检索结果-南通市图书馆

作者：芶思华南农业大学

学位级别：硕士

乳腺肿瘤是母犬发病率较高的肿瘤性疾病。目前临床上多采取外科手术切除联合化学药物治疗的手段,良性肿瘤一般预后良好,但恶性肿瘤常预后不良并导致宠物死亡。浸润和转移是恶性肿瘤的重要特征,也是导致患犬预后不良和死亡的主要原因。因... 详细信息

乳腺肿瘤是母犬发病率较高的肿瘤性疾病。目前临床上多采取外科手术切除联合化学药物治疗的手段,良性肿瘤一般预后良好,但恶性肿瘤常预后不良并导致宠物死亡。浸润和转移是恶性肿瘤的重要特征,也是导致患犬预后不良和死亡的主要原因。因此,寻找灵敏度高、特异性强的犬乳腺肿瘤预后标志物对准确评估患犬的预后情况、及时确定最有效的治疗方案、控制肿瘤转移转恶具有重要的临床意义。本实验通过高通量测序技术对3例犬乳腺癌组织及其癌旁组织的mrna进行测序分析,通过GO功能分析和KEGG Pathway分析筛选与犬乳腺癌转移相关的差异表达mrna。采用实时荧光定量聚合酶链式反应技术（Real-time quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR）对挑选出来的转移相关差异表达mrna进行验证,同时检测其在体外培养的原发灶细胞株（CHMp）和转移灶细胞株（CHMm）中的表达量。同时,采用免疫组织化学技术检测由PTPN1基因编码的PTP1B蛋白在犬乳腺癌组织和健康犬乳腺组织中的表达情况,并构建了PTPN1真核表达重组质粒以进一步探究PTPN1基因在肿瘤细胞信号转导中的作用机制。转录组测序结果显示,在犬乳腺癌和癌旁组织中共筛选到2208个差异表达mrna,其中上调1459个,下调749个。通过KEGG信号通路、GO功能分析筛选出与犬乳腺癌浸润和转移相关的差异表达mrna,包括PAI-1、PTPN1、VEGFC、VCAM1、ICAM1,主要在细胞迁移、细胞成分运动、细胞黏附等过程并且在缺氧诱导因子-1信号通路、黏合连接信号通路、血管内皮生长因子信号通路、肿瘤坏死因子信号通路中发挥作用,提示这些差异表达mrna在肿瘤浸润和转移过程中发挥着重要的作用。RT-qPCR结果显示,犬乳腺癌组织和癌旁组织中的PAI-1、VEGFC、PTPN1、VCAM1、ICAM1基因表达差异倍数和变化趋势与转录组测序结果一致,其中PAI-1和VEGFC基因表达量与对照组相比差异显著,PTPN1、VCAM1和ICAM1基因表达量与对照组相比差异不显著。将临床收集的犬乳腺肿瘤样品通过病理组织学检测结果分为恶性肿瘤组和良性肿瘤组,分别取病变位置的组织和对应的病变周围组织并采用RT-qPCR的方法检测PAI-1、PTPN1、VEGFC、VCAM1、ICAM1基因的表达水平。实验结果表明,PAI-1、PTPN1、VEGFC基因在恶性肿瘤和良性肿瘤中均高表达,但是病变位置组织和对应的病变周围组织相比未有显著差异;VCAM1基因在恶性肿瘤和良性肿瘤中均显著低表达,提示VCAM1与犬乳腺肿瘤的发生和发展等过程相关;ICAM1基因仅在恶性肿瘤中显著低表达,这种低表达在良性肿瘤中未出现显著差异,提示ICAM1可能作为鉴别犬乳腺肿瘤良恶性的潜在分子标记。为进一步明确这五个基因在犬乳腺肿瘤转移中的作用,对犬乳腺肿瘤细胞系CHMp和CHMm进行RT-qPCR,结果显示转移灶的CHMm细胞中的ICAM1基因表达量与CHMp细胞相比差异显著,PAI-1、PTPN1、VEGFC、VCAM1基因表达量与CHMp细胞相比均无显著差异,进一步说明ICAM1基因参与了犬乳腺肿瘤的浸润、转移过程。综上所述:ICAM1可作为犬乳腺肿瘤预后评估的潜在分子标志物。在临床上,通过分子生物学的方法检测基因的表达量变化会相对繁琐,而蛋白质是生物体内各种功能的执行者,相比于基因,可以更加直接地反映功能机制,并且通过免疫学的方法检测蛋白含量的变化更加方便快捷。高通量测序技术可以在全基因组范围内搜寻与犬乳腺肿瘤转移相关的mrna,再通过表达量显著变化的mrna找到在肿瘤转移过程中有变化和作用的蛋白质,本研究的GO功能分析和KEGG信号通路分析显示,PTPN1基因主要是通过其编码的PTP1B蛋白的去磷酸化作用来参与犬乳腺肿瘤细胞黏附进程的,可推测PTP1B与犬乳腺肿瘤的浸润、转移过程相关;本研究中通过RT-qPCR检测,PTPN1基因在犬乳腺肿瘤组织中高表达但与肿瘤周围的非肿瘤组织相比未有显著差异,推测PTP1B的作用与其酪氨酸磷酸酶活性有一定的相关性,少量表达的酪氨酸磷酸酶1B即可对肿瘤的浸润、转移产生影响。为了探究PTP1B在犬乳腺肿瘤中的表达水平以及蛋白酪氨酸磷酸酶1B参与犬乳腺肿瘤浸润、转移过程的具体分子机制,对采集的犬乳腺癌组织和健康组织进行免疫组化分析并构建了PTPN1的重组表达质粒。免疫组化结果显示:PTP1B蛋白在犬乳腺癌组织和健康犬乳腺组织中均低表达且PTP1B蛋白在犬乳腺癌组织中的表达量高于健康犬乳腺组织中的表达量,提示PTP1B蛋白在犬乳腺肿瘤浸润、转移过程发挥作用的主要因素是其酪氨酸磷酸酶活性。本实验筛选了与犬乳腺肿瘤转移相关的mrna并对其进行了验证分析,为解读犬乳腺肿瘤浸润、转

