检索结果-南通市图书馆

柔嫩艾美耳球虫地克珠利耐药株与敏感株基因组SNP杂合度的比较分析

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中国兽医杂志 2023年第7期59卷 82-86页

作者：毕菲菲张媛媛郝振凯孙霈于咏兰刘贤勇索勋中国农业大学动物医学院北京海淀100193 中国农业大学动物科技学院北京海淀100193

鸡球虫病是阻碍养禽业健康发展的重要寄生虫病。地克珠利作为一种低毒、广谱、高效的抗球虫药物得到了广泛使用,但长期使用导致鸡球虫耐药株广泛出现。为了探究鸡球虫对地克珠利产生耐药性的分子机制,本试验采用药物浓度递增的方法诱导... 详细信息

鸡球虫病是阻碍养禽业健康发展的重要寄生虫病。地克珠利作为一种低毒、广谱、高效的抗球虫药物得到了广泛使用,但长期使用导致鸡球虫耐药株广泛出现。为了探究鸡球虫对地克珠利产生耐药性的分子机制,本试验采用药物浓度递增的方法诱导耐药株,通过全基因组重测序分析柔嫩艾美耳球虫耐药株和敏感株之间单核苷酸多态性(SNP)的杂合度差异。结果显示,与敏感株相比,耐药株在蛋白激酶(EVM0000192)基因存在2个非同义突变,推测其与柔嫩艾美耳球虫的地克珠利耐药性的产生有关,本试验为后续利用更多耐药株的SNP来发掘地克珠利耐药基因提供了科学依据。

关键词：地克珠利柔嫩艾美耳球虫杂合度耐药性分子机制

20个短串联重复序列基因座杂合度与男性精神分裂症的相关性研究

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精神医学杂志 2022年第6期35卷 634-637页

作者：巴华杰杨春陆子全高志勤赵汉清常州市公安局物证鉴定所DNA实验室江苏常州213003 解放军联勤保障部队第九○四医院常州医疗区

目的探讨短串联重复序列(STR)基因座杂合度与男性精神分裂症(SCH)的相关性。方法运用PowerPlex 21 System荧光标记复合扩增体系对355例男性SCH患者(研究组)与473名健康男性(对照组)样本的20个STR基因座(D3S1358、D1S1656、D6S1043、D13S... 详细信息

目的探讨短串联重复序列(STR)基因座杂合度与男性精神分裂症(SCH)的相关性。方法运用PowerPlex 21 System荧光标记复合扩增体系对355例男性SCH患者(研究组)与473名健康男性(对照组)样本的20个STR基因座(D3S1358、D1S1656、D6S1043、D13S317、Penta E、D16S639、D2S1338、D18S51、CSF1PO、TH01、vWA、Penta D、D21S11、D5S818、D8S1179、TPOX、D12S391、D7S820、D19S433、FGA)开展PCR(聚合酶链反应)复合扩增,再针对扩增产物借助AB3500xL型基因分析系统开展电泳与基因测定。对比2个群体内杂合子比率与20个STR基因座在杂合度上的区别。结果两组20个STR基因座的基因型频率观察值与理论值分布皆与Hardy-Weinberg平衡相符(P>0.05)。D3S1358基因座研究组的杂合度高于对照组(P杂合度比较差异均无统计学意义(P>0.05)。结论D3S1358基因座杂合性增大和男性SCH的发病可能有关。

关键词：男性精神分裂症短串联重复序列杂合度

QF-PCR技术中短串联重复序列杂合度分析及与染色体核型结果的比较研究

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中国当代医药 2022年第11期29卷 12-15,F0003页

作者：许晨霞王德刚张艳芳郑国兵彭建明广东省中山市博爱医院产前诊断中心广东中山528400

目的使用QF-PCR技术对产前样本进行快速诊断,分析多重短串联重复序列(STR)标记杂合度以及三体峰型,为QF-PCR试剂盒STR位点的设计提供研究基础。方法选取2020年9月至2021年7月在中山市博爱医院产前诊断中心进行介入性产前诊断的525例样... 详细信息

