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云南横断山中部山区小型兽类感染巴贝虫的分子流行病学调查

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中国寄生虫学与寄生虫病杂志 2021年第2期39卷 278-282页

作者：王帆别双双张云宋静段兴德熊孟韬王剑江佳富高子厚董毅杜春红大理大学公共卫生学院大理671000 云南省地方病防治所大理671000 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

为了解云南省横断山中部山区小型兽类感染巴贝虫的情况,分别于2013、2016和2020年在云南省横断山中部山区的剑川、云龙和洱源等3个县,采用笼日法和夹线法捕获小型兽类。通过形态学进行种类鉴定,并取脾组织,提取巴贝虫DNA,巢式PCR扩增巴... 详细信息

为了解云南省横断山中部山区小型兽类感染巴贝虫的情况,分别于2013、2016和2020年在云南省横断山中部山区的剑川、云龙和洱源等3个县,采用笼日法和夹线法捕获小型兽类。通过形态学进行种类鉴定,并取脾组织,提取巴贝虫DNA,巢式PCR扩增巴贝虫18S r RNA基因片段,目的条带经双向测序后,进行同源性分析,采用Neighbor-Joining法构建系统进化发育树。共捕获小型兽类498只,通过形态学鉴定,分属于4目8科14属27种,主要优势鼠种有齐氏姬鼠、中华姬鼠和大绒鼠,共有55份样品扩增出巴贝虫18S r RNA基因片段,总阳性率为11%(55/498)。剑川县、云龙县和洱源县的小型兽类巴贝虫阳性率分别为0.5%(1/212)、31.6%(54/171)和0(0/115)。巴贝虫阳性检出率比较高的小兽为:大耳姬鼠11/17,滇绒鼠5/10,印度长尾鼩鼱2/4。BLAST比对结果表明,本次检出的样品序列具有高度同源性,相似性达99.6%,属于田鼠巴贝虫的大津(Otsu)型。云南省横断山中部山区小型兽类存在巴贝虫感染,属于田鼠巴贝虫的Otsu型。

关键词：云南横断山区小型兽类巴贝虫调查

四川老君山国家级自然保护区小型兽类调查及优势种遗传多样性分析

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四川动物 2022年第5期41卷 595-600页

作者：乔陆杨宇尚可王磊李凤君何松李健岳碧松四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室成都610065 四川省屏山县老君山国家级自然保护区管理局四川宜宾645353

2020年6—10月在四川老君山国家级自然保护区放置鼠夹8000夹次,共捕获小型兽类个体339只,隶属3目4科11属16种,主要来自阔叶林。结合文献记录,保护区共记录小型兽类32种,新记录6种。本次调查的优势种为北社鼠Niviventer confucianus、黑... 详细信息

2020年6—10月在四川老君山国家级自然保护区放置鼠夹8000夹次,共捕获小型兽类个体339只,隶属3目4科11属16种,主要来自阔叶林。结合文献记录,保护区共记录小型兽类32种,新记录6种。本次调查的优势种为北社鼠Niviventer confucianus、黑姬鼠Apodemus nigrus、四川短尾鼩Anourosorex squamipes和大绒鼠Eothenomys miletus。线粒体基因组细胞色素b基因序列遗传多样性分析发现,北社鼠和四川短尾鼩的遗传多样性较高,单倍型多样性、核苷酸多样性分别为0.775、0.01698和0.916、0.09082。本研究为保护区小型兽类的深入研究提供了重要的基础资料。

关键词：老君山国家级自然保护区小型兽类物种多样性遗传多样性

东喜马拉雅勒布沟非飞行小型兽类物种多样性垂直分布格局

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兽类学报 2020年第5期40卷 493-502页

作者：王作波胡一鸣周智鑫梁健超黄志文郑舒旸周江胡慧建贵州师范大学生命科学学院贵阳550001 广东省科学院动物研究所广东省动物保护与资源利用重点实验室广东省野生动物保护与利用公共实验室广州510260 南方科技大学环境科学与工程学院深圳518000

物种多样性沿海拔梯度的垂直分布格局在生物多样性研究与保护中受到广泛关注,中峰格局是物种多样性垂直分布四类格局中最为普遍的格局。中喜马拉雅沟谷的研究表明,小型兽类的垂直分布格局符合中峰模型。中喜马拉雅和东喜马拉雅具有相似... 详细信息

