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基于线粒体基因组云南斜睾总科和同盘总科5种复殖吸虫的系统分类研究

基于线粒体基因组云南斜睾总科和同盘总科5种复殖吸虫的系统分类...

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作者：李宗宪云南师范大学

学位级别：硕士

复殖吸虫亚纲Digenea是脊椎动物优势的内寄生虫之一,全球已记载25超科、148科、2700余属,18000余种。复殖吸虫亚纲一些科、属阶元间的分类地位、系统发育关系以及物种间的系统发育地位未得到一致的观点,其中常见且世界性分布的斜睾总科... 详细信息

复殖吸虫亚纲Digenea是脊椎动物优势的内寄生虫之一,全球已记载25超科、148科、2700余属,18000余种。复殖吸虫亚纲一些科、属阶元间的分类地位、系统发育关系以及物种间的系统发育地位未得到一致的观点,其中常见且世界性分布的斜睾总科和同盘总科,科、属的分类地位分歧较大。本研究综合采用形态鉴定、分子系统发育和比较基因组的研究方法,基于cox1、18S r DNA部分序列以及线粒体基因组的结构特征,研究寄生于无尾两栖类和鱼类的斜睾总科和同盘总科复殖吸虫的形态学鉴定以及系统发育关系。研究结果提供了复殖吸虫新的分子鉴定特征,分析了部分复殖吸虫的线粒体基因组特征,并从线粒体基因组的层面重建了斜睾总科和同盘总科部分物种在高阶元的系统发育关系。主要研究结果如下:1、于云南省曲靖市采集蛙类1科2属3种62只,于澜沧江水系洱海流域段采集到鱼类1科1属1种2尾。分类鉴定复殖吸虫4科4属5种,其中已记录3种,未定种1种,新种1种,分别为寄生于无指盘臭蛙Rana grahami的Glypthelmins quieta,寄生于昭觉林蛙***的Glypthelmins sp.,寄生于无指盘臭蛙和滇蛙Nidirana pleuraden的克劳德库姆斯舐血吸虫新种Haematoloechus claudecombesi ***.,寄生于无指盘臭蛙和滇蛙的黑斑蛙重盘吸虫Diplodiscus nigromaculati和寄生于黄颡鱼Pseudobagrus fulvidraco的印度东肌吸虫Orientocreadium indicum。2、本研究获得的5种复殖吸虫的线粒体基因组通过注释发现:（1）除印度东肌吸虫缺失trn E基因,其余4种复殖吸虫都具有36个基因,即12个蛋白编码基因、22个t RNA基因和2个r RNA基因;（2）Glypthelmins sp.、克劳德库姆斯舐血吸虫和黑斑蛙重盘吸虫的trn S1基因缺失了DHU臂以及trn T基因缺失了TΨC臂,而印度东肌吸虫为trn S2基因缺失DHU臂,trn T基因缺失了TΨC臂;（3）Glypthelmins quieta仅有trn S1基因缺失了DHU臂;（4）在克劳德库姆斯舐血吸虫和黑斑蛙重盘吸虫的非编码区中检测到似微卫星DNA序列。比较基因组学研究结果表明:（1）斜睾总科和同盘总科复殖吸虫均具有较高的AT偏好性;（2）斜睾总科和同盘总科物种线粒体基因组AT偏倚均为正值,GC偏倚均为负值,与高等脊椎动物相反;（3）cox1基因在斜睾总科和同盘总科复殖吸虫中都较为保守;（4）在同盘总科中所有复殖吸虫的trn E基因和trn G基因均发生互换。3、基于cox1和18S r DNA部分序列及线粒体基因组,系统发育重建的结果表明:（1）基于刻体属11种吸虫的18S r DNA的系统发育关系,不支持将刻体属纳入舐血科。基于线粒体的系统发育研究认为刻体属应隶于刻体科;（2）以斜睾科的Plagiorchis maculosus和刻体科的Glypthelmins hyloreus作为外群,基于cox1部分序列,美洲的7种舐血属吸虫单独聚为系统树的最基部一支,再与亚洲舐血属吸虫汇聚,后与非洲舐血属吸虫聚为一支,与蛙总科早期从非洲起源和扩散一致。我们推测非洲蛙类寄生的舐血属Haematoloechus可能在第三纪早期进入亚洲大陆并演化为亚洲舐血属;（3）以Echinostoma chankensis为外群,基于cox1部分序列,东肌科物种单独为一支,支持东肌科独立;（4）基于18S r DNA的系统发育树,重盘属物种在不同地理区域有较大的遗传距离,相同的区域内遗传距离较小,认为此类群具有较强的地理亲缘性。基于线粒体基因组的系统发育树,重盘属复殖吸虫未与同盘科复殖吸虫聚类,认为重盘属应隶于重盘科。

关键词：复殖吸虫斜睾总科同盘总科 cox1 18S rDNA 线粒体基因组系统分类

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云南黄颡鱼寄生东肌属(Orientocreadium)复殖吸虫一新种形态学及分子鉴定

云南黄颡鱼寄生东肌属(Orientocreadium)复殖吸虫一新种形态学及...

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第八届中国西部动物学学术研讨会

作者：李寄仟李俊徐伟江范丽仙云南师范大学生命科学学院生物能源持续开发利用教育部工程研究中心云南农业大学农学与生物技术学院

本研究于云南西双版纳景洪澜沧江水系南腊河支流段(N 21°37’26’’,E 101°35’13’’,海拔:744 m)的黄颡鱼Pelteobagrus fulvidraco消化道末检获复殖吸虫东肌科(Orientocreadiidae Skrjabin et Koval,1960)东肌属(Orientocreadium Tubangui,1931)1新种:黄颡东肌吸虫Orientocreadium fulvidraconis ***.。该新种自然感染率为16.7%(1/6),感染强度为1～45枚虫体。其与寄生于Clarius batrachus(印度)消化道内的*** Nigam,2015和寄生于Pseudobagrus surantiacus(日本)消化道内的*** Yamaguti,1934相似,但*** ***.虫体伸长呈柱状,体表无体棘,口吸盘小于腹吸盘,前咽较长,阴茎光滑无棘,子宫末端内部光滑无棘,后体两侧的卵黄腺自卵巢水平延伸至后睾丸后部水平,卵黄管不呈晶格状。上述特征明显区别于近似种***和***。基于28S rDNA部分序列,该种吸虫与Genbank中目前仅有的3种东肌吸虫属复殖吸虫的同源性序列比较结果显示,序列相似度在96.58%～99.53%之间,其中与***的相似度最高(99.53%)。基于28S r DNA部分序列双参数模型计算的遗传距离(Kimura-two-parameter)范围为0.002～0.029,与***的遗传距离最近(0.002)。序列采用邻接法(NJ)、最大似然法(ML)和最大简约法(MP)构建的系统发育关系表明,东肌科为斜睾总科(Plagiorchioidea Lühe,1901)中一个独立的分类单元并支持与Leptophallidae Dayal,1938并列为姊妹群聚为一大支,*** ***.与***合为姐妹群聚为一小支。综合上述形态学和基于28S r DNA部分序列的系统发育研究分析,认为该虫为科学上一新种,以宿主名命名为黄颡东肌吸虫Orientocreadium fulvidraconis ***.。

关键词：东肌属东肌科黄颡鱼东肌吸虫新种 Leptophallidae 斜睾总科系统发育 28S rDNA

来源： cnki会议评论

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