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天门冬科广义铃兰族的染色体数目与核型进化研究

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西北植物学报 2021年第8期41卷 1315-1332页

作者：张籍元张成孟然张代贵聂泽龙孟盈吉首大学生物资源与环境科学学院植物资源保护与利用重点实验室湖南吉首416000

广义铃兰族包括6属200余种单子叶植物,具有较为稳定的染色体数目以及明显的核型变化,是研究植物染色体进化非常理想的类群。该研究采用常规压片法对铃兰族5个物种植物的染色体形态、数目及其核型进行了观察分析,并全面收集和整理了铃兰... 详细信息

广义铃兰族包括6属200余种单子叶植物,具有较为稳定的染色体数目以及明显的核型变化,是研究植物染色体进化非常理想的类群。该研究采用常规压片法对铃兰族5个物种植物的染色体形态、数目及其核型进行了观察分析,并全面收集和整理了铃兰族所有已报道的共81种253条的染色体记录,通过综合统计、重建系统发育树,探讨铃兰族属间以及各属下种间的系统关系,以揭示物种间的亲缘关系和起源演化趋势。结果表明:(1)细胞学实验观察发现,铃兰族5个物种植物的染色体数目除蜘蛛抱蛋为2n=36外,其余4种均为2n=38,且均为二倍体,不对称性核型均为Stebbins’-2C型,核型不对称系数As.K%的变化范围为65%~69%,但染色体核型公式有差别。(2)所收集的铃兰族染色体报道记录中,绝大多数物种的染色体数目为2n=38,只在蜘蛛抱蛋属中有部分物种为2n=36;根据染色体长度变化核型主要分为单型和三型;统计结果显示,染色体2n=36的类群比2n=38的类群通常多1对中型染色体,少2对小型染色体,推测可能是由于2对小的染色体融合成为1对中型染色体。(3)基于4个叶绿体基因片段(rbcL、matK、psbA-trnH和trnL-F)和核基因ITS构建的铃兰族最新分子系统发育树显示,铃兰族分为三支,第Ⅰ支位于整个族的基部,为首先分化出来的铃兰-白穗花分支,均以x=19为基数;第Ⅱ支为万年青-吉祥草分支,染色体基数为x=19;第Ⅲ支为蜘蛛抱蛋-长柱开口箭分支,染色体基数为x=18或19;结合铃兰族染色体基数和核型分析发现,铃兰族染色体低基数的x=18是由x=19通过染色体融合或丢失进化而来,推测核型则是由比较对称的单型向不对称的三型演化而来。该研究结果为铃兰族属间关系及物种进化关系提供了细胞学支持证据。

关键词：铃兰族细胞学核型进化分子系统学

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5种国产苏铁的核型和核型进化

林业科学 2002年第3期38卷 49-51,T001页

作者：郑芳勤张晓萍潘爱芳何田华福州市国家森林公园福州350012 北京大学生命科学学院

本文报道了中国产 5种苏铁的核型 ,叉叶苏铁 2n =2 2 =4m +4sm +2st +12T ;多歧苏铁 2n =2 2 =4m+4sm +2st+12T ;苏铁 2n =2 2 =4m +6sm +12T ;台东苏铁 2n =2 2 =4m +6sm +12T ;台湾苏铁 2n =2 2 =4m +4sm+2st+12T。

关键词：苏铁中国核型核型进化

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人参属多物种核型进化和比较基因组学分析

分子植物育种 2023年

作者：张行吴博晓谭昙王红玥李新玲高可宁魏晓双祁新王真慧王振南吉林农业大学农学院

近年来，随着测序技术的发展，人参属多个物种基因组相继被测出，在全基因组水平上对人参属物种基因组结构与进化就有了新的认识。多倍化在植物进化过程中是普遍存在的，最新的研究表明，人参属物种在其进化过程中经历了复杂的多倍化过... 详细信息

近年来，随着测序技术的发展，人参属多个物种基因组相继被测出，在全基因组水平上对人参属物种基因组结构与进化就有了新的认识。多倍化在植物进化过程中是普遍存在的，最新的研究表明，人参属物种在其进化过程中经历了复杂的多倍化过程，也造成了其基因组结构异常复杂。本研究以已组装到染色体水平基因组的人参、屏边三七、西洋参以及竹节参为研究对象，葡萄为参考基因组，利用比较基因组学的研究方法，对人参属几个物种间进行基因组水平的联合比对分析，通过分析由全基因组加倍所导致的基因丢失、保留以及进化规律，得出人参属物种基因组进化过程以及基因组加倍后结构进化方式。结果表明，通过比较分析发现其祖先核心-真核基因组经历了3轮WGDs (γ， PG-β和PG-α)；人参属物种具有相对保守的祖先核心-真核基因组；它们发生过一次共同的WGT事件；人参属物种的基因组在进化历程中发生了大规模断裂融合以及重排。该项研究为理解人参属多倍化过程提供了清晰的基因组同源结构分析证据，对于人参属多物种基因组形成和基因进化研究提供了重要的理论基础。

