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亲本数目对鲍养殖群体AFLP标记位点及其遗传结构的影响

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水产学报 2004年第2期28卷 127-132页

作者：万俊芬包振民汪小龙张全启王如才中国海洋大学海洋生命学院中国海洋大学海洋生命学院山东青岛　266003华东理工大学海洋生化工程研究所上海　200237 山东青岛　266003

为了探讨不同的交配亲本数对鲍养殖群体遗传结构的影响,实验中对两个皱纹盘鲍自交群体SS(亲本数少)和LS(亲本数多)及两个皱纹盘鲍(♀)×日本盘鲍(♂)的杂交群体SH(亲本数少)和LH(亲本数多)进行了位点频率和遗传结构的AFLP标记分析。研... 详细信息

为了探讨不同的交配亲本数对鲍养殖群体遗传结构的影响,实验中对两个皱纹盘鲍自交群体SS(亲本数少)和LS(亲本数多)及两个皱纹盘鲍(♀)×日本盘鲍(♂)的杂交群体SH(亲本数少)和LH(亲本数多)进行了位点频率和遗传结构的AFLP标记分析。研究表明,自交组中亲本数少的SS群体的总位点数少于LS群体,后者的一些低频位点在前者中丢失,同时群体的位点频率发生漂移,SS的低频位点数目减少而高频位点略有增加。另外统计了各群体的相似指数和杂合度,发现SS群体的相似指数低于LS,而杂合度高于LS群体。在杂交组两群体(SH,LH)中位点数目频率、相似指数和杂合度变化趋势与两自交群体相似。两组结果均表明群体的亲本数减少会引起一些低频位点丢失及位点频率发生漂移,同时亲本数过少会导致群体的杂合度暂时升高。

关键词：鲍扩增片断长度多态性亲本数目位点频率杂合度

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鹅掌楸苗期生长杂种优势的SSR分析

林业科学 2011年第4期47卷 57-62页

作者：王晓阳李火根南京林业大学林木遗传和基因工程重点实验室南京210037 中国热带农业科学院香料饮料研究所万宁571533

以12个鹅掌楸种间杂交组合子代及其亲本自由授粉子代为材料,在分析各子代苗期生长性状及杂种优势表现的基础上,利用SSR分子标记检测鹅掌楸交配亲本的遗传距离以及杂交组合子代的杂合度,进而分析鹅掌楸苗期生长性状杂种优势与亲本遗传距... 详细信息

以12个鹅掌楸种间杂交组合子代及其亲本自由授粉子代为材料,在分析各子代苗期生长性状及杂种优势表现的基础上,利用SSR分子标记检测鹅掌楸交配亲本的遗传距离以及杂交组合子代的杂合度,进而分析鹅掌楸苗期生长性状杂种优势与亲本遗传距离及子代杂合度之间的相关性。结果表明:鹅掌楸亲本遗传距离及子代杂合度与苗期生长杂种优势之间的相关性均未达显著水平,表明二者可能并非鹅掌楸杂种优势形成的主要原因。

关键词：鹅掌楸杂种优势 SSR 遗传距离杂合度

奶山羊血液蛋白质多态性与产奶性能关系的研究

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畜牧兽医学报 1989年第S1期20卷 63-69页

作者：雒鸣峰西北农业大学奶山羊研究室

应用聚丙烯酰胺凝胶电泳法测定了350只西农莎能奶山羊(以下简称西农羊)的血红蛋白(Hb)、转铁蛋白(Tf)、白蛋白(Alb)和X-蛋白质(X-p)的遗传多态型,得出了这些位点在群体中的表现型和基因频率。用最小二乘法估计了Tf和Hb类型对母羊90天产... 详细信息

