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SLE及IDDM患者外周血单个核细胞中基因表达差异的研究

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中国免疫学杂志 2002年第10期18卷 720-723页

作者：王静钱冬萌高美华李文利王斌青岛大学医学院免疫学教研室青岛266021 青岛大学医学院山东省分子病毒重点实验室青岛266021

目的 :了解系统性红斑狼疮 (Systemiclupuserythematosus,SLE)和胰岛素依赖型糖尿病 (insulindependentdiabetesmellitusdisease,IDDM)外周血单个核细胞 (PBMC)的基因表达概况 ,为探讨这些基因表达的差异与该 2种疾病的关系奠定基础。方... 详细信息

目的 :了解系统性红斑狼疮 (Systemiclupuserythematosus,SLE)和胰岛素依赖型糖尿病 (insulindependentdiabetesmellitusdisease,IDDM)外周血单个核细胞 (PBMC)的基因表达概况 ,为探讨这些基因表达的差异与该 2种疾病的关系奠定基础。方法 :以分别来自SLE和IDDM患者的PBMCpolyA+ RNA为模板逆转录合成cDNA表达探针 ,与AtlascDNA表达阵列膜进行差异杂交。结果 :放射自显影结果显示在SLE疾病所分析的 1176种已知基因中 ,有表达差异的 376个 ,其中表达上调差异率大于 3的 8个 ,表达下调差异率大于 6的 6个 ;在IDDM疾病所分析的 1176种已知基因中 ,有表达差异的 5 5 8个 ,其中表达上调差异率大于 6的 13个 ,表达下调差异率大于 6的 3个。与细胞的分化增殖、粘附与信号转导、凋亡、转录与调控及DNA损伤修复等相关的基因表达水平发生了明显的改变。结论 :AtlascDNA表达阵列差异杂交分析为初步了解SLE及IDDN患者PBMC的基因表达概况 ,进而了解基因表达差异在疾病发生发展中的作用提供了一个较好的方法。

关键词： SLE IDDM 系统性红斑狼疮胰岛素依赖型糖尿病基因表达谱差异杂交 Atlas cDNA表达阵列

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草菇cDNA削减文库的构建

南京师大学报（自然科学版） 2005年第4期28卷 73-76页

作者：李迅邵蔚蓝江南大学工业生物技术教育部重点实验室江苏无锡214036

介绍一种改进的利用差异杂交和定向插入构建全长cDNA削减文库的方法.分别以诱导和非诱导条件培养草菇菌丝,两者都提取总RNA并采用PolyATtract mRNA Isolation System III试剂盒快速提取mRNA,由PowerScriptTM Reverse Transcriptase将诱... 详细信息

介绍一种改进的利用差异杂交和定向插入构建全长cDNA削减文库的方法.分别以诱导和非诱导条件培养草菇菌丝,两者都提取总RNA并采用PolyATtract mRNA Isolation System III试剂盒快速提取mRNA,由PowerScriptTM Reverse Transcriptase将诱导菌丝提取的mRNA进一步逆转录成cDNA第一链,用得到的cDNA第一链和非诱导菌丝提取的mRNA进行杂交,将未杂交上的cDNA第一链洗脱浓缩后,用SMARTTM cDNA Library Construction 试剂盒构建成草菇cDNA削减文库.经检测:原始文库滴度为2.5×105 pfu/mL,重组率为93%,插入cDNA大小在0.5～4.0 kb之间,文库扩增后,文库滴度为1.1×109 pfu/mL,并从中克隆到了若干植物纤维降解酶.结果表明其简化了实验步骤,而且更有利于富集所需全长基因,是构建cDNA文库的一种有效改进.

关键词：滴度重组率差异杂交 PCR

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正常脾脏与肝硬化脾脏组织基因表达概况分析

中华肝胆外科杂志 2002年第1期8卷 37-41页

作者：刘连新朱安龙赵金朋许军王秀琴刘芝华姜洪池吴旻哈尔滨医科大学第一临床医学院普通外科哈尔滨市150001 中国医学科学院中国协和医科大学肿瘤研究所肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室北京市100021

目的　了解正常脾脏与肝硬化脾脏的基因表达概况 ,寻找在两者之间的差异表达基因。方法　以正常脾脏及肝硬化脾脏组织的总RNA反转录合成含有α 3 2 PdATP的cDNA为探针 ,与Atlas微阵列表达分析膜进行差异杂交。结果　放射自显影结果经Atl... 详细信息

目的　了解正常脾脏与肝硬化脾脏的基因表达概况 ,寻找在两者之间的差异表达基因。方法　以正常脾脏及肝硬化脾脏组织的总RNA反转录合成含有α 3 2 PdATP的cDNA为探针 ,与Atlas微阵列表达分析膜进行差异杂交。结果　放射自显影结果经AtlasImageTM 软件分析显示 :在所分析的 5 88种已知基因中 ,CK8、ICE LAP6、PISSLARE等 32个在肝硬化脾脏组织中表达上调 ,byglycan、Caspase 10、CRAF 1等 45个表达下调 ,参与细胞增殖、凋亡、分化、细胞间相互作用 ,与细胞侵袭相关的基因表达水平发生了明显改变。结论　通过Atlas微阵列系统分析发现的这些基因的表达改变组成了一个不同情况下脾脏特异的基因表达谱 ,是人类首次全面系统地研究脾脏的基因表达改变 ,一些与脾脏变化有关的差异表达基因 ,对彻底了解脾脏在肝硬化过程中的变化及其所发挥的作用有重要的意义。Atlas微阵列技术的应用将为人类了解疾病的发生、发展过程提供一个较好的方法。