关键词：人参属核型进化多倍化基因组比对

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松科植物属间核型进化关系初探

南京林业大学学报（自然科学版） 1992年第2期16卷 37-41页

作者：陈天华赖焕林李宽钰吴若菁南京林业大学福建林学院

本文报道了对松科8个属54个种核型材料聚类分析的结果。通过与形态、生化及地理分布方面研实结果比较,认为松科各属在进化过程中除主流方向外,还可能存在“逆转”。

关键词：松科核型进化聚类分析

酵母全基因组加倍与染色体核型进化的关联性分析

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酵母全基因组加倍与染色体核型进化的关联性分析

作者：郑金金华北理工大学

学位级别：硕士

全基因组加倍是许多真核生物进化的核心,酵母物种在约1亿年前发生了一次全基因组加倍,使得基因组的染色体基数从8变为16。然而,现有经历加倍后的酵母物种的染色体条数是10到16,未经历加倍基因组的染色体条数6到8,表明酵母在进化过程中... 详细信息

全基因组加倍是许多真核生物进化的核心,酵母物种在约1亿年前发生了一次全基因组加倍,使得基因组的染色体基数从8变为16。然而,现有经历加倍后的酵母物种的染色体条数是10到16,未经历加倍基因组的染色体条数6到8,表明酵母在进化过程中基因组结构和染色体核型经历了复杂的变化。本研究对8个酵母物种基因组进行基因组同源结构比较分析,得到了经历加倍基因组内的旁系同源基因,每个基因组中约有20%基因是由全基因组加倍产生;对于获得的同源染色体片段按照相似性进行分组,得到了以不同酵母物种基因组为参考,与全基因组加倍和物种分化相联系的同源基因信息。重构了酵母祖先基因集,对现代酵母基因组形成过程中的基因丢失进行了统计,发现基因丢失是一种随机现象,丢失随时间累积,丢失染色体的片段不断延长且丢失片段的长度符合几何分布趋势;另一重要发现是,根据加倍酵母基因组内古代子基因组丢失水平差异,推断酵母亿年前的加倍可能一次异源加倍,即经历加倍的酵母共有一个异源多倍体祖先。对酵母祖先8条染色体到现代酵母基因组核型的形成过程进行了细致分析,揭示了酵母染色体数目减少的一个明显特征就是染色体间的融合,伴随有微型染色体形成,并在进化过程中丢失,其中融合过程中也包含有着丝粒的丢失。另外,染色体间的同源呈现显示克鲁维酵母(***)染色体核型更接近祖先核型,经历加倍的啤酒酵母(***)的染色体核型更接近祖先核型。同时,核型进化分析揭示了经历全基因组加倍的酵母基因组的染色体核型变化尺度更大。本研究构建了酵母多基因组、多参考、多层级的同源共线信息;分析了古代染色体核型到现代基因组形成过程中的变化,并用图加以展示,为酵母比较基因组研究提供了基础平台。

关键词：酵母全基因组加倍重复基因基因丢失核型进化

利用狗染色体特异探针探讨四种食肉目动物核型进化中所发生的染色体间和染色体内结构重排

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利用狗染色体特异探针探讨四种食肉目动物核型进化中所发生的染色...

比较染色体涂色显示小熊猫(Ailurus fulgens)具有高度保守的核型

中国遗传学会第七次代表大会暨学术讨论会

作者：佴文惠王金焕杨凤堂中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化重点实验室

已往研究表明大多数食肉目动物的核型是高度保守的,在核型进化过程中仅有少数染色体发生了重排;而犬科和熊科的染色体重组程度较高。在食肉目动物中,家狗具有最多的二倍体染色体数目和最高度重排的核型,并且有较为完善的基因组图谱,故... 详细信息

已往研究表明大多数食肉目动物的核型是高度保守的,在核型进化过程中仅有少数染色体发生了重排;而犬科和熊科的染色体重组程度较高。在食肉目动物中,家狗具有最多的二倍体染色体数目和最高度重排的核型,并且有较为完善的基因组图谱,故成为比较基因组研究的理想的参考物种之一。应用狗染色体特异探针进行食肉目动物比较基因组研究,可为我们提供前所未有的高分辨率。本研究利用狗染色体特异探针,与分属食肉目鼬科、獴科和猫科三个不同科的四种动物(石貂、果子狸、爪哇獴和猞猁)的染色体进行荧光原位杂交,构建了这四种动物与狗的比较染色体图谱。研究结果表明:虽然这四种动物的核型是高度保守的,但是在核型

关键词：染色体涂色食肉目动物核型进化染色体重排

来源： cnki会议评论

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Acta Genetica Sinica 2002年第2期29卷 124-127,T001页