关键词：犬乳腺肿瘤转移差异表达mrna 高通量测序技术

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基于转录组测序筛选黄牛低氧适应性相关差异基因

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华北农学报 2020年第2期35卷 217-227页

作者：侯孟典王会钟金城柴志欣益西康珠王吉坤王嘉博青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室西南民族大学四川成都610041 青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省重点实验室西南民族大学四川成都610041

为探明藏黄牛对低氧适应的相关差异表达基因并分析差异表达基因功能和代谢通路,以藏黄牛和三江黄牛心脏组织为研究对象,提取总RNA,建立测序文库后利用Illumina HiSeqTM 4000进行测序,经生物信息学分析筛选出差异表达转录本,并对差异表... 详细信息

为探明藏黄牛对低氧适应的相关差异表达基因并分析差异表达基因功能和代谢通路,以藏黄牛和三江黄牛心脏组织为研究对象,提取总RNA,建立测序文库后利用Illumina HiSeqTM 4000进行测序,经生物信息学分析筛选出差异表达转录本,并对差异表达基因进行GO富集和KEGG通路分析,最后采用荧光定量PCR(RT-qPCR)验证测序数据的准确性。结果表明:藏黄牛相比于三江黄牛得到显著差异表达基因608个,其中上调基因467个,下调基因141个,推测表达量较高的B2M、COX7C、NFATC1、ECE1、CAST基因是与低氧适应性相关的基因;差异转录本GO功能富集分析可知,在分子功能、细胞组分、生物过程分别富集到327,253,2 191个条目,其中富集程度最高的条目分别是细胞发育过程、结合与转录因子活性、细胞前缘。KEGG分析结果表明,差异转录本显著富集在8条通路,筛选低氧适应性候选基因NFATC1是MP-PKG信号通路与T细胞受体信号通路成员,推测其通过cGMP-PKG通路与T细胞受体信号通路参与低氧适应性调控。采用高通量测序技术对藏黄牛和三江黄牛心脏组织进行转录组测序分析,获得大量差异表达基因,为研究动物低氧适应性机制奠定基础。

