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基于异构信息网络与TF-IDF的核心药物发现算法

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计算机时代 2023年第5期 31-35页

作者：梁尘逸姚远哲电子科技大学信息与软件工程学院四川成都610054

提出一种基于异构信息网络和TF-IDF的核心药物发现算法。其核心思想是建立包含症状、方剂等多种类型对象的异构信息网络,并使用PathSim算法得到方剂之间的相似度来完成方剂聚类。以此为基础使用综合了剂量因素与TD-IDF算法原理的药物重... 详细信息

提出一种基于异构信息网络和TF-IDF的核心药物发现算法。其核心思想是建立包含症状、方剂等多种类型对象的异构信息网络,并使用PathSim算法得到方剂之间的相似度来完成方剂聚类。以此为基础使用综合了剂量因素与TD-IDF算法原理的药物重要性系数计算方法完成核心药物发现。本文从《伤寒论》的方剂中划分出9个主要聚类并给出了各个聚类上重要性排名前5的药物,该算法可以考虑到多方面的信息,合理地挖掘出核心药物。

关键词：异构信息网络 PathSim TF-IDF 聚类核心药物

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基于复杂网络的2型糖尿病治疗药物分析

中国药房 2018年第12期29卷 1668-1672页

作者：许少杰杨帆李海英邹兆重李忆琴中山市博爱医院药学部广东中山528403 中山市博爱医院内分泌科广东中山528403

目的:挖掘治疗2型糖尿病的用药规律,为临床治疗提供参考。方法:收集我院2012年1月-2017年6月807例2型糖尿病患者的临床数据资料,借助Gephi 0.9.1软件构建药物配伍复杂网络及各子网络的可视化图谱;运用MATLAB R2014a软件进行主题模型挖掘... 详细信息

目的:挖掘治疗2型糖尿病的用药规律,为临床治疗提供参考。方法:收集我院2012年1月-2017年6月807例2型糖尿病患者的临床数据资料,借助Gephi 0.9.1软件构建药物配伍复杂网络及各子网络的可视化图谱;运用MATLAB R2014a软件进行主题模型挖掘,并从节点距离、度中心性两个方面进行复杂网络、子网络和社团重叠结构分析,筛选出治疗2型糖尿病及其并发症的核心药物。结果与结论:本研究构建的药物配伍复杂网络共有节点119个,边24 412条,最大边权重为378,使用频次较高的药物包括门冬胰岛素注射液、氟伐他汀钠缓释片、盐酸二甲双胍片、阿卡波糖片等。该网络的平均距离为1.89,最大距离为4;89.90%的药物的距离为1或2,各药物间的联系较为紧密;门冬胰岛素注射液(0.914)、盐酸二甲双胍片(0.887)、伏格列波糖片(0.866)是该网络中的核心药物。共挖掘典型主题4个,分别为周围神经病变、外周血管病变、脂代谢异常、微细血管病变。子网络分析结果显示,各典型主题均以降糖治疗为基础,并辅以神经营养、降压、调脂以及改善视网膜病变的药物等。通过复杂网络分析所得的用药规律与2型糖尿病相关指南及临床实际相符,该方法在临床数据挖掘中具有一定意义。

关键词：复杂网络数据挖掘 2型糖尿病用药规律子网络社团重叠核心药物

基于复杂网络分析系统性红斑狼疮阴虚证中医临床核心症状及方药规律

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中国实验方剂学杂志 2019年第16期25卷 152-160页

作者：何美莹陈新林李先涛广州中医药大学基础医学院

目的:挖掘系统性红斑狼疮(SLE)阴虚证临床核心症状及方药,为中医临床辨证及治疗SLE阴虚证提供参考。方法:用复杂网络分析方法,通过临床回顾在广州中医药大学第一附属医院2011年1月至2017年5月病案室322例SLE患者病历以及计算机检索筛选... 详细信息

