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妊娠期糖尿病对新生小鼠脑组织形态结构及miRNA表达谱的影响

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中国儿童保健杂志 2024年第2期32卷 154-158,180页

作者：黄婉仪张又祥欧巧群刘元春郭家雨广州市第一人民医院儿科广东广州510180

目的研究妊娠期糖尿病(GDM)对新生小鼠脑组织形态结构及微小核糖核苷酸(miRNAs)表达谱的影响,为GDM子代神经发育异常预防和治疗提供新的研究靶点。方法将妊娠鼠分为模型组和对照组各10只,模型组小鼠通过注射链脲佐菌素建立GDM模型,测... 详细信息

目的研究妊娠期糖尿病(GDM)对新生小鼠脑组织形态结构及微小核糖核苷酸(miRNAs)表达谱的影响,为GDM子代神经发育异常预防和治疗提供新的研究靶点。方法将妊娠鼠分为模型组和对照组各10只,模型组小鼠通过注射链脲佐菌素建立GDM模型,测量不同时间的空腹血糖(FPG)和随机血糖(GLU)。造模成功小鼠随机分为模型A组和模型C组,对照组小鼠分为对照B组和对照D组,每组各5只。其中A、B组新生小鼠用于进行海马组织基因芯片检测及大脑形态结构观察;C、D组新生小鼠用于qRT-PCR检测海马组织的表达差异,以验证基因芯片筛选所得miRANs差异表达基因。新生小鼠脱颈处死,剥离脑组织观察整体形态结构,HE显色显微镜下观察海马组织结构变化。基因芯片检测小鼠海马组织miRNA表达谱,筛选差异miRNAs并预测其靶基因,对靶基因进行GO分析及信号转导通路分析。以qRT-PCR验证筛选的miRNAs相对表达量。结果与对照组比较,模型组自给药后第3天起GLU显著上升(P<0.01)。肉眼观察对照B组小鼠脑形态结构正常,外形结构光滑,脑回清晰,海马组织细胞结构排列紧密,染色均匀,结构完整;模型A组脑沟变浅,脑回增宽,海马组织细胞数量减少,排列疏松,核固缩深染。miRNA芯片初筛,对照组和模型组海马组织有11个差异表达miRNAs,全部为下调miRNAs,包括let-7b-5p、miR-130b-3p、miR-181c-5p、miR-181d-5p、miR-3099-3p、miR-3470a、miR-3473a、miR-3473b、miR-500-3p、miR-532-5p、miR-7047-5p(P<0.05)。靶基因预测和GO分析筛选出2个miRNAs(miR-3473b、miR-7047-5p),和5个与神经营养素信号通路相关的靶基因(MAPK3、MAPK11、MAPK14、CALM3、AKT3)。模型C组的miR-3473b及miR-7047-5p相对表达量均低于对照D组(t=19.13、6.24,P<0.05),验证结果与芯片检测结果相符。结论与正常妊娠小鼠子代相比,GDM子代小鼠存在脑结构发育异常和海马神经细胞损伤,且海马组织存在miRNAs异常表达,差异表达miRNA可作为GDM子代神经发育异常预防和治疗的研究靶点。

关键词：妊娠期糖尿病微小核糖核苷酸脑组织形态结构基因表达谱

随机森林算法预测绝经后骨质疏松症与2型糖尿病关联microRNA及其靶向基因调控作用

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中国骨质疏松杂志 2022年第2期28卷 248-254页

作者：潘俊曦田天照刘保新张胜冯庆辉彭志华蔡迎峰广州医科大学附属中医医院骨伤科广东广州510000

目的借助随机森林算法筛选绝经后骨质疏松症与2型糖尿病关联microRNA,通过生物信息学分析其调控作用。方法从GEO数据库获取绝经后骨质疏松症与2型糖尿病患者基因芯片数据,使用随机森林算法筛选与两疾病关联性较高的miRNA,通过表达量差... 详细信息

