检索结果-南通市图书馆

一株虹鳟源嗜冷黄杆菌CH06的基因组进化及毒力相关基因分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

水产学报 2022年第4期46卷 594-604页

作者：陈福广李绍戊卢彤岩中国水产科学研究院黑龙江水产研究所黑龙江省水生动物病害与免疫重点实验室

为了深入揭示我国鱼类病原菌嗜冷黄杆菌的基因组进化及其致病机制，本实验对嗜冷黄杆菌毒力菌株CH06进行全基因组测序，比较基因组分析并挖掘其毒力相关基因。基因组测序结果显示，CH06的基因组大小为2 836 981 bp,GC含量为32.56%，注释... 详细信息

为了深入揭示我国鱼类病原菌嗜冷黄杆菌的基因组进化及其致病机制，本实验对嗜冷黄杆菌毒力菌株CH06进行全基因组测序，比较基因组分析并挖掘其毒力相关基因。基因组测序结果显示，CH06的基因组大小为2 836 981 bp,GC含量为32.56%，注释出2 437个编码基因。通过平均核苷酸一致性(ANI)分析结果显示，CH06与12株嗜冷黄杆菌的ANI值均高于99%，菌株CH06应属于嗜冷黄杆菌分支。基因组序列分析发现，CH06含有5个插入序列、4个基因岛和3个前噬菌体，揭示这些可移动遗传元件推动了CH06的基因组进化。系统进化树和基因组共线性分析发现，CH06与菌株CSF259-93和FPG101亲缘关系较近。分泌系统分析显示，CH06中存在Ⅰ型分泌系统(type Ⅰ secretion system,T1SS)和Ⅸ型分泌系统(T9SS)。通过蛋白结构域特征分析发现，CH06包含56个T9SS效应蛋白和29个双组分系统元件，表明嗜冷黄杆菌可能存在复杂的致病机制和调控机制。本研究对CH06的基因组进化以及毒力相关基因进行分析，为我国鱼类病原嗜冷黄杆菌的进化、多样性及致病机制研究提供参考。

关键词：虹鳟嗜冷黄杆菌全基因组测序进化毒力相关基因

非洲猪瘟病毒毒力相关基因的鉴定及其功能研究进展

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

中国兽医学报 2023年

作者：蓝靖陆战豪罗瑞宋鑫孙元杨玉莹王涛仇华吉长江大学动物科学学院中国农业科学院哈尔滨兽医研究所动物疫病防控全国重点实验室

非洲猪瘟（African swine fever， ASF）是由非洲猪瘟病毒（African swine fever virus， ASFV）感染猪只所引起的一种急性、出血性、高度接触性传染病。自2018年ASF传入我国以来，已经流行了5年多，病毒已经演化出了低毒力的基因Ⅱ型... 详细信息

非洲猪瘟（African swine fever， ASF）是由非洲猪瘟病毒（African swine fever virus， ASFV）感染猪只所引起的一种急性、出血性、高度接触性传染病。自2018年ASF传入我国以来，已经流行了5年多，病毒已经演化出了低毒力的基因Ⅱ型和基因1型弱毒株，以及基因Ⅱ型和Ⅰ型重组毒株，这为该病的防控和疫苗研发带来了巨大挑战。ASF减毒活疫苗（live attenuated vaccines， LAVs）能够诱导良好的免疫保护，具备商品化疫苗的潜力。鉴定和研究毒力相关基因（virulence-associated genes， VAGs）对于LAVs的研发至关重要，也是ASFV研究的热点和难点。因此，本文对已鉴定的ASFV VAGs进行了全面系统的梳理和分析，并总结了VAGs编码蛋白的作用机制。同时，文章展望了如何全面鉴定ASFV VAGs及其编码蛋白的作用机制，以及如何利用已知的VAGs科学设计安全高效的LAVs，以期为ASFV的致病机制及LAVs研发提供参考。