应用聚丙烯酰胺凝胶电泳法测定了350只西农莎能奶山羊(以下简称西农羊)的血红蛋白(Hb)、转铁蛋白(Tf)、白蛋白(Alb)和X-蛋白质(X-p)的遗传多态型,得出了这些位点在群体中的表现型和基因频率。用最小二乘法估计了Tf和Hb类型对母羊90天产奶性能的基因型效应值,表明Tf类型对产奶性能的影响大于Hb类型;计算了Tf和Hb类型与产奶性能间的遗传相关系数和利用它们进行选种时相对于个体选择的效率,指出应用这些标记性状进行选种,对于在母羊未表现出生产能力之前或对公羊产奶性能的选择具有实际应用价值。

关键词：产奶性能血液蛋白质奶山羊最小二乘法估计基因频率乳脂率多态性育种值效应值杂合度

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尼西鸡遗传多样性微卫星标记分析

Zoological Research 2006年第1期27卷 68-74页

作者：叶朗惠霍金龙苗永旺朱胜全陈涛刘丽仙潘伟荣毕保良云南农业大学动物科学技术学院云南省种羊场云南寻甸655205 云南农业职业技术学院畜牧兽医系

尼西鸡抗病力强,产蛋性能高,适应高海拔及寒冷的气候条件,是具有独特群体遗传特性的高原地方鸡种。为了对其有效保护和合理利用提供遗传背景资料,筛选了家鸡基因组24条染色体上的33个微卫星标记,对随机选取的50个尼西鸡个体进行多态性检... 详细信息

尼西鸡抗病力强,产蛋性能高,适应高海拔及寒冷的气候条件,是具有独特群体遗传特性的高原地方鸡种。为了对其有效保护和合理利用提供遗传背景资料,筛选了家鸡基因组24条染色体上的33个微卫星标记,对随机选取的50个尼西鸡个体进行多态性检测,共检测到122个等位基因,每个座位平均等位基因数为3·7个。该群体平均多态信息含量和平均杂合度分别为0·5514和0·6350,大染色体较小染色体的微卫星多态性程度高。表明尼西鸡属多态性较丰富的群体。

关键词：尼西鸡微卫星标记遗传多样性多态信息含量杂合度

五指山小型猪近交系微卫星等位基因遗传规律的研究

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畜牧兽医学报 2009年第3期40卷 296-302页

作者：李凯牟玉莲韩建林杨述林刘岚员新旭郭勇冯书堂北京农学院北京102206 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193

利用14对微卫星DNA引物,以五指山小型猪（Wuzhishan Miniature pig,WZSP）F13~F18世代的3个近交家系为研究对象,通过估算基因杂合度（H）、多态信息含量（PIC）和等位基因数（N）等参数,对其遗传变异规律进行探讨,寻找其遗传稳定性的理... 详细信息

利用14对微卫星DNA引物,以五指山小型猪（Wuzhishan Miniature pig,WZSP）F13~F18世代的3个近交家系为研究对象,通过估算基因杂合度（H）、多态信息含量（PIC）和等位基因数（N）等参数,对其遗传变异规律进行探讨,寻找其遗传稳定性的理论依据。结果表明：在14个微卫星基因座上共检测到38个等位基因,总群体的平均H为0.42、平均PIC为0.37、平均N为2.71个;3个家系的平均H分别为0.41、0.45和0.42,平均N分别为2.36、2.29和2.50;F13~F18世代的平均H分别为0.31、0.42、0.36、0.41、0.37和0.20,平均N分别为2.21、2.57、2.43、2.57、2.36和1.64;Sw71、Sw510和Sw2409 3个基因座在WZSP 3个近交家系的13世代时已经完全纯合,而Sw205、Sw874和Sw936等基因座在这3个近交家系的6个世代中仍未能纯合。研究结论：初步揭示了WZSP近交家系中14个微卫星基因座上等位基因的变化规律;最重要的发现是有少数几个基因座,如Sw874和Sw936等一直处于出乎预料的高度杂合状态,这可能与WZSP近交家系的种质特异性有关,推测与这些基因座处于同一连锁群的某些功能基因在维持极高近交水平下WZSP的基本生存能力中起着关键作用。

