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极端油藏微生物多样性分析

环境科学与技术 2019年第2期42卷 32-37页

作者：徐海霞孟祥娟袁泽波王鹏陈德飞陈箐程昉赵静中国石油天然气股份有限公司塔里木油田分公司油气工程研究院新疆库尔勒841000 大连知微生物科技有限公司辽宁大连116023 大连理工大学精细化工国家重点实验室辽宁大连116024

文章通过对哈得油田超高温、超高盐油藏油水样品中微生物种类多样性和优势菌群的研究,考察极端油藏内源微生物的分布特征,探讨生物采油技术在超高温、超高盐油藏条件下的应用可行性。采集哈得油田HD1-1H、HD1-9H、HD1-15H、HD1-21H和HD1... 详细信息

文章通过对哈得油田超高温、超高盐油藏油水样品中微生物种类多样性和优势菌群的研究,考察极端油藏内源微生物的分布特征,探讨生物采油技术在超高温、超高盐油藏条件下的应用可行性。采集哈得油田HD1-1H、HD1-9H、HD1-15H、HD1-21H和HD1-23H 5组水平井油水样,利用第二代高通量测序技术测定油水样品内微生物的16S rDNA V3-V4变异区序列,应用QIIME软件整理和统计样本序列数目和操作分类单元(OTUs)数量,分析物种的丰度、分布和多样性,以及不同井微生物物种多样性丰度的差异。哈得油水样中内源微生物资源丰富,5组油水样属水平的微生物类群数分别为196、199、184、212和220,微生物在分类种类和所占比例上具有显著差异。优势菌群中有多种明确的采油功能微生物,如芽孢杆菌属、假单胞菌属、乳球菌属等。该研究明确了哈德油田具有较丰富的微生物采油物质基础,丰富了对超高温、超高盐极端油藏微生物多样性的认识,拓展了生物采油技术在极端油藏中的应用范围。

关键词：哈得油田极端油藏第二代测序技术微生物多样性分析生物采油技术

水果植物酵素微生物多样性分析及抗氧化能力测定

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粮食与油脂 2022年第6期35卷 137-142页

作者：张亚娟李市场张自平陈妍杜莹瑞龚明贵河南科技大学食品与生物工程学院河南洛阳471023

利用Illumina Miseq高通量测序技术对自然发酵的水果植物酵素原液进行宏基因组测序,采用比色法测定酵素对自由基的清除能力。在测序过程中细菌采用16SrDNA测序,真菌采用ITS1测序。结果表明:细菌的优势菌属为乳杆菌属(Lactobacillus)和... 详细信息

利用Illumina Miseq高通量测序技术对自然发酵的水果植物酵素原液进行宏基因组测序,采用比色法测定酵素对自由基的清除能力。在测序过程中细菌采用16SrDNA测序,真菌采用ITS1测序。结果表明:细菌的优势菌属为乳杆菌属(Lactobacillus)和梭菌属(Clostridium),真菌的优势菌属为酵母属(Saccharomyces)。水果植物酵素对DPPH自由基、ABTS自由基、羟基自由基和超氧阴离子自由基的IC_(50)值分别为1.65、1.08、1.24和55.90 mg/mL。证明经过自然发酵的水果植物酵素在清除体内自由基方面有较大潜力,为其在抗氧化功能性食品的开发应用提供了基础。

关键词：水果植物酵素微生物多样性分析 DPPH自由基 ABTS自由基

台西南海盆深海沉积物的微生物多样性分析和元基因组学研究

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台西南海盆深海沉积物的微生物多样性分析和元基因组学研究

作者：黄云鹏福建师范大学

学位级别：硕士

海洋微生物是潜在的新物种和天然产物的重要来源。为了研究台西南海盆北部陆坡区的微生物多样性,构建了16S rDNA基因文库并进行了PCR-RFLP的分析,然后对160个细菌克隆和50个古菌克隆进行了测序,对测序的结果进行了相应的分析,所分析的... 详细信息

