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基于多性状模型内蒙古绒山羊早期生长性状基因组预测准确性研究

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遗传 2024年第5期46卷 421-430页

作者：高林豫许琦何钰霄习海娇刘一帆张涛李金泉张燕军王瑞军吕琦梅步俊苏蕊王志英内蒙古农业大学动物科学学院呼和浩特010018 农业农村部肉羊遗传育种重点实验室呼和浩特010018 内蒙古自治区羊遗传育种与繁殖重点实验室呼和浩特010018 河套学院农学系巴彦淖尔015000

内蒙古绒山羊是经过长期自然选择和人工选育后形成的优良家畜品种,是目前世界一流的绒肉兼用山羊。多性状动物模型被认为可以显著提高畜禽遗传评估的准确性,实现性状间的间接选择。本文基于内蒙古绒山羊个体的系谱、基因型、环境以及早... 详细信息

内蒙古绒山羊是经过长期自然选择和人工选育后形成的优良家畜品种,是目前世界一流的绒肉兼用山羊。多性状动物模型被认为可以显著提高畜禽遗传评估的准确性,实现性状间的间接选择。本文基于内蒙古绒山羊个体的系谱、基因型、环境以及早期生长性状的表型记录,建立多性状动物模型,利用ABLUP、GBLUP、ssGBLUP三种方法进行早期生长性状(初生重、断乳重、断乳前平均日增重、周岁重)遗传参数及基因组育种值的估计,进一步利用五倍交叉验证方法评价基因组育种值估计准确性和可靠性。结果显示,3种方法估计的初生重遗传力为0.13~0.15,断乳重遗传力为0.13~0.20,日增重遗传力为0.11~0.14,周岁重遗传力为0.09~0.14,均属于中等偏低遗传力;断乳重和日增重、日增重和周岁重之间存在强的正遗传相关,相关系数分别为0.77~0.79和0.56~0.67,表型相关发现同样的规律;ABLUP、GBLUP和ssGBLUP法估计的初生重育种值准确性分别为0.5047、0.6694、0.7156,断乳重分别为0.6207、0.6456、0.7254;日增重分别为0.6110、0.6855、0.7357,周岁重分别为0.6209、0.7155、0.7756。综上所述,内蒙古绒山羊早期生长性状属于中等偏低遗传力,对其进行遗传选育改良速度相对较慢;通过对断乳重的选择可以实现其他生长性状的遗传改良;ssGBLUP方法估计内蒙古绒山羊早期生长性状基因组育种值的准确性和可靠性均最高,且显著高于ABLUP法,说明该方法是内蒙古绒山羊早期性状基因组选育的最佳方法。

关键词：内蒙古绒山羊早期生长性状多性状动物模型基因组育种值估计准确性

不同动物模型对高山美利奴羊早期生长性状遗传参数估计的比较

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中国农业科学 2018年第6期51卷 1202-1212页

作者：张剑搏袁超岳耀敬郭健牛春娥王喜军王丽娟吕会芹杨博辉中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所/中国农业科学院羊育种工程技术研究中心甘肃省绵羊繁育技术推广站

【目的】研究不同动物模型对高山美利奴羊早期生长性状遗传参数估计的影响,筛选适合高山美利奴羊早期生长性状遗传参数估计的最佳动物模型并估计早期生长性状的遗传参数,为高山美利奴羊早期阶段的选育提高提供理论依据。【方法】运用ASR... 详细信息