关键词：五指山小型猪近交家系微卫星杂合度生存力

黄河下游家绵羊与家山羊遗传关系的微卫星分析

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生物多样性 2008年第1期16卷 53-62页

作者：王建民岳文斌山西农业大学动物科技学院

为了探讨家养绵羊与山羊的属间遗传关系,我们利用13个定位于绵羊染色体上的微卫星基因座,分析了黄河下游4个地方绵羊品种、4个地方山羊品种和1个杂交绵羊类群的遗传结构及其系统发生关系。经Hardy-Weinberg平衡检验和中性测试,发现地方... 详细信息

为了探讨家养绵羊与山羊的属间遗传关系,我们利用13个定位于绵羊染色体上的微卫星基因座,分析了黄河下游4个地方绵羊品种、4个地方山羊品种和1个杂交绵羊类群的遗传结构及其系统发生关系。经Hardy-Weinberg平衡检验和中性测试,发现地方绵羊和山羊种群均处于不平衡状态(P杂合度和期望杂合度等遗传多样性参数进行比较,发现绵羊种群的遗传变异程度明显(PHo,FIS>0),但分别属于杂交和近交繁殖。通过群体遗传分化和系统发育拓扑结构分析,证明绵羊属由共同祖先分化而来的时间晚于山羊属,两属间的遗传距离为1.0708-1.5927,遗传分化时间约为19,807-28,955年;绵羊属内品种间的遗传分化程度(FST0.15)。本研究揭示了人工选择对同域家养绵羊与山羊交配系统的形成及群体遗传分化具有深刻的影响。

关键词： Ovis aries Capra hircus 微卫星基因座多态信息含量杂合度遗传距离

基于SSR标记的党参属部分药用植物的遗传多样性和遗传结构评价

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中国实验方剂学杂志 2018年第24期24卷 45-52页

作者：曹玲亚谷聪孙海峰吉姣姣高建平山西医科大学基础医学院药学院山西省道地药材资源开发工程技术研究中心太原030001 山西大学化学化工学院太原030006

目的:采用简单重复序列(SSR)标记技术对来自中国6个省市的党参属4种药用植物进行分析,为党参核心种质资源构建和分子标记辅助育种积累资料。方法:利用10对SSR分子标记引物对党参的遗传多样性和分化程度进行分析,并对党参属的3种药用植物... 详细信息

目的:采用简单重复序列(SSR)标记技术对来自中国6个省市的党参属4种药用植物进行分析,为党参核心种质资源构建和分子标记辅助育种积累资料。方法:利用10对SSR分子标记引物对党参的遗传多样性和分化程度进行分析,并对党参属的3种药用植物(党参、素花党参、川党参)居群进行聚类分析和遗传结构评价。结果:党参10对SSR引物各位点平均等位基因数(Na)和多态性位点百分率(PPL)分别为4. 1和100%;观察杂合度(Ho),期望杂合度(He),平均杂合度(Ha),Shannon’s信息指数(I)的平均值分别为0. 431 9,0. 486 2,0. 410 3,0. 853 7。党参居群水平上的Na,I,He和Ho分别为1. 9~3. 2,0. 44~0. 90,0. 28~0. 57和0. 27~0. 61;其中甘肃陇西德兴家种居群遗传多样性最丰富。遗传相似度的聚类分析将供试党参、素花党参、川党参和秦岭党参共38个居群划分为3类,秦岭党参居群单独为一类(类群Ⅰ),川党参居群和素花党参居群为第二类(类群Ⅱ),党参居群为第三类(类群Ⅲ)。党参、素花党参、川党参的遗传结构分析分为2个基因池,过渡类型少。结论:党参具有丰富的遗传多样性,这一特性与其迁地引种的历史以及自身生物学特性相关;党参居群间存在较高程度的遗传分化,这可能源于自然地理隔离以及近期人类活动引起的生态环境片段化。本文为党参遗传多样性、遗传结构和资源保护等方面的研究提供了理论依据。

