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从瘟疫病名研究进展探讨疫病文献筛选思路

浙江中医药大学学报 2022年第9期46卷 1008-1014页

作者：陈天玺郑洪张星浙江中医药大学基础医学院杭州310053

[目的]通过梳理瘟疫病名的研究进展,获取古医籍中疫病文献的筛选思路。[方法]首先明确瘟疫的定义,阐述其主要分类方式,对温病、伤寒等相关名词进行考辨。而后将疫病文献分为笼统的瘟疫和具体的病种2大类,列举今人对相关术语的研究进展。... 详细信息

[目的]通过梳理瘟疫病名的研究进展,获取古医籍中疫病文献的筛选思路。[方法]首先明确瘟疫的定义,阐述其主要分类方式,对温病、伤寒等相关名词进行考辨。而后将疫病文献分为笼统的瘟疫和具体的病种2大类,列举今人对相关术语的研究进展。[结果]瘟疫指具有传染或流行特征而且伤亡较严重的一类疾病。按寒热性质分为温疫、寒疫和杂疫,温疫又可分为温热疫、湿热疫和暑热疫。瘟疫和温病的概念是交叉的,其交集部分为温疫。瘟疫本属广义伤寒,后逐渐脱离伤寒独立,其与传染病的关系仍存在争议。从文献中梳理出概述性瘟疫名称3种:(1)“疒”部的瘟疫全称;(2)以时令与流行命名的术语;(3)其他。制作“传染病中西医病名对照表”,涵盖传染病6类53种,包括病毒性传染病、立克次体病、细菌性传染病、螺旋体病、原虫病和蠕虫病。[结论]本研究厘清了瘟疫的概念,找到了打开疫病文献宝库的钥匙,在相关研究中具有“破局”的效果。

关键词：瘟疫疫病病名文献筛选传染病中西医病名对照

基于网络药理学和文献筛选分析宣白承气汤治疗重型COVID-19的作用机制

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世界科学技术-中医药现代化 2020年第10期22卷 3472-3484页

作者：王世豪李彩霞王至婉河南中医药大学第一临床医学院郑州450000 河南省省立医院郑州450000 河南中医药大学第一附属医院郑州450000

目的基于网络药理学、文献筛选及分子对接探讨宣白承气汤治疗重型COVID-19的主要活性成分、作用靶点和相关通路,明确其潜在作用机制。方法利用TCMSP、PubChem和Swiss Target Prediction数据库筛选宣白承气汤的活性成分和作用靶点,从Gene... 详细信息

目的基于网络药理学、文献筛选及分子对接探讨宣白承气汤治疗重型COVID-19的主要活性成分、作用靶点和相关通路,明确其潜在作用机制。方法利用TCMSP、PubChem和Swiss Target Prediction数据库筛选宣白承气汤的活性成分和作用靶点,从GeneCards数据库获取与重型COVID-19发生、发展相关的基因,将两者取交集得到药物治疗的潜在靶标,并利用已发表的宣白承气汤治疗重症肺炎的文献,找出有效检测指标,与各靶标取交集后,找出最有可能起作用的关键靶标。运用Cytoscape软件构建活性成分靶标作用网络,并STRING数据库构建蛋白互做网络,并筛选出核心靶标;运用R软件对作用靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析。使用SYBYL软件将主要的活性成分与与SARS-CoV-23CL水解酶和血管紧张素转化酶II(ACE2)进行分子对接。结果宣白承气汤的亚油酸乙酯、亚麻酸乙酯等46个活性成分可能通过PI3K/Akt通路、HIF1通路、Ras信号通路等140条通路作用于以IL6(白介素6)为核心的108个靶点发挥其治疗作用。分子对接结果显示:杏仁中的丁二酸二异辛酯、大黄中的β-胡萝卜素氧化物和瓜蒌中的亚油酸乙酯与与SARS-CoV-23CL水解酶、ACE3等具有较好的结合性。结论网络药理学、文献筛选及分子对接均表明宣白承气汤可用于重型COVID-19的治疗。宣白承气汤所含的活性成分可能通过抗炎、抗病毒、调节免疫、抗凝等作用,对重型COVID-19引发的炎症、免疫损伤、凝血异常等具有潜在的预防与治疗作用。

关键词：宣白承气汤重型COVID-19 网络药理学文献筛选分子对接潜在作用机制

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基于PubMed筛选高质量文献的两种方法

实用医药杂志 2018年第11期35卷 1055-1057页

作者：赵小璐陈康刘强山东省千佛山医院山东济南250014 山东省军区济南第八干休所门诊部山东济南250002

PubMed是美国国家图书馆（NLM）下属的国家生物技术信息中心（NCBI）研发的文摘数据库,少数可查看全文.作为生物医学领域影响力最大的数据库之一,PubMed以其数据更新快,可免费使用,查全率高等优势受到医学科研工作者的青睐.

