检索结果-南通市图书馆

应用比较毒理基因组学数据库解析棉酚对动物机体的毒性作用机制

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

毒理学杂志 2023年第2期37卷 121-127,136页

作者：孔伟帅刘娟邓中原刘岩郑州大学生命科学学院河南郑州450001 北京市疾病预防控制中心食品中毒诊断溯源技术北京市重点实验室北京100013 郑州大学农学院河南郑州450001

目的利用生物信息学方法分析棉酚(gossypol)及其衍生物醋酸棉酚(gossypol acetic acid)诱导的差异基因和涉及的信号通路,解析棉酚对动物机体的毒性作用机制,为开发减毒棉酚类新药物提供思路。方法利用比较毒理基因组学数据库(Comparat... 详细信息

目的利用生物信息学方法分析棉酚(gossypol)及其衍生物醋酸棉酚(gossypol acetic acid)诱导的差异基因和涉及的信号通路,解析棉酚对动物机体的毒性作用机制,为开发减毒棉酚类新药物提供思路。方法利用比较毒理基因组学数据库(Comparative Toxicogenomic Database, CTD)筛选棉酚及其衍生物(醋酸棉酚)诱导的差异基因,分析两者诱导的共同差异基因、差异基因间相互作用网络、差异基因的KEGG通路,利用网络毒理学方法对分析结果进行验证。结果 CTD筛选得到棉酚及其衍生物(醋酸棉酚)诱导的差异基因115个,两者共同诱导的差异基因2个。基因相互作用网络分析与KEGG分析得出在差异基因中,CYCS、CASP3和BCL2L1有较多交互基因,介导多种细胞凋亡通路。以神经毒性为例,网络毒理学验证得出棉酚及其衍生物通过诱导CYCS、CASP3和BCL2L1等差异基因的表达引起对机体的毒作用。结论本次基于2022年2月更新的CTD所开展的生物信息学分析得出,棉酚类物质的毒性作用主要是通过线粒体依赖性细胞凋亡途径实现的,即棉酚及其衍生物诱导Bcl-2基因家族表达下调、Caspase基因家族表达上调进而促进细胞凋亡从而起到毒性作用。

关键词：棉酚醋酸棉酚比较毒理基因组学数据库 Caspase 线粒体依赖性细胞凋亡通路

基于毒理基因组学的PBDE-209和镉联合毒性效应研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

环境科学学报 2019年第6期39卷 2013-2023页

作者：王立新王英雪郑苗苗崔建升李珊黄飞宇河北科技大学环境科学与工程学院/河北省污染防治生物技术实验室石家庄050018 河北省药用分子化学重点实验室石家庄050018

多污染物引发的联合毒性是环境污染物风险评价中的重要问题之一,然而此类研究相对不足.多溴联苯醚和重金属镉可在多种环境介质中共存,虽对其各自单独暴露所产生的毒性已有相对明确的认识,但对二者联合毒性效应及其分子机制的探索仍十分... 详细信息

多污染物引发的联合毒性是环境污染物风险评价中的重要问题之一,然而此类研究相对不足.多溴联苯醚和重金属镉可在多种环境介质中共存,虽对其各自单独暴露所产生的毒性已有相对明确的认识,但对二者联合毒性效应及其分子机制的探索仍十分有限.生物信息学的发展为污染物的健康效应研究提供了一种新的思路.为此,本研究基于比较毒理基因组学数据库(CTD)分析了十溴联苯醚和镉在单独或共同暴露下所影响的基因和相关疾病,推测两种污染物对胎儿红系造血过程产生的潜在影响,并进一步整合外源红系细胞基因表达数据库中的基因芯片确证二者共同影响的基因集合.同时,通过对这些基因集合进行生物学过程和信号通路富集分析,筛选出潜在的靶基因JAK3和AKT2,并在无显著细胞毒性的暴露条件下,通过体外细胞实验验证了十溴联苯醚和镉对这两个靶基因表达的干扰.本研究结果可为预防多溴联苯醚和重金属的联合暴露风险提供一定的科学依据,同时,CTD数据库和外源特定疾病发生发展相关基因表达数据库联合使用,并结合传统毒理学研究手段的评价模式,可为污染物的共同暴露与特定疾病的相关性及分子机理的探索在研究思路和技术手段上提供参考.