关键词：非洲猪瘟非洲猪瘟病毒毒力相关基因减毒活疫苗致病机制

2021—2022年广东省深圳市大鹏新区海水及海产品溶藻弧菌的污染状况、毒力基因分布和耐药性研究

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

疾病监测 2024年

作者：黄妙芬刘坚基连宪强刘国栋范秋华骆文博李镇涛深圳市大鹏新区疾病预防控制中心

目的调查广东省深圳市海滨旅游区大鹏新区海水及市售海产品中溶藻弧菌污染状况，对溶藻弧菌环境分离株的毒力基因分布特征及耐药性进行分析，为溶藻弧菌感染防控提供数据支持。方法 2021年1月至2022年12月，每季度采集1次大鹏新区近岸... 详细信息

目的调查广东省深圳市海滨旅游区大鹏新区海水及市售海产品中溶藻弧菌污染状况，对溶藻弧菌环境分离株的毒力基因分布特征及耐药性进行分析，为溶藻弧菌感染防控提供数据支持。方法 2021年1月至2022年12月，每季度采集1次大鹏新区近岸海水及市售海产品样本，分离鉴定出溶藻弧菌，用肉汤稀释法测定其对17种抗生素的耐药性；采用PCR方法扩增溶藻弧菌毒力相关基因tdh、trh、tlh、toxR、fur、collagenase、toxS、ureR、flaA、ompW、aspA，产物用1%的琼脂糖凝胶电泳分析。结果采集海水样本304份，有103份检出溶藻弧菌，检出率为33.88%，不同季节海水中溶藻弧菌的检出率差异有统计学意义(χ2=10.09，P毒力相关基因均有不同比例的分布。结论深圳市大鹏新区海水及海产品中溶藻弧菌污染严重，菌株携带的毒力相关基因复杂多样，存在多重耐药，需对环境中溶藻弧菌进行长期监测，包括基因分型、毒力基因分布、耐药性、进化分析等，可为进一步研究溶藻弧菌进化规律及制定防控策略提供数据支持。

关键词：溶藻弧菌海水海产品毒力相关基因耐药性

华南四省食品中空肠弯曲菌分离株的毒力相关基因分析和ERIC-PCR分型

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

微生物学报 2014年第1期54卷 14-23页

作者：郑扬云吴清平吴葵张菊梅郭伟鹏吴克刚广东省微生物研究所、广东省华南应用微生物重点实验室-省部共建国家重点实验室培育基地、广东省菌种保藏与应用重点实验室、广东省微生物应用新技术公共实验室广东广州510070 广东工业大学轻工化工学院广东广州510006 中国科学院南海海洋研究所广东广州510632

【目的】了解空肠弯曲菌(Campylobacter jejuni)在华南四省食品中的污染状况及其遗传多样性,为食源性病原菌的风险监测和控制提供基础数据。【方法】采用传统国标和MPN组合的方法对华南四省市售生鲜禽畜肉及其制品、生食蔬菜、熟食、水... 详细信息

【目的】了解空肠弯曲菌(Campylobacter jejuni)在华南四省食品中的污染状况及其遗传多样性,为食源性病原菌的风险监测和控制提供基础数据。【方法】采用传统国标和MPN组合的方法对华南四省市售生鲜禽畜肉及其制品、生食蔬菜、熟食、水产品、速冻食品、奶制品、食用菌7大类食品进行C.jejuni污染调查,对分离到的C.jejuni菌株进行12种毒力相关基因检测分析和ERIC-PCR分型。【结果】2011-2012年共检测样品558份,检出阳性样品14份,检出率2.51%,其中肉与肉制品的检出率达13.2%,污染量达8.77 MPN/g,获得C.jejuni14株。毒力相关基因分析显示9种毒力相关基因的携带率超过50%,而pldA和wlaN的携带率均为14.3%,virB11的携带率为0。ERIC-PCR分析结果显示15株C.jejuni可分为3簇共10种基因型,其中簇A中有4株的指纹图谱基本相同。【结论】华南四省中的生鲜禽肉类样品,存在不同程度的空肠弯曲菌污染,尤其是福州的鸭肉样品,其MPN值大于110 MPN/g,应加强生禽肉类的食品安全防控。

