌酮、头孢噻肟、头孢他啶等常见药物具有不同程度的敏感性,其中提取的灵杆菌素对苏云金芽胞杆菌以色列亚种(Bacillus thuringiensis israelensis,Bti)LLP29胞晶混合液杀埃及伊蚊(Aedes aegypti)活性具有显著增效作用(共毒系数为128.06)。本研究为开发Bt增效剂及构建新型工程菌提供了理论基础。

关键词：沙雷氏菌灵杆菌素 LLP29 分离鉴定

沙雷氏菌（DH-S01）类固醇雌激素降解基因组初步研究

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沙雷氏菌（DH-S01）类固醇雌激素降解基因组初步研究

作者：赵雪莹东北师范大学

学位级别：硕士

目前,世界卫生组织已将环境雌激素列为第1类致癌物,由其造成的污染已经成为全球性的第三大环境问题,严重威胁人类健康和生态安全。治理雌激素污染迫在眉睫,也日益成为社会关注的热点问题。利用微生物降解代谢过程进行雌激素生物降解,是... 详细信息

目前,世界卫生组织已将环境雌激素列为第1类致癌物,由其造成的污染已经成为全球性的第三大环境问题,严重威胁人类健康和生态安全。治理雌激素污染迫在眉睫,也日益成为社会关注的热点问题。利用微生物降解代谢过程进行雌激素生物降解,是去除环境中雌激素最环保、最经济的有效方法,在雌激素污染治理中发挥至关重要的作用,日益受到人们的重视。本文从某生产雌激素药厂附近土壤样品中筛选分离得到一株能够高效降解类固醇雌激素的菌株,命名为DH-S01。形态学观察显示,菌落呈圆形,边缘整齐,有光泽,呈橙红色或紫红色,菌体易挑起,呈杆状,无鞭毛。生理生化实验确定为革兰氏染色阴性细菌,能够代谢葡萄糖、麦芽糖、蔗糖等。结合分子生物学鉴定,确定菌株DH-S01为沙雷氏菌（Serratia）。降解实验结果表明,菌株DH-S01能够利用类固醇雌激素雌酮和17β-雌二醇为唯一碳源进行生长传代培养,实验周期内的雌酮和17β-雌二醇的生物降解率都在90%以上。为了深入了解该菌株的基因组结构与功能信息和其雌激素降解机制,基于PacBio测序平台,对菌株进行全基因组测序及分析。菌株DH-S01基因组由一个大小为5256558bp的环状染色体组成,GC含量为59.53%,编码区包含4874个基因。此外,非编码区域包含84个散在重复序列、110个串联重复序列、140个非编码RNA（ncRNA）以及12个基因岛。根据平均核苷酸同一性（ANI）分析结果,将菌株DH-S01进一步鉴定为Serratia nematodiphila。通过数据库对编码基因进行功能注释,结果表明,DH-S01具有丰富的代谢功能基因,可为进一步研究细菌降解代谢机理以及开发具有高应用价值的工程菌提供资源。根据基因功能的注释结果以及文献报道,总共确定了13个参与类固醇雌激素降解过程的相关基因,编码9种类固醇雌激素降解酶,包括使苯环开环的邻苯二酚1,2-双加氧酶（catA）、1种类固醇核心降解酶以及7种类固醇侧链降解酶。通过PCR克隆技术和RT-PCR技术,分别证实了菌株DH-S01中类固醇雌激素降解酶的存在及相关基因的表达。通过与3株已知沙雷氏菌基因组比较分析,DH-S01与S.nematodiphila DZ0503S BS1和S.marcescens Db11共线性较高,与S.fonticola DSM 4576的共线性较低。在泛基因组中,总共鉴定出6471个基因,其中共有3252个同源基因组成核心基因组,其中包括菌株DH-S01中存在的8种类固醇雌激素降解酶的相关编码基因。此外,DH-S01中还存在与特定环境适应性有关的85个特有基因。以上研究结果证实了DH-S01在遗传水平上具备较强降解类固醇雌激素的能力。这不仅增加了沙雷氏菌属的基因组学信息,还丰富了类固醇雌激素降解菌种类。此外,本论文研究结果为类固醇雌激素降解机制和降解相关酶的研究提供了进一步的信息,从而为受类固醇雌激素污染的环境提供微生物修复理论依据。

关键词：类固醇雌激素沙雷氏菌全基因组测序生物降解

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沙雷氏菌抗生性次级代谢产物合成机制

微生物学杂志 2017年第4期37卷 115-119页

作者：白腾飞刘月芹延安大学生命科学学院陕西延安716000 陕西省区域生物资源保育与利用工程技术研究中心陕西延安716000

沙雷氏菌(Serratia)是一类重要的生防菌,能分泌多种抗生性代谢产物,如灵菌红素、脂肽、碳青霉烯、几丁质酶、异硫霉素、硝吡咯菌素、水解酶、大环内酯类抗生素、嗜铁素等,从而抑制不同植物病原真菌的生长。总结了沙雷氏菌中已报道的抗... 详细信息

沙雷氏菌(Serratia)是一类重要的生防菌,能分泌多种抗生性代谢产物,如灵菌红素、脂肽、碳青霉烯、几丁质酶、异硫霉素、硝吡咯菌素、水解酶、大环内酯类抗生素、嗜铁素等,从而抑制不同植物病原真菌的生长。总结了沙雷氏菌中已报道的抗生性次级代谢产物生物合成机制,重点阐述了次生代谢产物的功能、合成途径等的新进展,同时对沙雷氏菌在生物防治中的应用和其作为生防菌剂的前景进行展望。

关键词：沙雷氏菌抗生性次级代谢产物合成机制生物防治