海洋微生物是潜在的新物种和天然产物的重要来源。为了研究台西南海盆北部陆坡区的微生物多样性,构建了16S rDNA基因文库并进行了PCR-RFLP的分析,然后对160个细菌克隆和50个古菌克隆进行了测序,对测序的结果进行了相应的分析,所分析的细菌群体总共有83个OTUs,在群体结构上,Proteobacteria和Planctomycetes是细菌群体中的优势类群,其他的细菌类群分别是Acidobacteria,Actinobacteria,Chloroflexi,Chlamydiae和Firmicutes。利用测序的细菌序列构建进化树上,发现其中有三个潜在的新的细菌类群。在所研究的古菌群体中,所有的克隆都来源于Crenarchaeota门,其中属于Marine GroupⅠCrenarchaeota的序列最多。为研究和挖掘群体中的基因信息和基因资源,利用总沉积物DNA构建了元基因组fosmid文库,从文库中选取了一些克隆进行了RFLP预分析,以观察文库克隆的多样性,随机选取了大约200个fosmid克隆进行了末端测序。所构建的fosmid文库大约含有1,000,000个克隆,文库克隆的平均插入片段为38kb,末端测序的结果显示文库中包含了丰富且多样的基因信息,如碳水化合物代谢、转运因子等相关的基因信息,这些基因信息为研究微生物群体和环境之间的关系提高了重要的线索。利用功能为基础的筛选方法,从元基因组文库中筛选获得6个酯裂解基因,其中5个基因是新的酯酶基因,并有一个新的酯酶家族,对酯酶Lip1和Lip18进行了克隆和原核表达,两者都表现出了酯裂解活性,编码的蛋白经SDS-PAGE检测约为32kDa。本实验研究了台西南盆地微生物群体的多样性,揭示了该微生物群体的基因和遗传信息,也揭示了微生物群体基因信息与环境之间可能的联系,从该群体中挖掘得到了有用的活性基因资源,具有重要的生态学和环境微生物学意义。

关键词：深海沉积物微生物多样性分析海洋元基因组酯裂解基因

沼液处理体系微生物多样性分析及其沼液培养链带藻PW1

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沼液处理体系微生物多样性分析及其沼液培养链带藻PW1

作者：邵珊珊福建师范大学

学位级别：硕士

近年来,中国养殖产业的迅猛发展,畜禽养殖场废水未经妥善处理而随意排放给生态环境带来严重威胁。养殖废水经厌氧发酵后能得到清洁能源沼气,但是发酵后的沼液中仍含有大量的氮、磷等无机盐以及有机物。沼液处理体系中的微生物群落组成... 详细信息

