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化学学报 2002年第11期60卷 2043-2048页

作者：王建国陈寒松赵卫光马翼李正名韩玉芬南开大学元素有机化学研究所元素有机化学国家重点实验室天津300071

通过比较分子力场分析方法 (CoMFA)和比较分子相似性指数分析方法 (CoMSIA) ,系统研究了 30个 2 烷基(烷硫基 ) 5 吡唑基 1,3,4 二唑 (噻二唑、三唑 )类化合物抑制水稻纹枯病菌生物活性的三维定量构效关系 .对于CoMFA ,研究了不... 详细信息

通过比较分子力场分析方法 (CoMFA)和比较分子相似性指数分析方法 (CoMSIA) ,系统研究了 30个 2 烷基(烷硫基 ) 5 吡唑基 1,3,4 二唑 (噻二唑、三唑 )类化合物抑制水稻纹枯病菌生物活性的三维定量构效关系 .对于CoMFA ,研究了不同移动步长对考虑静电场和立体场作用时构效关系的影响 ;对于CoMSIA ,研究了移动步长、场的组合、衰减因子α等参数变化对构效关系的影响 ,发现当考虑立体场、疏水场、氢键受体场的贡献时能得到较好的结果 .分别得到了两种方法最为理想的 3D QSAR模型 ,所得三维等值线图为发现更高活性化合物提供了有力的指导作用 .

关键词：吡唑衍生物水稻纹枯病 CoMFA CoMSIA 3D-QSAR 比较分子场方法结构杀菌剂生物活性三维定量构效关系

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带有分子轨道能量的3D-QSAR对N-氨基咪唑的研究(英文)

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物理化学学报 2006年第2期22卷 209-214页

作者：乔颖欣周家驹中国科学院过程工程研究所生物化学学国家重点实验室中国科学院研究生院北京100049

N-氨基咪唑(NAIMs)能通过三种不同的作用方式抑制HIV-1的复制.用比较分子场(CoMFA)方法对一系列有共同骨架的NAIM分子建立3D-QSAR模型.与以往模型不同的是,在偏最小二乘(PLS)分析中尝试引入分子轨道能量的信息来研究生物活性与分子轨道... 详细信息

N-氨基咪唑(NAIMs)能通过三种不同的作用方式抑制HIV-1的复制.用比较分子场(CoMFA)方法对一系列有共同骨架的NAIM分子建立3D-QSAR模型.与以往模型不同的是,在偏最小二乘(PLS)分析中尝试引入分子轨道能量的信息来研究生物活性与分子轨道能量的关系.结果得到了几个模型,分子轨道能量对模型的贡献能为21.7%,轨道HOMO5对模型的贡献最大.

关键词： N-氨基咪唑抑制HIV-1复制三维定量构效关系分子轨道能量比较分子场方法 MOPAC6/PM3

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距离比较法识别光系统Ⅱ电子传递抑制剂药效团模型

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有机化学 2001年第10期21卷 732-736页

作者：刘小兰孙命文欣周卫红杨霞缪方明天津师范大学化学与生命科学学院天津理工学院化工系

采用距离比较法(Distance Comparisons,DISCO)识别出在结构上不同的九个光系统Ⅱ(PSⅡ)电子传递抑制剂分子的药效团模型,并进行了比较分子场(CoMFA)研究.这些研究结果将应用在全新先导化合物的设计中.

关键词：距离比较法药效团模型比较分子场方法光系统Ⅱ 电子传递抑制剂除草剂

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丙型肝炎病毒NS5A抑制剂的3D-QSAR研究

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重庆理工大学学报（自然科学） 2015年第5期29卷 52-60,F0003页

作者：孟令鑫刘蒙蒙王远强林治华重庆理工大学药学与生物工程学院重庆400054 重庆大学化学化工学院重庆400044

丙型病毒性肝炎感染是输血后肝炎的主要病因之一。NS5A蛋白的小分子抑制剂显示出很强的体外抑制病毒生长的活性,并且初步的临床评价也证实了NS5A抑制剂能很好地抑制体内丙型肝炎病毒的生长。因此,研发高效的NS5A小分子抑制剂为治疗丙型... 详细信息

丙型病毒性肝炎感染是输血后肝炎的主要病因之一。NS5A蛋白的小分子抑制剂显示出很强的体外抑制病毒生长的活性,并且初步的临床评价也证实了NS5A抑制剂能很好地抑制体内丙型肝炎病毒的生长。因此,研发高效的NS5A小分子抑制剂为治疗丙型肝炎提供了新的策略。进行了daclatasvir丙型肝炎病毒NS5A复制抑制剂的三维定量构效关系(3D-QSAR)研究,通过SYBYL-X 2.1.1分子模拟软件系统搜寻方法搜寻出化合物的最低能量构象,然后在Triops力场中用共轭梯度最小化进行优化。应用比较分子力场分析(Co MFA)和比较分子相似性指数分析(Co MSIA)进行分子活性构象的选择、分子叠合、建立空间场范围以及数据统计。用22个衍生物作为训练集建立模型,用6个衍生物作为测试集来验证模型的优劣。结果表明:Co MFA模的交叉相互验证系数q2=0.578,回归系数r2=0.939,Co MSIA模型的q2=0.584,r2=0.968。这些结论为丙型肝炎病毒NS5A复合体抑制剂的药物设计和筛选提供了理论依据。

关键词：丙型肝炎病毒NS5A抑制剂三维定量构效关系比较分子场方法比较分子相似性指数分析法

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光系统(II)抑制剂三维构效关系的研究

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天津师大学报（自然科学版） 2001年第1期21卷 1-4页

作者：刘小兰杨霞刘晓红赵茹缪方明天津师范大学化学与生命科学学院天津300074

采用比较分子场方法 ( Co MFA)对顺式氰基丙烯酸酯化合物进行了三维构效关系的研究 ,获得了具有较强预测能力的四点药效团模型 .距离空间图显示四点为苯环中心 (疏水中心 * )、羰基氧 ( O* * )和碳 ( C# )原子以及乙氧基的氧原子 ( O# #... 详细信息

采用比较分子场方法 ( Co MFA)对顺式氰基丙烯酸酯化合物进行了三维构效关系的研究 ,获得了具有较强预测能力的四点药效团模型 .距离空间图显示四点为苯环中心 (疏水中心 * )、羰基氧 ( O* * )和碳 ( C# )原子以及乙氧基的氧原子 ( O# # ) .原子间的距离为 :*— * * 0 .3 6 87nm,*— # 0 .3 6 56 nm,# #— * * 0 .3 950 nm,# #— # 0 .3 950 nm.

关键词：光系统抑制剂比较分子场方法三维构效关系顺式氰基丙烯酸酯化合物药效团模型

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