目的借助随机森林算法筛选绝经后骨质疏松症与2型糖尿病关联microRNA,通过生物信息学分析其调控作用。方法从GEO数据库获取绝经后骨质疏松症与2型糖尿病患者基因芯片数据,使用随机森林算法筛选与两疾病关联性较高的miRNA,通过表达量差异分析、ROC验证筛选出关键miRNA;通过Targetscan、miRWalk2.0和DIANA TOOLS等数据库预测靶向基因,构建关键miRNA-靶向基因调控网络,使用DAVID6.8进行GO、KEGG富集分析。结果从GEO数据库获取GSE70318芯片数据,随机森林算法筛选重要性排名前10位的miRNA进行表达量差异分析,其中4个miRNA表达量显著差异,ROC验证后获得关键miRNA为hsa-miR-369-3p。数据库预测获得hsa-miR-369-3p的44个靶向基因,主要富集于细胞外基质组织、细胞锌离子稳态、染色质结合、矿物质吸收、代谢途径等GO过程及KEGG信号通路。结论通过挖掘基因芯片数据,借助随机森林算法筛选出关联绝经后骨质疏松症与2型糖尿病的关键miRNA hsa-miR-369-3p。hsa-miR-369-3p可能通过调控靶向基因所参与的生物学过程、分子信号通路,介导骨代谢与内分泌代谢活动,发挥关联调控绝经后骨质疏松症与2型糖尿病的作用。

关键词：绝经后骨质疏松症 2型糖尿病随机森林微小核糖核苷酸生物信息学

基于生物信息学分析探讨类风湿关节炎与骨关节炎之间的关系

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中国免疫学杂志 2022年第8期38卷 903-908,914页

作者：章晓云李华南(指导) 陈锋柴源甘斌陈丁鹏江西中医药大学南昌330004 广西中医药大学附属瑞康医院骨科南宁530011

目的:利用生物信息学分析探讨类风湿关节炎(RA)与骨关节炎(OA)之间的关系。方法:通过GEO数据库获取RA和OA血清基因芯片表达谱,筛选两者之间的差异miRNA并取交集,利用FunRich软件对交集miRNA进行转录因子预测及功能富集分析。应用String... 详细信息

目的:利用生物信息学分析探讨类风湿关节炎(RA)与骨关节炎(OA)之间的关系。方法:通过GEO数据库获取RA和OA血清基因芯片表达谱,筛选两者之间的差异miRNA并取交集,利用FunRich软件对交集miRNA进行转录因子预测及功能富集分析。应用String及Cytoscape软件对交集miRNA作用的靶基因进行蛋白互作网络构建,并筛选出核心mRNA,最后利用DAVID数据库对mRNA进行GO功能分析及KEGG信号通路分析。结果:共获得hsa-miR-4281、hsa-miR-98-5p、hsamiR-3613-3p及hsa-miR-6858-3p 4个差异miRNA,其生物过程主要涉及肽代谢、转录、翻译等,涉及10个核心转录因子:LHX3、SP4、NFIC、VSX2、HOXA7、TCF3、MYC、HOXB4、ETS1、SP1。蛋白互作分析提示CDC5L、HNRNPU、GATAD2A、CHD4、ACTB为互作网络中的核心靶点;GO富集分析结果显示交集miRNA所调控mRNA的生物学过程主要涵盖mRNA代谢过程的调控、细胞周期过程的负调控、有丝分裂细胞周期等,KEGG富集结果信号通路主要涉及调控干细胞多能性的信号通路、Hippo信号通路、FoxO信号通路、Apelin信号通路、p53信号通路等。结论:RA与OA两者之间交集miRNA和核心基因的发现有助于了解两种疾病发病机制的相关性,为治疗两种疾病的共同药物研发及治疗方式提供一定的参考。

关键词：类风湿关节炎骨关节炎生物信息学微小核糖核苷酸信号通路

脑动脉瘤破裂出血后脑脊液中miRNA-3177-3p与脑血管痉挛的发病关系及临床意义

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国际神经病学神经外科学杂志 2023年第3期50卷 6-11页

作者：翁传波江涛张洋刘师林江录伟王绪扣安徽医科大学第一附属医院神经外科安徽合肥230041 安徽省公共卫生临床中心神经外科安徽合肥230041 安徽省转化医学研究院安徽合肥230031 安徽医科大学第二附属医院神经外科安徽合肥230031

目的测定动脉瘤性蛛网膜下腔出血(aSAH)后脑血管痉挛(CV)患者与脑血管未痉挛患者脑脊液中miRNA-3177-3p的表达情况,探讨其与CV的发病关系及临床意义。方法将29例aSAH患者分成脑血管痉挛组(CV组)与脑血管未痉挛组(nonCV组)。比较两组... 详细信息