近年来,中国养殖产业的迅猛发展,畜禽养殖场废水未经妥善处理而随意排放给生态环境带来严重威胁。养殖废水经厌氧发酵后能得到清洁能源沼气,但是发酵后的沼液中仍含有大量的氮、磷等无机盐以及有机物。沼液处理体系中的微生物群落组成及动态变化对于污水处理系统的稳定运行具有重要意义。通常生化处理工程研究是从宏观水平上进行分析设计,而沼液生化处理反应池从生态学的观点来看,可将其视为一个生态系统。通过一些微生物分子生态学的研究方法从分子水平上进行深入研究具有重要理论和应用价值,对了解污染物的生化反应本质及污染物降解过程中各种有用微生物分析具有重要参考意义。因此,本论文对夏季和冬季等不同季节的沼液处理体系的五个生化反应池进行取样,通过微生物多样性组成谱系测序分析手段,研究了不同季节环境条件下各生化处理池体系中优势菌群的组成。结果发现:通过对样本建立16S rDNA和18S rDNA基因文库,检测到各个生化处理反应池的优势菌群都有:变形菌门(Proteobacteria)、蓝细菌门(Cyanobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidete)、绿弯菌门(Chloroflexi)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)、绿藻门(Chlorophyta),其次在冬季取样时,发现隐真菌门(Cryptomycota)在好氧池2(hy2)和氧化塘(yt)体系中逐渐成为主要微生物菌群。以上研究表明:废水处理体系的微生物种类很丰富,在一定反应阶段起主要作用的微生物类群呈动态变化。应用微藻对废水及富营养化水体中氮磷等营养物质的去除作用己有大量研究,且研究内容及深度都比较成熟。但沼液中污染物浓度极高,大部分藻类无法适应这一恶劣体系,本论文从养殖污水中分离纯化得到一株链带藻,并将其命名为链带藻PW1(Desmodesmus ***1),具有较强的处理沼液污染能力。链带藻PW1是一种体型较大的沉水绿藻,细胞群体聚集后肉眼可见,繁殖能力强。链带藻PW1在培养基中生长时会自然沉降于培养液底部,通过将沉降后的高密度藻细胞和含少量培养液的藻浆简单浓缩就能较容易把藻体从净化后水体中分离出来。这样大大减少了微藻处理完沼液后从水体中分离出来的操作步骤。本文研究了链带藻PW1在实验室摇瓶培养条件下,净化沼液的效果。进一步对比分析用BG-11培养基和沼液培养基收获藻体的生物活性物质,以评价链带藻PW1在沼液处理中的资源化利用价值。为了探究链带藻PW1是否具有用于大规模沼液处理的可能性,还将其接种于板式光生物反应器中,研究链带藻PW1去除沼液中污染物的效果。本论文从以下几个方面进行研究,获得主要结果如下:(一)为了研究不同季节条件下,沼液处理体系中五个生物反应池中微生物群落结构及组成的动态变化,分别对夏、冬两个季节的沼液处理池取样,进行微生物多样性测序分析。研究结果表明:(1)在冷暖两个季节条件下,五个沼液处理池的微生物群落及物种丰度存在明显差异。(2)冷暖两个季节条件下,五个沼液处理池在门分类水平上的菌群优势门类差异较小,而在属分类水平上的差异较大。(3)沼液处理池的运行效果与微生物多样性的分布情况存在一定联系。(二)在实验室摇瓶培养条件下,对比研究了链带藻PW1在沼液浓度为25%,50%,75%,100%时对沼液中污染物质(TN,TP,COD,NH-N)的去除效果和藻细胞的生长状况。实验结果表明:(1)链带藻PW1能够很好地适应以上四种沼液环境并且迅速生长。(2)链带藻PW1在四种沼液浓度中生长对TN,TP,NH-N去除效果都很显著。在培养8天后,在100%和25%沼液中,TN和NH-N最高去除率分别为64.8%和78.4%;100%沼液中总磷的去除率最高可达92.8%,表明链带藻PW1对总磷具有很理想的净化作用。(3)链带藻PW1对沼液中COD的降解效率最大仅为13.8%,说明链带藻PW1对猪沼液中的有机化合物的去除作用甚微,需要配合其他异养化微生物。进一步对在正常培养基(BG-11)和沼液中生长的链带藻PW1收获的藻粉进行营养价值分析,对两种培养环境中藻粉的蛋白质,多糖,脂质,叶绿素等指标进行测定,评价链带藻PW1资源化应用价值。结果表明:链带藻PW1在沼液中生长更易于积累油脂类物质;正常培养基下生长的链带藻PW1更易于积累蛋白质和叶绿素等物质;在两种培养基生长的PW1,多糖含量无显著差别。(三)为了研究分离的链带藻PW1(Desmodesmus ***1)是否具有应用在沼液大规模处理的可能性,用板式光生物反应器对链带藻PW1研究其对沼液污染物的净化效果。结果表明:(1)链带藻PW1在板式光生物反应器中能正常生长,最大生物量达到了1.50±0.02 g/L。(2)14天后,链带藻PW1对沼液中的总氮去除率为73.7%,总磷去除率为60

关键词：沼液链带藻微生物多样性分析氨氮磷

城市污水处理厂生物除臭滴滤池微生物多样性分析和高效脱硫菌株筛选

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城市污水处理厂生物除臭滴滤池微生物多样性分析和高效脱硫菌株筛...

