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广东高州野生稻应用核心种质取样策略

作物学报 2009年第3期35卷 459-466页

作者：陈雨潘大建杨庆文刘斌范芝兰陈建酉李晨广东省农业科学院水稻研究所广东广州510640 中国农业科学院作物科学研究所北京100081

广东省高州野生稻(简称"高野",下同)具有丰富的遗传多样性,是水稻遗传改良的重要基因库。以217份高野保存材料为对象,结合按居群分类和系统聚类选择的方法,通过多重比较认为20%为最佳取样比例,从中筛选出了43份材料作为应用核心种质。... 详细信息

广东省高州野生稻(简称"高野",下同)具有丰富的遗传多样性,是水稻遗传改良的重要基因库。以217份高野保存材料为对象,结合按居群分类和系统聚类选择的方法,通过多重比较认为20%为最佳取样比例,从中筛选出了43份材料作为应用核心种质。对表型保留比例、表型方差、多样性指数、变异系数、极差符合率、均值符合率、标准差符合率等重要检验指标的分析表明,该应用核心种质很好地代表了总样品的遗传多样性和变异幅度。利用34对SSR引物对应用核心种质进行分析表明,其平均等位基因数为6.879,平均遗传多样性指数达0.656,基因杂合度达0.558,76.7%的材料在遗传背景上不同,且各居群材料相对较为独立。高野应用核心种质的筛选为该资源的高效研究利用奠定了良好的材料基础。

关键词：普通野生稻应用核心种质表型遗传背景 SSR

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玉米应用核心种质的构建与应用

植物遗传资源学报 2023年第4期24卷 911-916页

作者：李永祥李会勇扈光辉刘旭洋李春辉张登峰黎裕王天宇中国农业科学院作物科学研究所北京100081 河南省农业科学院粮食作物研究所郑州450002 黑龙江省农业科学院玉米研究所哈尔滨150086

应用核心种质是针对解决育种问题而建立的成套优异种质集合,也是种质资源研究紧密衔接作物育种的体现形式。鉴于玉米核心种质研究现状,明确了玉米应用核心种质的基本范畴和特征,提出在玉米核心种质资源的基础上,进一步融入重要育种性状... 详细信息

应用核心种质是针对解决育种问题而建立的成套优异种质集合,也是种质资源研究紧密衔接作物育种的体现形式。鉴于玉米核心种质研究现状,明确了玉米应用核心种质的基本范畴和特征,提出在玉米核心种质资源的基础上,进一步融入重要育种性状的优异等位基因,构建分别适应不同生态区、杂种优势类群明确、所含优异等位基因清晰、无明显遗传累赘的应用核心种质,将是今后玉米种质资源研究的工作重点。最后,对玉米应用核心种质构建的关键问题进行了论述,以期推动我国玉米应用核心种质构建相关工作的高效发展,使其能够在较长的一段时间内对我国玉米育种研究提供有效的物质和信息支撑。

关键词：玉米种质资源核心种质应用核心种质育种应用

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大豆磷效率应用核心种质的根构型性状评价

科学通报 2004年第13期49卷 1249-1257页

作者：赵静付家兵廖红何勇年海胡月明邱丽娟董英山严小龙华南农业大学根系生物学研究中心广州510642 中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室北京100081 吉林省农业科学院国家转基因植物中试与产业化基地公主岭136100

应用GIS方法构建了大豆磷效率的应用核心种质,并对大豆种质的重要根系性状根构型进行了系统的评价和对比分析,结果揭示了大豆根构型与磷效率的关系及其可能的进化规律.研究发现:(ⅰ)大豆根构型与磷效率密切相关.浅根型大豆根系具有合理... 详细信息

应用GIS方法构建了大豆磷效率的应用核心种质,并对大豆种质的重要根系性状根构型进行了系统的评价和对比分析,结果揭示了大豆根构型与磷效率的关系及其可能的进化规律.研究发现:(ⅰ)大豆根构型与磷效率密切相关.浅根型大豆根系具有合理的三维空间分布,有利于大豆对耕层土壤磷的吸收,从而显著提高了大豆的磷效率和产量;(ⅱ)大豆地上部株型、根构型和磷效率具有协同进化的趋势,直立型的栽培大豆一般具有浅根根构型和较高的磷效率,蔓生型的野生大豆一般具有深根根构型和较低的磷效率,半野生型大豆的根构型和磷效率介于两者之间;(ⅲ)磷有效性对根构型具有调节作用,在土壤表层施磷条件下,大豆根系普遍变浅,说明根构型和磷效率的协同进化可能是由于长期耕作施肥的结果.上述研究结果可为改良大豆根系性状、提高大豆磷效率提供重要理论依据.