关键词：党参简单重复序列遗传多样性遗传结构平均等位基因数多态性位点百分率杂合度

白皮松保育遗传学——天然群体遗传多样性评价与保护策略

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林业科学 2005年第1期41卷 57-64页

作者：李斌顾万春中国林业科学研究院林业研究所北京100091

在白皮松天然林中采取分层取样 ,抽取 10个群体 2 10个单株。测定分析 16种酶系统 ,得到 31个酶位点。白皮松物种水平遗传多样性参数为 :平均等位基因数AS=1 74 2 ,平均有效等位基因数AeS=1 4 9,多态位点百分率PS=5 4 8% ,期望杂合度He... 详细信息

在白皮松天然林中采取分层取样 ,抽取 10个群体 2 10个单株。测定分析 16种酶系统 ,得到 31个酶位点。白皮松物种水平遗传多样性参数为 :平均等位基因数AS=1 74 2 ,平均有效等位基因数AeS=1 4 9,多态位点百分率PS=5 4 8% ,期望杂合度HeS=0 16 2 ;白皮松群体水平遗传多样性参数为 :平均等位基因数AP=1 39± 0 11,平均有效等位基因数AeP=1 30± 0 12 ,多态位点百分率PP=34 85 %± 8 4 6 % ,期望杂合度HeP=0 0 99± 0 0 4 9,观测杂合度HoP =0 0 95± 0 0 4 2。白皮松遗传多样性在松属树种中属于中等偏下 ,群体间分化明显 ,遗传分化系数FST =0 133,群体间遗传距离 D =0 12 8,大于松属平均水平。根据Nei’s遗传一致度将 10个群体分为 3组。白皮松群体遗传多样性中心与资源分布中心和表型多样性分布中心吻合 ,适宜采取中心群体原地保护和多群体异地联合保存相结合的保护策略。

关键词：白皮松遗传多样性杂合度天然群体有效等位基因数多态位点保育表型多样性松属物种

胶质射脉革菌(Phlebia tremellosa)单核菌株的制备与单核体筛选

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基因组学与应用生物学 2021年第2期40卷 656-662页

作者：郭洋贾晨波张彦雄苏建宇徐春燕宁夏大学生命科学学院西部特色生物资源保护与利用教育部重点实验室银川750021

为获得胶质射脉革菌(Phlebia tremellosa)BBEL0901的单核体,本研究首先考察了溶壁酶的浓度、菌龄、酶解时间、稳渗剂浓度等因素对原生质体产量的影响,进而采用正交试验优化影响原生质体制备的关键条件,最后基于细胞核染色的方法鉴定单... 详细信息

为获得胶质射脉革菌(Phlebia tremellosa)BBEL0901的单核体,本研究首先考察了溶壁酶的浓度、菌龄、酶解时间、稳渗剂浓度等因素对原生质体产量的影响,进而采用正交试验优化影响原生质体制备的关键条件,最后基于细胞核染色的方法鉴定单核菌株,基于ITS序列对单核体进行分子鉴定后采用二代测序技术对单核体的全基因组DNA进行检测。结果表明:采用马铃薯葡萄糖(PDB)加富培养基中静置培养4.5 d的菌丝,以0.65 mol/L氯化钠为稳渗剂,用5%的溶壁酶酶解3 h的原生质体产量最大;通过荧光染色和显微镜观察获得了三株单核菌株,对单核菌株M73的全基因组测序显示胶质射脉革菌的基因组为36.1 Mb,杂合度较低。本研究为胶质射脉革菌全基因组测序及基因功能的验证提供了可靠的实验材料。

关键词：胶质射脉革菌(Phlebia tremellosa) 原生质体单核体杂合度