目的:挖掘系统性红斑狼疮(SLE)阴虚证临床核心症状及方药,为中医临床辨证及治疗SLE阴虚证提供参考。方法:用复杂网络分析方法,通过临床回顾在广州中医药大学第一附属医院2011年1月至2017年5月病案室322例SLE患者病历以及计算机检索筛选出的134篇中医药治疗SLE的文献,对SLE阴虚证中医临床的症状、用药进行复杂网络构建,计算网络的拓扑性质参数,分析SLE阴虚证中医临床核心症状、方药、配伍规律和组方特点。结果:运用复杂网络分析方法得出,本研究中治疗SLE阴虚证的核心中药主要有生地黄、牡丹皮、赤芍、知母、黄芩、青蒿清热,山萸肉收涩,秦艽祛风湿热,鳖甲、女贞子补阴,白芍补血,茯苓、泽泻、薏苡仁利水消肿,山药、甘草片补气,制半夏化痰;核心处方为青蒿鳖甲汤、六味地黄丸;核心症状有疲乏、眠差、纳差、低热、五心烦热、盗汗、头晕、皮疹、皮肤红斑、面部鲜红蝶形红斑、斑疹暗红、脱发、腰膝酸软、关节痛、肌肉痛、耳鸣、口干、咽痛、舌红、苔少、脉细数。核心症状与证候诊断标准进行比较,有新的临床常见症状出现,即眠差、纳差、面部鲜红蝶形红斑、斑疹暗红。结论:SLE以阴虚血热为主要病机,治疗应养阴生津、清热凉血、清虚热,本文运用复杂网络分析法对计算机文献检索及临床病历回顾性研究探讨SLE阴虚证中医临床的症方药规律得出结论与临床基本一致,可为SLE阴虚证中医临床辨证治疗作参考。

关键词：系统性红斑狼疮阴虚证复杂网络分析核心药物方药规律核心症状

贝达喹啉治疗耐多药和利福平耐药结核病的现状与展望

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中华结核和呼吸杂志 2023年第3期46卷 211-216页

作者：时正雨邹莉萍李秀黄涛吴桂辉唐神结成都市公共卫生临床医疗中心结核科成都610000 首都医科大学附属北京胸科医院、北京市结核病胸部肿瘤研究所北京101149

耐多药和利福平耐药结核病的流行情况依然严峻,贝达喹啉是治疗该病的核心药物之一,可以提高治疗成功率和降低病死率。该药在组成全口服短程治疗方案、与其他抗结核新药联合使用、特殊人群中的使用等方面具有很好的应用前景,但目前仍处... 详细信息

耐多药和利福平耐药结核病的流行情况依然严峻,贝达喹啉是治疗该病的核心药物之一,可以提高治疗成功率和降低病死率。该药在组成全口服短程治疗方案、与其他抗结核新药联合使用、特殊人群中的使用等方面具有很好的应用前景,但目前仍处于探索阶段。本专题探讨贝达喹啉的临床应用现状和展望,旨在为医务工作者提供借鉴。

关键词：抗结核新药耐多药临床应用现状核心药物特殊人群利福平耐药结核病专题探讨贝达喹啉

基于中医传承辅助平台的王阶教授治疗频发室性早搏用药经验传承

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中国实验方剂学杂志 2021年第7期27卷 161-168页

作者：李洪峥赵鑫王阶但文超张辉连文静何庆勇北京中医药大学北京100029 中国中医科学院广安门医院北京100053 河南中医药大学郑州450000

目的:借助中医传承辅助平台(V2.5)软件,研究王阶教授治疗频发性室性早搏的用药经验与组方规律,传承王阶教授临床诊疗频发室性早搏的经验。方法:收集并整理王阶教授2016-2020年治疗频发室性早搏的医案处方,采用改进的互信息法、关联规则... 详细信息