关键词：空肠弯曲菌 ERIC-PCR分型毒力相关基因

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

溶藻弧菌的毒力相关基因及其对小鼠的致病力

微生物学报 2014年第1期54卷 80-88页

作者：熊盼彭喜春魏霜陈沿廷赵晖唐书泽吴希阳暨南大学理工学院食品科学与工程系广东广州510632 湖北省出入境检验检疫局检验检疫技术中心湖北武汉430022

【目的】通过多重PCR检测和小鼠动物实验,对溶藻弧菌环境分离株的毒力因子进行评估,以期获得较强致病菌株和弱致病菌株之间的差别,并初步探讨该菌毒力因子对小鼠的致病机理。【方法】采用多重PCR体系检测毒力相关基因,我妻氏血平板溶血... 详细信息

【目的】通过多重PCR检测和小鼠动物实验,对溶藻弧菌环境分离株的毒力因子进行评估,以期获得较强致病菌株和弱致病菌株之间的差别,并初步探讨该菌毒力因子对小鼠的致病机理。【方法】采用多重PCR体系检测毒力相关基因,我妻氏血平板溶血实验和平板酶活实验检测溶藻弧菌株的溶血素和胞外酶;以昆明小白鼠为实验动物,攻毒方式为灌胃和腹腔注射,根据小鼠的致病症状和死亡情况来分析和对比溶藻弧菌的胞外分泌物以及菌体本身的毒性。【结果】10株溶藻弧菌产淀粉酶、卵磷脂酶的比例为100%,脂肪酶、明胶酶次之(为70%),脲酶均未被检出;神奈川现象阳性菌株率为60%。毒力基因检测的结果显示10株溶藻弧菌中toxR、Collagenase、tlh、FlaA、ompW、AspA、fur这些与毒力有关的基因均有分布,而toxS、trh、tdh、UreR并未检出。10株溶藻弧菌中的VA009对小鼠显示了较强的致病性,能造成腹腔积液,经腹腔注射感染此菌后7 d内死亡率高达80%。【结论】不同的溶藻弧菌对小鼠的致病性存在较大差异,溶藻弧菌菌体本身比胞外分泌物对其毒性的贡献要大,而副溶血弧菌的毒性则由其胞外分泌物起主要作用;比较我们筛选出的强致病菌株与弱致病菌株,其上述毒力基因的分布并没有差别,说明溶藻弧菌可能存在一套与副溶血弧菌不同的独立的毒力基因系统。

关键词：溶藻弧菌毒力相关基因致病性小鼠

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

钩端螺旋体毒力相关基因的分布特点分析

中华流行病学杂志 2003年第12期24卷 1122-1125页

作者：赵莉蒋秀高聂一新肖玉春徐建国中国疾病预防控制中心传染病预防控制所人兽共患病室

目的　探讨钩端螺旋体 (钩体 )毒力相关基因的分布特点。方法　根据钩体赖型赖株全基因组序列的生物信息学分析资料 ,选择了 12个可能与钩体毒力相关的基因 ,采用聚合酶链反应(PCR)方法 ,对中国问号钩体 38株参考菌株和 81株分离的野生... 详细信息