关键词： PubMed F1000 GoPubMed 文献筛选

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如何提高医学综述的写作水平

中华神经科杂志 2022年第12期55卷 1335-1340页

作者：李崧张军韩秋琴乐卫东大连医科大学附属第一医院神经疾病研究所大连116021 上海健康医学院附属周浦医院神经科上海201318

文献综述是医学杂志的重要组成部分,给广大读者提供了医学研究的最新进展和前沿思路,深得医务工作者的喜爱。优秀的综述并非简单的文献罗列,作者不仅需要对文献中的重要发现和亮点进行总结,更要对当前的研究状况做出公正的评价,深入剖... 详细信息

文献综述是医学杂志的重要组成部分,给广大读者提供了医学研究的最新进展和前沿思路,深得医务工作者的喜爱。优秀的综述并非简单的文献罗列,作者不仅需要对文献中的重要发现和亮点进行总结,更要对当前的研究状况做出公正的评价,深入剖析不足之处并提出自己独到的观点,目的是让读者全面和准确地了解这一领域的研究进展,并启发读者开拓思路,把握未来方向,开展创新研究。文中将重点针对医学文献综述撰写过程中的选题、文献搜集和筛选、资料分析和评价等环节,重点诠释如何提高医学综述的写作水平。

关键词：综述写作综述选题文献筛选综述思维要素

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自然语言处理在系统评价中的应用

中国循证医学杂志 2021年第6期21卷 715-720页

作者：秦璇刘佳利王雨宁邓可马玉邹康李玲孙鑫四川大学华西医院中国循证医学中心成都610041

系统评价可为临床实践和医疗卫生决策提供重要证据支持。但在系统评价的制作过程中,文献筛选和数据提取是非常耗时的工作步骤。自然语言处理(NLP),作为计算机科学和人工智能的研究方向之一,可加速系统评价中的文献筛选和数据提取过程。... 详细信息

系统评价可为临床实践和医疗卫生决策提供重要证据支持。但在系统评价的制作过程中,文献筛选和数据提取是非常耗时的工作步骤。自然语言处理(NLP),作为计算机科学和人工智能的研究方向之一,可加速系统评价中的文献筛选和数据提取过程。本文回顾了系统评价对快速文献筛选和数据提取的需求;介绍了NLP的发展历程和机器学习类型,系统整理了现有可用于系统评价初筛、全文筛选和数据提取过程的NLP工具;讨论了现有NLP在系统评价领域应用时存在的问题,并对其未来发展提出了展望。

关键词：自然语言处理机器学习系统评价文献筛选数据提取

经典深度学习算法对中文随机对照试验智能判别应用

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中国循证医学杂志 2019年第11期19卷 1262-1267页

作者：毛渤淳陈圣恺谢雨姚攀李春洁四川大学口腔疾病研究国家重点实验室国家口腔疾病临床医学研究中心成都610041 四川大学计算机学院成都610065 四川大学华西口腔医院口腔颌面外科华西口腔医学院循证口腔医学教研室成都610041

目的评价采用深度学习算法卷积神经网络(CNN)智能识别中文医学文献中随机对照试验(RCT)的效果。方法计算机检索CNKI数据库,限定年限为2014年全年、主题为"口腔"的医学文献并导出包含标题、摘要信息的题录,采用双人独立标注后核对、讨论... 详细信息

