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基于深度学习的水产动物疾病防治事件抽取研究

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基于深度学习的水产动物疾病防治事件抽取研究

作者：沙明洋大连海洋大学

学位级别：硕士

随着水产养殖规模的不断扩大,传统的病害防治技术已经无法满足水产养殖业的需求。因此,亟需一种有效的方法来辅助病害防治技术的研究。事件知识图谱是一种利用人工智能技术赋能传统水产养殖产业的方法,可以转变病害防治技术的研究方式... 详细信息

随着水产养殖规模的不断扩大,传统的病害防治技术已经无法满足水产养殖业的需求。因此,亟需一种有效的方法来辅助病害防治技术的研究。事件知识图谱是一种利用人工智能技术赋能传统水产养殖产业的方法,可以转变病害防治技术的研究方式。事件抽取作为构建事件知识图谱的关键环节,有效的事件抽取方法可以提升图谱构建的质量。由于水产动物疾病防治事件含有大量的专有名词边界模糊、事件实体过长和长尾事件实体识别等问题,通用的事件抽取方法无法有效地完成水产动物疾病防治事件抽取任务。因此,本文旨在开展基于深度学习的水产动物疾病防治事件抽取研究,以解决上述问题并提高事件抽取的准确性和效率。本文取得如下研究成果:(1)提出了一种基于动态权重的多模型集成事件抽取方法。该方法用于解决水产动物疾病防治事件抽取任务中的专有名词边界模糊和事件实体长度过长的问题。采用动态权重的Gate模块融合ERNIE和Mac BERT预训练模型学习的语义特征;将语义信息传入BiLSTM捕捉文本长距离语义依赖;采用条件随机场对输出标签添加约束。实验结果表明,提出的基于动态权重的多模型集成事件抽取方法F1值达到了74.15%。研究表明,该方法能有效提升水产动物疾病防治事件抽取任务的效果。(2)提出了一种融合胶囊网络的BTCapMB事件抽取方法。该方法用于解决水产动物疾病防治事件实体长尾识别问题。首先,采用BERT+Text CNN模型提取文本初始特征和局部特征,并利用Multi-BiLSTM模型进一步提取不同维度且带有依赖信息的文本特征;其次,采用胶囊网络模型学习不同事件实体之间的空间语义关系;最后,将MultiBiLSTM和胶囊网络模型提取的特征进行融合。实验结果表明,该方法在水产动物疾病防治事件数据集(DLOU-FZ)上F1值达到了75.83%,是一种有效的水产动物疾病防治事件抽取方法。(3)构建了水产动物疾病防治事件知识图谱。通过人工标注和事件抽取任务抽取出关键的水产动物疾病防治文本事件信息后,将提取的事件信息存储到Excel表格中。利用Neo4j图数据库构建了水产动物疾病防治事件知识图谱,为水产养殖业的健康发展奠定基础。

关键词：水产动物疾病事件抽取动态权重胶囊网络知识图谱

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面向水产动物疾病知识图谱的质量控制研究

面向水产动物疾病知识图谱的质量控制研究

作者：王梓铭大连海洋大学

学位级别：硕士

随着水产养殖业规模的不断扩大和环境的复杂化,水产动物疾病问题日益显著,给水产养殖业可持续发展带来了挑战。建立水产动物疾病知识图谱是辅助解决水产动物疾病防治问题的有效途径。然而,如何提高知识图谱质量一直是制约知识图谱应用... 详细信息