目的使用QF-PCR技术对产前样本进行快速诊断,分析多重短串联重复序列(STR)标记杂合度以及三体峰型,为QF-PCR试剂盒STR位点的设计提供研究基础。方法选取2020年9月至2021年7月在中山市博爱医院产前诊断中心进行介入性产前诊断的525例样本作为研究对象,运用QF-PCR技术对13、18、21及性染色体非整倍体进行快速诊断,使用GeneMapper 5.0软件查看并记录STR分型结果图。结果13、18、21及X染色体的STR标记中杂合度最高分别为D13S742、D18S386、D21S1414、DXS8377;杂合度最低的分别为D13S628、D18S391、D21S1433、DXS981。QF-PCR技术发现异常样本共计31例(5.9%),其中三体型27例(21三体19例,18三体6例,13三体2例),X单体1例,染色体其他异常3例;检测到18和21三体中均有4例STR标记为2∶1或者1∶2的双峰;STR位点均为单峰2例,STR位点仅一个双峰23例。结论与传统染色体核型分析比较,QF-PCR技术能更快速诊断常见染色体非整倍体的数目异常,具有简便快速、特异性高的优点。在设计QF-PCR试剂盒时需要选择D13S742、D18S386、D21S1414等杂合度高的STR位点。

关键词： QF-PCR 短串联重复序列分型染色体核型杂合度快速产前诊断

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杜民杂交猪基因杂合度与繁殖性状关系研究

东北农业大学学报 2015年第9期46卷 83-86,92页

作者：王希彪牟春堂郝小燕狄生伟崔世泉童县伟杨庆山东北农业大学动物科学技术学院哈尔滨150030

利用25个微卫星标记对3个世代杜民杂交猪进行基因杂合度遗传学检测,统计产仔数、初生重、初生窝重、21日龄重以及21日龄窝重等繁殖性状。通过基因杂合度与繁殖性状间相关分析,结果表明,随着选育世代增加,群体平均杂合度呈逐代降低趋势;... 详细信息

利用25个微卫星标记对3个世代杜民杂交猪进行基因杂合度遗传学检测,统计产仔数、初生重、初生窝重、21日龄重以及21日龄窝重等繁殖性状。通过基因杂合度与繁殖性状间相关分析,结果表明,随着选育世代增加,群体平均杂合度呈逐代降低趋势;3个世代群体平均杂合度变化趋势与各个繁殖性状变化趋势基本一致;基因杂合度与产仔数、初生窝重间呈显著正相关关系(P杂合度的变化对产仔数和初生窝重等繁殖性状有显著影响。

关键词：杜民杂交猪微卫星标记杂合度繁殖性状

基于二代测序技术的甜橙基因组杂合度与起源研究

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基于二代测序技术的甜橙基因组杂合度与起源研究

作者：焦文标华中农业大学

学位级别：硕士

二代测序技术的快速发展推动了基因组学等组学的高通量定量研究。基于二代测序技术的全基因组重测序研究有助于研究物种遗传多样性,种群结构,物种起源与进化,以及全基因组关联分析。柑橘作为世界第一大水果,同时也是果树类物种的遗传、... 详细信息

二代测序技术的快速发展推动了基因组学等组学的高通量定量研究。基于二代测序技术的全基因组重测序研究有助于研究物种遗传多样性,种群结构,物种起源与进化,以及全基因组关联分析。柑橘作为世界第一大水果,同时也是果树类物种的遗传、育种、基因组学研究的重要参考物种之一。甜橙被认为起源于野生宽皮橘和野生柚的杂交后代,通过珠心胚无性繁殖,并以嫁接等方式培育;因此其基因组具有高度的杂合性。基因组杂合度是植物杂种优势的遗传基础。此前的研究对于甜橙基因组杂合度的研究缺少全基因组范围内研究结果,同时对于甜橙的起源模式和遗传来源缺少全基因组研究的证据。本研究中,我们利用全基因组测序数据,对甜橙基因组的杂合度进行了深入的研究,分析了杂合位点对基因表达的影响,同时确定了甜橙基因组的遗传来源,并对其遗传模式进行了推测。主要研究结果如下： 1)利用甜橙参考基因组的杂合二倍体亲本测序数据,使用生物信息学分析工具预测亲本的杂合位点,总共发现SNP位点868,490个,InDe1位点151,080个,大片段结构变异位点3,517个,包括2,615个删除变异,836个插入变异,66个倒位变异。同时,利用不能比对到参考基因组的读段数据,组装出非参考基因组序列42Mb,并注释出134个蛋白质编码基因。 2)根据杂合位点的注释结果,我们定义了有害突变的位点;并结合不同组织下的RNA-seq基因表达数据,发现了近半数含有该位点的基因存在组织差异表达现象,而位于大片段删除变异区段的基因存在低表达的现象;此外我们发现了1,062个基因呈现等位差异表达的模式。 3)利用野生宽皮橘和野生柚的全基因组测序数据,我们共鉴定出甜橙基因组中39.7Mb和118.2Mb的区段来源于野生柚和野生宽皮橘,两者来源比例接近于1：3,我们推测甜橙的起源模式：野生柚母本与野生宽皮橘父本杂交得到F1代,以F1代为母本再和野生宽皮橘父本杂交,得到的后代就是野生甜橙的祖先,再经过人工培育选择得到现代的甜橙。