目的　探讨钩端螺旋体 (钩体 )毒力相关基因的分布特点。方法　根据钩体赖型赖株全基因组序列的生物信息学分析资料 ,选择了 12个可能与钩体毒力相关的基因 ,采用聚合酶链反应(PCR)方法 ,对中国问号钩体 38株参考菌株和 81株分离的野生菌株 ,以及 12株非致病性的双曲钩体共 131株菌株进行了检测。结果　问号钩体中各毒力相关基因分布广泛 ,双曲钩体中仅检测到个别毒力相关基因。lipL32基因存在于所有检测的问号钩体 ,lipL36基因在问号钩体不同菌株中的变异较大 ,阳性检测率为 0 %～ 90 .91% ;la16 0 8基因在问号钩体黄疸出血群菌株中阳性检测率为87.5 0 % ,而在其他血清群菌株间阳性检测率为 0 %～ 2 5 .0 0 % ,sphA基因仅在问号钩体少数菌株中能检测到 ,阳性检测率为 17.6 5 % ,且在中国赛罗群哈焦型参考菌株中未检测到。结论　这些基因可能是问号钩体重要的毒力相关基因。其中lipL32可能是问号钩体各血清群菌株共同抗原的编码基因 ;lipL36基因可能和问号钩体血清群特异性和多样性有关 ;la16 0 8基因可能是黄疸出血群菌株特有的基因 ;哈焦型菌株与问号钩体菌株在基因结构具有较大的差异。

关键词：钩端螺旋体毒力相关基因分布特点聚合酶链反应

不同种(株)利什曼原虫毒力相关基因的表达差异

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国寄生虫学与寄生虫病杂志 2009年第4期27卷 307-311页

作者：张仁刚张洁敬保迁川北医学院免疫学与分子生物学研究所南充637000

目的观察不同种(株)利什曼原虫前鞭毛体和无鞭毛体的毒力相关基因表达情况。方法制备杜氏利什曼原虫、婴儿利什曼原虫、热带利什曼原虫、硕大利什曼原虫和墨西哥利什曼原虫等5种7株利什曼原虫前鞭毛体和无鞭毛体的总RNA,采用半定量RT-PC... 详细信息

目的观察不同种(株)利什曼原虫前鞭毛体和无鞭毛体的毒力相关基因表达情况。方法制备杜氏利什曼原虫、婴儿利什曼原虫、热带利什曼原虫、硕大利什曼原虫和墨西哥利什曼原虫等5种7株利什曼原虫前鞭毛体和无鞭毛体的总RNA,采用半定量RT-PCR法,以α-微管蛋白基因和3-磷酸甘油醛脱氢酶基因(GAPDH)作为阳性对照,根据GenBank公布的GDP甘露糖焦磷酸酶基因(GDPMP)、A2抗原相关蛋白基因(A2rel)、脂磷酸多糖合成蛋白1基因(LPG1)、脂磷酸多糖合成蛋白2基因(LPG2)、动基体膜蛋白11基因(KMP-11)、胱氨酸蛋白酶C基因(CPC)、亲水性酰化表面蛋白B1基因(HASPB1)、胱氨酸蛋白酶2基因(CPB2)、胱氨酸蛋白酶B2.8基因(CPB2.8)和热激蛋白100基因(CLPb)等毒力相关基因的核苷酸序列,设计特异性引物进行RT-PCR扩增,分析以上各基因在各种(株)前鞭毛体和无鞭毛体中的表达情况。结果各毒力基因在不同种(株)利什曼原虫的前鞭毛体和无鞭毛体中的表达明显不同,HASPB1基因在7个种(株)利什曼原虫的无鞭毛体和杜氏利什曼原虫前鞭毛体中均表达,GDPMP、LPG1、LPG2、CPB2.8、CPB2、A2rel和CLP基因分别在特定种(株)的前鞭毛体和/或无鞭毛体中表达,CPC基因仅在杜氏利什曼原虫SC10株和硕大利什曼原虫无鞭毛体内表达,KMP-11基因在7个种(株)利什曼原虫前鞭毛体或无鞭毛体内均不表达。结论毒力相关基因的表达存在种特异性和期特异性。

关键词：利什曼原虫毒力相关基因表达

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

沈阳农业大学学报 2019年第5期50卷 550-558页

作者：周媛媛张学谅王静陈欣李睿尹荣兰王超黄晨尹荣焕沈阳农业大学东北畜禽疫病研究教育部重点实验室/畜牧兽医学院沈阳110161 吉林省畜牧兽医科学研究院长春130062