物种多样性沿海拔梯度的垂直分布格局在生物多样性研究与保护中受到广泛关注,中峰格局是物种多样性垂直分布四类格局中最为普遍的格局。中喜马拉雅沟谷的研究表明,小型兽类的垂直分布格局符合中峰模型。中喜马拉雅和东喜马拉雅具有相似的自然地理和气候条件,由此,推断东喜马拉雅沟谷的小型兽类垂直分布格局可能也符合中峰格局。为此,在东喜马拉雅勒布沟对非飞行小型兽类开展实地调查,选取研究海拔范围为2300~5000 m,沿海拔梯度连续设置9个300 m海拔段45个样方采集点,累计布夹16200次,共采集标本372号,分属3目5科10种。研究结果显示:该沟谷非飞行小型兽类物种丰富度在2600~2900 m海拔段出现峰值,随后随着海拔的升高递减,即从最低海拔到中海拔段上升至峰值后开始递减至趋于平缓,即显示出中峰格局特点。喜马拉雅山脉东西走向导致其南翼各沟谷拥有相似的地理和气候特征,如各沟谷都南北走向,受印度洋暖流气候影响,拥有相似的植被垂直带分布等,这使得非飞行小型兽类物种多样性垂直分布呈现出相似的特点,推论:在大尺度背景下,地理和气候条件可能是影响物种多样性垂直分布格局的关键因素。

关键词：喜马拉雅勒布沟小型兽类物种多样性垂直分布海拔梯度

云南省孟连县边境地区小型兽类及其寄生蚤种类组成和分布调查

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中国媒介生物学及控制杂志 2022年第3期33卷 366-370页

作者：浦恩念段兴德冯志刚刘正祥蔡文凤王剑秦媛李豪唐永泉邵宗体云南省地方病防治所云南省鼠疫防治研究中心云南省自然疫源性疾病防控技术重点实验室云南大理671000 孟连傣族拉祜族佤族自治县疾病预防控制中心云南孟连665800 普洱市疾病预防控制中心云南普洱665000

目的了解云南省孟连傣族拉祜族佤族自治县(孟连县)边境地区小型兽类及其寄生蚤的物种构成、数量分布等情况,为媒介生物传染病监测和防控提供基础数据。方法2020年11月,在孟连县的2个边境乡镇利用笼捕法和夹夜法在居民区、农耕区和林区... 详细信息

目的了解云南省孟连傣族拉祜族佤族自治县(孟连县)边境地区小型兽类及其寄生蚤的物种构成、数量分布等情况,为媒介生物传染病监测和防控提供基础数据。方法2020年11月,在孟连县的2个边境乡镇利用笼捕法和夹夜法在居民区、农耕区和林区调查小型兽类的物种构成及密度,收集小型兽类体表寄生蚤,计算染蚤率和蚤指数。采用生态学方法分析小型兽类的构成和分布,采用β多样性指数进行群落相似性分析,不同生境之间的捕获率比较用χ^(2)检验。结果共捕获小型兽类313只,隶属于3目4科9属15种。黄胸鼠、黑缘齿鼠和臭鼩为优势种,分别占47.60%、20.13%和10.86%。居民区捕获率为3.25%,以黄胸鼠(97.44%)捕获较多;农耕区和林区的优势种均为黄胸鼠、黑缘齿鼠和臭鼩,小型兽类的群落相似性系数为0.80,小型兽类群落相似程度较高,捕获率分别为18.42%和19.20%,差异无统计学意义(χ^(2)=0.146,P=0.703)。共获蚤99匹,隶属于1目4科7属7种,平均蚤指数为0.32,印鼠客蚤和偏远古蚤为优势种,分别占69.70%和20.20%。结论云南省孟连县边境地区鼠疫主要宿主和媒介蚤分布广泛,部分地区小型兽类捕获率及其体表蚤指数较高,建议持续开展相关监测,并对鼠、蚤密度较高的地区开展预防性灭鼠、灭蚤,降低鼠传疾病风险。

关键词：小型兽类寄生蚤云南省

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九龙贡嘎山地栖小型兽类空间分布格局

九龙贡嘎山地栖小型兽类空间分布格局

作者：周恩华西华师范大学

学位级别：硕士

区域物种多样性及其空间分布格局是进行生物多样性保护与管理的重要基础。小型兽类作为影响生物多样性的重要因素,在维持生态系统的结构和功能等方面起着不可替代的作用。贡嘎山地处我国西南山地,各类珍稀动植物种类繁多,具有极高的生... 详细信息