关键词：黄牛心脏组织低氧适应性差异表达mrna 功能富集分析

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蒙古斑点马黑、白毛色区域皮肤中相关基因的表达研究

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畜牧兽医学报 2022年第1期53卷 100-111页

作者：白东义拉希玛赵若阳陶娜拉韩海格丁文淇贾紫洁刘慧莹王文兴黄博光芒来内蒙古农业大学动物科学学院内蒙古自治区马属动物遗传育种与繁殖重点实验室农业农村部马属动物遗传育种与繁殖科学观测实验站内蒙古农业大学马属动物研究中心呼和浩特010018 内蒙古中蕴马产业集团锡林浩特026000 锡林郭勒盟镶黄旗农牧和科技局镶黄旗013250

本试验以蒙古斑点马为研究对象,分别对蒙古斑点马体躯白色区域和黑色区域皮肤的表型和差异表达基因进行分析并验证,试图解析蒙古斑点马毛色形成的分子机制,为今后保护和开发利用蒙古斑点马奠定基础。选择蒙古斑点马体躯白色和黑色区域... 详细信息

本试验以蒙古斑点马为研究对象,分别对蒙古斑点马体躯白色区域和黑色区域皮肤的表型和差异表达基因进行分析并验证,试图解析蒙古斑点马毛色形成的分子机制,为今后保护和开发利用蒙古斑点马奠定基础。选择蒙古斑点马体躯白色和黑色区域皮肤制作组织切片,HE染色后在显微镜下观察其表型差异;对白色和黑色区域皮肤组织进行转录组测序,比较差异表达mrnas;将筛选到的典型基因通过免疫荧光试验和实时荧光定量试验,对转录组测序结果进一步验证。结果显示,蒙古斑点马黑色皮肤组织和白色皮肤组织中的色素分布有明显的差异,黑色素细胞主要分布于黑色皮肤组织表皮和毛囊毛球部位,而白色皮肤组织相应的位置未发现有黑色素沉积。740个基因的表达量在黑白两个不同颜色皮肤组织中存在显著差异(P表达量较高,215个基因在蒙古斑点马白色皮肤组织表达量较高。差异表达mrnas主要富集到了黑色素生成等通路,其中TYR、TYRP1、DCT、PAX3、DAPL1等基因与毛色形成相关。在蒙古斑点马毛囊中,TYR和TYRP1蛋白在毛囊的毛球部位不表达。DCT在毛囊毛球的毛母质部位表达。因此,蒙古斑点马的毛色形成主要由黑色素形成相关的基因的表达量所决定。

关键词：蒙古斑点马皮肤组织差异表达mrna

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蒙古马(斑点)胎儿期黑白毛色区域皮肤组织相关基因表达分析

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中国农业大学学报 2022年第3期27卷 96-105页

作者：白东义拉希玛图格琴赵若阳陶娜拉韩海格丁文淇贾紫洁刘慧莹王文兴黄博光芒来内蒙古农业大学动物科学学院/内蒙古自治区马属动物遗传育种与繁殖重点实验室/农业农村部马属动物遗传育种与繁殖科学观测实验站/内蒙古农业大学马属动物研究中心呼和浩特010018 内蒙古中蕴马产业集团锡林浩特026000 锡盟镶黄旗农牧和科技局 013250