【目的】研究不同动物模型对高山美利奴羊早期生长性状遗传参数估计的影响,筛选适合高山美利奴羊早期生长性状遗传参数估计的最佳动物模型并估计早期生长性状的遗传参数,为高山美利奴羊早期阶段的选育提高提供理论依据。【方法】运用ASReml软件对固定效应进行F检验,判断固定效应中的因子是否显著,筛选出对高山美利奴羊早期生长性状具有显著影响作用的固定效应;其次运用ASReml软件中的AIREML算法通过不同动物模型估计高山美利奴羊早期生长性状的遗传参数,根据各模型随机效应的不同构建了4个动物模型,各模型中均包含固定效应、随机效应和残差效应,其中模型1的随机效应包括个体加性遗传效应,模型2的随机效应包括个体加性遗传效应、母体遗传效应,模型3的随机效应包括个体加性遗传效应、个体永久环境效应,模型4的随机效应包括个体加性遗传效应、母体遗传效应和个体永久环境效应。最后,通过赤池信息量准则(AIC)指数和似然比检验(LRT)对不同模型中的随机效应进行比较分析筛选出最佳动物模型,利用最佳动物模型估计出高山美利奴羊早期生长性状的遗传参数。【结果】(1)血统类型、出生年份、配种月份、初生月份、群别、性别以及出生类型对高山美利奴羊早期生长性状初生重、断奶重、断奶前平均日增重和断奶毛长均有极显著的影响(P早期生长性状受个体加性遗传效应和母体遗传效应影响极显著,而受个体永久环境效应的影响可以忽略不计。因此,模型2是高山美利奴羊早期生长性状遗传参数估计的最佳动物模型。【结论】高山美利奴羊早期生长性状受母体遗传效应的影响比其他随机效应更显著;模型2为高山美利奴羊早期生长性状遗传参数估计的最佳动物模型。基于最佳动物模型估计的初生重、断奶重、断奶前平均日增重、断奶毛长、妊娠期的遗传力分别为0.0924±0.0160、0.0651±0.0126、0.0681±0.0130、0.0865±0.0148、0.0902±0.0174,母体遗传效应分别为0.1623±0.0113、0.1098±0.0112、0.0898±0.0112、0.0173±0.0107、0.0477±0.0146。

关键词：动物模型高山美利奴羊早期生长性状遗传参数遗传力母体遗传效应

用不同模型估计绒山羊早期生长性状遗传参数的比较

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Acta Genetica Sinica 2004年第6期31卷 578-581页

作者：白俊艳李金泉道尔吉张勤内蒙古农业大学动物科学与医学学院呼和浩特010018 中国农业大学动物科学技术学院北京100094

利用内蒙古伊盟阿尔巴斯白绒山羊种羊场从 1993年至 2 0 0 0年间白绒山羊的早期生长性状 (包括出生重、断乳重、日增重和周岁重 )的场内测定数据 ,对 4种不同动物模型估计遗传参数的差异进行了比较分析。不同模型中对母体遗传效应和母... 详细信息

利用内蒙古伊盟阿尔巴斯白绒山羊种羊场从 1993年至 2 0 0 0年间白绒山羊的早期生长性状 (包括出生重、断乳重、日增重和周岁重 )的场内测定数据 ,对 4种不同动物模型估计遗传参数的差异进行了比较分析。不同模型中对母体遗传效应和母体环境效应作了不同的考虑 :模型Ⅰ ,不考虑母体遗传效应和母体环境效应 ;模型Ⅱ ,仅考虑母体遗传效应 ;模型Ⅲ ,仅考虑母体环境效应 ;模型Ⅳ ,同时考虑母体遗传效应和母体环境效应。利用MTDFREML程序采用非求导约束最大似然法 (DFREML)估计各模型中的方差组分 ,用似然比检验对不同模型的差异进行检验。结果表明 :对于出生重 ,母体遗传效应和母体环境效应都有极显著的影响 ,应采用模型Ⅳ进行分析 ;对于断乳重和日增重 ,母体遗传效应的影响不显著 ,而母体环境效应的影响极显著 ,应采用模型Ⅲ进行分析 ;对于周岁重 ,母体环境效应的影响不显著 ,而母体遗传效应的影响显著 ,应采用模型Ⅱ进行分析。

关键词：绒山羊早期生长性状动物模型母体效应

蛋用鹌鹑的VIPR-1基因的多态性与早期生长性状的关联分析

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浙江农业学报 2021年第8期33卷 1393-1401页

