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新鞘氨醇杆菌属9-1的纤维素酶基因Nspcel8A的克隆表达与酶学特性

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基因组学与应用生物学 2021年第4期40卷 1634-1642页

作者：卢春艳覃洁李明栋冯家勋段承杰广西大学生命科学与技术学院亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室南宁530005

木质纤维素转化成燃料酒精是缓解能源和环境危机的途径之一。降低将木质纤维素转化成生物燃料的生产成本,需要提高纤维素酶产量或筛选到具更高酶活性的纤维素酶。新鞘氨醇杆菌(Genus Novosphingobium)属于鞘氨醇杆菌科(Sphingomonads),... 详细信息

木质纤维素转化成燃料酒精是缓解能源和环境危机的途径之一。降低将木质纤维素转化成生物燃料的生产成本,需要提高纤维素酶产量或筛选到具更高酶活性的纤维素酶。新鞘氨醇杆菌(Genus Novosphingobium)属于鞘氨醇杆菌科(Sphingomonads),该科的细菌新陈代谢多样化,能够降解有机化合物,也可应用于木质素的降解,但目前新鞘氨醇杆菌属细菌的纤维素酶基因的研究未见报道。本研究对新鞘氨醇杆菌属细菌菌株9-1的纤维素酶基因Nspcel8A进行了克隆表达和酶学特性鉴定。Nspcel8A含有属于糖基水解酶家族8的催化结构域。该酶在大肠杆菌中实现了异源表达并获得了表达产物。Nspcel8A对羧甲基纤维素(carboxymethylcellulose, CMC)的最适作用pH值和温度分别为4.0和40℃,Nspcel8A具有良好的pH值稳定性,在pH值3.5~11.0范围内放置24 h后能够保持60%以上的酶活力。Nspcel8A对CMC的K_(m)值为10 mg/mL,V_(max)为14μmol·min^(-1)·mg^(-1)。底物特异性测试显示Nspcel8A对CMC有最高的酶活力(8.40 U/mg),但对不可溶纤维维如磷酸膨胀纤维素和Avicel只有较低的酶活力或没有酶活。高效液相色谱法分析显示Nspcel8A不能降解纤维二糖、纤维三糖、纤维四糖,能把纤维五糖部分降解成纤维二糖和纤维三糖,能把纤维六糖降解为纤维二糖、纤维三糖和纤维四糖,并以纤维三糖为主。以上结果显示Nspcel8A是一个内切葡聚糖酶,由于它不能水解结晶纤维素,说明它不是Novosphingobium sp.9-1主要的纤维素降解酶。

关键词：新鞘氨醇杆菌糖基水解酶内切葡聚糖酶酶学特性

深海多环芳烃降解菌新鞘氨醇杆菌H25的降解特性及降解基因

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微生物学报 2008年第9期48卷 1208-1213页

作者：袁军赖其良郑天凌邵宗泽厦门大学生命科学学院厦门361005 国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传重点实验室厦门361005

【目的】为了从深海环境中筛选新的多环芳烃降解菌,了解其降解基因及降解特性。【方法】以原油作为碳源从印度洋深海海水样品中富集筛选出降解能力较强的多环芳烃降解菌,并根据已报道的相关菌属的多环芳烃起始双加氧酶大亚基序列及侧翼... 详细信息

【目的】为了从深海环境中筛选新的多环芳烃降解菌,了解其降解基因及降解特性。【方法】以原油作为碳源从印度洋深海海水样品中富集筛选出降解能力较强的多环芳烃降解菌,并根据已报道的相关菌属的多环芳烃起始双加氧酶大亚基序列及侧翼序列设计兼并引物进行扩增。【结果】获得了1株能够高效降解原油、柴油及多种多环芳烃的菌株H25。经16SrDNA序列系统发育分析表明它属于新鞘氨醇杆菌属(Novosphingobium)(96%)。并从该菌株中扩增获得2条相似度为91.0%双加氧酶基因片段。2条序列在NCBI上Blastn分析表明均与菌株*** DSM12444T的降解质粒pNL1上的双加氧酶大亚基具有最高相似度,分别为99.6%和91.0%。根据pNL1上的双加氧酶序列设计引物获得了包含H25双加氧酶大亚基及上下游序列的2个基因片段H25Ⅰ(2.9kb)和H25Ⅱ(4.5kb)。另外,单碳降解实验表明H25对联苯、2-甲基萘、2,6-二甲基萘、菲、二苯并噻吩、二苯并呋喃等均有较好的降解能力。【结论】H25菌株是Novosphingobium属可能的新种。深海细菌在大洋环境多环芳烃污染的自然净化中起到一定作用,并在环境生物修复中有较大的应用前景。