为确定相关候选基因在毛色产生过程中的差异,以及相互之间的关系,试图解析胎儿期蒙古马毛色形成的分子机制,为今后保护和开发利用蒙古马(斑点)奠定基础,本研究以蒙古马(斑点)胎儿为研究对象,首先对胎儿期蒙古马体躯白色和黑色区域皮肤... 详细信息

为确定相关候选基因在毛色产生过程中的差异,以及相互之间的关系,试图解析胎儿期蒙古马毛色形成的分子机制,为今后保护和开发利用蒙古马(斑点)奠定基础,本研究以蒙古马(斑点)胎儿为研究对象,首先对胎儿期蒙古马体躯白色和黑色区域皮肤组织制作石蜡切片,进行组织学观察,其次对胎儿期蒙古马白色和黑色区域皮肤进行RNA-seq,构建mrna表达谱,筛选相关差异表达基因,进行GO和KEGG功能富集分析。结果表明:1)通过组织学观察,黑色素在胎儿黑色皮肤组织表皮里沉积很明显,毛乳头、毛母质部位均有黑色素沉积。相反,白色皮肤组织中没有黑色素沉淀;2)RNA-seq筛选毛色产生差异的相关基因,共鉴定出660个基因,其表达量在黑白2个不同颜色皮肤组织中存在显著差异(P表达量较高,59个基因在蒙古马胎儿白色皮肤组织表达量较高。差异表达基因TYR、TYRP1、DCT、PAX3和DAPL1等富集到了黑色素生成通路。综上,胎儿时期蒙古马的毛色形成主要由黑色素形成相关基因决定,可为后期蒙古斑点马选育环节中对毛色的筛选提供科学理论依据。

关键词：蒙古马(斑点) 胎儿皮肤组织差异表达mrna

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肝细胞癌中心及侵袭性边缘编码RNA表达谱及其与肝细胞癌预后的初步研究

肝细胞癌中心及侵袭性边缘编码RNA表达谱及其与肝细胞癌预后的初...

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作者：廖敏学川北医学院

学位级别：硕士

目的:编码RNA失调是导致肿瘤的重要因素。研究在肝细胞癌(HCC)侵袭性边缘异常表达且与肿瘤生物学行为及患者预后相关的mrna具有一定意义。方法:我们对GEO数据库中数据进行差异表达分析,使用热图和层次聚类对分析结果进行验证。Venn分析... 详细信息

目的:编码RNA失调是导致肿瘤的重要因素。研究在肝细胞癌(HCC)侵袭性边缘异常表达且与肿瘤生物学行为及患者预后相关的mrna具有一定意义。方法:我们对GEO数据库中数据进行差异表达分析,使用热图和层次聚类对分析结果进行验证。Venn分析筛选出在HCC中心和侵袭性边缘同时上调与下调的DEG,并对这些DEG进行了功能、通路富集及蛋白相互作用分析。对筛选出的潜在重要DEG在TCGA数据库中进行验证,并研究了这些DEG表达值与HCC患者生存及分期的关系。最后我们在临床样本以及Huh7、HCCLM3及L02细胞株中对侵袭性边缘具有特征性高表达的CDC45进行了验证。结果:我们在HCC中心筛选出1981个DEG,在HCC侵袭性边缘筛选出382个DEG。301个DEG在HCC中心与HCC侵袭性边缘表现出相同的上调/下调趋势,CDC45在侵袭性边缘的表达水平高于HCC中心。这301个DEG主要富集于有丝分裂,信号转导,细胞周期,p53通路及其他涉及肿瘤的信号通路。潜在关键mrna经TCGA数据库中数据验证,证明CDC45、FAM83D、AURKB、TPX2,CHEK1的表达在HCC中异常上调,这些DEG的上调与降低的总体生存时间(OS)和进展的AJCC TNM分期相关。最后,CDC45在侵袭性边缘的异常高表达水平(高于HCC中心)在临床样本中得到验证,且肝癌细胞株Huh7、HCCLM3中同样出现CDC45表达水平升高。结论:本研究发现了HCC中的差异表达mrna存在肿瘤组织中空间分布上的差异,这些差异可预测出特定的生物学功能,且在一定程度上反映了患者的生存时间和肿瘤分期。此项研究可能为HCC的术后管理和精准治疗提供新的思路。

