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江西水产科技 2024年第4期 1-7页

作者：肖俊姚远龚海波巫伟华龙凡丁立云江西省水产科学研究所江西南昌330039 农业农村部湖泊渔业资源环境科学观测实验站江西南昌330039 江西省水生生物保护救助中心江西南昌330096

为探究鱼油和豆油作为饲料脂肪源对彭泽鲫亲本卵巢发育的影响,将健康的初始体质量为253.78±5.34 g的彭泽鲫分别以鱼油(FO)和豆油(SO)两种脂肪源的试验饲料饲喂60 d。采用Illumina NovaSeq 6000高通量测序平台对彭泽鲫亲本卵巢组织进行... 详细信息

为探究鱼油和豆油作为饲料脂肪源对彭泽鲫亲本卵巢发育的影响,将健康的初始体质量为253.78±5.34 g的彭泽鲫分别以鱼油(FO)和豆油(SO)两种脂肪源的试验饲料饲喂60 d。采用Illumina NovaSeq 6000高通量测序平台对彭泽鲫亲本卵巢组织进行转录组测序。然后将所测序列经质控,组装后对比到GO KEGG等数据库中进行注释,并对其进行差异基因等的聚类分析。试验结果显示,FO组平均得到4.33×10^(7)条Raw Reads,原始数据过滤掉测序接头序列、未知碱基序列、低质量序列后平均得到4.19×10^(7)条Clean Reads,碱基数6.50Gb;SO组平均得到4.30×10^(7)条Raw Reads,原始数据过滤掉测序接头序列、未知碱基序列、低质量序列后平均得到4.15×10^(7)条Clean Reads,碱基数6.45Gb。经过纯化后,Q20比例在97.25%以上,Q30比例在91.55%以上。在SO组相对FO组比较中,按照q1的筛选条件,得到425个差异表达基因(DEGs),显著上调基因有290个,显著下调基因有135个,共筛选出7个性腺发育相关基因,其中6个基因显著上调,1个基因显著下调。对DEGs进行GO功能分析表明,差异表达的基因对比到GO数据库共898个GO term,这些term分别对应细胞组分,分子功能以及生物过程等三大类,差异基因主要涉及到生物调控、细胞过程、代谢过程和刺激反应等。通过KEGG富集分析结果表明,两组样本之间的差异表达基因富集194条通路,主要涉及细胞进程、环境信息处理、遗传信息处理、新陈代谢、有机系统等五大类代谢通路。其中细胞生长和死亡、信号分子和相互作用、氨基酸代谢和脂类代谢等富集显著。

关键词：彭泽鲫亲本脂肪源转录组测序差异表达基因 KEGG富集

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