关键词：大豆应用核心种质根构型磷效率地理信息系统有效性协同进化

芝麻应用核心种质DNA分子身份证和种质资源数据库共享平台构建

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芝麻应用核心种质DNA分子身份证和种质资源数据库共享平台构建

作者：杨文娟中国农业科学院

学位级别：硕士

芝麻(Sesamum indicum,2n=26)是世界上最古老的油料作物之一,营养丰富,用途广泛,在食品、药品及保健品研发上均具有很高的利用价值。我国目前收集芝麻种质资源8115份,居世界前列,但长期以来由于芝麻种质资源信息交流平台有限,影响了资... 详细信息

芝麻(Sesamum indicum,2n=26)是世界上最古老的油料作物之一,营养丰富,用途广泛,在食品、药品及保健品研发上均具有很高的利用价值。我国目前收集芝麻种质资源8115份,居世界前列,但长期以来由于芝麻种质资源信息交流平台有限,影响了资源利用率,而且至今尚未构建标准的分子生物学鉴定方法。从分子水平上能对种质进行区分,并较大程度的实现资源信息共享,是种质高效利用和有效保护的重要途径,对芝麻种质资源研究和品种改良均具有重要意义。因此,本研究以建立的应用核心种质为实验材料,探索了芝麻DNA分子身份证的构建方法;基于已获取的8115份芝麻种质资源基本信息和表型数据,建立了数据库,构建了网络共享平台。研究获得以下结果:1.通过对705份芝麻核心种质4年4点精准鉴定,依据优异育种目标,筛选出131份芝麻应用核心种质,分为高产、优质、抗病抗逆、生育期适宜、适应机械化、株型特异、综合性状优良七大类。2.为了探索芝麻DNA分子身份证的构建方法,以应用核心种质为材料,利用SSR变性聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,从基于芝麻全基因组开发的32对SSR引物中,筛选出7对多态性高、带型清晰且空白条带少的引物,确定为核心引物。在此基础上,通过SSR荧光毛细管电泳技术,用获得的7对核心引物分析131份应用核心种质,共检测出53个多态性位点,一个引物能检测出的多态性位点数最多达12个。3.将毛细管电泳得到的分子量数据以数字+英文字母方式编码,利用IDANAlysis4.0软件筛选出6对核心引物排列组合:ZMM1494、ZMM1648、ZMM3037、ZMM2818、ZMM1851、ZMM1935,构建出如“4A32645(AC017)”这种简单、易使用的字符串DNA分子身份证,并确定了不同应用型的组内引物组合。利用条码软件将字符串DNA分子身份证转化为条形码和二维码DNA分子身份证,该类型分子身份证可迅速被电子设备识别,拓宽了DNA分子身份证的使用范围,并为以后芝麻种质标准化和品种DNA分子身份证库的构建奠定了重要的技术基础。4.对我国收集保存的8115份芝麻种质资源基础收集品的基本信息、形态特征和生物学特性、抗性等共计90420条数据信息及芝麻核心种质、微核心种质、应用核心种质信息进行规范整理,并广泛搜集其他与芝麻种质资源相关的资料,构建了芝麻种质资源信息数据库,并以该数据库为数据来源,通过开源的LAMP网站应用系统,结合HTML和Java Script语言建成了芝麻种质资源信息网络共享平台http://***。该平台集芝麻种质资源信息浏览、种质信息检索、种质资源实物索取功能为一体,共享种质数据量大、内容涵盖面广、实用性强,既可为专业的科技工作者提供标准化、准确性高的芝麻相关信息和实物资源,又可为广大芝麻爱好者提供专业的科普知识。