随着水产养殖业规模的不断扩大和环境的复杂化,水产动物疾病问题日益显著,给水产养殖业可持续发展带来了挑战。建立水产动物疾病知识图谱是辅助解决水产动物疾病防治问题的有效途径。然而,如何提高知识图谱质量一直是制约知识图谱应用的瓶颈问题之一。因此,开展面向水产动物疾病知识图谱的质量控制研究具有重要意义,提高知识图谱质量、促进知识共享和应用。本文针对以上问题,进行了水产动物疾病知识图谱质量控制研究,主要内容如下:(1)提出了一种融合自注意力机制和Tree LSTM的水产动物疾病知识图谱显性三元组质检方法。针对水产动物疾病知识图谱在半自动化构建过程中出现数据错误和数据丢失的现象,以及知识图谱的三元组实体与实体之间语义信息关联性弱的问题,采用Word2Vec建立水产动物疾病词向量库(Aquatic animal dataset Word2Vec,AADWord2Vec);引入自注意力机制能够捕捉上下文特征信息;通过Tree LSTM增强语义扩展性;最后利用Softmax分类真假三元组。实验结果表明,该方法在准确率、召回率和F1值方面表现出优异的性能,分别达到了85.6%、84.5%和85.0%,是一种有效的水产动物疾病知识图谱显性三元组质检方法。(2)提出了一种水产动物疾病知识图谱隐含三元组质检方法(Implied triplet quality inspection,ITQI)。针对水产动物疾病知识图谱中由于关系传递存在的大量隐含三元组对质检效果的影响,以及未有效利用实体之间的空间语义关联导致对实体特征提取不充分问题,采用有向图最长路径搜索算法搜索所有知识图谱中的搜索路径,构建具有隐含关系的三元组,从而扩充源三元组的个数并生成三种噪声三元组;利用Trans R预训练得到扩充后的真实三元组的初始特征;采用Text CNN对三元组矩阵进行建模,并通过Bi LSTM对特征图进行语义关联学习获得高层特征;利用对三元组建模的特征进行真假三元组的分类。实验结果表明,ITQI方法能够显著提升水产动物疾病知识图谱质检的准确性,在公开数据集上的表现也优于其他算法。(3)搭建了Ocean-KG知识图谱服务平台。将ATT-TLSTM模型和ITQI算法嵌入到平台中能够实现知识图谱查询、质量评估和问答功能,方便养殖户和动物医生提供辅助决策和治疗参考。从而为水产养殖业的发展和水产动物健康管理提供有力支持。

关键词：水产动物疾病知识图谱质量控制质量评估错误检测

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水产动物疾病药物防治的误区及科学用药

中国水产 2005年第10期 58-59页

作者：南微微刘桐令河北省河间市畜牧水产局 062450

一、水产动物疾病药物防治的误区1、不对症用药:有些渔民不管发生什么鱼病,一律用漂白粉、硫酸铜等进行防治.不对症下药,不仅起不到防治鱼病的效果,还会造成浪费,甚至会贻误时机,加重病情.

关键词：水产动物疾病药物防治科学用药对症用药对症下药漂白粉硫酸铜鱼病

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代谢组学技术在水产动物疾病研究中的应用

中国生物化学与分子生物学报 2018年第9期34卷 942-948页

作者：赵贤亮陈鹤孔祥会河南师范大学水产学院动物医学系河南新乡453007

代谢组学是定量描述生物内源性代谢物质的整体及其对内因和外因变化应答规律的的一门新学科。近年来,代谢组学技术在水产动物疾病中的研究备受关注,特别是为感染性疾病发生机制及防控研究提供了一种新的手段。本文介绍了代谢组学技术及... 详细信息

代谢组学是定量描述生物内源性代谢物质的整体及其对内因和外因变化应答规律的的一门新学科。近年来,代谢组学技术在水产动物疾病中的研究备受关注,特别是为感染性疾病发生机制及防控研究提供了一种新的手段。本文介绍了代谢组学技术及其在水产动物研究中的应用,包括代谢组学技术在水产动物感染性疾病、细菌耐药及环境应激等方面应用进行综述,分析了代谢组学在水产动物疾病研究中面临的问题与挑战,并对未来水产动物代谢组学研究趋势进行了展望,以期为代谢组学技术在水产动物疾病发病机制和药物研发方面更深入的运用提供参考。

关键词：代谢组学水产动物疾病细菌耐药环境应激

基于动态权重的多模型集成水产动物疾病防治事件抽取方法

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华中农业大学学报 2023年第3期42卷 80-87页

作者：沙明洋张思佳傅庆财于红李枳錡喻文甫刘珈宁大连海洋大学信息工程学院/辽宁省海洋信息技术重点实验室大连116023 设施渔业教育部重点实验室(大连海洋大学) 大连116023

为提高水产动物疾病防治事件抽取的准确性,有效解决抽取过程中出现的专有名词边界模糊和事件实体过长等问题,本研究将动态权重思想引入多模型集成的事件抽取方法中。改进后的方法利用百度自然语言理解开放平台(enhanced representation ... 详细信息

