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2020—2022年广东省儿童弯曲菌的耐药性和分子流行特征分析

中国人兽共患病学报 2024年

作者：刘佳俊何冬梅徐静程琦史亚辉欧阳方竹柯碧霞广东省疾病预防控制中心广东省新发传染病应急检测技术研究与应用重点实验室广东药科大学公共卫生学院

目的了解2020—2022年广东省儿童感染空肠弯曲菌和结肠弯曲菌的检出率、耐药特征、毒力特征及多位点序列分型等分子流行特征和病原学特征。方法在广东省广州市2家医院采集2020—2022年疑似感染儿童病例的肛拭子或粪便样本,过滤法分离... 详细信息

目的了解2020—2022年广东省儿童感染空肠弯曲菌和结肠弯曲菌的检出率、耐药特征、毒力特征及多位点序列分型等分子流行特征和病原学特征。方法在广东省广州市2家医院采集2020—2022年疑似感染儿童病例的肛拭子或粪便样本,过滤法分离培养弯曲菌,用微生物质谱系统进行鉴定;采用琼脂稀释法进行抗生素耐药水平分析;提取细菌基因组核酸,开展全基因组测序,基于全基因组测序结果分析弯曲菌耐药基因、毒力基因、多位点序列分型和基于全基因组单核苷酸多态性的系统发育分析。结果本研究的持续性常规监测检出弯曲菌53株,弯曲菌的阳性检出率为2.94%,其中,空肠弯曲菌占81.13%(43/53),结肠弯曲菌占18.87%(10/53)。集中采样处理的多病原监测筛查出弯曲菌16株,其中,空肠弯曲菌11株,结肠弯曲菌5株。对其中46株弯曲菌完成了耐药实验和全基因组测序,包括33株空肠弯曲菌和13株结肠弯曲菌。弯曲菌对临床治疗广泛使用的红霉素的耐药率为21.73%(10/46),对四环素的耐药率为80.43%(37/46),对喹诺酮类抗生素萘啶酸和环丙沙星的耐药率为76.08%(35/46)和71.73%(33/46),对氯霉素的耐药率最低,为2.17%(1/46)。结肠弯曲菌的耐药率普遍高于空肠弯曲菌,在红霉素、庆大霉素、链霉素、泰利霉素和克林霉素指标上的差异具有统计学意义。共检出30株多重耐药菌,有9种多重耐药表型。基于全基因组序列分析,46株弯曲菌携带喹诺酮类、四环素类、β-内酰胺类、氨基糖苷类等抗生素耐药基因;携带5类共128种毒力因子基因;所有46株弯曲菌比对出35种ST型,系统发育分析显示无明显优势ST型,结肠弯曲菌较空肠弯曲菌的SNPs更多。结论 2020—2022年广东省弯曲菌的阳性检出趋于稳定,空肠弯曲菌的检出率高于结肠弯曲菌。弯曲菌分离株对四环素和喹诺酮类抗生素耐药严重,多重耐药谱广泛,其中结肠弯曲菌耐药更为严重;耐药基因和耐药表型有较强的关联,具有一定的预测意义。空肠弯曲菌的毒力基因较结肠弯曲菌更为丰富,可能与更高的检出率和致病性有关。系统发育分支明确且序列呈现较高的遗传多样性,无明显优势克隆群。

关键词：空肠弯曲菌结肠弯曲菌耐药性全基因组测序毒力因子特征

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