作者：李倩华东师范大学

学位级别：硕士

近年来,随着城市规模的不断扩大,城市污水处理厂越来越被居民生活区所包围,污水处理过程中产生的恶臭气体,不仅会影响污水处理厂员工的身体健康及工作环境,还会给周围居民的正常生活带来严重的危害。因此,污水处理厂配置适当的除臭工艺... 详细信息

近年来,随着城市规模的不断扩大,城市污水处理厂越来越被居民生活区所包围,污水处理过程中产生的恶臭气体,不仅会影响污水处理厂员工的身体健康及工作环境,还会给周围居民的正常生活带来严重的危害。因此,污水处理厂配置适当的除臭工艺系统势在必行。生物法治理污染空气始于20世纪50年代,最初是用土壤来治理生活污水厂散发的恶臭气体。由于生物法治理废气具有经济、高效和环保的优点,目前已经得到广泛应用,并开展了大量有关工艺、填料及影响处理效率的各种元素(如温度、pH、营养物质)等方面的应用研究。处理系统中微生物的生长受到各种环境因素的影响,只有深入了解微生物的种群结构以及微生物与环境因素的相互作用关系,才能通过调整运行参数和改进工艺,控制微生物的适度生长,并保持相对的稳定,从而提高生物法治理恶臭气体的效率和性能。本文采用常规微生物计数、克隆文库、分子生物学方法对上海市闵行水质净化厂生物除臭滴滤池中填料微生物多样性进行了研究,同时筛选鉴定其中的高效脱硫菌。得到以下结论：(1)异养细菌在填料生物膜中占着绝对的数量优势,而亚硝化细菌、硝化细菌和硫化细菌的MPN计数显示,硫化细菌的含量最高,硝化细菌次之,亚硝化细菌最少。(2)2#与3#生物除臭滴滤池装置填料生物膜中的细菌多样性差异较大,2#中主要包括Proteobacteria和Bacteroidetes两大门类的细菌,而3#中主要是Gammaproteobacteria纲细菌,菌种相对单一。(3)从1#、2#、3#生物除臭滴滤池装置的填料生物膜中分离纯化得到19株脱硫菌,通过比较各脱硫菌生成硫酸盐速率的大小,可以得出具有高效脱硫能力的菌株依次为J3、J10、J13、J7、J8、J9、J2、J1、J11、J17、J14,这些脱硫菌在利用硫代硫酸钠进行脱硫反应的过程中,硫酸盐的生成速率均不低于0.0085g/(L·h).(4)通过菌落形态观察和分子生物学技术手段,对分离出的高效脱硫菌进行鉴定。可以得知筛选出的高效脱硫菌主要分为4个属：Thiobacillus属、Halothiobacillus属、Pseudomonas属、Dyella属。本次实验分离筛选出的11株高效脱硫菌中,分别有3株硫杆菌、2株盐硫杆状菌、4株假单胞菌、2株黄色单胞菌。(5)通过摇瓶实验,研究筛选出的脱硫效率最高的菌株J3(Halothiobacillus neapolitanus)的生长曲线,以及最适培养条件。可以得出,此菌株最适生长温度范围为25-30℃,最适生长pH范围为6.5-7.0。

关键词：生物除臭滴滤池微生物计数克隆文库微生物多样性分析高效脱硫菌

不同养殖模式下肉鸡舍内气溶胶微生物多样性分析

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不同养殖模式下肉鸡舍内气溶胶微生物多样性分析

第九届全国畜牧兽医青年科技工作者学术研讨会

作者：马腾韩少杰 Imran Khan 张宏福中国农业科学院北京畜牧兽医研究所

引言/目的肉鸡集约化养殖过程中产生大量微生物气溶胶,不仅会导致疾病发生,影响肉鸡的生产性能,还威胁从业人员的健康。近年来伴随着养殖技术改进,我国白羽肉鸡主要养殖模式由传统平养快速向能更好环境控制的笼养模式过渡。本研究以笼... 详细信息