关键词：生物信息学肝细胞癌 mrna 差异表达mrna 细胞周期

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长链非编码RNA在肝细胞肝癌中的表达谱分析

长链非编码RNA在肝细胞肝癌中的表达谱分析

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作者：倪淑君浙江大学

学位级别：硕士

背景近年来,越来越多的证据表明,长链非编码RNA(LongnocodingRNA,lncRNA),能够通过多种机制参与并影响包括肿瘤在内的各种生物学过程。肝细胞肝癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)是全世界范围内最普遍且死亡率最高的肿瘤之一,对其的全... 详细信息

背景近年来,越来越多的证据表明,长链非编码RNA(LongnocodingRNA,lncRNA),能够通过多种机制参与并影响包括肿瘤在内的各种生物学过程。肝细胞肝癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)是全世界范围内最普遍且死亡率最高的肿瘤之一,对其的全转录组水平研究,尤其是长链非编码RNA的研究报道仍然较少。方法本研究利用高通量RNA测序,对12例HCC患者的组织样本(包括原发肿瘤组织及其配对的癌旁组织)进行转录组测序,筛选出肝癌差异表达mrna(differentially expressed mrna,DEG)lncRNA(differentially expressed lncRNA,DEL),并在21例HCC患者组织中进行了实时定量PCR(Quantitative reverse transcription-PCR,qRT-PCR)验证。使用Student' s t检验和线性回归分析等关联分析DEL的表达与不同的临床病理特征的相关性。根据皮尔逊相关系数和富集分析等生物信息学方法构建DEG和DEL在肝癌中的共表达调控网络。利用RNAi干扰肝癌细胞内源性DEL的表达,,并检测肝癌细胞增殖和迁移能力变化,以探索DEL的生物学功能。结果本研究在12对HCC患者组织中确认了 439个差异表达的DEG和214个差异表达的DEL。同时,发现了一系列差异表达的lncRNA与肿瘤大小、组织分化、肝门静脉癌栓(Portal vein tumor thrombosis,PVTT)、组织及血清甲胎蛋白(Alpha-fetoprotein,AFP)水平等存在显著相关性,尤其是NONHSAT122051,不仅与肿瘤大小、组织分化及PVTT均密切相关,其表达水平更与血清AFP呈线性相关(p=0.0005),在今后研究中有望成为HCC新型生物标志物。此外,共表达调控网络,揭示肝癌特异lncRNA可能涉及代谢、细胞周期、化学致癌、补体与凝血级联等相关信号通路,在HCC中发挥重要的调控作用。最后,发现沉默内源性NONSHAT122051与NONHSAT003826的表达水平能显著抑制肝癌细胞系的迁移能力,提示其可促进HCC转移。结论本研究的发现不仅增加了对肝癌转录组的系统性认识,更揭示了肝癌特异lncRNA的生物学功能及可能的分子调控机制,为后续对肝癌的诊断、治疗及预后提供了新的思路。

关键词：肝细胞肝癌长链非编码RNA RNA测序差异表达mrna 差异表达lncRNA 共表达调控网络

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三伪尖毛虫营养期和包囊期的形态及休眠相关基因的研究

三伪尖毛虫营养期和包囊期的形态及休眠相关基因的研究

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作者：孙佳佳华东师范大学

学位级别：硕士

纤毛虫原生动物是一种高度分化的单细胞真核生物。当环境不良时,它能形成休眠包囊,外界条件转好时再脱包囊成营养细胞。形成包囊时,细胞形态会发生一系列变化,这是一种受到多种基因共同调控的生命现象。对纤毛虫细胞休眠现象的研究,不... 详细信息