为提高水产动物疾病防治事件抽取的准确性,有效解决抽取过程中出现的专有名词边界模糊和事件实体过长等问题,本研究将动态权重思想引入多模型集成的事件抽取方法中。改进后的方法利用百度自然语言理解开放平台(enhanced representation through knowledge integration,ERNIE)和澎湃BERT(MLM as correction BERT,MacBERT)2个预训练模型来学习文本语义信息;采用动态权重的gate模块融合特征;将学习到的语义信息传入双向长短时记忆网络(bi-directional long shortterm memory,BiLSTM)中,并通过条件随机场(conditional random field,CRF)对输出标签序列进行约束。选取ERNIE⊕MacBERT-CRF模型和ERNIE⊕MacBERT-BiLSTM-CRF模型(⊕代表简单相加求平均的融合方法)作为对照模型对提出的方法进行融合性能对比试验验证,结果显示,该方法 F1值达74.15%,比经典模型BiLSTM-CRF提高了20.02个百分点。结果表明,该方法用于水产动物疾病防治事件抽取具有更好的效果。

关键词：水产动物疾病事件抽取 ERNIE MacBERT 动态权重健康养殖

分子生物学技术在水产动物疾病诊断中的研究进展

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水利渔业 2004年第3期24卷 4-6页

作者：王雪鹏闫茂仓岳永生山东农业大学动科院 271018 华中农业大学水产学院

近年来,分子生物技术在水产养殖疾病诊断上得以广泛应用。根据目前国内外研究的动向,对免疫检测技术、核酸检测技术、核酸技术与免疫学相结合方法等进行了综述,详细阐明了各个技术的原理、特点及应用。病原体的提纯是应用这些方法的主... 详细信息

近年来,分子生物技术在水产养殖疾病诊断上得以广泛应用。根据目前国内外研究的动向,对免疫检测技术、核酸检测技术、核酸技术与免疫学相结合方法等进行了综述,详细阐明了各个技术的原理、特点及应用。病原体的提纯是应用这些方法的主要困难。

关键词：分子生物学技术水产动物疾病免疫学诊断技术核酸诊断技术核酸技术

RNA干扰技术防治水产动物疾病专利技术现状

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中国水产 2011年第10期 58-60页

作者：王少华国家知识产权局专利局化学发明审查部

RNA干扰技术（RNA interferece，RNAi）是由内源性或外源性短链RNA诱导同源mRNA降解，导致基因沉默的现象。从理论上来讲，几乎所有涉及到基因异常高表达的人类、动物、植物疾病都有可能设计出相应的siRNA来沉默疾病相关基因，从而达到... 详细信息

RNA干扰技术（RNA interferece，RNAi）是由内源性或外源性短链RNA诱导同源mRNA降解，导致基因沉默的现象。从理论上来讲，几乎所有涉及到基因异常高表达的人类、动物、植物疾病都有可能设计出相应的siRNA来沉默疾病相关基因，从而达到治疗目的。由于RNAi在动植物抵抗外源病毒、生长发育调控方面起着重要作用，而且在功能基因组研究、基因治疗方面有着广泛的应用前景，

关键词： RNA干扰技术水产动物疾病专利技术防治 mRNA降解疾病相关基因基因沉默基因治疗

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分子生物学技术在水产动物疾病诊断上的应用

安徽农业科学 2007年第31期35卷 9939-9940页

作者：孔祥会边中春河南师范大学生命科学学院河南新乡453007 河南师范大学图书馆河南新乡453007

对限制性酶切、探针杂交和PCR诊断等方面对分子生物学在疾病诊断上的应用进行了综述,旨在为水产动物疾病的分子诊断相关研究提供参考。

关键词：分子生物学水产动物疾病分子诊断

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水产动物疾病防治的给药方法与技术(续)

渔业致富指南 2005年第4期 60-61页

作者：陈昌福孟长明华中农业大学水产学院武汉430070 河南省新乡市康大消毒剂有限公司河南新乡453700

首先，要根据药物的种类决定用于预防和治疗疾病的基本用药量，在各种渔用药物的使用说明书中经常可以看见“按每千克鱼体有XX毫克药物，拌和在饲料中……”或者“在每千克饲料中添加XX％的药物……”的表达方式。需要说明的是，所谓标... 详细信息

首先，要根据药物的种类决定用于预防和治疗疾病的基本用药量，在各种渔用药物的使用说明书中经常可以看见“按每千克鱼体有XX毫克药物，拌和在饲料中……”或者“在每千克饲料中添加XX％的药物……”的表达方式。需要说明的是，所谓标准用药量，是指对水产动物的单位重量或单位饲料中添加药物用药的量，与实际用药量“标准用药量×饲料总重量（千克）”之间是有差别的。

关键词：用药量饲料水产动物疾病渔用药物鱼体添加使用说明书给药方法预防和治疗决定