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小麦属G组染色体编码的高分子量谷蛋白亚基多态性

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中国农业大学学报 2002年第3期7卷 33-37页

作者：李保云尤明山梁荣奇张义荣刘广田中国农业大学作物学院北京100094 北京市农林科学院北京100089

用 SDS- PAGE和 PCR扩增方法对提莫菲维小麦和阿拉拉特小麦 G组染色体编码的高分子量谷蛋白亚基 (HMW- GS)的多态性进行了研究。无论从蛋白质水平还是从 DNA水平来看 ,G组染色体编码的HMW- GS都存在遗传多样性 ,1 5个供试材料表现出 8... 详细信息

用 SDS- PAGE和 PCR扩增方法对提莫菲维小麦和阿拉拉特小麦 G组染色体编码的高分子量谷蛋白亚基 (HMW- GS)的多态性进行了研究。无论从蛋白质水平还是从 DNA水平来看 ,G组染色体编码的HMW- GS都存在遗传多样性 ,1 5个供试材料表现出 8种带型 ,并与普通小麦和硬粒小麦的 HMW- GS不同 ,为了研究 G组染色体编码的 HMW- GS与小麦品质的关系 ;利用普通小麦的 Glu- 1 Y位点中部重复结构区的保守序列设计的 2个特异性引物对 G组染色体进行 PCR扩增可以鉴别 Glu- 1 G位点的等位基因变异 ,且与SDS-

关键词：提莫菲维小麦阿拉拉特小麦 G组染色体高分子量谷蛋白亚基 HMW-GS Glu-1Y位点 Glu-1G位点多态性小麦属

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小麦属与簇毛麦属一人工杂交新类群

西北植物学报 1990年第1期10卷 67-69页

作者：傅杰陈漱阳西北植物研究所陕西杨陵712100

小簇毛麦属(新杂交属) X Tritihaynaldia J. Fu et S. Y. Chen nothogen. nov. 本新杂交属系小麦属与簇毛麦属人工杂交形成的一新类群。新杂交属与小麦属的主要区别为叶面和叶缘疏生柔毛,叶鞘及其边缘有纤毛;穗轴棱上有柔毛,上半部穗轴... 详细信息

小簇毛麦属(新杂交属) X Tritihaynaldia J. Fu et S. Y. Chen nothogen. nov. 本新杂交属系小麦属与簇毛麦属人工杂交形成的一新类群。新杂交属与小麦属的主要区别为叶面和叶缘疏生柔毛,叶鞘及其边缘有纤毛;穗轴棱上有柔毛,上半部穗轴节易断,节部密生柔毛;颖革质,具隆起3—4脉,脉上有短硬毛或茸毛,背具锐脊,脊上着生硬毛或纤毛,长2—3毫米。芽鞘紫红色。染色体组型中增加了V组染色体。

关键词：小麦属簇毛麦属杂交新类群

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小麦属的分类研究

西北植物学报 1991年第3期11卷 212-224页

作者：蔡联炳张树源李健华中国科学院西北高原生物研究所西宁810001

本文通过小麦属植物的栽培实验观察,对小麦属外部形态、叶表皮,花粉及淀粉粒的性状进行了分类价值的评价和演化趋势的探讨,从而在前人研究的基础上将该属修订处理为3组15种,即线穗组含2种,扁穗组含3种,柱穗组含10种。过去形态划分中的... 详细信息

本文通过小麦属植物的栽培实验观察,对小麦属外部形态、叶表皮,花粉及淀粉粒的性状进行了分类价值的评价和演化趋势的探讨,从而在前人研究的基础上将该属修订处理为3组15种,即线穗组含2种,扁穗组含3种,柱穗组含10种。过去形态划分中的一些种如茹科夫斯基小麦、科尔希二粒小麦、野生二粒小麦、东方小麦和瓦维洛夫小麦等分别以新组合或新等级的形式归并到相应的种类中。

关键词：小麦属分类

小麦属Xa 21-类似蛋白激酶基因的克隆及与同源位点序列比较

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河南农业大学学报 2007年第5期41卷 475-479页

作者：牛吉山刘瑞王林海郑磊河南农业大学国家小麦工程技术研究中心河南郑州450002 安阳市农业科学研究所河南安阳455000

对小麦属Xa21-类似蛋白激酶基因进行了克隆及与同源序列比较研究.在小麦(Triticum aestivum)高分子量麦谷蛋白基因位点附近有一个编码LRR-类受体蛋白激酶的基因位点(暂标记为TaXa),编码蛋白与水稻(O ryza sativa)抗病蛋白Xa 21类似.通... 详细信息