纤毛虫原生动物是一种高度分化的单细胞真核生物。当环境不良时,它能形成休眠包囊,外界条件转好时再脱包囊成营养细胞。形成包囊时,细胞形态会发生一系列变化,这是一种受到多种基因共同调控的生命现象。对纤毛虫细胞休眠现象的研究,不仅有助于了解真核生物在逆境下细胞物质合成与代谢及信号传递机制,还能为进一步探索真核细胞结构和功能、起源和进化等方面提供新的资料。有关纤毛虫休眠过程的形态学研究虽有一定积累,但是对皮层纤毛器的去分化规律了解较少;而对于纤毛虫休眠相关的分子机制,因研究起步较晚,知之甚少。本研究以三伪尖毛虫(Oxytricha trifallax)为实验材料,应用电子显微镜技术和转录组技术对三伪尖毛虫营养细胞和休眠包囊的形态和基因表达情况进行了研究,观察了其形成包囊时胞质内细胞器变化、皮层纤毛器的连续性分化过程,探索了休眠相关基因和信号通路的调控机制。1.三伪尖毛虫营养期和包囊期细胞形态研究三伪尖毛虫营养期细胞长约55μm,宽约24μm,腹面纤毛为典型的尖毛虫“8-5-5”模式,具有6列背触毛。形成包囊时,腹面纤毛器中波动膜、口庭、口围带先瓦解,Ⅴ/3、Ⅴ/4及位于细胞中部6-7根缘棘毛依次向细胞质内抽缩成短小棘毛并暂停吸收,之后Ⅳ/2、Ⅴ/2、Ⅵ/2及剩余缘棘毛依次消失,额腹区棘毛在细胞变成球形后先聚集再瓦解,最后暂停吸收的短棘毛被吸收;与腹面纤毛器去分化不同的是,背触毛单元的裸毛基体再分化长出纤毛,形成具有两根纤毛结构的背触毛单元。最终成熟的包囊直径约为15μm,表面具有褶皱,包囊壁为典型的4层;胞质中有大量的自噬泡、线粒体等胞器;2枚大核融和为1枚,小核1枚或多枚,呈圆球形。结果表明:(1)三伪尖毛虫形成毛基体吸收型包囊,休眠过程中,腹面纤毛器有序依次地去分化,而背触毛则出现再分化;(2)比较该过程及已有其他纤毛虫纤毛器去分化的报道可知,腹面纤毛器去分化规律很可能因种而异,但亲缘关系越近则越为相似;(3)三伪尖毛虫背触毛的再分化现象与前人报道过的凯氏异毛虫(Allotricha curdsi)一致,可能是尖毛虫类纤毛虫的共有特征;(4)三伪尖毛虫与大部分腹毛类纤毛虫纤毛器的去分化都起始于口器,可能是纤毛虫休眠开始时会停止摄食的原因。2.三伪尖毛虫休眠相关基因的研究应用转录组技术对纤毛虫***营养体和包囊的基因表达情况进行了研究,测得的转录组数据及生物信息学分析结果显示:(1)共测得营养体和包囊差异转录本809条,与营养体相比,包囊中511条m RNA为上调表达,298条m RNA为下调表达;(2)对这些差异表达m RNA进行GO功能注释,有586条m RNA匹配到了GO注释,共注释到1337个GO条目:上调表达的286条m RNA共注释到963个GO条目,下调表达的200条m RNA匹配到516个GO注释条目;(3)这些差异条目的富集在三大类中:主要与糖类、脂质和蛋白质代谢及细胞分裂相关的生物过程,溶酶体、胞外空间和细胞壁的细胞组分,以及磷酸激酶、氧化酶、肽酶、超氧化物歧化酶等酶类的分子功能相关;(4)对这些差异转录本进行KEGG分析,共映射到207条不同的通路中,与营养细胞相比,休眠包囊的上调转录本注释到144条通路,下调转录本注释到180条通路,其中显著富集的通路有溶酶体、c AMP、花生四烯酸代谢、细胞凋亡、三羧酸循环、自噬、谷胱甘肽代谢、抗原处理与呈递、鞘脂糖合成、脂肪酸延长以及氨基酸合成等。分析结果表明:(1)与肾形虫和阿米巴虫形成包囊时细胞内c AMP水平升高一致,三伪尖毛虫包囊中c AMP通路中的钙调蛋白激酶和Na+-K+-ATP酶α亚基相关基因表达上调,这可能证明c AMP通路会参与原生动物的休眠调控;(2)同时在饥饿、拥挤等不良环境中,细胞还优先表达大量HSP70蛋白,进而促进谷胱甘肽过氧化物酶、超氧化物歧化酶及SDR家族还原酶等内源性氧化酶水平,启动应激反应机制来降低环境对细胞的胁迫;(3)此外,与透射电镜下观察到包囊中出现的大量自噬泡结构相对应,应用转录组技术也筛选到了自噬和溶酶体通路中组织蛋白酶D、L、B的差异性表达,这可能与蛋白质降解、包囊壁形成以及休眠期营养物质供应相关;(4)三伪尖毛虫的差异表达基因显著富集在自噬和溶酶体通路中,但这一现象在同为腹毛类的冠突伪尾柱虫研究中未见报道。这可能是因为与“毛基体部分吸收型包囊”类纤毛虫相比,“毛基体吸收型包囊”类纤毛虫在形成包囊时,自噬现象更为明显。纤毛虫营养体形成包囊是一个稳定有序的分化过程,受到多种基因及信号通路的共同调控,而这些差异表达基因和信号通路起到了至关重要的作用。本研究比较细致地观察了皮层纤毛器的分化顺序和特征,可为研究不同生理条件下纤毛虫细胞结构分化特征研究提供相关素材。在形态学的基础上,还运用转录组学技术探索了毛基体吸收型包