关键词：十溴联苯醚镉比较毒理基因组学数据库联合毒性红系造血

双酚A致雄性生殖损害毒性通路的富集分析及关键凋亡信号通路的实验研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

第三军医大学学报 2021年第1期43卷 38-44页

作者：袁文博刘文斌陈洪强柴子力张光辉曹佳新乡医学院公共卫生学院河南新乡453001 陆军军医大学(第三军医大学)军事预防医学系毒理学研究所重庆400038

目的探讨低剂量双酚A(bisphenol A,BPA)暴露导致的雄性生殖损伤中可能涉及的关键毒性通路。方法利用比较毒理基因组学数据库(Comparative Toxicogenomics Database,CTD)筛选BPA毒性相关基因,对其进行功能富集,探索可能的作用通路,确认... 详细信息

目的探讨低剂量双酚A(bisphenol A,BPA)暴露导致的雄性生殖损伤中可能涉及的关键毒性通路。方法利用比较毒理基因组学数据库(Comparative Toxicogenomics Database,CTD)筛选BPA毒性相关基因,对其进行功能富集,探索可能的作用通路,确认相关通路中的关键基因。采用终浓度为0(DMSO对照组)、20、40、80μmol/L BPA处理小鼠精原细胞株GC-2细胞72 h,观察细胞形态并检测凋亡发生率,采用RT-qPCR和Western blot检测关键基因mRNA和蛋白表达水平。结果通过对CTD数据库中BPA相关的疾病进行筛选,得到1460个相关基因,GO富集分析发现这些基因在生殖系统发育、生殖结构发育等分子生物过程中有明显富集,KEGG富集分析发现其在HIF-1和PI3K-Akt等信号通路中有明显富集(P基因分别为HIF-1α、PKC、P300/CBP以及PI3K、JAK、P53、BCL-2。BPA染毒GC-2细胞,发现凋亡率上升,且存在剂量-效应关系(P组相比,染毒组PI3K和JAK的mRNA表达下调,P53和BCL-2上调(P<0.05);PI3K和BCL-2的蛋白水平下调,P53则上调(P<0.05)。结论PI3K-Akt信号通路在低剂量BPA暴露致GC-2细胞凋亡过程中可能发挥重要作用。

关键词：双酚A 比较毒理基因组学数据库 GC-2细胞细胞凋亡 PI3K-Akt信号通路男性泌尿生殖系统疾病

基于CTD数据库的双酚A及其衍生物双酚F和双酚S的生物信息学分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

毒理学杂志 2022年第5期36卷 442-447,455页

作者：刘福志朱丹丹陈扬佳邓锂峰肖默涂卓特泉州医学高等专科学校福建泉州362011

目的利用生物信息学技术分析双酚A(bisphenol A, BPA)及其衍生物双酚F(bisphenol F, BPF)、双酚S(bisphenol S, BPS)共同影响的关键信号通路及可能的机制,为BPA及其衍生物BPF、BPS相关研究提供一定的线索和思路。方法利用比较毒理基... 详细信息

目的利用生物信息学技术分析双酚A(bisphenol A, BPA)及其衍生物双酚F(bisphenol F, BPF)、双酚S(bisphenol S, BPS)共同影响的关键信号通路及可能的机制,为BPA及其衍生物BPF、BPS相关研究提供一定的线索和思路。方法利用比较毒理基因组学数据库(CTD),筛选BPA及其衍生物BPF、BPS共同影响的hub基因,使用可视化和Hipolt在线工具对hub基因进行通路分析,筛选关键基因。结果获得BPA及其衍生物BPF、BPS共同影响的50个hub基因,其中EGFR基因Degree最高为22。GO和KEGG富集分析,得到具有统计学意义的差异GO条目140个(P学途径(biological processes, BP)有119个,细胞组分(cellular components, CC)有5个,分子功能(molecular function, MF)有16个,其中BP间有较多交互基因,如EGFR、ESR1和CAV1等。KEGG分析中具有统计学意义差异最高的2条通路,包括膀胱癌(P=3.40×10^(-6))和甲状腺癌(P=5.21×10^(-5)),并且膀胱癌信号通路主要受到EGFR和CDK4等基因的调控。结论本次基于2021年4月更新的CTD数据库所开展的生物信息学分析提示,BPA及其衍生物BPF、BPS共同暴露可能引起关键基因EGFR改变,EGFR可能通过成纤维细胞增殖影响膀胱癌的发生发展。

关键词：双酚A 双酚F 双酚S 比较毒理基因组学数据库生物信息学分析