对小麦属Xa21-类似蛋白激酶基因进行了克隆及与同源序列比较研究.在小麦(Triticum aestivum)高分子量麦谷蛋白基因位点附近有一个编码LRR-类受体蛋白激酶的基因位点(暂标记为TaXa),编码蛋白与水稻(O ryza sativa)抗病蛋白Xa 21类似.通过反转录PCR途径,从普通小麦和二粒小麦(Triticum turgidum)的TaXa同源位点分离了3个cDNA克隆,ZS 860(GenBank查询号:EF 394367),ZS 2000(GenBank查询号:EF 394368)和ZS 2001(GenBank查询号:EF 394369).TaXa位点的祖先基因可能编码1 028个氨基酸组成的多肽.一个完整的TaXa蛋白包括N-端保守区、LRR结构域、一个跨膜区和位于C—端的丝氨酸—苏氨酸蛋白激酶功能域.在基因进化过程中,由于碱基代换、缺失和插入导致了开放读码框的改变,使该位点基因的编码多肽缩短.本研究对小麦属TaXa同源位点编码氨基酸序列和1个大麦(Hordeum vulgare)中的同源蛋白进行了详细比较.

关键词：小麦属富亮氨酸重复(LRR) 类受体蛋白激酶

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小麦属与山羊草属的细胞质变异

国外农学（麦类作物） 1990年第3期 1-8页

作者：常胁恒一郎杨天章

本文是关于小麦属和山羊草属细胞质变异最近研究的评述,包括引入异源细胞质对各种小麦性状的遗传效应和小麦与异源细胞质所分离的细胞器DNA之间的分子差异两方面的内容。虽然有关线粒体的变异还了解得很少,但这两个属细胞质变异的全貌... 详细信息

本文是关于小麦属和山羊草属细胞质变异最近研究的评述,包括引入异源细胞质对各种小麦性状的遗传效应和小麦与异源细胞质所分离的细胞器DNA之间的分子差异两方面的内容。虽然有关线粒体的变异还了解得很少,但这两个属细胞质变异的全貌、胞质基因组和质体基因组的进化途径,已在很大程度上得到了阐明。同时,本文还指出了具有异源细胞质的普通小麦对育种有用的一些性状。

关键词：小麦属细胞质变异

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小麦属叶绿体基因组生物信息学分析

小麦属叶绿体基因组生物信息学分析

作者：李裕华山西大学

学位级别：硕士

小麦（Trticum aestivum L.）是我国主要的粮食作物,也是世界上最重要的谷物之一。随着环境变化和生活水平的提高,人们对小麦的产量和品质有了更高的要求。偃麦草属植物（Thinopyrum spp.）和山羊草属植物（Aegilops Linn.）是小麦的近... 详细信息

小麦（Trticum aestivum L.）是我国主要的粮食作物,也是世界上最重要的谷物之一。随着环境变化和生活水平的提高,人们对小麦的产量和品质有了更高的要求。偃麦草属植物（Thinopyrum spp.）和山羊草属植物（Aegilops Linn.）是小麦的近缘物种,同小麦属植物一样,一直以来都被视为小麦遗传改良的资源库。叶绿体是植物细胞所特有的细胞器,是光合作用的主要场所。叶绿体拥有独立的核外基因组,编码与自身功能相关的部分基因,具有半自主性。叶绿体基因组（chloroplast DNA,cp DNA）中含有大量功能基因,其在物种鉴定及系统进化研究中的应用价值已经受到研究者们的广泛关注和逐步认可。由于高通量测序技术的迅速发展,小麦属植物的叶绿体基因组不断被测序,由此产生了大量数据信息。本研究以小麦及其近缘种共17个物种的叶绿体全基因组序列为研究对象,揭示其结构特征,对其重复序列进行统计分析,同时通过比较基因组学的方法分析其反向重复区（Invert repeat,IR）边界、差异热点区和共线性。随后我们分析了小麦属12个种的叶绿体基因组密码子偏好性,揭示了影响其密码子偏好性的主要因素,为小麦属植物叶绿体基因组的进化遗传学和叶绿体基因工程研究奠定基础。主要研究结果如下:（1）小麦属叶绿体基因组均为双链环状四分体结构,长度在135835-136157bp之间,编码121-133个基因,其中32-39个t RNA,4个r RNA。GC含量均接近于38.3%。在小麦及其近缘种属共17个种的叶绿体基因组中,检测到串联重复序列27-39个,散在重复序列45-57个,统计到的简单重复序列总次数在1110-1251。（2）通过比较基因组学研究发现,硬粒小麦在进化过程中,叶绿体基因组IR边界发生了收缩;小麦属叶绿体基因组的差异热点区主要集中在非编码区,编码区分布较少,说明编码区较为保守;共线性分析发现禾本科物种内的基因组结构及基因排列顺序基本一致,呈线性化排列,禾本科物种叶绿体基因组结构相对于双子叶植物烟草、拟南芥、棉花在LSC存在两个明显的倒位片段以及一个小片段移位。（3）小麦属12个物种的叶绿体基因相对同义密码子使用度（Relative synonymous codon usage,RSCU）分析结果显示,使用频率较高的密码子大多为NNA和NNT,即这些物种编码叶绿体基因的密码子末端碱基大多为AT。（4）有效密码子数（Effective number of codons,ENC）绘图分析结果显示大部分基因位于预测曲线以下;奇偶偏好（Parity Rule 2,PR2）绘图分析结果显示,小麦属植物的叶绿体基因组中密码子的第三位显示出T/C偏差;中性绘图的斜率表示突变压力仅占12.45%～30.55%,表明突变压力对密码子使用偏好性的影响较小。（5）对应性分析结果表明ENC和密码子适应指数（codon adaptation index,CAI）是影响小麦属对应性分析结果中轴1的主要影响因素,推断出基因表达水平对小麦属密码子偏好性存在影响。