关键词：纤毛器去分化再分化差异表达mrna GO功能注释 KEGG分析自噬 cAMP

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新疆哈萨克族食管鳞癌组织中长链非编码RNA MIR663AHG的表达及其相关mrna

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山东医药 2018年第6期58卷 41-43页

作者：程丽云史贵军方春晓李光华郑勇陈卫刚石河子大学医学院第一附属医院新疆石河子832000

目的观察长链非编码RNA MIR663AHG(lncRNA MIR663AHG)在新疆哈萨克族食管鳞癌组织中的表达情况及其相关的mrna。方法 17例食管鳞癌患者,其中哈萨克族7例(观察组)、汉族10例(对照组)。采用q RT-PCR技术检测两组食管鳞癌组织和配对的癌旁... 详细信息

目的观察长链非编码RNA MIR663AHG(lncRNA MIR663AHG)在新疆哈萨克族食管鳞癌组织中的表达情况及其相关的mrna。方法 17例食管鳞癌患者,其中哈萨克族7例(观察组)、汉族10例(对照组)。采用q RT-PCR技术检测两组食管鳞癌组织和配对的癌旁组织中的lncRNA MIR663AHG表达,并与前期基因芯片筛选出的哈萨克族食管鳞癌肿瘤组织与正常组织差异基因的结果作对比,筛选出与观察组lncRNA MIR663AHG显著相关的mrna。结果观察组食管鳞癌组织较癌旁组织及对照组食管鳞癌组织中lncRNA MIR663AHG的相对表达量高(P均表达量相比P>0.05。在2 475个差异基因中,共筛选出16个与lncRNA MIR663AHG显著相关的mrna。结论 lncRNA MIR663AHG在新疆哈萨克族食管鳞癌组织中高表达,可能通过调节相关mrna参与哈萨克族食管鳞癌的发生发展。

关键词：长链非编码RNA MIR663AHG 食管鳞癌差异表达mrna 哈萨克族新疆

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