关键词：深海新鞘氨醇杆菌多环芳烃降解双加氧酶

新鞘氨醇杆菌US6-1降解HMW-PAHs的代谢路径和转录调控研究

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新鞘氨醇杆菌US6-1降解HMW-PAHs的代谢路径和转录调控研究

作者：杨璐溪厦门大学

学位级别：硕士

多环芳烃(PAHs)是一类在环境中广泛分布的有机化学污染物,具有“三致”(致癌、致畸、致突变)效应,通过食物链的传递会对生态环境和人体健康造成极大危害。目前研究结果表明,微生物的降解与转化是消除PAHs污染的有效方式之一。以苯并芘(B... 详细信息

多环芳烃(PAHs)是一类在环境中广泛分布的有机化学污染物,具有“三致”(致癌、致畸、致突变)效应,通过食物链的传递会对生态环境和人体健康造成极大危害。目前研究结果表明,微生物的降解与转化是消除PAHs污染的有效方式之一。以苯并芘(BaP)为代表的高分子量PAHs (HMW-PAHs)因其结构稳定、难降解,可在环境中长期存在。能以BaP为唯一碳源和能源进行矿化的微生物研究报道较少,代谢路径也不够清楚。本论文以一株筛选自海洋环境的、高效的PAHs降解菌Novosphingobium pentaromativorans US6-1为模式菌株,结合实时荧光定量PCR技术和链特异转录组测序技术,针对其对菲(Phe)、芘(Pyr)和苯并芘的降解特性,降解关键酶在不同PAHs诱导下的差异表达,质粒pLA1在芳烃降解中的作用,以及在苯并芘胁迫条件下生理应答过程等进行了较为系统的研究。主要研究结果如下： 1.采用GC/MS技术,检测了新鞘氨醇杆菌US6-1对Phe、Pyr和BaP的降解能力,结果显示：US6-1分别在24h,48h和6d培养后,对起始浓度为10ppm的菲、芘和苯并芘的降解率可达99.02%,52.88%和14.54%。说明新鞘氨醇杆菌US6-1能以Phe、Pyr和BaP为唯一碳源和能源生长,在培养12h、48h和6d后已经分别启动了对Phe、Pyr和BaP的降解;2.对新鞘氨醇杆菌US6-1基因组进行分析,发现了两条中心代谢路径,分别为原儿茶酸代谢路径和邻苯二酚代谢路径。其中原儿茶酸代谢路径的基因主要分布在在染色体上,而邻苯二酚代谢路径的关键基因主要分布在质粒pLA1上。应用SDS-变温法得到了一株敲除质粒pLA1的突变株CPUS6-1,比较US6-1和CPUS6-1在降解16种芳烃(苯并[a]芘、芘、菲、蒽酮、1-羟基-2萘甲酸、1-萘酚、2-萘酚、萘、水杨酸、邻苯二酚、苯甲酸、龙胆酸、4-羟基苯甲酸、原儿茶酸、邻苯二甲酸、间苯二酚)时的差异,证实了邻苯二酚代谢路径存在于质粒pLAl上,同时发现了质粒pLA1在芳烃降解中起着关键作用。我们还发现US6-1能降解龙胆酸,但是CPUS6-1却不能降解,说明有一条未知的龙胆酸代谢路径存在于质粒pLA1上,或者质粒pLAl控制着龙胆酸降解路径基因的表达;3.对新鞘氨醇杆菌US6-1的基因组中降解PAHs的功能基因进行进一步分析,发现了17个具有环羟基化双加氧酶(RHOs)保守结构域的基因,经过ClassRHO软件分析后,17个RHOs中有7个得到了准确分型。除RHOs外,对质粒上分布的其他降解基因及调控基因,在PAHs降解时mRNA水平上的表达差异进行了跟踪,结果显示：RHOtype I NSU626的表达量和未得到分型的RHONSULA1141与其他两种类型的RHOs明显不同,而其它基因的表达模式基本相同,均是在Phe和BaP降解条件下基因的表达量高于Pyr。 4.在以BaP为唯一碳源和不添加任何碳源的条件下,以细菌全局调控系统的关键基因为分子标记,应用链特异转录组测序技术结合实时荧光定量PCR技术,跟踪高分子量PAHs (BaP)胁迫下,US6-1在饥饿应答、群体感应以及启动细胞程序性死亡等应急反应过程中的基因表达差异,结果显示：针对OD600、ETSA和CFU进行了检测,发现新鞘氨醇杆菌US6-1在培养过程中,其OD600值变化不大,而CFU变化幅度较大,由此我们可以得出新鞘氨醇杆菌US6-1会从可培养状态变为不可培养状态以适应不适环境;针对降解路径中的降解基因和应急反应调节基因进行了相对基因表达含量测定,结果表明新鞘氨醇杆菌US6-1在BaP组和Control组内降解基因的表达和应急反应调节基因的表达有相似之处,都可调控自身的基因表达对不良环境的变化做出有效应答。