关键词：小麦属叶绿体基因组生物信息学密码子偏好性

小麦属和山羊草属Waxy基因5’端非编码区序列变异分析

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小麦属和山羊草属Waxy基因5’端非编码区序列变异分析

作者：高震四川农业大学

学位级别：硕士

利用特异性引物,采用PCR克隆从33份小麦属(Triticum L.)和山羊草属(Aegilops L.)材料中共克隆得到39条Waxy基因5,端非编码区(5’UTR)序列。同时,结合NCBI中已知的42条小麦近缘种属Waxy基因序列和8条来自大麦、水稻、玉米、马铃薯和拟南... 详细信息

利用特异性引物,采用PCR克隆从33份小麦属(Triticum L.)和山羊草属(Aegilops L.)材料中共克隆得到39条Waxy基因5,端非编码区(5’UTR)序列。同时,结合NCBI中已知的42条小麦近缘种属Waxy基因序列和8条来自大麦、水稻、玉米、马铃薯和拟南芥中Waxy基因序列,对所得序列的酶切位点、插入缺失片段、重复序列和上游开放阅读框序歹(?)(uORFs)的多态性等进行了分析,并采用聚类分析和系统进化分析分别考察了种属间、序列类型间和序列间的关系,以期深入了解小麦属和山羊草属Waxy基因5,端的变异,为进一步了解Waxy基因的功能和调节机制,以及利用小麦属和山羊草属基因资源奠定基础。主要研究结果如下： 1、在小麦属和山羊草属二倍体及小麦属四倍体(AABB)材料中,Waxy基因5,端非编码区特异引物仅能扩增获得单一条带,而在小麦属六倍体(AABBDD)中可扩增获得两条条带;对所有条带回收、克隆测序,共获得39条序列,其中来源于染色体7D位点的序列较7A和4A位点的序列更长;基于序列差异,可将四倍体和六倍体材料中的Waxy基因5,端非编码区序列分为染色体组是/ABB的四倍体A型、B型、染色体组是AABBDD的六倍体Ⅰ型、Ⅱ型、染色体组是(AAGG或AAAAGG)的GⅠ型和GⅡ型共6大类。 2、在小麦属和山羊草属序列中,共包含有170个单核苷酸突变位点和484个多态性位点;同时具有丰富的插入缺失变异,平均插入缺失(Indels)长度为8.5bp;所有序列均在未端处含有一个Pst Ⅰ酶切位点,而在序列的中心区域250bp-350bp范围内具有丰富的限制性内切酶位点变异,其酶切位点及分布与大麦、玉米和水稻有相似处,而与双子叶植物拟南芥和马铃薯有较大差异。序列间存在简单重复序列“GAA”和"CTGA"重复变异;共检测得到65个上游开放阅读框,可归为37类,序列长度为66bp-546bp,而uORFs类型间的不同主要是由单核苷酸多态性(SNPs, Single Nucleotide Polymorphisms)(?)口插入缺失所造成的。 3、序列间限制性内切酶位点、插入缺失和上游开放阅读框的比较表明,Ⅰ型序列与来自于粗山羊草(Ae. tauschii)的序列高度相似,而Ⅱ型序列与B型更相似,且两者均与相似来自高大山羊草(Ae. Longissima)的序列;A型序列与来自拟斯卑尔脱山羊草(Ae. speltoides)的序列更相似。通过与从二倍体材料中获得的序列相比较,发现四倍体和六倍体材料Waxy基因5’UTR中仍然保存着其各自祖先种的特征区域。 4、基于序列类型间的聚类表明,一粒系的野生一粒、栽培一粒和乌拉尔图小麦聚为一类,且野生一粒和栽培一粒亲缘关系较近;粗山羊草和Ⅰ型序列聚在一起,GⅡ型、高大山羊草、B型序列和Ⅱ型序列被聚类在一起,而拟斯卑尔脱山羊草和A型序列聚为一类。此外,不同种属间聚类分析表明小麦属四倍体不同物种与六倍体物种的亲缘关系存在较大差异,推测只有部分四倍体物种参与了六倍体的生成。乌拉尔图小麦(T. urartu)的祖先种材料可能参与了提莫菲维系(AAGG,AAAAGG)的形成与进化过程;粗山羊草(Ae. tauschii)、高大山羊草(Ae. Longissima)和拟斯卑尔脱山羊草(Ae. speltoides)的祖先种材料均参与了普通小麦(AABBDD)的形成与进化过程,且高大山羊草(Ae. Longissima)比拟斯卑尔脱山羊草(Ae. speltoides)在较晚的时期参与该进化过程。NCBI中所有Waxy基因5,端非编码区进行BLAST聚类分析,玉米和水稻的序列相似度较高,分别聚为一类,来自小麦族的Waxy基因序列差异较大被聚类为多个大类,其中一粒系小麦序列聚为一类,且与高粱和部分玉米的序列较近;四倍体小麦、六倍体小麦和山羊草属Waxy基因5,端序列和小麦属Waxy基因序列聚为一大类;另外,来自大麦属Waxy基因序列聚为一类,且与部分山羊草属Waxy基因序列亲缘关系较近。