作者：田颖佴文惠王金焕杨云飞杨凤堂中国科学院昆明动物研究所昆明650223

以狗的整条染色体特异探针 ,通过比较染色体涂色 (ComparativeChromosomePainting) ,建立了小熊猫和狗的比较染色体图谱。狗的 38条常染色体探针在小熊猫染色体上共检出 71个同源片段。其中狗的 18条常染色体每一条在小熊猫染色体上各... 详细信息

以狗的整条染色体特异探针 ,通过比较染色体涂色 (ComparativeChromosomePainting) ,建立了小熊猫和狗的比较染色体图谱。狗的 38条常染色体探针在小熊猫染色体上共检出 71个同源片段。其中狗的 18条常染色体每一条在小熊猫染色体上各有 1个同源片段 ,其余的 2 0条常染色体每一条在小熊猫染色体上各有 2至 5个同源片段。广泛的染色体结构重排造成了小熊猫与狗的核型差异 :至少需要经过 2 8次断裂 ,4 9次融合 ,4次倒位才能将狗的核型 (2n =78)“转变”为小熊猫的核型 (2n =36 )。结合已发表的狗与家猫的比较染色体图谱 ,我们推测 :小熊猫与家猫之间共存在 2 6个同源片段 ,二者的核型之间显示了较高的同源性。通过比较分析狗的染色体同源片段在小熊猫与家猫染色体上的分布和排列 ,可以看出 :4次染色体易位 ,2次倒位造成了小熊猫与家猫的核型差异。我们的工作进一步证实了利用基因组高度重排的物种 (如 :狗 )的染色体特异探针与核型保守的物种 (如 :家猫、水貂、小熊猫 )进行比较染色体涂色研究 ,不但可以准确快速地鉴别物种进化过程中所发生的染色体间的结构重排 ,而且还可揭示染色体内的结构重组。

关键词：小熊猫狗家猫比较染色体涂色核型进化

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豹子花属及百合属13种25居群的核型研究

植物分类与资源学报 2011年第5期33卷 477-494页

作者：万娟周颂东高云东何兴金四川大学生命科学学院四川成都610064

采用常规压片法对豹子花属6种11居群和百合属7种14居群进行了核型研究,并用不对称系数AI度量核型不对称性,以CVCL-CVCI散点图比较近缘类群之间的亲缘关系。结果表明:1)除美丽豹子花No-mocharis basilissa为三倍体外,其余全为二倍体;2)... 详细信息

采用常规压片法对豹子花属6种11居群和百合属7种14居群进行了核型研究,并用不对称系数AI度量核型不对称性,以CVCL-CVCI散点图比较近缘类群之间的亲缘关系。结果表明:1)除美丽豹子花No-mocharis basilissa为三倍体外,其余全为二倍体;2)核型在种间、居群间存在变异,特别是在随体染色体的数目和位置以及B染色体的有无上种间存在明显差别;3)CVCL-CVCI散点图显示豹子花属与百合属关系密切;4)染色体结构变异产生数量和类型不同的次缢痕,是豹子花属植物进化的主要方式。豹子花属在从其起源地和分化中心高黎贡山向四周扩散时,细胞核型方面伴随着出现了非整倍体、三倍体、B染色体和次缢痕进化的类型。

关键词：核型进化豹子花属百合属次缢痕不对称系数AI

基于比较核型分析方法追溯百合族(百合科)二型性核型的起源(英文)

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植物分类与资源学报 2014年第6期36卷 737-746页

作者：殷根深杨志云蒋镇宇龚洵中国科学院昆明植物研究所资源植物与生物技术所级重点实验室云南昆明650201 中国科学院大学北京100049 国立成功大学生命科学系

百合族具有非常一致的二型性核型,由4条长染色体以及20条短染色体组成。目前有两个假说解释其二型性核型的来源,着丝粒横裂和多倍化。但是,具体是哪一种机制起主要作用仍然不清楚。根据文献以及自己的实验结果,我们整理并重新分析了百... 详细信息

百合族具有非常一致的二型性核型,由4条长染色体以及20条短染色体组成。目前有两个假说解释其二型性核型的来源,着丝粒横裂和多倍化。但是,具体是哪一种机制起主要作用仍然不清楚。根据文献以及自己的实验结果,我们整理并重新分析了百合亚科和美德兰亚科所有属的核型资料。比较核型分析结果表明,来自单条染色体的特征、染色体臂数、核型不对称性以及染色体的相对长度诸方面的证据都支持着丝粒横列是百合族核型进化的主要机制,但不能排除其它的机制也在起着作用,如臂间倒位和易位。臂间倒位和易位可能在郁金香族的核型进化中起着主要的作用。另外,本研究还报道了三个种的核型,粗茎贝母(Fritillaria crassicaulis)、准格尔郁金香(Tulipa suaveolens)和尖果洼瓣花(Gagea oxycarpa)。

关键词：二型核型着丝粒横裂比较核型分析核型进化百合族