作者：董智豪陈宇黄高想白俊艳李静云赵淑娟雷莹王新乐胡琦杭范征宇河南科技大学动物科技学院河南洛阳471023 洛阳市动物遗传育种重点实验室河南洛阳471023

为分析VIPR-1基因是否能作为鹌鹑早期生长性状的相关分子标记或者候选基因,以中国黄羽鹌鹑、中国白羽鹌鹑、朝鲜鹌鹑3个蛋用鹌鹑品种作为实验对象,采用PCR-RFLP技术和测序技术检测VIPR-1基因的外显子6-7的多态性,并分析该基因多态性与... 详细信息

为分析VIPR-1基因是否能作为鹌鹑早期生长性状的相关分子标记或者候选基因,以中国黄羽鹌鹑、中国白羽鹌鹑、朝鲜鹌鹑3个蛋用鹌鹑品种作为实验对象,采用PCR-RFLP技术和测序技术检测VIPR-1基因的外显子6-7的多态性,并分析该基因多态性与蛋用鹌鹑早期生长性状的关联程度。结果表明,在3个蛋用鹌鹑品种中的VIPR-1基因外显子6-7区域共检测出15个SNP位点,分别为A94G、G97T、C201T、A204G、A233G、C260G、A299T、C354T、A355G、C378T、C407G、A425C、A543G、G585T、A586G。对HpyCH4IV位点(A355G)进行酶切分析,可以检测到3种基因型即AA(285 bp/811 bp)、AG(285 bp/811 bp/1096 bp)和GG(1096 bp)。中国黄羽鹌鹑和中国白羽鹌鹑的AA、AG、GG基因型频率分别为0.227、0.636、0.136和0.087、0.609、0.304。朝鲜鹌鹑AG和GG基因型频率分别为0.235和0.765。1~4周龄时,VIPR-1基因的HpyCH4IV位点与中国黄羽鹌鹑的日增重、体重、胫长、胸宽、胸深、胸骨长、胫围有显著关联性(P生长率均有显著的关联性(P生长均有显著的关联性(P早期生长性状具有一定影响。

关键词：蛋用鹌鹑 VIPR-1基因 PCR-RFLP 早期生长性状基因多态性

红鳍东方鲀ctgf基因的SNPs筛选及其与早期生长性状的关联分析

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基因组学与应用生物学 2022年第4期41卷 762-770页

作者：周金旭王宁徐浩王冠马文超杨晓肖龙刘圣聪仇雪梅孟雪松王秀利大连海洋大学水产与生命学院大连116023 大连天正实业有限公司大连116011

结缔组织生长因子(connective tissue growth factor,CTGF)是一种分泌蛋白,可调节细胞的增殖、分化和生长。为探究ctgf基因是否存在单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)及其与红鳍东方鲀早期生长性状的相关性,本研究对... 详细信息

结缔组织生长因子(connective tissue growth factor,CTGF)是一种分泌蛋白,可调节细胞的增殖、分化和生长。为探究ctgf基因是否存在单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)及其与红鳍东方鲀早期生长性状的相关性,本研究对2月龄的893个红鳍东方鲀个体的体重、体长和体全长早期的生长性状进行了测定,筛选了ctgf基因上的SNPs位点,利用最小二乘法分析了SNPs与早期生长性状间的相关性。结果表明,在ctgf基因上存在14个SNP位点,其中C23T、G39T和C270G位点为错义突变,这些位点编码的氨基酸种类由苏氨酸、亮氨酸和丙氨酸分别变为甲硫氨酸、苯丙氨酸和甘氨酸。C23T、G39T和C270G位点均与红鳍东方鲀早期生长性状相关,其中C23T位点的CC基因型个体的体长极显著长于CT基因型个体的体长(P生长性状上极显著大于GG基因型和GT基因型个体的体重和体全长(P早期生长性状的选择、分子标记辅助育种提供了参考。