关键词：新鞘氨醇杆菌高分子量多环芳烃(HMW-PAHs) 代谢路径应急反应转录组

新鞘氨醇杆菌US6-1 tonB2基因缺失株的构建与功能研究

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新鞘氨醇杆菌US6-1 tonB2基因缺失株的构建与功能研究

作者：赵卫军厦门大学

学位级别：硕士

Novosphingobium pentaromativorans US6-1 是一株筛选自 Ulsan 海湾沉积物的革兰氏阴性菌,能高效降解2环至5环的PAHs。链特异转录组测序发现,苯并芘(BaP)压力下共有13个TonB系统相关基因表达水平显著上调,为揭示TonB系统在菌株US6-1应... 详细信息

Novosphingobium pentaromativorans US6-1 是一株筛选自 Ulsan 海湾沉积物的革兰氏阴性菌,能高效降解2环至5环的PAHs。链特异转录组测序发现,苯并芘(BaP)压力下共有13个TonB系统相关基因表达水平显著上调,为揭示TonB系统在菌株US6-1应对BaP压力中的作用,我们以TonB系统中的关键基因tonB为研究对象,在基因组序列分析和实时荧光定量PCR分析的基础上通过自杀性质粒同源重组的方法构建了新鞘氨醇杆菌US6-1 toB基因缺失菌株,并对tonB基因缺失株的生物学特性展开了研究,主要研究结果如下:(1)基因组序列的分析结果表明菌株US6-1有4个tonB基因,我们分别将其称为tonB1、tonB2、tonB和 tonB4。tonB3(JI59S10120)处于tonB3(JI59S10120)/exbD1(J159S10130)/exbD2(JI59S10135)/motA(J159_S10125)基因簇中;tonB1(JI59S03025),tonB2(JI59S06215)和tonB4(JI59S15490)以单顺反子的形式存在,其侧翼没有发现exbB/exbD或其同源基因,这3个tonB基因可能是通过直接与相应的TonB依赖性受体相互作用而发挥相应的生物学功能。(2)氨基酸序列分析表明tonB3与tonB1、tonB2、tonB4基因编码氨基酸之间的同源性分别为18.58%、23.04%、23.96%,两个exbD基因编码氨基酸之间的同源性为24%;值得注意的是菌株US6-1基因组中有43个TonB依赖性受体蛋白编码基因,它们之间的氨基酸同源性为10%～60.47%。(3)多重序列比对分析显示4个TonB蛋白的C末端结构域都具有“YP”基序,除TonB4外其他3个TonB蛋白都具有“SSG”基序;对TonB蛋白的C末端序列进行三维结构预测发现TonB1、TonB2、TonB3和TonB4的C末端结构域均由2个a螺旋和3个β折叠片构成。(4)在以BaP为唯一碳源和不添加任何碳源的条件下,通过实时荧光定量PCR跟踪BaP胁迫和饥饿压力下tonB基因的表达差异。结果显示:饥饿处理4d后,基因tonB1、tonB3、tonB4的表达水平显著上调且明显高于BaP处理4d后该基因的表达水平;BaP处理2d、6d后,基因tonB2表达水平显著上调且明显高于饥饿处理组中该基因的表达水平。我们推测基因tonB2与菌株US6-1响应BaP压力有关,而基因tonB1、ton53、tonB4可能参与了菌株US6-1的饥饿应答过程。(5)本研究通过自杀性质粒同源重组的方法构建了菌株US6-1 toB2基因的缺失菌株US6-1AtonB2,并对缺失株的生物学特性进行了初步研究。结果表明,tonB2基因的缺失对菌株US6-1ΔtonB2的生长并没有影响,与US6-1相比缺失株US6-1ΔtonB2对菲(Phe)和BaP的降解能力显著下降,由此可知基因tonB2在菌株US6-1降解多环芳烃的过程中扮演重要角色。此外,缺失株US6-1AtonB2的生物膜形成能力显著增强。