引言/目的肉鸡集约化养殖过程中产生大量微生物气溶胶,不仅会导致疾病发生,影响肉鸡的生产性能,还威胁从业人员的健康。近年来伴随着养殖技术改进,我国白羽肉鸡主要养殖模式由传统平养快速向能更好环境控制的笼养模式过渡。本研究以笼养肉鸡和平养肉鸡舍内微生物气溶胶为研究对象,采用高通量测序法分析其中细菌丰度、组成,评估养殖模式对空气质量的影响,为提高畜禽舍空气环境质量,构建绿色、健康的养殖环境控制技术提供数据基础。

关键词：养殖模式相对丰度微生物气溶胶气溶胶颗粒物白羽肉鸡微生物多样性分析肉鸡舍

来源： cnki会议评论

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DNA提取对微生物多样性测序分析的影响

中国生物工程杂志 2017年第11期37卷 12-18页

作者：安云鹤程小艳田彦捷马凯高丽娟武会娟北京市理化分析测试中心北京100089 北京市基因测序与工程技术研究中心北京100094

运用高通量测序技术分析复杂样品中微生物种群的变化情况,已经成为目前微生物研究领域的热点问题之一。而微生物的样品准备,如DNA提取和16S可变区的扩增等,对于测序完成后的数据分析以及微生物原始群落组成的影响是至关重要的。采用国... 详细信息

运用高通量测序技术分析复杂样品中微生物种群的变化情况,已经成为目前微生物研究领域的热点问题之一。而微生物的样品准备,如DNA提取和16S可变区的扩增等,对于测序完成后的数据分析以及微生物原始群落组成的影响是至关重要的。采用国产试剂盒(天根土壤微生物基因组提取试剂盒)和进口试剂盒(MOBIO土壤微生物基因组提取试剂盒)分别对土壤样品和羊瘤胃食糜样品进行DNA提取。然后选取总DNA起始量为25ng,对16S V3可变区进行PCR扩增和文库构建,最后通过数据分析比较不同试剂盒提取的DNA对微生物多样性变化的影响,包括OTU数目、稀释曲线、微生物数量及物种种类等。研究发现,在相同DNA模板量和PCR条件下,进口试剂盒提取的DNA能够获得更多的微生物种类。

关键词： DNA提取高通量测序微生物多样性分析

黄花菜茎叶与青贮玉米混合比例对青贮质量和微生物多样性的影响

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草地学报 2024年

作者：郑敏娜康佳惠邹璨阳侯向阳梁秀芝韩志顺陈燕妮山西农业大学高寒区作物研究所山西农业大学农学院农业农村部饲草高效生产模式创新重点实验室

为探索黄花菜（Hemerocallis citrina Baroni）茎叶饲料资源化利用的新途径，本试验将黄花菜茎叶与青贮玉米按质量比100：0(T1)，80：20(T2)，60：40(T3)，40：60(T4)，20：80(T5)，0：100(T6)进行混合青贮，发酵70d后，对各样品进行感... 详细信息

为探索黄花菜（Hemerocallis citrina Baroni）茎叶饲料资源化利用的新途径，本试验将黄花菜茎叶与青贮玉米按质量比100：0(T1)，80：20(T2)，60：40(T3)，40：60(T4)，20：80(T5)，0：100(T6)进行混合青贮，发酵70d后，对各样品进行感官鉴定、品质评价和微生物多样性分析。结果表明：与黄花菜茎叶单贮相比，黄花菜茎叶与青贮玉米混合青贮有利于改善青贮饲料的气味和结构，并且基于对16个青贮指标的灰色关联度分析发现，黄花菜茎叶与青贮玉米混合青贮品质优于黄花菜茎叶单贮。在细菌属水平上，共有1192个类群被分类，其中，植物乳杆菌属（Lactiplantibacillus）、泛菌属（Pantoea）、未分类的肠杆菌属（unclassified＿Enterobacteriacea）是所有混合青贮模式中的优势属，结合冗余分析结果发现，氨态氮含量对各样品微生物群落组成影响更显著。综上考虑，从黄花菜茎叶利用最大化角度出发，以T4比例青贮为佳。

关键词：黄花菜茎叶青贮玉米混合青贮青贮质量评价微生物多样性分析

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不同家蚕品种肠道微生物多样性初步分析

不同家蚕品种肠道微生物多样性初步分析