关键词：全基因组重测序单核苷酸多态性短片段插入和删除结构变异杂合度基因表达甜橙起源

连续近交下家猪微卫星基因组杂合度与经济性状的相关性研究

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Acta Genetica Sinica 2001年第1期28卷 20-28页

作者：吴晓林李栒 MereteFredholm 湖南省畜牧兽医研究所动物分子生物学实验室湖南农业大学基因工程湖南省重点实验室长沙410128 湖南农业大学基因工程湖南省重点实验室丹麦皇家兽医农业大学动物科学与医学系

从已定位于家猪０１、０２、１１、１３、１７、１８号染色体上的遗传标记中选用５６个具有足够覆盖率的微卫星标记，对１个连续５代近交家系共１９２头家猪进行了基因组扫描分析。用平均微卫星标记杂合度估计基因组杂合度（ＧＨ）。... 详细信息

从已定位于家猪０１、０２、１１、１３、１７、１８号染色体上的遗传标记中选用５６个具有足够覆盖率的微卫星标记，对１个连续５代近交家系共１９２头家猪进行了基因组扫描分析。用平均微卫星标记杂合度估计基因组杂合度（ＧＨ）。ＧＨ对于屠宰重（ＳＷＴ）和日均屠宰重（ＡＤＳＧ）为显著正相关效应，对于背膘厚（ＢＦＤＰ）的相关效应不显著且方向也不一致。ＧＨ的相关效应随近交世代递增而是非线性变化趋势：ＧＨ对于ＳＷＴ和ＡＤＳＧ的相关效应在近交前２世代呈上升趋势，２世代分别到达最大值（２２．４３ｋｇ和０．１３２ｋｇ／ｄ），此后随近交世代的递增而递减；ＧＨ对于ＢＦＤＰ的相关效应随世代递增而非线性递减。微卫星杂合度的相关效应在不同染色体间存在较大差异，对ＳＷＴ和ＡＳＤＧ均表现为正效应，其中又以１３号染色体标记杂合度的相关效应为最大（６．３０６ｋｇ和０．０３２ｋｇ／ｄ），其次依次为１号、１７号、１８号、２号和１１号。各染色体微卫星标记杂合度对于ＢＦＤＰ的相关效应估值的标准误差大，且效应方向不一致（１８号染色体为正效应，其余染色体为负效应）。由此得到如下３点启示：第一，对于经济性状重要的基因（ｅ．ｇ．ＱＴＬ）不

关键词：微卫星近交杂合度基因组扫描家猪经济性状

17个短串联重复序列基因座杂合度与冲动攻击行为的相关性

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国际遗传学杂志 2014年第6期37卷 286-290页

作者：何益民巴华杰杨春余海鹰赵汉清张书友解放军第102医院检验科常州市公安局刑警支队DNA实验室解放军第102医院全军精神医学中心

目的探讨短串联重复序列(STR)基因座杂合度与冲动攻击行为的关系。方法运用PowerPlex 18D System荧光标记复合扩增试剂盒对249例冲动攻击行为军人个体与313例非攻击行为对照个体样本进行PCR复合扩增,然后应用ABI3130XL型基因分析系统对... 详细信息