目的评价采用深度学习算法卷积神经网络(CNN)智能识别中文医学文献中随机对照试验(RCT)的效果。方法计算机检索CNKI数据库,限定年限为2014年全年、主题为"口腔"的医学文献并导出包含标题、摘要信息的题录,采用双人独立标注后核对、讨论的方式进行RCT人工筛选,并将最终结果用于CNN算法模型训练。完成该算法模型训练后,组织前瞻性对照试验,检索2018年1月至3月CNKI上发表的所有口腔医学文献,以双人核对后最终结果作为金标准,将CNN算法结果与单人初次标注的结果(人工水平)进行对比,计算两组的灵敏度(SEN)与特异度(SPE)。并调整算法的划分阈值,通过绘制受试者操作特征(ROC)曲线确定最佳阈值。结果纳入1 246条RCT和4 754条非RCT用于CNN训练与测试。最终对照试验纳入RCT 249条、非RCT 949条,得到人工筛选的SEN=98.01%,SPE=98.82%。该算法模型对RCT筛选的SEN随阈值升高而减小,SPE随阈值升高而增大,进行27次阈值变动后,所得ROC曲线下面积为0.9977。得到该算法模型的最佳准确度阈值(阈值=0.4,SEN=98.39%,SPE=98.84%)与高SEN阈值(阈值=0.06,SEN=99.60%,SPE=94.10%)。结论经本研究建立的中文RCT数据库训练后,CNN算法对中文RCT的筛选效果较为出色,前瞻性对照试验证明其具有足以替代人工水平的RCT筛选效果。

关键词：深度学习随机对照试验文献筛选循证医学

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孔子和《五经》的编纂初探

出版发行研究 1994年第1期 46-48,F003页

作者：申非农业出版社

孔子和《五经》的编纂初探申非一、见于《五经》中的编辑工作《五经》是否经过孔子删修，自唐宋以来说法纷坛，有完全肯定的，有部分肯定的，也有完全否定的。据清末民初经学家刘师培在《经学教科书》中说：孔子生于周王朝衰微之世，周... 详细信息

孔子和《五经》的编纂初探申非一、见于《五经》中的编辑工作《五经》是否经过孔子删修，自唐宋以来说法纷坛，有完全肯定的，有部分肯定的，也有完全否定的。据清末民初经学家刘师培在《经学教科书》中说：孔子生于周王朝衰微之世，周游列国，终未见用，不得展其抱负以匡...

关键词：孔子《五经》文献征集文献筛选编辑工作修订

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高校图书馆资源建设的问题与对策

图书情报工作 2005年第3期49卷 98-100页

作者：王晓波姚乐野四川大学图书馆成都610064 四川大学公共管理学院成都610064

针对当前高校图书馆资源建设中存在的经费有限、纸本文献资源购置随意和盲目、电子资源购置缺乏科学系统的评估和理性分析等种种弊端,在调研和实践的基础上,从文献筛选的原则和方法、加强校内文献资源的整合和建设、加强地区内和地区间... 详细信息

针对当前高校图书馆资源建设中存在的经费有限、纸本文献资源购置随意和盲目、电子资源购置缺乏科学系统的评估和理性分析等种种弊端,在调研和实践的基础上,从文献筛选的原则和方法、加强校内文献资源的整合和建设、加强地区内和地区间以及与国外文化教育机构文献资源的共建共享与协作3个方面,进行可行性的对策研究。

关键词：高校图书馆资源建设文献筛选

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浅谈系统评价的文献偏倚问题

循证医学 2001年第1期1卷 55-57页

作者：屈会起林珊邱明才天津医科大学总医院内科天津300052

文献偏倚是指由于无法全面地获得相关的临床研究资料,从而影响系统评价结果的真实性。常见的文献偏倚主要包括:1)文献发表偏倚,指某些研究始终不能被发表或被延迟发表;2)文献查寻偏倚,指系统评价过程中,没有全面地获得已发表的相关文献... 详细信息

文献偏倚是指由于无法全面地获得相关的临床研究资料,从而影响系统评价结果的真实性。常见的文献偏倚主要包括:1)文献发表偏倚,指某些研究始终不能被发表或被延迟发表;2)文献查寻偏倚,指系统评价过程中,没有全面地获得已发表的相关文献;3)文献筛选偏倚,是由于文献筛选不当,错误地剔除了某些有用的文献。文献偏倚评估的常用方法是以各研究的样本量为横坐标,作用大小为纵坐标,绘制漏斗形图。

关键词：系统评价文献偏倚临床研究发表偏倚文献筛选系统评价