关键词：红鳍东方鲀结缔组织生长因子(ctgf)基因单核苷酸多态性早期生长性状

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非遗传因素对疆南绒山羊早期生长性状的影响

中国畜牧杂志 2024年第5期60卷 172-177页

作者：陆庆伟刘文娜李彬吴翠玲付雪峰秦崇凯新疆农业大学动物科学学院新疆乌鲁木齐830052 新疆畜牧科学院畜牧研究所新疆绒毛用羊遗传育种与繁殖实验室(XJYS1105) 新疆乌鲁木齐830011 阿克苏地区畜牧技术推广中心新疆阿克苏843000 新疆师范大学生命科学学院中亚区域跨境有害生物联合控制国际研究中心新疆特殊环境物种多样性应用与调控实验室新疆乌鲁木齐830017

绒山羊早期生长性状不仅是评定生长发育的重要指标,而且在减少养殖成本和提高经济效益方面具有举足轻重的作用。本研究旨在探讨非遗传因素对疆南绒山羊早期生长性状的影响规律。收集2015—2020年阿克苏地区白虎台绒山羊基地6 409只疆南... 详细信息

绒山羊早期生长性状不仅是评定生长发育的重要指标,而且在减少养殖成本和提高经济效益方面具有举足轻重的作用。本研究旨在探讨非遗传因素对疆南绒山羊早期生长性状的影响规律。收集2015—2020年阿克苏地区白虎台绒山羊基地6 409只疆南绒山羊产羔记录、整群记录和配种记录,采用SAS 9.4软件的GLM过程,分析出生年份、出生月份、母亲年龄、性别、群别对初生重和周岁重的影响。结果表明,出生年份、性别和群别对早期生长性状有极显著影响;出生月份对初生重有显著影响,对周岁重没有显著影响;母亲年龄对早期生长性状没有显著影响。因此,建议统一牧场管理,合理分配放牧草场,以确保母羊在配种前后的饲养水平和生产性能基本一致;提高饲养员的饲养管理水平,并在枯草期对妊娠母羊进行补饲,以降低自然环境对早期生长性状的影响;适当调整母羊的初产年龄,增加3~4岁母羊的数量,并及时淘汰6岁以上的母羊,以提高羔羊的初生重。

关键词：疆南绒山羊非遗传因素最小二乘方差分析早期生长性状

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蛋鸡早期生长性状、40周龄体尺性状和72周龄屠宰性状的典型相关分析

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四川农业大学学报 2016年第3期34卷 359-364页

作者：李永峰王克华曲亮窦套存马猛沈曼曼郭军胡玉萍王星果中国农业科学院家禽研究所江苏扬州225125

【目的】旨在揭示蛋鸡早期生长性状、40周龄体尺性状和72周龄屠宰性状3组性状间的相互关系。【方法】选取利用东乡青壳蛋鸡和白来航鸡构建的F2代资源群体母鸡1 186只,采用简单相关分析法和典型相关分析法对3组性状间25个变量进行分析。... 详细信息

【目的】旨在揭示蛋鸡早期生长性状、40周龄体尺性状和72周龄屠宰性状3组性状间的相互关系。【方法】选取利用东乡青壳蛋鸡和白来航鸡构建的F2代资源群体母鸡1 186只,采用简单相关分析法和典型相关分析法对3组性状间25个变量进行分析。【结果】简单相关分析的结果表明:25个变量间共有284对存在极显著简单相关(P早期生长性状与40周龄体尺性状、早期生长性状与72周龄屠宰性状和40周龄体尺性状与72周龄屠宰性状3组性状间第一典型相关系数分别为0.726、0.826和0.741,均达到极显著水平(P性状间总相关信息量的96.3%、96.4%和86.5%。在3组性状间起主要作用的性状有18周龄体重、开产体重、胫围、体斜长、屠体重和爪重。【结论】典型相关分析比简单相关分析能更准确、全面地反映蛋鸡早期生长性状、40周龄体尺性状和72周龄屠宰性状3组性状间的相关关系,为蛋鸡的选育提供依据。