区域物种多样性及其空间分布格局是进行生物多样性保护与管理的重要基础。小型兽类作为影响生物多样性的重要因素,在维持生态系统的结构和功能等方面起着不可替代的作用。贡嘎山地处我国西南山地,各类珍稀动植物种类繁多,具有极高的生物多样性科研价值。迄今为止,九龙县贡嘎山区域地栖小型兽类(以下简称小型兽类)的研究相当匮乏,为进一步了解该区域小型兽类的多样性信息,本研究采用铗日法于2019年7月至2021年8月分别对九龙贡嘎山东、西坡海拔1 700～4 500 m和3 100～4 700 m段的小型兽类群落组成及多样性进行了调查,按照400 m海拔梯度设置样方。东坡:54个样方,铗日数13 816个;西坡:38个样方,铗日数9 306个。通过对区域内小型兽类的物种、功能和系统发育多样性的综合分析,可以更好地理解其空间分布格局。主要研究结果如下:(1)小型兽类组成:九龙贡嘎山共捕获478只小型兽类,隶属3目6科13属26种。列入中国生物多样性红色名录的濒危物种(EN)1种,即滇攀鼠(Vernaya fulva),中国特有种13种。东坡共捕获286只小型兽类,隶属3目5科11属22种,中国特有种12种,大耳姬鼠(Apodemus latronum)为优势种,占总捕获数的17.48%。西坡共捕获192只小型兽类,隶属3目6科11属15种,中国特有种7种,大耳姬鼠和高原松田鼠(Neodon irene)为优势种,分别占总捕获数的30.73%和15.63%。纹背鼩鼱(Sorex cylindricauda)、川西鼠兔(Ochotona gloveri)、川西缺齿鼩鼱(Chodsigoa hypsibia)、陕西鼩鼱(Sorex sinalis)和川鼩(Blarinella quadraticauda)为九龙贡嘎山区域新纪录种。(2)小型兽类物种多样性垂直(海拔)分布格局:运用观察物种丰富度,稀疏化物种丰富度,Chao2丰富度及Jackknife2丰富度对小型兽类物种丰富度的垂直分布格局进行评价与研究:东、西坡结果较为一致,均为左偏倚的分布格局,其中,东坡在海拔2 500～3 300 m梯度物种丰富度最高,西坡在海拔3 500～3 900 m梯度物种丰富度出现峰值;利用Shannon-Wiener、Simpson、Margalef多样性指数和Pielou均匀度指数对小型兽类物种多样性指数的垂直分布格局进行了评估研究:东坡Shannon-Wiener、Simpson和Margalef多样性指数计算结果呈左偏倚分布模式,在2 500～2 900 m的梯度上达到高峰,但是Pielou均匀度指数随着海拔的增加没有显著变化。西坡亦呈左偏倚分布格局,Shannon-Wiener多样性指数与Margalef多样性指数在3 500～3 900 m梯度上达到高峰,而Pielou均匀度指数与Simpson多样性指数则随海拔增加呈降低趋势;采用Chao-S(?)rensen相似性指数表征不同海拔梯度间物种的相似程度:东坡高海拔带(3 500～4 300 m)的物种相似性较低,因而β多样性较高,小型兽类物种的更替随着距离的增加而增加,且在高海拔地区物种随距离的更替更为明显,而西坡高海拔带间的β多样性较低,在3 000～4 000 m海拔段之间,小型兽类分布相对较均匀,在海拔4 000 m以上物种更替开始变大。(3)小型兽类功能多样性垂直(海拔)分布格局:东坡小型兽类连续型功能性状(除耳长)的群落水平功能性状值(CWM)都随海拔升高呈下降趋势,西坡的所有功能性状的CWM随海拔升高都呈下降趋势。东坡在1 700～2 100 m和2 500～2 900 m海拔段SES.MFD>0,而在2 100～2 500 m和2 900～4500 m海拔段SES.MFD小型兽类不同功能多样性指数的海拔分布格局有较大的差异,无明显规律。其中,东坡的功能丰富度(FRic)、功能均匀度(FEve)及群落总CWM在海拔1 700～2 100 m梯度达到最高,而功能分歧度(FDiv),功能离散度(FDis)和Rao Q均在2 100～2 500 m海拔梯度达到峰值,且FRic、FDis和Rao Q随海拔升高而降低,西坡的功能丰富度、功能分歧度在海拔3 500～3 900 m达到峰值,功能均匀度、功能离散度、Rao Q和群落总CWM在3 100～3 500 m海拔段最高。(4)小型兽类系统发育多样性垂直(海拔)分布格局:东坡在海拔3 700m以下,净亲缘指数(NRI)和最近亲缘指数(NTI)为负值,而在海拔3 700m以上,NRI和NTI为正值,随海拔升高群落系统发育结构呈现“聚集-发散”状态;西坡随海拔升高系统发育结构呈现聚集状态。东坡平均成对系统发育距离(MPD)和平均最近系统

