检索结果-南通市图书馆

作者：魏千然黑龙江大学

学位级别：硕士

全基因组关联研究(Genome-Wide Association Study,GWAS)是在全基因组范围内对遗传变异进行检验,以发现与特定性状或复杂疾病显著关联的基因变异。然而这些变异只解释了大多数性状整体遗传力的一小部分,而联合分析多个性状能提高识别新... 详细信息

全基因组关联研究(Genome-Wide Association Study,GWAS)是在全基因组范围内对遗传变异进行检验,以发现与特定性状或复杂疾病显著关联的基因变异。然而这些变异只解释了大多数性状整体遗传力的一小部分,而联合分析多个性状能提高识别新的基因变异的功效,特别是多效性基因变异。另外,由于个体水平数据难以获得,而汇总数据通常是公开可用的,且关于各种性状的汇总数据日益增多,所以基于汇总数据的方法变得越来越流行。本文提出了基于主成分的自适应关联检验(Adaptive Test based on Principal Components,ATPC),该方法基于汇总数据检验单个基因变异与多元性状的关联性。ATPC方法首先在性状相关矩阵的基础上构建一系列包含不同数量主成分的检验统计量,其次计算出这些统计量所对应的值,最后利用聚合柯西关联检验结合这些值,得到最终的检验统计量。模拟研究的结果表明,ATPC方法能控制第一类错误率,与几个多元性状关联方法相比,在大多数情况功效较高,表现稳定。对关于血脂的汇总数据进行分析,ATPC识别出很多被单性状关联分析遗漏的新SNPs。对显著关联的SNPs进行GO、KEGG与Reactome富集分析,许多SNPs被富集到与血脂性状相关的生物学通路。这些分析表明ATPC方法是有效的,计算效率高,具有实际应用价值。

关键词：关联分析多元性状汇总统计量主成分

来源：

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

关于基因多效性检验中互斥假设检验的总结与探索

引用

应用数学进展 2023年第4期12卷 1531-1548页

作者：范宇轩李兰玉青岛大学数学与统计学院山东青岛

基因多效性是指单个基因能够影响多个性状的表达水平。能够有效检测基因多效性的存在并了解其产生的原因具有重要的统计学以及生物学意义。复杂原假设条件下的互斥检验方法十分适用于该类问题且具有较好的说服力。不失一般性的情况下,... 详细信息

基因多效性是指单个基因能够影响多个性状的表达水平。能够有效检测基因多效性的存在并了解其产生的原因具有重要的统计学以及生物学意义。复杂原假设条件下的互斥检验方法十分适用于该类问题且具有较好的说服力。不失一般性的情况下,本文主要针对于两个性状的汇总统计量进行研究。我们将新构建的方法与IUT (intersection-union test)、PLACO (pleiotropic analysis under composite null hypothesis)、DACT (divide-aggregate composite-null test)、MAIUP (mixture-adjusted inter-section-union test for pleiotropy test)几种方法进行了对比。模拟结果显示,新方法与MAIUP方法相比在能够在某些特定的情形下能够更好的控制一类错误同时保证检验功效。最后将上述方法应用于冠状动脉疾病以及扁桃体切除的数据来进行实证分析。

关键词：互斥检验基因多效性汇总统计量

来源：

维普期刊数据库博看期刊评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

欢迎您,

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

在线全文

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

欢迎您,

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

在线全文

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：