关键词：新鞘氨醇杆菌 TonB蛋白实时定量PCR 基因敲除

几株新鞘氨醇杆菌的趋化性及其相关基因组成特点

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微生物学报 2017年第3期57卷 399-410页

作者：廖晓敬杨璐溪 Hetharua Buce 周梦凯郑天凌田蕴厦门大学滨海湿地生态系统教育部重点实验室生命科学学院福建厦门361102

【目的】选择了几株隶属于新鞘氨醇杆菌属(Novosphingobium)的有和没有多环芳烃(PAHs)降解能力的细菌,在基因组水平比较分析它们的趋化通路,并探究其中一些菌株对芳香化合物和三羧酸(TCA)循环中间代谢产物的趋化性。【方法】通过基因组... 详细信息

【目的】选择了几株隶属于新鞘氨醇杆菌属(Novosphingobium)的有和没有多环芳烃(PAHs)降解能力的细菌,在基因组水平比较分析它们的趋化通路,并探究其中一些菌株对芳香化合物和三羧酸(TCA)循环中间代谢产物的趋化性。【方法】通过基因组的比较分析,研究了几株新鞘氨醇杆菌的趋化蛋白组成和趋化基因分布,并采用滴定法和游动平板法检测了相关菌对芳香族化合物和TCA循环中间代谢产物的趋化性。【结果】*** US6-1、*** F2、Novosphingobium indicum K13、Novosphingobium stygium DSM 12445、Novosphingobium sp.C2AC等5株新鞘氨醇杆菌对芳香族化合物和TCA循环中间代谢物具有不同程度的趋化性;所选的7株已完成基因组测序的新鞘氨醇杆菌*** F2、*** US6-1、Novosphingobium ***1Y、Novosphingobium ***12、Novosphingobium *** 2-17,Novosphingobium sp.B-7和Novosphingobium *** 19370均含有趋化蛋白MCP、CheW、CheA、CheB、CheR和CheY,且亲缘关系最近的US6-1、F2和PP1Y 3株菌的che基因簇中的基因排列一致,为che W-Y-D-B-R-A-(X);新鞘氨醇杆菌的趋化系统属Fla类型。【结论】几株新鞘氨醇杆菌都具有较为完整的趋化通路,且对多种芳烃及其代谢物的趋化性各不相同,其中菌株US6-1趋化现象最明显。

关键词：趋化性新鞘氨醇杆菌趋化蛋白芳烃化合物

一株海洋新鞘氨醇杆菌phe-8(Novosphingobium sp.)的PAHs降解基因和降解特性

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厦门大学学报（自然科学版） 2006年第B5期45卷 257-261页

作者：崔志松邵宗泽厦门大学生命科学学院福建厦门361005 国家海洋局第三海洋研究所福建厦门361005

以菲为唯一碳源和能源从厦门近海海水样品中筛选到一株能够降解多种PAHs的细菌.16S rDNA序列同源性分析表明它可能属于新鞘氨醇杆菌属(Novosphingobiumsp.).根据已经报道的PAHs起始双加氧酶大亚基基因序列,设计了一对简并引物,并PCR扩... 详细信息

以菲为唯一碳源和能源从厦门近海海水样品中筛选到一株能够降解多种PAHs的细菌.16S rDNA序列同源性分析表明它可能属于新鞘氨醇杆菌属(Novosphingobiumsp.).根据已经报道的PAHs起始双加氧酶大亚基基因序列,设计了一对简并引物,并PCR扩增得到了约700 bp的基因片段.比对结果显示它同已报导的一株降解菌Novosphingobium ar-omaticivoransF199质粒上的bphA1 f基因相似度最高,达到98.26%,该基因编码的蛋白推断是萘或联苯双加氧酶大亚基.以PCR产物为模板制备DNA探针,Southern杂交表明:该基因位于其质粒DNA上.采用气相色谱-质谱联用测定了该菌的降解率,发现它可以高效降解多种高分子量PAHs.