目的:借助中医传承辅助平台(V2.5)软件,研究王阶教授治疗频发性室性早搏的用药经验与组方规律,传承王阶教授临床诊疗频发室性早搏的经验。方法:收集并整理王阶教授2016-2020年治疗频发室性早搏的医案处方,采用改进的互信息法、关联规则、复杂系统熵聚类、无监督的熵层次聚类,对处方中药物的性味、归经、应用频次、药对组合等进行统计、关联规则分析与新方发现。结果:共收集王阶教授治疗频发室性早搏处方122则,中药110味,多为辛、甘药物,归经则以脾经为主,兼有心、肾、肝、肺、胃经。使用单药频次最高的桂枝、白芍、生牡蛎、生龙骨、炙甘草、大枣,高频对药为桂枝-白芍116次(占95.08%);常用角药为桂枝-生龙骨-生牡蛎108次(占88.52%),桂枝-白芍-生龙骨106次(占86.89%),桂枝-白芍-生牡蛎106次(占86.89%)。常用药对为木香-砂仁等。核心处方药物为桂枝-白芍-炙甘草-生姜-大枣-生龙骨-生牡蛎-牛膝-党参-黄芪-肉苁蓉-茯苓-酸枣仁。结论:王阶教授治疗频发室性早搏的用方以桂枝加龙骨牡蛎汤为主,药物以桂枝、白芍、生牡蛎、生龙骨、炙甘草、大枣等为主,临床诊疗时随病、证、症进行用药加减。

关键词：组方分析用药规律室性早搏中医传承辅助系统核心药物

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基于复杂网络挖掘古代止痛方剂用药规律

中医杂志 2013年第2期54卷 145-148,166页

作者：孟凡红李明李敬华牛亚华中国中医科学院中医药信息研究所

目的通过复杂网络挖掘技术,总结古代止痛方剂的核心药物、配伍规律及用药特点,以期为疼痛的临床治疗及新药开发提供参考。方法筛选汉代到金元时期的代表性方书著作14部,收集止痛方剂2746首,建立中药止痛方剂数据库并进行术语规范;利用... 详细信息

目的通过复杂网络挖掘技术,总结古代止痛方剂的核心药物、配伍规律及用药特点,以期为疼痛的临床治疗及新药开发提供参考。方法筛选汉代到金元时期的代表性方书著作14部,收集止痛方剂2746首,建立中药止痛方剂数据库并进行术语规范;利用复方药物配伍的无尺度网络规律,构建止痛方剂复杂网络,分析止痛方剂的核心药物及配伍规律。结果按疼痛部位分类,挖掘出腹痛、胸心痛、头痛、肢节痛、腰痛、胁痛、眼目痛、咽痛、全身痛、齿痛在汉唐、金宋元时期排名前10位的高频单味药和药对。结论运用复杂网络挖掘技术,得到了汉唐、宋金元时期治疗各类痛证的核心药物、配伍药对以及用药特点,为今后进一步深入挖掘历代止痛方剂的用药配伍规律起到了示范作用。

关键词：止痛方剂核心药物用药规律复杂网络数据挖掘

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基于药物研发思路的药学综合性实验构建

药学教育 2017年第5期33卷 28-30页

作者：段薇蒋雪云首都医科大学药学院实验教学中心国家级实验教学示范中心北京100069

多学科交叉、融合、渗透已成为当前药学学科发展的显著特征。基于药物研发思路,围绕核心药物新药研发过程,构建内容涵盖计算机辅助药物设计、药物合成、药物分离纯化、药物分析鉴定、载药脂质体制备及药效学评价等实验内容的药学综合实... 详细信息

多学科交叉、融合、渗透已成为当前药学学科发展的显著特征。基于药物研发思路,围绕核心药物新药研发过程,构建内容涵盖计算机辅助药物设计、药物合成、药物分离纯化、药物分析鉴定、载药脂质体制备及药效学评价等实验内容的药学综合实验。经过十余年探索与实践,已独具特色,取得显著的教学效果。