关键词：芝麻种质资源应用核心种质 DNA分子身份证数据库

黄麻炭疽菌代表性菌株分离鉴定及应用核心种质的构建

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黄麻炭疽菌代表性菌株分离鉴定及应用核心种质的构建

作者：郭艳春福建农林大学

学位级别：硕士

黄麻,为锦葵科（Malvaceae）黄麻属（Corchorus）一年生草本植物,是世界上最重要的韧皮部纤维作物之一。炭疽病会严重影响黄麻纤维的产量和品质,明确炭疽病病原菌致病力并构建一批优异的应用核心种质是促进黄麻遗传育种、挖掘优异基因... 详细信息

黄麻,为锦葵科（Malvaceae）黄麻属（Corchorus）一年生草本植物,是世界上最重要的韧皮部纤维作物之一。炭疽病会严重影响黄麻纤维的产量和品质,明确炭疽病病原菌致病力并构建一批优异的应用核心种质是促进黄麻遗传育种、挖掘优异基因和提高生产利用的必要途径。本研究对中国黄麻主产区采集得到的黄麻炭疽病病原菌样本进行分离鉴定和致病力测定;对黄麻抗病种质资源进行了抗性评价,并构建了一批黄麻应用核心种质;最后通过SSR荧光标记毛细管电泳技术构建了黄麻应用核心种质的DNA分子身份证。主要结果如下:1.在实验室前期分离鉴定我国黄麻主产区炭疽病病原菌92个菌株的基础上,进一步分离纯化,结合形态学特征鉴定,从中选取11个代表性病原菌菌株,对r DNA-ITS和LSU区域进行基因序列分析。系统进化树显示,菌株ZZ4、GX19等10个菌株为胶胞炭疽菌（Colletotrichum gloeosporioides）,菌株CS3为黑线炭疽菌（Colletotrichum dematium）。从分子水平上证实中国黄麻主产区近年炭疽病发生的病原菌类型主要有胶孢炭疽菌和黑线炭疽菌。2.为了明确这11个代表性炭疽病病原菌的致病力,以福黄麻3号和福农5号为材料,分别在福州市和三明市两地进行人工接种的致病力测定。根据病斑大小,可将炭疽菌11个代表性菌株的致病力划分为强、中、弱3个类型。其中,菌株GX19的致病力较强,在福州地区病斑大小分别为11.70±2.79 mm、16.40±5.82 mm,在三明地区病斑大小分别为13.00±1.56 mm、13.40±2.32 mm。而黑线炭疽菌菌株CS3在福州和三明两地的病斑较小,说明胶孢炭疽菌和黑线炭疽菌间致病力也存在差异,黑线炭疽菌的致病力可能比胶孢炭疽菌弱。3.利用强致病力菌株GX19对300份黄麻种质资源进行抗性鉴定,可划分为高抗、抗、中抗、中感、感和高感6个类型。其中爱店野生种、巴麻72-1、广巴矮等40份种质表现为高抗,占总数的13.33%。在300份黄麻种质资源的2016-2018年农艺性状统计基础上,结合2019年对农艺性状进一步鉴定和抗性种质的筛选,本研究筛选出纤维产量高、纤维品质好、抗逆、生育期适宜、适宜机械化等优异的应用核心种质,加上4份骨干亲本,按特性可分为16个应用型,剔除不同组内同一种质,共58份品种。构建的黄麻应用核心种质可促进黄麻遗传育种和挖掘优异基因。4.为了便于黄麻应用核心种质的鉴定、保护和智能化管理,本研究采用SSR荧光标记毛细管电泳技术分析了12对荧光核心引物的多态性,共检测出140个多态性位点。将毛细管电泳得到的分子量数据以数字+英文字母方式编码,选取12对荧光核心引物的组合,成功构建出58份应用核心种质的字符串、条形码和二维码等三种形式的DNA分子身份证。以上结果可为促进黄麻种质资源的高效利用及快速分子鉴定提供科学依据。

关键词：黄麻炭疽病病原菌应用核心种质荧光毛细管电泳 DNA分子身份证