关键词：蛋鸡早期生长性状 40周龄体尺性状 72周龄屠宰性状典型相关分析

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不同因素对南疆绒山羊早期生长性状的影响

家畜生态学报 2015年第1期36卷 28-31页

作者：李彦飞田可川陶卫东郑文新黄锡霞张富全新疆农业大学动物科学学院新疆乌鲁木齐830052 新疆畜牧科学院新疆乌鲁木齐830000 新疆畜牧科学院新疆种羊与羊毛羊绒质量监督检验中心新疆乌鲁木齐830000 新疆阿克苏地区山羊研究中心新疆阿克苏843000

应用SAS 8.1软件的最小二乘方差分析法对影响南疆绒山羊早期生长性状的因素进行分析,为南疆绒山羊进一步选育和遗传评估提供依据。结果表明:母羊年龄、出生年份、出生月份、出生类型和性别对南疆绒山羊初生重、平均日增重有极显著影响(P... 详细信息

应用SAS 8.1软件的最小二乘方差分析法对影响南疆绒山羊早期生长性状的因素进行分析,为南疆绒山羊进一步选育和遗传评估提供依据。结果表明:母羊年龄、出生年份、出生月份、出生类型和性别对南疆绒山羊初生重、平均日增重有极显著影响(P0.05)。因此,应注重不同因素尤其是母羊年龄对南疆绒山羊早期生长性状的影响,优化羊群年龄结构,淘汰年龄较大的母羊,提高生产效率。此外,这些影响早期生长性状的因素可以作为固定效应放到模型中,最终为南疆绒山羊早期选种和遗传参数估计奠定基础。

关键词：南疆绒山羊最小二乘方差分析法早期生长性状

MyoG基因型对二花脸猪早期生长性状及肌肉组织学特性的影响

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农业生物技术学报 2002年第4期10卷 367-372页

作者：林万华黄路生艾华水周利华郭源梅麻骏武晏学明罗明江西农业大学江西省动物生物技术重点开放实验室江西农业大学江西省动物生物技术重点开放实验室江西农业大学江西省动物生物技术重点开放实验室江西农业大学江西省动物生物技术重点开放实验室江西农业大学江西省动物生物技术重点开放实验室江西农业大学江西省动物生物技术重点开放实验室江西农业大学江西省动物生物技术重点开放实验室江西农业大学江西省动物生物技术重点开放实验室南昌 330045 广西师范大学生物学系桂林 541004 南昌 330045 南昌 330045 南昌 330045 南昌 330045 南昌 330045 南昌 330045 南昌 330045

肌细胞生成素(myogenin,MyoG)是骨骼肌转录因子MyoD家族的一员,在肌细胞的形成过程中起着中心调控作用。利用21窝不同日龄的二花脸猪(Susscrofa Erhua)共97头,根据日龄组分布分成1组(日龄阶段):49 d,2组:58～60 d,3组:61～70 d,4组:71～... 详细信息

肌细胞生成素(myogenin,MyoG)是骨骼肌转录因子MyoD家族的一员,在肌细胞的形成过程中起着中心调控作用。利用21窝不同日龄的二花脸猪(Susscrofa Erhua)共97头,根据日龄组分布分成1组(日龄阶段):49 d,2组:58～60 d,3组:61～70 d,4组:71～80 d,5组:81～90 d,6组:228 d;采用索氏脂肪抽提法和石蜡组织切片-图像分析法对其背最长肌及半腱肌的肌肉组织学特性进行了测定。根据MyoG基因PCR-RFLP多态性,对二花脸猪不同的MyoG基因型与相关性状即初生重、20日龄体重、断奶重及肌肉组织学特性的关系进行了分析。结果表明:(1)在二花脸猪不同的MyoG基因型间,初生重差异极显著(PBB;肌纤维密度在1～5组表现为AB>BB,4组组内差异显著(P性状表现为组内基因型间差异不显著。

关键词：猪肌细胞生成素基因 PCR-RFLP 早期生长性状肌肉组织学特性