关键词：小麦属山羊草属 Waxy基因 5’UTR Indels uORFs 限制性内切酶位点

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ACGM标记在小麦属中的通用性

麦类作物学报 2006年第5期26卷 16-19页

作者：卢泳全吴为人浙江大学农业与生物技术学院浙江杭州310029

为检验水稻基因组数据在小麦属中的通用性,利用基于水稻基因组数据设计的扩增共有序列遗传标记(ACGM)扩增小麦属12种不同材料,结果有32对引物可以至少在1种小麦属材料中获得扩增产物,占引物总数的80%;在能够获得特异性产物的32对引物中,... 详细信息

为检验水稻基因组数据在小麦属中的通用性,利用基于水稻基因组数据设计的扩增共有序列遗传标记(ACGM)扩增小麦属12种不同材料,结果有32对引物可以至少在1种小麦属材料中获得扩增产物,占引物总数的80%;在能够获得特异性产物的32对引物中,有4对引物的产物在供试材料之间没有多态性位点;有28对引物可以在供试小麦材料之间获得多态产物,占引物总数的70%。这表明以水稻基因组序列开发的ACGM标记在小麦中有一定的通用性。

关键词：小麦属 ACGM标记扩增

根据叶表皮微形态特征探讨山羊草属基因在小麦属中的渗入Ⅰ．组间途径

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西北植物学报 1995年第1期15卷 40-47页

作者：蔡联炳中国科学院西北高原生物研究所

解剖观察了小麦属３个组、山羊草属６个组的叶片远轴面表皮，并根据表皮上长细胞、短细胞、气孔器细胞、刺毛和大毛在各个类群中形态、数量和分布式样的差异，从组群角度对山羊草属基因在小麦属中的渗入进行了分析。结果表明：小麦属中... 详细信息

解剖观察了小麦属３个组、山羊草属６个组的叶片远轴面表皮，并根据表皮上长细胞、短细胞、气孔器细胞、刺毛和大毛在各个类群中形态、数量和分布式样的差异，从组群角度对山羊草属基因在小麦属中的渗入进行了分析。结果表明：小麦属中除线穗组无山羊草属基因侵入外，其余扁穗组和柱穗组皆为山羊草属基因可能的受体类群；山羊草属中除无芒山羊草组、顶芒山羊草组和小伞山羊草组无基因输出外，拟斯卑尔脱组和节节麦组均有基因进入小麦属，其中拟斯卑尔脱组基因最大可能进入扁穗组，节节麦组基因最大可能进入柱穗组；柱穗山羊草组的表皮结构较特殊，它是否为山羊草属基因的供体类群值得进一步研究。

关键词：小麦属山羊草属叶表皮特征基因渗入禾本科