目的测定动脉瘤性蛛网膜下腔出血(aSAH)后脑血管痉挛(CV)患者与脑血管未痉挛患者脑脊液中miRNA-3177-3p的表达情况,探讨其与CV的发病关系及临床意义。方法将29例aSAH患者分成脑血管痉挛组(CV组)与脑血管未痉挛组(nonCV组)。比较两组患者的一般临床资料;通过生物信息数据分析确定miRNA-3177-3p作为研究对象,测定两组患者脑脊液中miRNA-3177-3p实际表达情况并比较差异;预测miRNA-3177-3p下游靶基因ATP1B3,构建ATP1B3质粒,双萤光素酶报告实验验证miRNA-3177-3p与ATP1B3靶向关系;最后,ELISA法测定两组患者脑脊液中ATP1B3转录产物ATP1β3含量并比较差异。结果 CV组患者Hunt评级高于non-CV组(P<0.05);CV组脑脊液中miRNA-3177-3p表达丰度为(0.873±0.044),与non-CV组(0.908±0.034)比较,差异有统计学意义(t=2.157,P=0.040);双萤光素酶报告实验结果显示,与miRNA-3177-3p作用后,ATP1B3-3’UTR区相较对照组活性降低15%(P<0.05);将ATP1B3-3’UTR区进行突变,ATP1B3-3’UTR区相较突变前活性上升14%(P<0.05);ELISA法证实表达产物ATP1β3在CV组脑脊液中(1.776±0.013)ng/mL高于non-CV组(1.722±0.016)ng/mL(t=7.778,P=0.000)。结论 CV患者脑脊液中miRNA-3177-3p表达下调,ATP1B3高表达可能参与了CV的发病过程,该机制可能在预测与治疗CV上具有一定临床意义。

关键词：动脉瘤破裂出血脑血管痉挛微小核糖核苷酸脑脊液

小梁网处microRNAs在原发性开角型青光眼发病机制中的研究进展

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巴楚医学 2022年第3期5卷 1-5页

作者：赖俊衣陈君毅复旦大学眼耳鼻喉科医院眼科上海200031

青光眼是不可逆性致盲性眼病,中国是青光眼患者人数最多的国家。小梁网(TM)是前房角处由胶原纤维构成的网状结构,它是眼房水排出的重要通路,该处的病理性改变可升高眼内压,导致青光眼的发生。近年来,不少研究聚焦于微小核糖核苷酸(miRNA... 详细信息

青光眼是不可逆性致盲性眼病,中国是青光眼患者人数最多的国家。小梁网(TM)是前房角处由胶原纤维构成的网状结构,它是眼房水排出的重要通路,该处的病理性改变可升高眼内压,导致青光眼的发生。近年来,不少研究聚焦于微小核糖核苷酸(miRNA)在青光眼中的作用,包括影响TM细胞数量及功能、细胞外基质重塑及TM细胞收缩性等,这说明miRNAs对TM功能调控非常重要。本文将对TM处miRNAs在原发性开角型青光眼(POAG)发病机制中的研究进展进行综述,为临床治疗POAG提供新思路。

关键词：原发性开角型青光眼微小核糖核苷酸小梁网细胞外基质

循环microRNA-21对冠心病不稳定斑块的预测意义

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中华急诊医学杂志 2016年第7期25卷 878-882页

作者：李韶南刘震曾冲李广镰罗义雷晓明广州市第一人民医院心内科广州510180

目的探讨冠心病（CAD）患者循环microRNA-21（miRNA-21）相对表达量与冠状动脉内不稳定斑块的关系。方法连续收集2012年1月至2014年12月在广州市第一人民医院心内科住院并接受冠状动脉造影（CAG）及血管内超声（IVUS）检查的CAD患者10... 详细信息

目的探讨冠心病（CAD）患者循环microRNA-21（miRNA-21）相对表达量与冠状动脉内不稳定斑块的关系。方法连续收集2012年1月至2014年12月在广州市第一人民医院心内科住院并接受冠状动脉造影（CAG）及血管内超声（IVUS）检查的CAD患者100例，根据IVUS检查患者冠脉内是否具有不稳定斑块分为稳定斑块组（SP组）45例、不稳定斑块组（UP组）55例，并选择同期在本院体检中心进行健康体检的50例健康对照病例作为对照组。采用实时荧光定量聚合酶链式反应技术（qRT-PCR）测定入选病例空腹静脉血浆miRNA-21的相对表达量，分析血浆miRNA-21水平与CAD患者不稳定斑块的关系。结果不稳定斑块组患者血浆miRNA-21相对表达量显著高于稳定斑块组和对照组[（0.87±0.10）vs.（0.78±0.11）vs.（0.67±0.08）, P＜0.05]，将CAD患者血浆miRNA-21水平与患者是否存在不稳定斑块做出受试者工作曲线（ROC）, 血浆miRNA-21的曲线下面积（AUC）为0.869（95%CI： 0.797～0.940）。多因素Logistic回归分析显示血浆miRNA-21是CAD患者存在不稳定斑块的独立预测因子（P＜0.05）。结论血浆miRNA-21水平升高预示CAD患者冠状动脉内斑块的不稳定状态，是预测CAD患者存在不稳定斑块的重要生物标志物之一。