关键词：贡嘎山小型兽类物种多样性功能多样性系统发育多样性

基于4种线粒体基因序列的广东省南雄市农区小型兽类DNA条形码分析

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中国媒介生物学及控制杂志 2022年第1期33卷 48-53页

作者：姜洪雪姚丹丹林思亮冯志勇广东省农业科学院植物保护研究所植物保护新技术重点实验室广东广州510640

目的利用4种线粒体基因对广东省南雄市农田害鼠进行鉴定,探讨不同条形码基因应用于小型兽类鉴定的可靠性。方法2019年在南雄市珠玑镇农田捕获110只鼠形动物样本,对部分样本通过提取基因组DNA、通用引物扩增线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ... 详细信息

目的利用4种线粒体基因对广东省南雄市农田害鼠进行鉴定,探讨不同条形码基因应用于小型兽类鉴定的可靠性。方法2019年在南雄市珠玑镇农田捕获110只鼠形动物样本,对部分样本通过提取基因组DNA、通用引物扩增线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)、线粒体细胞色素B(Cytb)、16S rRNA和线粒体DNA控制区(D-loop)基因片段及测序,经同源性比对、遗传距离分析和系统发育树构建鉴定鼠种,并与传统形态学鉴定结果进行比较。结果经过4种基因序列条形码分析,样本隶属于2目2科4属6种。其中臭鼩鼱D-loop不能扩增出条带,臭鼩鼱Cytb、黄毛鼠16S rRNA序列不能正确比对。不同鼠种及不同基因种内遗传距离均小于种间遗传距离。系统发育树显示,同一鼠种均聚为一支,支持率在99%以上,6个样本遗传学鉴定结果与形态学鉴定结果不同。结论DNA条形码技术是传统形态学鉴定的有力补充,实际应用时,可依据数据库的完整性和准确性合理选择不同的条形码基因,并利用多基因相互验证,以保证鉴定结果准确。

关键词： DNA条形码小型兽类种类鉴定线粒体基因

云南省家鼠鼠疫流行静息期内小型兽类的群落特征及差异分析

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中国媒介生物学及控制杂志 2023年第2期34卷 227-232页

作者：段彪任天广陶继宏苏超浦恩念赵文红亚红祥吴鹤松鲁亮云南省地方病防治所鼠疫防治科云南省鼠疫防治研究中心云南省自然疫源性疾病防控技术重点实验室云南大理671000 大理大学护理学院云南大理671000 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所媒介生物控制室北京102206

目的了解2008年后云南省家鼠鼠疫疫源地流行静息期内小型兽类的群落特征,探讨和分析引起群落结构差异变化的原因,为制订鼠疫防治措施提供科学的数据支持。方法采用分层抽样法在云南省选择地理位置和鼠疫流行静息年限具有代表性的澜沧拉... 详细信息

目的了解2008年后云南省家鼠鼠疫疫源地流行静息期内小型兽类的群落特征,探讨和分析引起群落结构差异变化的原因,为制订鼠疫防治措施提供科学的数据支持。方法采用分层抽样法在云南省选择地理位置和鼠疫流行静息年限具有代表性的澜沧拉祜族自治县(澜沧县)、弥渡县、耿马傣族佤族自治县(耿马县)、宜良县、梁河县、勐海县和元江哈尼族彝族傣族自治县(元江县),弥勒和文山市以及保山市隆阳区等10个县(市、区)开展现场调查工作,采用形态学方法鉴定捕获的小型兽类,应用Excel 2010软件整理、分析采样数据,采用描述性研究方法分析群落结构特征。结果在10个调查区内共捕获小型兽类2889只,鉴定为4目5科14属22种,黄胸鼠的构成比为56.97%(1646/2889),为优势种;褐家鼠(6.82%)、臭鼩(5.71%)、齐氏姬鼠(5.33%)、中华姬鼠(5.16%)、卡氏小鼠(3.53%)、灰麝鼩(2.94%)、锡金小鼠(2.94%)、小家鼠(2.32%)、黑缘齿鼠(2.25%)、四川短尾鼩(1.80%)和北树鼩(1.11%)为习见种;大绒鼠(0.93%)、北社鼠(0.63%)、小毛猬(0.42%)、中华鼩猬(0.35%)、大耳姬鼠(0.21%)、大足鼠(0.17%)、长尾大麝鼩(0.17%)和巢鼠(0.10%)为少见种;小板齿鼠(0.07%)和针毛鼠(0.07%)为稀有种。10个调查地区小型兽类的优势种表现为:澜沧、勐海和耿马县仅以黄胸鼠为优势种,其余7个调查区以黄胸鼠及其他1~3种小型兽类为优势种,但弥渡县和宜良县2个调查区的第1优势种均非黄胸鼠。结论云南省家鼠鼠疫疫源地静息期内的小型兽类群落结构具有多样性,群落结构的区域性差异明显。