关键词：基因表达谱脾脏差异杂交 Atlas微阵列肝硬化实验研究

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微阵列分析肝癌组织中的整合素

中华肝胆外科杂志 2001年第11期7卷 677-680页

作者：刘连新朱安龙曲欣刘芝华王秀琴姜洪池吴旻哈尔滨医科大学第一临床医学院普通外科哈尔滨市150001 中国医学科学院中国协和医科大学肿瘤研究所分子肿瘤学国家重点实验室北京100021

目的了解肝癌中整合素的表达概况,探寻在肝癌及正常肝组织中的表达差异。方法以肝癌及癌旁正常肝组织的总 RNA 反转录合成含有α^(32)P dATP 的 cDNA 为探针,与 Atlas 微阵列表达分析膜进行差异杂交,并应用半定量 RT-PCR 验证。结果放... 详细信息

目的了解肝癌中整合素的表达概况,探寻在肝癌及正常肝组织中的表达差异。方法以肝癌及癌旁正常肝组织的总 RNA 反转录合成含有α^(32)P dATP 的 cDNA 为探针,与 Atlas 微阵列表达分析膜进行差异杂交,并应用半定量 RT-PCR 验证。结果放射自显影结果经 AtlasImage^(TM)软件分析显示:在所分析的588种已知基因中,整合素相关的基因共有17个,其中 integrin alpha8、betal、beta7、beta8等4个在肝癌组织中表达上调。结论通过 Atlas 微阵列系统分析发现的这些基因的表达改变组成了一个肝癌特异的基因表达谱,是人类首次全面系统地研究肝癌的基因表达改变,整合素基因的差异表达为研究肝癌的侵袭、粘连和转移机制提供了有益的线索。

关键词：肝细胞癌基因表达谱差异杂交 Atlas微陈列整合素逆转录聚合酶链反应

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食管癌及癌旁组织中基因表达的初步研究

中华医学遗传学杂志 1999年第5期16卷 303-306页

作者：周津刘芝华王秀琴周传农赵峻张汝刚吴晣中国医学科学院肿瘤研究所细胞生物室分子肿瘤学国家重点实验室北京100021 中国医学科学院北京100021

目的　了解食管癌的基因表达概况，寻找在食管癌及癌旁组织中差异表达基因。方法　以癌及癌旁组织ｐｏｌｙＡ＋ＲＮＡ反转录合成的ｃＤＮＡ为探针，与Ａｔｌａｓ微点阵表达分析膜进行差异杂交。结果放射自显影结果显示在所... 详细信息

目的　了解食管癌的基因表达概况，寻找在食管癌及癌旁组织中差异表达基因。方法　以癌及癌旁组织ｐｏｌｙＡ＋ＲＮＡ反转录合成的ｃＤＮＡ为探针，与Ａｔｌａｓ微点阵表达分析膜进行差异杂交。结果放射自显影结果显示在所分析的５８８种已知基因中，ｃｄｃ２５Ｂ、ＭＭＰ、ＭＥＴ等６１个在食管癌组织中表达上调，ｃｙｔｏｋｅｒａｔｉｎ４、ＢＡＤ、ＩＬ１ＲＥＣＥＰＴＯＲＡＮＴＡＧＯＮＩＳＴ、ＩＬ６等２２个表达下调，参与细胞增殖、凋亡、分化和转移调控的多种基因的表达水平发生了明显改变。结论　这些基因的表达改变组成了一个食管癌特异的基因表达谱，首次为食管癌细胞的恶性表型提供了分子遗传学参考数据，一些与肿瘤发生相关的差异表达基因为发展生物标记物或肿瘤早期诊断和治疗提供了线索。Ａｔｌａｓ微点阵表达分析滤膜的差异杂交为初步了解某一组织或细胞的表达状况提供了一个较好的方法。

关键词：食管癌基因表达差异杂交癌旁组织

用cDNA微阵列技术快速筛选粗毛栓菌的表达基因

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用cDNA微阵列技术快速筛选粗毛栓菌的表达基因

中国遗传学会第七次代表大会暨学术讨论会

作者：孙迅江明锋李校张义正四川大学生命科学学院四川省分子生物学及生物技术重点实验室

粗毛栓菌(Trametes gallica)是一种寄生于杨木上且具有较强降解木质纤维素能力的白腐菌。利用比较遗传学方法研究该菌的次生代谢机制和遗传组成具有重要意义。目前的cDNA微阵列技术已经能够用来有效和高通量地分析生物体内基因的差异表... 详细信息

粗毛栓菌(Trametes gallica)是一种寄生于杨木上且具有较强降解木质纤维素能力的白腐菌。利用比较遗传学方法研究该菌的次生代谢机制和遗传组成具有重要意义。目前的cDNA微阵列技术已经能够用来有效和高通量地分析生物体内基因的差异表达。本研究试图利用cDNA微阵列技术快速筛选粗毛栓菌的表达基因,所用cDNA芯片来自另一种用于研究木质纤维素生物降解系统的模式菌株——黄孢原毛平革菌(Phanerochaete chrysosporium)。结果显示,两种白腐菌具有一些相似的cDNA序列的基因。

关键词：粗毛栓菌黄孢原毛平革菌基因芯片差异杂交次生代谢

来源： cnki会议评论

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植物功能基因组研究策略

植物功能基因组研究策略