为探究副猪嗜血杆菌同一血清型不同菌株间毒力相关基因的差异以及LpxC基因的遗传特性,本试验设计35种毒力相关基因的特异性引物,对副猪嗜血杆菌血清型4型的两种菌株进行PCR验证,并将两株菌株的LpxC基因连接到T5载体上,转化到大肠杆菌感... 详细信息

为探究副猪嗜血杆菌同一血清型不同菌株间毒力相关基因的差异以及LpxC基因的遗传特性,本试验设计35种毒力相关基因的特异性引物,对副猪嗜血杆菌血清型4型的两种菌株进行PCR验证,并将两株菌株的LpxC基因连接到T5载体上,转化到大肠杆菌感受态细胞中进行克隆及测序,得到921bp目的片段。在NCBI上进行比对分析,运用DNA star软件对LpxC基因进行核苷酸同源性比对,同时对LpxC基因编码的蛋白质进行生物信息学分析。结果表明:35种毒力相关基因中除SapA基因,其余34种在两个菌株中共同存在,两株HPS的LpxC基因序列与各参考菌株之间的同源性均在97%~100%之间,说明LpxC基因在副猪嗜血杆菌中保守存在。系统进化树结果显示XM1602菌株LpxC基因与SH0165菌株处于同一分支,FS0035菌株LpxC基因与ZJ0906菌株处于同一分支。同时,菌株FS0035和XM1602的LpxC基因编码的蛋白质等电点分别为5.59和5.45;该蛋白质为亲水性蛋白,无跨膜结构;二级结构包括α螺旋、伸展链、β转角和无规卷曲。结果证实,同一血清4型,两株不同的副猪嗜血杆菌菌株在毒力相关基因上存在一定的差异;LpxC基因在两个菌株中保守性较高,变异性较低。

关键词：副猪嗜血杆菌毒力相关基因 LpxC 序列分析生物信息学分析

空肠弯曲菌PCR-RAPD分子亚分型及其毒力相关基因分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

农业生物技术学报 2010年第3期18卷 586-591页

作者：薛峰徐飞张小荣祝长青栾军蒋原陆承平江苏出入境检验检疫局动植物与食品检测中心南京农业大学动物医学院东北农业大学成栋学院扬州大学兽医学院

对113株不同来源的空肠弯曲菌(Campylobacter jejuni)进行RAPD分析,得到15个基因型,其中菌株分布最集中的基因型为V10、V11、V12和V14,所占比例分别为11.50%、12.39%、13.27%和10.62%,不同源分离株呈高度交叉分布。空肠弯曲菌分离株毒... 详细信息

对113株不同来源的空肠弯曲菌(Campylobacter jejuni)进行RAPD分析,得到15个基因型,其中菌株分布最集中的基因型为V10、V11、V12和V14,所占比例分别为11.50%、12.39%、13.27%和10.62%,不同源分离株呈高度交叉分布。空肠弯曲菌分离株毒力相关基因分析显示,黏附相关基因cadF和racR的平均携带率分别为92.45%和38.69%,鞭毛蛋白基因flaA的平均携带率为73.58%;毒素调节基因cdtA、cdtB、cdtC、wlaN和virB11质粒基因的平均携带率分别为71.70%、52.83%、96.23%、12.26%和1.89%;热休克蛋白和转运相关蛋白基因dnaJ和ceuE的平均携带率分别为0.94%和65.09%,CiaB和pldA基因的平均携带率分别为39.62%和9.43%,58.82%的细菌含有6个以上的毒力相关基因。对不同来源的空肠弯曲菌毒力基因的分析结果显示,鸡源各类毒力基因的携带率普遍高于其他来源的检测结果。

关键词：空肠弯曲菌分子亚分型 PCR-RAPD 毒力相关基因