关键词：微小核糖核苷酸动脉粥样硬化冠状动脉疾病

基于生物信息学探讨骨质疏松症与膝骨关节炎的关系

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中国骨质疏松杂志 2021年第1期27卷 6-12页

作者：陈桐莹高丰禾汪悦东林燕平黄佳纯黄宏兴万雷王世浩赵宇刘远祥袁嘉尧广州中医药大学第三临床医学院广东广州510405 广州中医药大学第三附属医院广东广州510375

目的利用生物信息学探索骨质疏松症与膝骨关节炎的关系。方法通过GEO数据库查找骨质疏松症和膝骨关节炎血清基因芯片表达谱;采用GEO2R筛选出差异miRNA并在miRDB、Targetscan进行靶基因预测;DAVID6.8数据库对差异基因进行功能GO分析及KEG... 详细信息

目的利用生物信息学探索骨质疏松症与膝骨关节炎的关系。方法通过GEO数据库查找骨质疏松症和膝骨关节炎血清基因芯片表达谱;采用GEO2R筛选出差异miRNA并在miRDB、Targetscan进行靶基因预测;DAVID6.8数据库对差异基因进行功能GO分析及KEGG信号通路分析;应用STRING、Cytoscape软件建立蛋白相互作用网络。结果本研究共获得骨质疏松症与膝骨关节有交集的4个差异miRNA,蛋白相互作用网络共含278个节点与545条连线。筛选出10个核心基因:VEGFA、ESR1、CCND1、PRKACA、GSK3β、H2AFX、SHH、EGR1、DNMT3A、DNMT3B。结论交集miRNA和核心基因的发现有助于了解骨质疏松症与膝骨关节炎的相关性,了解两病的相关发病机理,为药物的开发提供靶点。

关键词：骨质疏松膝骨关节炎生物信息学微小核糖核苷酸

外泌体miRNA在阿尔茨海默病诊治中的研究进展

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中华老年医学杂志 2020年第6期39卷 717-721页

作者：段贤孙启英李雯雯黄娟许宏伟周亚芳易芳胡雅岑周琳中南大学湘雅医院老年神经内科长沙410008

外泌体是由各种细胞分泌的球形微囊泡(30-100nm),其内包含多种蛋白质、脂质、信使RNA(mRNA)和微小RNA(miRNA)等分子,外泌体可以将这些分子传递到邻近细胞和/或远距离输送到其他组织细胞而发挥作用。外泌体miRNA通过调节β-淀粉样蛋白(A... 详细信息

外泌体是由各种细胞分泌的球形微囊泡(30-100nm),其内包含多种蛋白质、脂质、信使RNA(mRNA)和微小RNA(miRNA)等分子,外泌体可以将这些分子传递到邻近细胞和/或远距离输送到其他组织细胞而发挥作用。外泌体miRNA通过调节β-淀粉样蛋白(Aβ)和p-Tau蛋白的异常表达、与Toll样受体相互作用启动炎性反应等参与阿尔茨海默病(AD)的发病;外泌体miRNA还可作为AD的潜在治疗靶点。外泌体作为良好的运载体,有很大的研究价值。本综述总结了有关外泌体miRNA在AD发生发展过程中的作用,及其作为AD潜在治疗靶点的研究文献。大量的证据表明外泌体miRNA表达紊乱在AD的发病机制中发挥了重要作用,并可作为AD诊断的新型潜在生物标志物及治疗靶点。

关键词：外泌体微小核糖核苷酸阿尔茨海默病

microRNAs与组织纤维化关系的研究进展

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临床心血管病杂志 2015年第11期31卷 1238-1241页

作者：赵明明王海蓉临沂市沂水中心医院心内科山东临沂276400 武汉大学中南医院

多种原因如高糖、缺血等,可导致心肌纤维化的发生。纤维化主要与细胞外基质的合成与分解失衡相关,可导致器官功能不全。微小核糖核苷酸(mcroRNA)参与了组织器官纤维化的发生发展,现将其研究进展进行综述。

关键词：微小核糖核苷酸纤维化心肌