关键词：新鞘氨醇杆菌多环芳烃生物降解双加氧酶降解率

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PAHs降解菌—新鞘氨醇杆菌的趋化性研究

PAHs降解菌—新鞘氨醇杆菌的趋化性研究

作者：廖晓敬厦门大学

学位级别：硕士

包括多环芳烃(PAHs)在内的持久性有机污染物的微生物降解已成为当今环境科学研究的前沿课题。新鞘氨醇杆菌(Novosphingobium)普遍具有降解芳烃等污染物的特性,是优良的芳烃污染环境修复菌。之前人们对微生物降解芳香族化合物的基因、代... 详细信息

包括多环芳烃(PAHs)在内的持久性有机污染物的微生物降解已成为当今环境科学研究的前沿课题。新鞘氨醇杆菌(Novosphingobium)普遍具有降解芳烃等污染物的特性,是优良的芳烃污染环境修复菌。之前人们对微生物降解芳香族化合物的基因、代谢途径和调控手段等进行了系统地研究。对近年来很热门又很棘手的有机物污染环境治理问题而言,微生物对烃类的摄取机制是重要的课题,揭示微生物捕获PAHs的分子转运机制是实现有机物污染生物修复的重要前提。本论文以新鞘氨醇杆菌为研究对象,以新鞘氨醇杆菌如何捕获疏水性PAHs为突破口,采用基因组学、反转录实时荧光PCR等技术对其趋化性、趋化基因、趋化蛋白表达及其与PAHs降解的关联等方面进行了较为系统地研究,获得的主要结果如下： 1.对一株分离自红树林湿地沉积物中PAHs降解菌N. pentaromativorans F2进行了全基因组测序,其基因组精细图构建与生物信息学分析结果显示：F2基因组大小为5.12M,GC含量为63.16%,总共得到33个Scaffold,5,291个基因,占到基因组总长的89.16%;KEGG PATHWAY注释发现有23个基因注释到细菌趋化性通路中,其中5个甲基趋化受体蛋白MCP,1个感受器激酶CheA,1个偶联蛋白CheW,2个反应调节子CheY,2个MCP甲基化酶CheB,2个MCP甲基转移酶CheR,1个融合蛋白cheBR,1个趋化受体谷氨酰胺脱酰胺酶CheD,3个鞭毛马达开关FliG/M/NY,2个鞭毛定子MotA和3个MotB。与其相似性为99.859%的模式菌株*** US6-1则有22个基因注释到细菌趋化性通路中,多了CheX但缺少融合蛋白cheBR。 2.对已完成全基因组测序的新鞘氨醇杆菌的趋化基因分布进行分析,结果显示它们均至少含一个che簇,能够形成完整的趋化通路,是有实际功能的趋化系统,其中F2、PP1Y和US6-1的che簇中趋化基因排列顺序一致,与亲缘关系稍远的AP12和Rr2-17的趋化基因排列不同,验证了它们之间的亲缘关系,仅Rr2-17有3个趋化基因簇,表明Rr2-17有着较复杂的趋化系统。趋化蛋白组成分析显示新鞘氨醇杆菌均含有MCP、CheW、CheA、 CheB、CheR和CheY,组成机制上与Bacillus较相似,与***差别较大。 3.用Pfam和MiST数据库将F2和US6-1的趋化蛋白结构域可视化,结果显示它们的趋化蛋白均有着相同的域结构;分析已测序细菌的趋化基因CheA的域结构发现新鞘氨醇杆菌的趋化系统属于Fla类型。鉴于趋化系统的关键核心蛋白CheA的HATPase和CheW两个结构域高度保守,cheA可以作为趋化性细菌的生物标志物(biomaker),用于检测环境中的趋化细菌。 4.采用滴定法和游动平板法研究N. pentaromativorans F2、N. pentaromativorans US6-1、Novosphingobium indicum K13、Novosphingobium stygium DSM12445、Novosphingobium sp.C2AC及N. pentaromativorans US6-1质粒突变株CP-US6-1对芳烃化合物和其中间代谢物的趋化性,结果显示新鞘氨醇杆菌具有趋化性的共同特性,但趋化能力强弱因菌株而异。菌株US6-1和其大质粒缺失株CP-US6-1的趋化性比较研究发现失去降解邻苯二酚能力的CP-US6-1菌株也失去了对邻苯二酚的趋化性,US6-1的趋化性可能属于代谢依赖型。 5.根据趋化转运蛋白的基因序列信息设计特异性引物,采用RT-qPCR技术研究这些蛋白在菲和芘诱导下的实时表达,结果发现在菲诱导下趋化转运相关蛋白的表达量均上调;在芘诱导下,趋化蛋白激酶CheA和转运相关蛋白MFS透酶(NSU850)的表达下调,但甲基趋化受体蛋白MCPJ和MCP130表达上调。验证了US6-1的代谢依赖型趋化性,且表明甲基趋化受体蛋白能直接感应PAHs。