关键词：家鼠黄胸鼠鼠疫疫源地小型兽类群落差异

四川黑竹沟地区非飞行小型兽类物种多样性与群落组成

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生物多样性 2020年第6期28卷 678-687页

作者：岳先涛张塔星窦亮刘洁冉江洪毛夜明马晓龙张尧四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室成都610065 四川大学生命科学学院四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室成都610065 四川黑竹沟国家级自然保护区管理局四川峨边614300

四川黑竹沟国家级自然保护区位于生物多样性丰富的凉山山系,在保护和维持区域生物多样性方面具有极其重要的地位,然而对该自然保护区兽类群落的研究却极为缺乏。为了了解该自然保护区及周边的小型兽类群落,本文作者在2018年4-10月调查... 详细信息

四川黑竹沟国家级自然保护区位于生物多样性丰富的凉山山系,在保护和维持区域生物多样性方面具有极其重要的地位,然而对该自然保护区兽类群落的研究却极为缺乏。为了了解该自然保护区及周边的小型兽类群落,本文作者在2018年4-10月调查了该区域的非飞行小型兽类物种多样性及其群落组成。在海拔1,537-3,830 m间共设置样方184个,布设鼠夹9,016铗日,捕获小型兽类536只,隶属4目7科13属21种。包括滇攀鼠(Vernaya fulva)和等齿鼩鼹(Uropsilus aequodonenia)两个稀有物种在内的共计9个物种为该地区首次报道,丰富了物种分布记录。结合历史资料,黑竹沟地区共记录小型兽类43种,隶属4目9科28属。在43种小型兽类中,东洋界物种37种,占绝对优势(86%),分布型以喜马拉雅-横断山型占优,为18种(占东洋界48.6%)。本次调查捕获的21种小型兽类中,群落优势种为中华姬鼠(Apodemus draco,33.2%)、北社鼠(Niviventer confucianus,21.3%)和中华绒鼠(Eothenomys chinensis,12.7%)。随着海拔上升,群落优势种组成发生变化,由北社鼠+中华姬鼠+针毛鼠(Niviventer fulvescens)+短尾鼩(Anourosorex squamipes)群落,转变为中华绒鼠+中华姬鼠+凉山沟牙田鼠(Proedromys liangshanensis)+西南绒鼠(Eothenomys custos)群落。群落物种区系的分布型组成随着海拔升高而发生变化,喜马拉雅-横断山型物种随海拔升高所占比例增大;分布于喜马拉雅-横断山的特有种分布的下限、中点和上限平均海拔都高于非特有种,且特有种和非特有种的中点和下限平均海拔差异显著(n=21,df=19,P=0.013;n=21,df=19,P小型兽类及群落多样性的数据资料,有利于该地区物种多样性的研究和保护。

关键词：小型兽类群落垂直多样性黑竹沟国家级自然保护区峨边彝族自治县

青海柴达木盆地小型兽类及体表寄生蚤种群多样性

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野生动物学报 2020年第3期41卷 610-615页

作者：李海龙何建赵延梅杨汉青马英青海省地方病预防控制所西宁811602

为研究青海柴达木盆地小型兽类及体表寄生蚤的种群结构,探讨该地区的小型兽类及体表寄生蚤的空间分布格局。采用铗夜法共捕获小型兽类1007只,隶属于3目6科14属15种,小型兽类成体占大多数,雌雄比例相近。共梳检体表寄生蚤2008匹蚤,隶属于... 详细信息

为研究青海柴达木盆地小型兽类及体表寄生蚤的种群结构,探讨该地区的小型兽类及体表寄生蚤的空间分布格局。采用铗夜法共捕获小型兽类1007只,隶属于3目6科14属15种,小型兽类成体占大多数,雌雄比例相近。共梳检体表寄生蚤2008匹蚤,隶属于3总科5科14属30种,雌蚤数量远大于雄蚤,角叶蚤总科的蚤数量最多。结果显示子午沙鼠、小毛足鼠是柴达木盆地的优势种,蚤类的组成和分布状况随地理环境、气候条件、植被和宿主动物等情况的差异而不同。

关键词：柴达木盆地小型兽类寄生蚤种群