关键词：药学综合实验基于药物研发思路核心药物

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蒲辅周先生治疗湿证用药规律的数据挖掘研究

世界科学技术-中医药现代化 2021年第9期23卷 3195-3201页

作者：张辉何庆勇惠小珊但文超孟培培中国中医科学院广安门医院北京100053 北京中医药大学研究生院北京100029

目的探讨近代中医大家蒲辅周先生的临床治疗湿证的用药经验与组方规律,为传承其临床经验提供参考。方法收集整理蒲辅周先生医案处方共100首方剂,采用改进的互信息法、关联规则、复杂系统熵聚类、无监督的熵层次聚类,进行单药、对药、角... 详细信息

目的探讨近代中医大家蒲辅周先生的临床治疗湿证的用药经验与组方规律,为传承其临床经验提供参考。方法收集整理蒲辅周先生医案处方共100首方剂,采用改进的互信息法、关联规则、复杂系统熵聚类、无监督的熵层次聚类,进行单药、对药、角药的统计、关联规则分析与新方发现。结果蒲辅周先生治疗湿证使用单药频次最高的为茯苓51次(占51.00%)、甘草42次(占42.00%)、通草42次(占42.00%),高频对药为通草-茵陈27次(占27.00%),通草-薏苡仁27次(占27.00%),半夏-茯苓26次(占26.00%),常用角药为滑石-通草-杏仁20次(占20.00%),通草-茯苓-薏苡仁18次(占18.00%),通草-薏苡仁-茵陈18次(占18.00%)。核心处方药物为茯苓、甘草、通草、薏苡仁、半夏。结论蒲辅周先生治疗湿证的用方以清·吴鞠通《温病条辨》的三仁汤、杏仁滑石汤等方剂为主,药物以茯苓、薏苡仁、通草等为主,用于临床时还应随证加减。

关键词：组方规律中医传承辅助系统核心药物湿证

基于复杂网络分析系统性红斑狼疮热毒炽盛证中医临床症方药规律

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中华中医药学刊 2019年第11期37卷 2699-2703,I0009页

作者：何美莹陈新林李先涛广州中医药大学基础医学院

目的:挖掘系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus, SLE)热毒炽盛证临床核心症状及方药,为中医临床辨证及治疗SLE热毒炽盛证提供参考。方法:用复杂网络分析方法,通过临床回顾病案室322例SLE患者病历,对SLE热毒炽盛证中医临床的症... 详细信息

目的:挖掘系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus, SLE)热毒炽盛证临床核心症状及方药,为中医临床辨证及治疗SLE热毒炽盛证提供参考。方法:用复杂网络分析方法,通过临床回顾病案室322例SLE患者病历,对SLE热毒炽盛证中医临床的症状、用药进行复杂网络构建,计算网络的拓扑性质参数,分析SLE热毒炽盛证中医临床核心症状、方药、配伍规律和组方特点。结果:运用复杂网络分析方法得出,本研究中SLE热毒炽盛证的核心症状主要有疲乏、眠差、纳差、高热、神昏、脱发、红色皮疹、四肢红斑、面部鲜红蝶形红斑、关节痛、关节肿痛、口舌生疮、口渴、咳嗽、咯黄痰、舌红、苔黄、脉滑数、脉弦数;核心治疗中药主要有水牛角、生地黄、赤芍、牡丹皮清热凉血,黄芩清热燥湿,金银花清热解毒,薏苡仁、茯苓利水消肿,甘草补气调和;核心处方为犀角地黄汤。核心症状与证候诊断标准进行比较,有新的临床常见症状出现,即疲乏、眠差、纳差、脱发、红色皮疹、关节肿痛、口舌生疮、咳嗽、咯黄痰、脉滑数。结论:本文运用复杂网络分析法对临床病历回顾性研究探讨SLE热毒炽盛证中医临床的症方药规律得出结论与临床基本一致,可为SLE热毒炽盛证中医临床辨证治疗作参考。

关键词：系统性红斑狼疮热毒炽盛证复杂网络分析 Gephi 核心药物方药规律核心症状