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亚洲特有种卵圆扁蝼蛄虾鳃虱（等足目：寄生下目：鳃虱科）全线粒体基因组序列的分析研究

亚洲特有种卵圆扁蝼蛄虾鳃虱（等足目：寄生下目：鳃虱科）全线粒...

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作者：李玥山西师范大学

学位级别：硕士

据统计,截至目前等足目物种数量约10300种,是甲壳动物中生态多样性和形态多样性指数都很高的类群,包括11个亚目,其中缩头水虱亚目是等足目中唯一寄生生活的类群,主要包括寄生于鱼类的缩头水虱总科和寄生于十足目的寄生下目。本文以寄生... 详细信息

据统计,截至目前等足目物种数量约10300种,是甲壳动物中生态多样性和形态多样性指数都很高的类群,包括11个亚目,其中缩头水虱亚目是等足目中唯一寄生生活的类群,主要包括寄生于鱼类的缩头水虱总科和寄生于十足目的寄生下目。本文以寄生下目中的亚洲特有种卵圆扁蝼蛄虾鳃虱Gyge ovalis(Shiino,1939)为研究对象,进行了线粒体全基因组测序与分析,首次揭示了寄生等足类—缩头水虱亚目寄生下目物种的线粒体全基因组结构,是等足目中继海蟑螂Ligia oceanica(Linnaeus,1767),澳大利亚淡水虱Eophreatoicus sp.-14,蛀木水虱Limnoria quadripunctata和Bathynomus sp.四个线粒体全基因组数据之后的第五个物种的线粒体全基因组结构分析。结果表明卵圆扁蝼蛄虾鳃虱的线粒体全基因组大小为14,268 bp(KY038353),其中各碱基所占的比例为:A:27.01%,T:32.56%,C:17.83%,G:22.60%。基因组成和顺序与等足目模式结构较为接近,基因组由34个基因组成,包括13个蛋白编码基因,19个t RNA基因和2个r RNA基因。其中trn G,trn I,trn S1基因缺失。基因组中不全是正GC偏移在(+)链和负偏移在(-)链。19个t RNA基因的二级结构绝大多数是常见的三叶草形,在trn C中与其他已知的等足类动物一样也发现DHU臂缺失的现象。rRNA的总长为1758 bp,其中16s rRNA长度为1174 bp,12s rRNA长度为584 bp。基因组中同时包含有2个长片段的非编码区(Long-noncoding regions),分别是位于trn N和12s rRNA之间的长为121bp的片段和位于trnW和cytb之间长为211bp的片段。其中较长的长为211bp非编码片段被认为是基因组的控制区。本文通过对Genbank中11种具有完整蛋白编码基因的等足目物种以及卵圆扁蝼蛄虾鳃虱的蛋白编码基因进行分析,利用最大似然法和贝叶斯法构建系统发育树,结果表明卵圆扁蝼蛄虾鳃虱与同一亚目物种Bathynomus sp.和Eurydice pulchra不能聚为一支,而是单独成为一支。这一结果与通过单一基因18S rDNA数据和外部形态特征分析所得结果不同,并不支持Dreyer&W?gele的观点,他们认为寄生下目和缩头水虱科是姐妹群,而且认为前者是由后者演变而来的。本文研究结果对于揭示等足目内部各亚目的系统发育关系具有很重要的意义,也从另外一个侧面说明等足目基因序列保守性较其他甲壳动物差一些。等足目各亚目之间准确的系统发育关系确定还需要更多的基因组数据进一步来证实。

关键词：等足目寄生下目鳃虱科卵圆扁蝼蛄虾鳃虱线粒体基因组系统发育

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