关键词：新鞘氨醇杆菌趋化性多环芳烃基因表达

西柏三烯-4,6-二醇降解产香菌培养基条件优化

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烟草科技 2017年第12期50卷 55-60,69页

作者：黄申夏璠钱玉梅魏涛贾春晓毛多斌郑州轻工业学院食品与生物工程学院

为提高新鞘氨醇杆菌(Novosphingobium panipatense YII-3)对西柏三烯-4,6-二醇的降解效率,利用响应面法对发酵培养基的组成进行了优化。结果表明:(1)通过单因素实验确定了最佳碳源及其浓度、氮源及其浓度、初始pH和培养温度。(2)以上述... 详细信息

为提高新鞘氨醇杆菌(Novosphingobium panipatense YII-3)对西柏三烯-4,6-二醇的降解效率,利用响应面法对发酵培养基的组成进行了优化。结果表明:(1)通过单因素实验确定了最佳碳源及其浓度、氮源及其浓度、初始pH和培养温度。(2)以上述4个单因素为考察因子设计了4因素3水平的Box-Behnken响应面分析实验,得到的最佳培养基组成为麦芽糖0.66 g/L、酵母粉0.91 g/L、pH=9和培养温度35℃。(3)该条件下培养的新鞘氨醇杆菌对西柏三烯-4,6-二醇的降解率从最初的64.58%增加到84.71%,与优化前相比提高了20.13百分点。Box-Behnken响应面分析实验用于新鞘氨醇杆菌的培养基优化是可行的,且数学模型的预测值与实验观察值相符。

关键词：西柏三烯-4 6-二醇新鞘氨醇杆菌降解率培养基 Box-Behnken设计响应面

大西洋洋中脊深海多环芳烃降解菌群的优势菌分析

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微生物学报 2009年第7期49卷 902-909页

作者：崔志松邵宗泽国家海洋局第一海洋研究所海洋生态研究中心青岛266061 国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室厦门361005

【目的】为了分析大西洋洋中脊深海海水及表层沉积物中多环芳烃(PAHs)降解菌群中的优势菌。【方法】采用富集培养法和平板涂布法从深海样品中分离可培养细菌及PAHs降解菌。通过16S rRNA基因测序完成系统发育分析。采用变性梯度凝胶电泳(... 详细信息

【目的】为了分析大西洋洋中脊深海海水及表层沉积物中多环芳烃(PAHs)降解菌群中的优势菌。【方法】采用富集培养法和平板涂布法从深海样品中分离可培养细菌及PAHs降解菌。通过16S rRNA基因测序完成系统发育分析。采用变性梯度凝胶电泳(DGGE)及DNA测序分析降解菌群中的优势菌。【结果】总共分离到16株细菌,包括一株PAHs降解菌Novosphingobium sp.4D。系统发育分析发现,可培养细菌中两个最大的类群分别与Alcanivorax dieselolei NO1A(5/16)和Tistrella mobilis TISTR1108T(5/16)亲缘关系最近。DGGE结果表明,在菌群MC2D中菌株4L(以及4M、4N,Alcanivorax dieseloleiNO1A,99.21%)、4D(Novosphingobium pentaromativorans US6-1T,97.07%)和4B(以及4E、4H、4K,Tistrella mobilisTISTR1108T,>99%)是降解菌群中的优势菌。而降解菌群MC3CO中的优势菌是菌株5C(以及5H,Alcanivorax dieselolei NO1A,>99%)、条带5-8代表的未培养菌株(Novosphingobium aromaticivorans DSM12444T,99.41%)、5J(Tistrella mobilisTISTR 1108T,99.52%)和5F(以及5G,Thalassospira lucentensis DSM14000T,<97%)。【结论】本研究发现在大西洋洋中脊深海海水及表层沉积物中Alcanivorax、Novosphingobium、Thalassospira、Tistrella属的细菌是PAHs降解菌群中的优势菌,其中的主要降解菌是Novosphingobium属的细菌。

关键词：多环芳烃生物降解大西洋洋中脊深海新鞘氨醇杆菌