目的探讨短串联重复序列(STR)基因座杂合度与冲动攻击行为的关系。方法运用PowerPlex 18D System荧光标记复合扩增试剂盒对249例冲动攻击行为军人个体与313例非攻击行为对照个体样本进行PCR复合扩增,然后应用ABI3130XL型基因分析系统对扩增产物进行基因检测。比较两个群体中杂合子比率及17个STR基因座杂度性的差异。结果 17个STR基因座在两个群体均符合Hardy-Weinberg平衡;丽个群体中的杂合子比率差异无统计学意义(P=0.533);在CSF1PO基因座冲动攻击行为组的杂合度显著低于对照组(P=0.035);其余STR基因座两组的杂合度无统计学意义(P>0.05)。结论 CSF1PO基因座杂合性降低可能与冲动攻击行为的发生相关。

关键词：人染色体冲动攻击行为短串联重复序列杂合度

级进杂交绵羊微卫星基因杂合度与生长性能的关系

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南京农业大学学报 2006年第1期29卷 67-71页

作者：刘国庆孙业良杨利国谢庄代蓉任航行南京农业大学动物科技学院江苏南京210095 新疆农垦科学院畜牧研究所新疆石河子832000

利用10个微卫星基因座对陶赛特绵羊及其与新疆细毛羊级进杂交一代、二代和三代4个绵羊群体进行了遗传学检测,计算出各个群体的平均杂合度和平均生产性能的数值,分析群体杂合度与生产性能间的相关系数和变化趋势。结果表明:随级进杂交程... 详细信息

利用10个微卫星基因座对陶赛特绵羊及其与新疆细毛羊级进杂交一代、二代和三代4个绵羊群体进行了遗传学检测,计算出各个群体的平均杂合度和平均生产性能的数值,分析群体杂合度与生产性能间的相关系数和变化趋势。结果表明:随级进杂交程度的增加,群体的杂合度逐渐降低,趋向于陶赛特群体的杂合度;微卫星标记杂合度与各个时期的体重、体高、体长和管围间呈正相关,其中杂合度与各个时期的体长呈显著正相关,而与各个时期的胸围呈负相关。微卫星基因杂合度对各个时期生长性能的相关效应在不同级进杂交群体间存在一定的差异。由此得到3点启示:(1)基因杂合度与生长性能间不是简单的相关关系;(2)级进杂交可使有害基因与中性标记连锁遗传,从而部分或全部抵消杂合优势的表现,甚至出现杂合劣势;(3)不同时期基因间的互作对于性状的作用是不一样的。

关键词：绵羊级进杂交微卫星杂合度

短串联重复序列基因座CSF1PO和FGA杂合度与攻击行为关系的研究

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中华脑科疾病与康复杂志（电子版） 2013年第6期3卷 25-28页

作者：杨春巴华杰余海鹰赵汉清张书友高志勤解放军第102医院全军精神医学中心江苏常州213003 常州市公安局刑警支队DNA实验室

目的探讨短串联重复序列基因座杂合度与攻击行为的关系。方法运用PowerPlex18D System荧光标记复合扩增试剂盒对525例攻击行为军人个体(包括276例主动攻击行为个体和249例被动攻击行为个体)与313例对照样本个体外周静脉血进行PCR复合扩... 详细信息

目的探讨短串联重复序列基因座杂合度与攻击行为的关系。方法运用PowerPlex18D System荧光标记复合扩增试剂盒对525例攻击行为军人个体(包括276例主动攻击行为个体和249例被动攻击行为个体)与313例对照样本个体外周静脉血进行PCR复合扩增,然后应用ABI3130XL型基因分析系统对扩增产物进行基因检测。比较三个群体中杂合子比率及17个STR基因座杂度性的差异。结果 17个STR基因座均符合Hardy-Weinberg平衡;三个群体中的杂合子比率差异无统计学意义(P>0.05);在CSF1PO基因座,被动攻击行为组的杂合度显著低于对照组(66.7%vs.74.8%,χ2=4.43,P=0.035);在FGA基因座,主动攻击行为的杂合度显著低于被动攻击行为组(81.9%vs.88.4%,χ2=4.29,P=0.038);其余STR基因座三组的杂合度无统计学意义(P>0.05)。结论 CSF1PO和FGA基因座可能与攻击行为的发生有关;CSF1PO基因杂合性降低可能与被动攻击行为发生相关;FGA基因座杂合性改变可能与攻击行为发生的类型相关。

关键词：被动攻击型人格障碍染色体,人微卫星重复串联重复序列杂合度